Yuriko Kobayashi

Profile Information

Affiliation: Faculty of Applied Biological Sciences, Gifu University
: 准教授, 応用生物科学研究科
: 准教授, 連合農学研究科

Degree: 博士（農学）(岐阜大学)

Researcher number: 40610952
J-GLOBAL ID: 201601000428032598
researchmap Member ID: 7000014346

External link: http://www.abios.gifu-u.ac.jp/koyama/

植物の環境ストレス耐性機構に関する研究／遺伝的多様性を利用した栄養環境や有害元素などの植物の環境ストレス耐性に関する遺伝学的・分子生物学的研究

Research Interests

Research Areas

Life sciences / Plant nutrition, soil science / Plant Nutrition and Soil Science

Research History

Apr, 2017 - Present

Associate professor, Faculty of Applied Biological Sciences, Gifu University
Apr, 2011 - Mar, 2017

Faculty of Applied Biological Sciences, Gifu University
Apr, 2008 - Mar, 2011

日本学術振興会特別研究員（ＰＤ）独立行政法人理化学研究所バイオリソースセンター
Apr, 2007 - Mar, 2008

王子製紙株式会社森林資源研究所

Education

Apr, 2003 - Mar, 2006

The United Graduate School of Agricultural Science, Gifu University
Apr, 2001 - Mar, 2003

The Graduate School of Agriculture, Gifu University

Awards

Nov, 2022

優秀ポスター賞, 緑色植物が制御するアルミニウム誘導性遺伝子群の発現比較, 日本土壌肥料学会中部支部第102回例会

宮地右, 渡邉ひかり, 阿相幸恵, 井内聖, 小林正智, 小林佑理子, 小山博之
Aug, 2018

優秀ポスター賞, AtALMT1 のアルミニウム誘導を制御する転写因子STOP1 内部の調節領域に関する研究, 日本土壌肥料学会2018年度神奈川大会

伊藤弘樹, 小林佑理子, 藤田美紀, 井内聖, 小林正智, 小山博之
Sep, 2015

優秀ポスター賞, シロイヌナズナのアルミニウム応答する根からのリンゴ酸放出と代謝の関連性に関する研究, 日本土壌肥料学会2015年度京都大会

榎本拓央, 及川彰, 小林佑理子, 小山博之
Sep, 2014

優秀ポスター賞, シロイヌナズナにおけるアルミニウム及び低pH耐性のゲノムワイド関連解析, 日本土壌肥料学会2014年度東京大会

中野友貴, 大橋聖, 楠和隆, 時澤睦朋, 山本義治, 井内聖, 小林正智, 小山博之, 小林佑理子
Sep, 2013

優秀ポスター賞, アルミニウム応答性リンゴ酸トランスポーターALMT1遺伝子の転写制御機構の解析., 日本土壌肥料学会 2013年名古屋大会

時澤睦朋, 小林安文, 小林佑理子, 山本義治, 小山博之
May, 2013

優秀ポスター賞, 光防御関連遺伝子ELIP2プロモーターに含まれる, 強光, UV-B,低温ストレス応答を統合する制御配列, 日本光合成学会2013年度大会

速水菜月, 坂井優作, 吉岡洋平, 百町満朗, 時澤睦朋, 井内聖, 小林正智, 齋藤竜典, 小林佑理子, 小山博之, 山本義治
2012

優秀ポスター賞, リンゴ酸トランスポーターAtALMT1活性化を介したリンゴ酸放出機構の解析, 日本土壌肥料学会2012年鳥取大会

安佐伊美夏, 小林佑理子, 小林安文, 井内聖, 小林正智, 小山博之
2009

Inoue Research Award for Young Scientists
2008

JSSSPN Award for Young Scientists, JSSSPN
2007

第４０回日本無菌生物ノートバイオロジー学会総会会長奨励賞, JAGLG

Papers

STOP1-regulated SMALL AUXIN UP RNA55 (SAUR55) is involved in proton/malate co-secretion for Al tolerance in Arabidopsis

Agrahari RK, Kobayashi Y, Enomoto T, Miyachi T, Fujita M, Iuchi S, Kobayashi M, Yamamoto YY, Koyama H

Plant Direct, Jan, 2024 Peer-reviewed
The transcription factors, STOP1 and TCP20, are required for root system architecture alterations in response to nitrate deficiency.

Mutsutomo Tokizawa, Takuo Enomoto, Rahul Chandnani, Javier Mora-Macías, Connor Burbridge, Alma Armenta-Medina, Yuriko Kobayashi, Yoshiharu Y Yamamoto, Hiroyuki Koyama, Leon V Kochian

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 120(35) e2300446120, Aug 29, 2023
Cowpea NAC1/NAC2 transcription factors improve growth and tolerance to drought and heat in transgenic cowpea through combined activation of photosynthetic and antioxidant mechanisms

Richa Srivastava, Yuriko Kobayashi, Hiroyuki Koyama, Lingaraj Sahoo

Journal of Integrative Plant Biology, 65(1) 25-44, Jan, 2023
Enhanced osmotic adjustment, antioxidant defense, and photosynthesis efficiency under drought and heat stress of transgenic cowpea overexpressing an engineered DREB transcription factor

Sanjeev Kumar, J. Muthuvel, Ayan Sadhukhan, Yuriko Kobayashi, Hiroyuki Koyama, Lingaraj Sahoo

Plant Physiology and Biochemistry, 193 1-13, Dec 15, 2022
4-3-7 Al 耐性遺伝子PGIP1 の発現量ゲノムワイド関連解析によるPGIP1 発現を制御するシグナル伝達経路と遺伝子の同定（4-3 植物の有害元素 2022年度東京大会）

榎本拓央, 伊藤弘樹, 中野友貴, 柳瀬笑子, 渡部敏裕, 井内聖, 小林正智, 山本義治, 小山博之, 小林佑理子

日本土壌肥料学会講演要旨集, 68 55-55, Sep 5, 2022
Overexpression of cowpea NAC transcription factors promoted growth and stress tolerance by boosting photosynthetic activity in Arabidopsis

Richa Srivastava, Yuriko Kobayashi, Hiroyuki Koyama, Lingaraj Sahoo

Plant Science, 319, Jun, 2022
Liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) based metabolomic fingerprinting in contrasting rice varieties for iron (Fe) excess.

Saradia Kar, Raj Kishan Agrahari, Emiko Yanase, Yuriko Kobayashi, Hiroyuki Koyama, Sanjib Kumar Panda

Plant Stress, 4, Apr, 2022
Expression GWAS of PGIP1 Identifies STOP1-Dependent and STOP1-Independent Regulation of PGIP1 in Aluminum Stress Signaling in Arabidopsis

Raj Kishan Agrahari, Takuo Enomoto, Hiroki Ito, Yuki Nakano, Emiko Yanase, Toshihiro Watanabe, Ayan Sadhukhan, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Sanjib Kumar Panda …

Frontiers in Plant Science, 12, Dec 17, 2021
STOP1 regulatory system: Centered on multiple stress tolerance and cellular nutrient management

Hiroyuki Koyama, Liujie Wu, Raj Kishan Agrahari, Yuriko Kobayashi

Molecular Plant, 14(10) 1615-1617, Oct 4, 2021
High affinity promoter binding of STOP1 is essential for the early aluminum-inducible expression of novel Al resistance genes GDH1 and GDH2 in Arabidopsis.

Mutsutomo Tokizawa, Takuo Enomoto, Hiroki Ito, Liujie Wu, Yuriko Kobayashi, Javier Mora-Macías, Dagoberto Armenta-Medina, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Mika Nomoto …

Journal of experimental botany, 72(7) 2769-2789, Jan 22, 2021 Peer-reviewed
Expression genome-wide association study identifies that phosphatidylinositol-derived signalling regulates ALUMINIUM SENSITIVE3 expression under aluminium stress in the shoots of Arabidopsis thaliana

Ayan Sadhukhan, Raj Kishan Agrahari, Liujie Wu, Toshihiro Watanabe, Yuki Nakano, Sanjib Kumar Panda, Hiroyuki Koyama, Yuriko Kobayashi

Plant Science, 302, Jan, 2021 Peer-reviewedCorresponding author
Comparative RNA-Seq analysis of the root revealed transcriptional regulation system for aluminum tolerance in contrasting indica rice of North East India.

Jay Prakash Awasthi, Kazutaka Kusunoki, Bedabrata Saha, Yuriko Kobayashi, Hiroyuki Koyama, Sanjib Kumar Panda

Protoplasma, Nov 13, 2020
Aluminum-Specific Upregulation of GmALS3 in the Shoots of Soybeans: A Potential Biomarker for Managing Soybean Production in Acidic Soil Regions

Raj Kishan Agrahari, Yuriko Kobayashi, Pankaj Borgohain, Sanjib Kumar Panda, Hiroyuki Koyama

Agronomy, 10(9) 1228-1228, Aug 20, 2020 Peer-reviewed
A single-population GWAS identified AtMATE expression level polymorphism caused by promoter variants is associated with variation in aluminum tolerance in a local Arabidopsis population

Yuki Nakano, Kazutaka Kusunoki, Haruka Maruyama, Takuo Enomoto, Mutsutomo Tokizawa, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Leon V. Kochian, Hiroyuki Koyama, Yuriko Kobayashi

Plant Direct, 4(8), Aug 1, 2020 Peer-reviewedCorresponding author
Genome-Wide Association Study and Genomic Prediction Elucidate the Distinct Genetic Architecture of Aluminum and Proton Tolerance in Arabidopsis thaliana

Yuki Nakano, Kazutaka Kusunoki, Owen A. Hoekenga, Keisuke Tanaka, Satoshi Iuchi, Yoichi Sakata, Masatomo Kobayashi, Yoshiharu Y. Yamamoto, Hiroyuki Koyama, Yuriko Kobayashi

Frontiers in Plant Science, 11, Apr, 2020 Peer-reviewedCorresponding author
Genome-wide association studies of agronomic traits consisting of field-and molecular-based phenotypes

Yuki Nakano, Yuriko Kobayashi

Reviews in Agricultural Science, 8 28-45, 2020 Peer-reviewedCorresponding author
4-1-21 STOP1はHsfA2とGDHの転写調節を介して低酸素耐性を制御する（4-1 植物の多量栄養素，2019年静岡大会）

榎本拓央, 時澤睦朋, 伊藤弘樹, 井内聖, 小林正智, 山本義治, 小林佑理子, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集, 65 47-47, Sep 3, 2019
Sensitive to Proton Rhizotoxicity1 Regulates Salt and Drought Tolerance of Arabidopsis thaliana through Transcriptional Regulation of CIPK23

Ayan Sadhukhan, Takuo Enomoto, Yuriko Kobayashi, Toshihiro Watanabe, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Lingaraj Sahoo, Yoshiharu Y. Yamamoto, Hiroyuki Koyama

Plant and Cell Physiology, 60(9) 2113-2126, Sep 1, 2019 Peer-reviewed
Involvement of phosphatidylinositol metabolism in aluminum-induced malate secretion in Arabidopsis

Liujie Wu, Ayan Sadhukhan, Yuriko Kobayashi, Naohisa Ogo, Mutsutomo Tokizawa, Raj Kishan Agrahari, Hiroki Ito, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Akira Asai …

Journal of Experimental Botany, 70(12) 3329-3342, Jun, 2019 Peer-reviewed
STOP1 regulates the expression of HsfA2 and GDHs that are critical for low-oxygen tolerance in Arabidopsis

Takuo Enomoto, Mutsutomo Tokizawa, Hiroki Ito, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Yoshiharu Y. Yamamoto, Yuriko Kobayashi, Hiroyuki Koyama

Journal of Experimental Botany, 70(12) 3297-3311, Jun, 2019 Peer-reviewed

Misc.

How do plants remember drought?

Ayan Sadhukhan, Shiva Sai Prasad, Jayeeta Mitra, Nadeem Siddiqui, Lingaraj Sahoo, Yuriko Kobayashi, Hiroyuki Koyama

Planta, 256(1), Jul, 2022
Synergistic and antagonistic pleiotropy of STOP1 in stress tolerance

Ayan Sadhukhan, Yuriko Kobayashi, Satoshi Iuchi, Hiroyuki Koyama

Trends in Plant Science, 26(10) 1014-1022, Oct, 2021
Smart fertilizer management: the progress of imaging technologies and possible implementation of plant biomarkers in agriculture

Raj Kishan Agrahari, Yuriko Kobayashi, Takashi Sonam Tashi Tanaka, Sanjib Kumar Panda, Hiroyuki Koyama

Soil Science and Plant Nutrition, 67(3) 248-258, 2021
STOP1はHsfA2とGDHの転写調節を介して低酸素耐性を制御する

榎本拓央, 時澤睦朋, 時澤睦朋, 伊藤弘樹, 井内聖, 小林正智, 山本義治, 小林佑理子, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web), 65, 2019
アルミニウムシグナル非感受性突然変異体の解析

小林佑理子, 楠和隆, 藤井健生, HUANG Chaokun, WU Liujie, 榎本拓央, 伊藤弘樹, 井内聖, 小林正智, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集, 64, 2018
アルミニウム耐性機構における窒素代謝関連遺伝子GDHの役割

大澤拓巳, 榎本拓央, 伊藤弘樹, 小林佑理子, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集, 64, 2018
アルミニウム条件下におけるシロイヌナズナの硫酸代謝関連遺伝子の発現解析

榎本拓央, 小林佑理子, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集, 63, 2017
アルミニウム耐性に関わる転写因子STOP1の根における転写制御ネットワークの解析

時澤睦朋, 榎本拓央, 藤井健生, 小林佑理子, 井内聖, 小林正智, 野元美佳, 多田安臣, 山本義治, 小山博之

根の研究, 25(4), 2016
Activation of disease resistance in rice and Arabidopsis by Penicillium pinophilum infection

46(2) 91-94, 2016
4-3-14 Isolation and characterization of aluminum tolerance genes in pigeonpea

Daspute Abhijit Arun

Abstracts of the meeting, the Society of the Science of Soil and Manure, (61) 76-76, Sep 9, 2015
P4-3-17 RNA-seqを用いたシロイヌナズナ野生種のアルミニウムストレス応答トランスクリプトーム比較解析(ポスター,4-3 植物の有害元素,2015年度京都大会)

楠和隆, 中野友貴, 田中啓介, 坂田洋一, 小林佑理子, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集, (61) 82-82, Sep 9, 2015
P4-3-15 シロイヌナズナのアルミニウム応答する根からのリンゴ酸放出と代謝の関連性に関する研究(ポスター,4-3 植物の有害元素,2015年度京都大会)

榎本拓央, 及川彰, 小林佑理子, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集, (61) 82-82, Sep 9, 2015
4-3-17 シロイヌナズナ転写制御因子STOP1によるアルミニウム耐性遺伝子の転写制御機構の解析(4-3 植物の有害元素,2015年度京都大会)

時澤睦朋, 榎本拓央, 小林佑理子, 野元美佳, 多田安臣, 山本義治, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集, (61) 77-77, Sep 9, 2015
P4-3-7 AtALMT1prom::GFP遺伝子を用いたシロイヌナズナアルミニム応答変異体の単離(ポスター,4-3 植物の有害元素,2015年度京都大会)

藤井健生, 中野友貴, 伊藤弘樹, 井内聖, 小林佑理子, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集, (61) 79-79, Sep 9, 2015
P4-3-18 ゲノムワイド関連解析によるシロイヌナズナの根の成長維持のための塩耐性に重要な遺伝子座の特定(ポスター,4-3 植物の有害元素,2015年度京都大会)

小林佑理子, 中野友貴, 楠和隆, 井内聖, 小林正智, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集, (61) 83-83, Sep 9, 2015
6 チャ(Camellia sinensis L.)のSTOP1相同遺伝子の解析(中部支部講演会,2014年度各支部会)

田中靖乃, 一家崇志, 松田知子, 小林佑理子, 井内聖, 小林正智, 小山博之, 森田森田

日本土壌肥料学会講演要旨集, (61) 270-270, Sep 9, 2015
Altered amino acid metabolism of the roots of Arabidopsis under Al-responsive malate excretion

45(2) 68-71, 2015
4-1-21 酸感受性変異体stop1の低酸素ストレス応答の解析(4-1 植物の多量栄養素,2014年度東京大会)

榎本拓央, 伊藤弘樹, 小林安文, 小林佑理子, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集, (60) 53-53, Sep 9, 2014
VI-4 Aluminum sensing in STOP1/AtALMT1 system(VI Mineral transport and sensing in plants)

KOYAMA Hiroyuki, TOKIZAWA Mutsutomo, KOBAYASHI Yuriko

Abstracts of the meeting, the Society of the Science of Soil and Manure, (60) 216-216, Sep 9, 2014
P4-3-14 シロイヌナズナ根部のイオンストレスに応答するトランスクリプトーム解析(ポスター,4-3 植物の有害元素,2014年度東京大会)

楠和隆, 小林安文, 小林佑理子, 小山博之

日本土壌肥料学会講演要旨集, (60) 78-78, Sep 9, 2014

Books and Other Publications

The Molecular Physiology and Regulation of Aluminum Resistance in Higher Plants.

Koyama, H, Kobayashi, Y, Panda, S.K, Taylor, G.J (Role: Joint author)

2015

Presentations

Al耐性遺伝子PGIP1の発現量GWASによる PGIP1発現を制御するシグナル伝達経路と遺伝子の同定

Raj Kishan Agrahari, 榎本拓央, 伊藤弘樹, 中野友貴, 柳瀬笑子, 渡部敏裕, 井内聖, 小林正智, 山本義治, 小山博之, 小林佑理子

日本土壌肥料学会2022年度東京大会, Sep, 2022
ゲノム・トランスクリプトーム解析から見えた根の酸化ストレス応答とその多様性

Kobayashi Yuriko

日本土壌肥料学会2018年度神奈川大会, Aug 31, 2018 Invited
ゲノムワイド関連解析によってNIP1;1がH2O2感受性バリエーションに関与することが明らかになった

小林佑理子, Sadhukhan Ayan, 中野友貴, 井内聖, 小林正智, Sahoo Lingaraj, 小山博之

日本土壌肥料学会2017年度仙台大会, Sep 5, 2017
シロイヌナズナにおけるイオンストレス耐性の自然変異とトランスポーター遺伝子の関連

小林佑理子

第12回トランスポーター研究会年会, Jul 8, 2017 Invited
植物の環境適応戦略と微生物生存戦略の共進化

小林佑理子

日本無菌生物ノートバイオロジー学会総会, 2015 Invited
ゲノムワイド関連解析によるシロイヌナズナの根の成長維持のための塩耐性に重要な遺伝子座の特定

小林佑理子, 中野友貴, 楠和隆, 井内聖, 小林正智, 小山博之

日本土壌肥料学会, 2015
A genome-wide association study of Aluminum tolerance in Arabidopsis thaliana.

Kobayashi, Y, Nakano, Y, Kusunoki, K, Iuchi, S, Yamamoto, Y.Y, Kobayashi, M, Koyama, H

9th International Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH, 2015
STOP2はSTOP1転写因子制御下にあるAlと低pH耐性関連遺伝子の転写を活性化する

小林佑理子, 大山慶直, 小林安文, 伊藤弘樹, 井内聖, 藤田美紀, 趙成日, Tazib Tanveer, Markkandan Ganesan, 小林正智, 小山博之

第55回日本植物生理学会, 2014
STOP1 Regulatory System for Aluminum and Proton Tolerance in Several Plant Species.

Yuriko Kobayashi, Yasufumi Kobayashi, Hiroki Ito, Yoshiharu Sawaki, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Hiroyuki Koyama

Plant Biology, 2014
Understanding Environmental Stress-Tolerant Mechanism through the Genome-Wide Association Study Using Wild Populations of Arabidopsis thaliana

Yuriko Kobayashi

Mar, 2013 Invited
ゲノムワイド関連解析によるミネラルストレス耐性の理解

Yuriko Kobayashi

Nov, 2012 Invited
ゲノムワイド関連解析から見るミネラルストレス耐性の多様性

Yuriko Kobayashi

Sep, 2012 Invited
Analysis of soil environmental stress-tolerance in Arabidopsis thaliana via genome-wide association study

Yuriko Kobayashi

Sep, 2011 Invited

Teaching Experience

Professional Memberships

Research Projects

Adaptive evolution to acid soil reveals gene regulatory networks for aluminum tolerance

Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2022 - Mar, 2026
Mechanism of transcriptional activation of aluminum tolerance gene through a signal transduction pathway

Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C), Grant-in-Aid for Scientific Research (C), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2019 - Mar, 2022

Kobayashi Yuriko
Characterization of low pH and aluminum signal transduction based on chemical genetics

Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research, Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research, Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2016 - Mar, 2018

KOBAYASHI Yuriko
Making new tolerant plants by molecular modification of the lipid bilayer

Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2015 - Mar, 2018

WAGATSUMA Tadao, KOYAMA Hiroyuki, KURODA Masaharu, OKAZAKI Youzou
Molecular understanding of acid soil tolerance based on genome-wide association study.

Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (A), Grant-in-Aid for Young Scientists (A), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2012 - Mar, 2016

Kobayashi Yuriko
Pilot studies for high throughput analysis of Arabidopsis GWAS

Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research, Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research, Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2012 - Mar, 2014

YAMAMOTO Yoshiharu Y., KOBAYASHI Yuriko
シロイヌナズナ生態型間差を活用したアルミニウム耐性機構の分子レベルでの解明

科学研究費助成事業特別研究員奨励費, 特別研究員奨励費, 日本学術振興会, 2008 - 2010

小林佑理子
精密なQTL解析にもとづくアルミニウム耐性遺伝子群の単離と分子改良への応用

科学研究費助成事業特別研究員奨励費, 特別研究員奨励費, 日本学術振興会, 2004 - 2005

小林佑理子
化合物ライブラリーを用いたリンゴ酸分泌メカニズムの薬理学的解析

小林佑理子

Social Activities

◎研究室から大学はいま：植物生育,遺伝情報で比較

Other

岐阜新聞, マスコミ報道, Aug 7, 2018

Other

特定管理産業廃棄物管理責任者

Profile Information

Research Interests

Research Areas

Research History

Education

Awards

Papers

Misc.

Books and Other Publications

Presentations

Teaching Experience

Professional Memberships

Research Projects

Social Activities

Other

Menu

Coauthors