柴田 綾

J-GLOBALへ         更新日: 17/09/09 03:16
 
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研究者氏名
柴田 綾
 
シバタ アヤ
所属
岐阜大学
部署
工学部 化学・生命工学科 生命化学コース
職名
助教
学位
工学(岐阜大学)

研究分野

 
 

経歴

 
2015年
   
 
岐阜大学 工学部 助教
 

論文

 
新規架橋型核酸の開発とその遺伝子抑制法への応用
Nagaya Yuki, Kitamura Yoshiaki, Nakashima Remi, Shibata Aya, Ikeda Masato, Kitade Yukio
Nucleosides, nucleotides&nucleic acids   35(2) 64   2016年2月   [査読有り]
We developed a practical and reliable method for synthesizing an abasic deoxyribonucleoside, 1,2-dideoxy-d-ribofuranose (dR(H)) via elimination of nucleobase from thymidine. To synthesize oligonucleotides bearing dR(H) by the standard phosphoramid...
Abe Naoko, Matsumoto Ken, Nishihara Mizuki, Nakano Yukiko, Shibata Aya, Maruyama Hideto, Shuto Satoshi, Matsuda Akira, Yoshida Minoru, Ito Yoshihiro, Abe Hiroshi
Scientific reports   5 16435   2015年   [査読有り]
We recently reported that circular RNA is efficiently translated by a rolling circle amplification (RCA) mechanism in a cell-free Escherichia coli translation system. Recent studieshave shown that circular RNAs composed of exonic sequences are abu...
Ren Qin, Tsunaba Kana, Kitamura Yoshiaki, Nakashima Remi, Shibada Aya, Ikeda Masato, Kitade Yukio
Bioorganic&medicinal chemistry letters   24(6) 1519-1522   2014年3月   [査読有り]
Positron emission tomography (PET) is a highly sensitive quantitative imaging technique for studying molecular pathways and interactions in vivo. This imaging technique plays a key rolein drug discovery, pharmacokinetics, pharmacodynamics, and ass...
Shibata Aya, Nakano Yukiko, Ito Mika, Araki Mika, Zhang Jie, Yoshida Yasuhiko, Shuto Satoshi, Mannervik Bengt, Mogenstern Ralf, Ito Yoshihiro, Abe Hiroshi
The Analyst   138(24) 7326-7330   2013年11月   [査読有り]
We havesynthesized a series of 4-substituted-2-nitrobenzene-sulfonyl compounds for caged fluorogenic probes and conducted a Hammett plot analysis using the steady-state kinetic parameters. The results revealed that the glutathione transferase (GST...

Misc

 
Aya Shibata, Yoshihito Ueno, Mari Iwata, Haruka Wakita, Akira Matsuda, Yukio Kitade
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters   22 2681-2683
This Letter describes the synthesis and properties of double-stranded antisense oligonucleotides connected with a pentaerythritol linker. We found that double-stranded antisense oligonucleotides with aminomethyl residues have high affinity for sin...
Masato Ikeda, Masato Ikeda, Masato Ikeda, Keito Horio, Tomoya Tsuzuki, Ryo Torii, Aya Shibata, Aya Shibata, Yoshiaki Kitamura, Yoshiaki Kitamura, Hiroshi Katagiri, Yukio Kitade, Yukio Kitade, Yukio Kitade
Tetrahedron Letters   
© 2015 Elsevier Ltd. Herein, we describe a new methodology for the solid phase submonomer synthesis (SPSS) of arylopeptoids using a reductive amination reaction as the key step instead of a nucleophilic substitution reaction, which is generally us...
Yuki Nagaya, Yoshiaki Kitamura, Yoshiaki Kitamura, Remi Nakashima, Aya Shibata, Aya Shibata, Masato Ikeda, Masato Ikeda, Masato Ikeda, Yukio Kitade, Yukio Kitade, Yukio Kitade
Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids   35 64-75   2016年1月
© 2016 Taylor & Francis Group, LLC. We developed a practical and reliable method for synthesizing an abasic deoxyribonucleoside, 1,2-dideoxy-D-ribofuranose (dRH) via elimination of nucleobase from thymidine. To synthesize oligonucleotides bearing ...
Aya Shibata, Yoshihito Ueno, Akira Matsuda, Yukio Kitade
Nucleic acids symposium series (2004)   73-74
This paper describes the synthesis and properties of double-stranded antisense oligonucleotides connected with a pentaerythritol linker. We found that double-stranded antisense oligonucleotides with aminomethyl residues have high affinity for sing...
Yoshihito Ueno, Takumi Kato, Kumiko Sato, Yasutomo Ito, Mahito Yoshida, Takumi Inoue, Aya Shibata, Masahiro Ebihara, Yukio Kitade
Journal of Organic Chemistry   70 7925-7935
The synthesis and properties of a nucleic acid analogue consisting of a benzene-phosphate backbone are described. The building blocks of the nucleic acid analogue are composed of bis(hydroxymethyl)-benzene residues connected to nucleobases via the...

担当経験のある科目

 
 

競争的資金等の研究課題

 
文部科学省: 科学研究費補助金(若手研究(B))
研究期間: 2015年 - 2016年    代表者: 柴田 綾
文部科学省: 科学研究費補助金(若手研究(B))
研究期間: 2010年 - 2011年    代表者: 柴田 綾
本研究ではアリールスルフォニル基を保護基に用いてGST検出のためのプローブ開発を行った。開発したプローブは、基質自身はGSH修飾を受けず排出機構の影響を受けないため、細胞内で安定してシグナルを発生させることが可能である。このアリールスルフォニル基を用いて、GSTで活性化される蛍光、化学発光、19F-NMRプローブおよびプロドラックの合成に成功した。
微量遺伝子の検出を指向した自己切断型検出プローブの開発
代表者: 柴田 綾
生細胞内での遺伝子検出を指向した分子移動型プローブの開発
日本学術振興会: 科学研究費助成事業
研究期間: 2015年4月 - 2017年3月    代表者: 柴田綾
特定刺激でRNA干渉効果が誘起されるRNA分子の開発
岐阜大学: 活性化経費
研究期間: 2015年6月 - 2016年3月    代表者: 柴田綾