吉田 亮

J-GLOBALへ         更新日: 17/03/15 02:55
 
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研究者氏名
吉田 亮
 
ヨシダ リョウ
URL
http://daweb.ism.ac.jp/yoshidalab/index.html
所属
情報・システム研究機構
部署
統計数理研究所 モデリング研究系 データ同化研究開発センター
職名
准教授

論文

 
Tokunaga, Terumasa The Institute of Statistical Mathematics, Hirose, Osamu Kanazawa University, Kawaguchi, Shoutarou Kanazawa University, Toyoshima, Yu University of Tokyo, Teramoto, Takayuki Kyushu University, Ikebata, Hisaki 総合研究大学院大学, Kuge, Sayuri Kyushu University, Ishihara, Takeshi Kyushu University, Iino, Yuichi University of Tokyo, Yoshida, Ryo The Institute of Statistical Mathematics
Bioinformatics   30:12 i43-i51   2014年6月   [査読有り]
Yamashita, Hiroshi 総合研究大学院大学, Higuchi, Tomoyuki The Institute of Statistical Mathematics, Yoshida, Ryo The Institute of Statistical Mathematics
Journal of Chemical Information and Modeling   54:5 1289-1300   2014年5月   [査読有り]
データ同化によって線虫の神経系をまるごと読み解く~現状と課題
徳永 旭将 統計数理研究所, 吉田 亮 統計数理研究所, 岩崎 唯史 茨城大学
シミュレーション   32巻(4号) 31-38   2013年12月   [査読有り]
Yamauchi, Mai 東京大学医科学研究所, Yamaguchi, Rui 東京大学医科学研究所, Nakata, Asuka 東京大学医科学研究所, Kohno, Takashi 国立がん研究センター, Nagasaki, Masao 東京大学医科学研究所, Shimamura, Teppei 東京大学医科学研究所, Imoto, Seiya 東京大学医科学研究所, Saito, Ayumu 東京大学医科学研究所, Ueno, Kazuko 東京大学医科学研究所, Hatanaka, Yousuke 東京大学医科学研究所, Yoshida, Ryo 統計数理研究所, Higuchi, Tomoyuki 統計数理研究所, Nomura, Masaharu 東京医科大学, Beer, David Comprehensive Cancer Center,University of Michigan, Yokota, Jun 国立がん研究センター, Miyano, Satoru 東京大学医科学研究所, Gotoh, Noriko 東京大学医科学研究所
PLoS One   7(9) e43923   2012年9月   [査読有り]
Kawano, Shuichi 大阪府立大学, Shimamura, Teppei 東京大学医科学研究所, Niida, Atsushi 東京大学医科学研究所, Imoto, Seiya 東京大学医科学研究所, Yamaguchi, Rui 東京大学医科学研究所, Nagasaki, Masao 東京大学医科学研究所, Yoshida, Ryo 統計数理研究所, Print, Cristin Univ. of Auckland, Miyano, Satoru 東京大学医科学研究所
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics   9(4) 966-972   2012年7月   [査読有り]
SiGN-SSM: open source parallel software for estimating gene networks with state space models
Tamada, Yoshinori The University of Tokyo, Yamaguchi, Rui Institute of Medical Science, The University of Tokyo, Imoto, Seiya Institute of Medical Science, The University of Tokyo, Hirose, Osamu The University of Tokyo, Nagasaki, Masao Institute of Medical Science, The University of Tokyo, Miyano, Satoru Institute of Medical Science, The University of Tokyo
Bioinformatics   27 1172-1173   2011年4月   [査読有り]
Bayesian experts in exploring reaction kinetics of transcription circuits
Yoshida, Ryo Institute of Statistical Mathematics, Masaya, Saito Institute of Statistical Mathematics, Hiromichi, Nagao Institute of Statistical Mathematics, Tomoyuki, Higuchi Institute of Statistical Mathematics
Bioinformatics   26 i589-i595   2010年10月   [査読有り]
Bayesian learning in sparse graphical factor models via variational mean-field annealing
Yoshida, Ryo Institute of Statistical Mathematics, West, Mike Duke University
Journal of Machine Learning Research   11 1771-1798   2010年10月   [査読有り]
A state space representation of VAR models with sparse learning for dynamic gene networks
Kojima, Kaname , Yamaguchi, Rui , Imoto, Seiya , Yamauchi, Mai , Nagasaki, Masao , Yoshida, Ryo , Shimamura, Teppei , Ueno, Kazuko , Higuchi, Tomoyuki , Gotoh, Noriko , Miyano, Satoru
Genome Informatics   22 56-68   2009年   [査読有り]
細胞内生化学反応経路のグラフィカルモデリングと統計的推測手法の新展開
吉田 亮 , 樋口 知之
日本統計学会誌   38:2 213-236   2009年   [査読有り]
Statistical absolute evaluation of gene ontology terms with gene expression data
Gupta, Pramod, K. Institute of Medical Science, University of Tokyo, Yoshida, Ryo Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems , Imoto, Seiya Institute of Medical Science, University of Tokyo, Yamaguchi, Rui Institute of Medical Science, University of Tokyo, Miyano, Satoru Institute of Medical Science, University of Tokyo
Proceedings of 3rd International Symposium on Bioinformatics Research and Applications, Lecture Note in Bioinformatics, Springer-Verlag   4463 146-157   2007年   [査読有り]
Finding module-based gene networks with state-space models - Mining high-dimensional and short time-course gene expression data
Yamaguchi, Rui Institute of Medical Science, University of Tokyo, Yoshida, Ryo Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems , Imoto, Seiya Institute of Medical Science, University of Tokyo, Higuchi, Tomoyuki Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems , Miyano, Satoru Institute of Medical Science, University of Tokyo
IEEE Signal Processing Magazine   24(1) 37-46   2007年   [査読有り]
Identification of activated transcription factors from microarray gene expression data of Kampo-medicine treated mice
Yamaguchi, Rui Institute of Medical Science, University of Tokyo, Yamamoto, Masahiro , Imoto, Seiya Institute of Medical Science, University of Tokyo, Nagasaki, Masao Institute of Medical Science, University of Tokyo, Yoshida, Ryo Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems , Tsuiji, Kenji , Ishige, Atsushi , Asou, Hiroaki , Watanabe, Kenji , Miyano, Satoru Institute of Medical Science, University of Tokyo
Genome Informatics   18 119-129   2007年   [査読有り]
Clustering with time course gene expression profiles and the mixture of state space models
Hirose, Osamu Institute of Medical Science, University of Tokyo, Yoshida, Ryo Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems , Yamaguchi, Rui Institute of Medical Science, University of Tokyo, Imoto, Seiya Institute of Medical Science, University of Tokyo, Higuchi, Tomoyuki Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems , Miyano, Satoru Institute of Medical Science, University of Tokyo
Genome Informatics   18 258-266   2007年   [査読有り]
Computational discovery of aberrant splice variations with genome-wide exon expression profiles
Yoshida, Ryo Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems , Numata, Kazuyuki Institute of Medical Science, University of Tokyo, Imoto, Seiya Institute of Medical Science, University of Tokyo, Nagasaki, Masao Institute of Medical Science, University of Tokyo, Doi, Atsushi Institute of Medical Science, University of Tokyo, Ueno, Kazuko Institute of Medical Science, University of Tokyo, Miyano, Satoru Institute of Medical Science, University of Tokyo
Proceedings of IEEE 7th International Symposium on Bioinformatics and Bioengineering   715-722   2007年   [査読有り]
Importance sampling with the estimated sampler
Hemmi, Masayuki Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems , Yoshida, Ryo Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems , Eguchi, Shinto Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems
Biometrika   94 985-991   2007年   [査読有り]

書籍等出版物

 
データ同化入門―次世代のシミュレーション技術―
樋口 知之 統計数理研究所, 上野 玄太 統計数理研究所, 中村 和幸 明治大学, 中野 慎也 統計数理研究所, 吉田 亮 統計数理研究所
2011年9月   

競争的資金等の研究課題

 
状態空間モデルに基づく高次元時系列データ解析の理論と方法論の研究
科研費若手研究(B)
研究期間: 2006年4月 - 2008年3月    代表者: 吉田 亮
組織的メタ遺伝子解析の多重検定理論とその応用化
科研費若手研究(B)
研究期間: 2009年4月 - 2011年3月    代表者: 吉田 亮
組織的メタ遺伝子解析の多重検定理論とその応用化
科研費若手研究(B)
研究期間: 2009年4月 - 2010年3月    代表者: 吉田 亮
最先端トランスクリプトーム解析のための統計的バイオモデリング
科研費若手研究(B)
研究期間: 2011年4月 - 2013年3月    代表者: 吉田 亮
最先端トランスクリプトーム解析のための統計的バイオモデリング
科研費若手研究(B)
研究期間: 2011年4月 - 2013年3月    代表者: 吉田 亮