神沼英里

J-GLOBALへ         更新日: 17/07/28 17:59
 
アバター
研究者氏名
神沼英里
eメール
ekaminumnig.ac.jp
URL
http://kaken.nii.ac.jp/ja/r/90314559
所属
国立遺伝学研究所
部署
生命情報研究センター
職名
助教
学位
博士(工学)

プロフィール

国立遺伝学研究所 生命情報研究センター所属。ライフサイエンスAIが専門。DNA配列データ・実験計測画像データを中心とした生命科学分野での自動アノテーション研究に従事。最近は、大規模生命情報データを対象とした機械学習モデリングやクラウドサイエンス(クラウドソーシング応用)の研究をしています。

研究分野

 
 

経歴

 
2009年4月
   
 
国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ研究センター 助教
 
2001年7月
 - 
2009年3月
独立行政法人理化学研究所 研究員
 
1999年4月
 - 
2001年6月
和歌山大学 システム工学部 助手
 
1999年2月
 - 
1999年3月
日本学術振興会 特別研究員DC2
 

論文

 
Minamikawa MF, Nonaka K, Kaminuma E, Kajiya-Kanegae H, Onogi A, Goto S, Yoshioka T, Imai A, Hamada H, Hayashi T, Matsumoto S, Katayose Y, Toyoda A, Fujiyama A, Nakamura Y, Shimizu T, Iwata H
Scientific reports   7(1) 4721   2017年7月   [査読有り]
Mochizuki T, Tanizawa Y, Fujisawa T, Ohta T, Nikoh N, Shimizu T, Toyoda A, Fujiyama A, Kurata N, Nagasaki H, Kaminuma E, Nakamura Y
PloS one   12(2) e0172269   2017年2月   [査読有り]
Shimizu T, Kitajima A, Nonaka K, Yoshioka T, Ohta S, Goto S, Toyoda A, Fujiyama A, Mochizuki T, Nagasaki H, Kaminuma E, Nakamura Y
PloS one   11(11) e0166969   2016年11月   [査読有り]
Mashima J, Kodama Y, Fujisawa T, Katayama T, Okuda Y, Kaminuma E, Ogasawara O, Okubo K, Nakamura Y, Takagi T
Nucleic acids research   45(D1) D25-D31   2016年10月   [査読有り]
T. Shimizu, E. Kaminuma, K. Nonaka, T. Yoshioka, S. Goto, T. Matsumoto, Y. Katayose, T. Mochizuki, Y. Tanizawa, A. Toyoda, A. Fujiyama, Y. Nakamura
Acta Horticulturae      2016年9月   [査読有り]

書籍等出版物

 
次世代シーケンサーデータの解析手法 第 7 回 ロングリードアセンブリ
谷澤 靖洋、神沼 英里、中村 保一、遠野 雅徳 、 大崎 研、清水 謙多郎 、門田 幸二 (担当:共著)
乳酸菌学会誌vol27,No.2 解説   2016年7月   
育種学研究 Vol.17 No.2 2014年第56回シンポジウム(シンポジウム・ワークショップ)報告
神沼英里, 望月 孝子, 門田 有希, 小林 正明, 大柳 一, 矢野 健太郎 (担当:共著, 範囲:遺伝研スパコンとコマンドラインでのNGSデータ使い倒し講座)
2015年7月   
実験医学別冊「次世代シークエンス解析スタンダード」
長崎英樹,望月孝子,谷沢靖洋,神沼英里,中村保一 (担当:共著, 範囲:Ⅵ-4 DDBJ Read Annotation Pipeline 解析パイプラインによるRNA-Seq de novo assemblyとイネ多型解析)
羊土社   2014年8月   
遺伝子図鑑
国立遺伝学研究所「遺伝子図鑑」編集委員会 (担当:分担執筆, 範囲:3−9 葉緑体, 11−4 遺伝子のデータベース)
悠書館   2013年10月   ISBN:978-4-903487-79-3
育種学研究 Vol. 15 No. 3 2012年第54回シンポジウム(シンポジウム・ワークショッ プ)報告
神沼 英里, 七夕 高也, 矢野 健太郎, 清水 顕史, 岩田 洋佳 (担当:共著, 範囲:育種のための情報解析ツール使い倒し塾)
日本育種学会   2013年10月   

講演・口頭発表等

 
神沼英里,藤澤 貴智,林 史,西澤 達也,中村 保一,小笠原 理
環境微生物系学会合同大会2017   2017年8月29日   
Eli Kaminuma, Takatomo Fujisawa, Fumi Hayashi, Tatsuya Nishizawa, Yasukazu Nakamura, Osamu Ogasawara
NIG International Symposium 2017   2017年5月29日   
配列注釈オープンデータに基づくDNA Smart Taggerの開発
神沼英里, 藤澤 貴智, 林史, 西澤 達也, 中村 保一, 小笠原 理
NGS現場の会第5回大会   2017年5月22日   
神沼英里, 林史
国立遺伝学研究所 一般公開   2017年4月8日   
Mai Minamikawa, Keisuke Nonaka, Eli Kaminuma, Hiromi Kajiya-Kanegae, Akio Onogi, Shingo Goto, Terutaka Yoshioka2, Atsushi Imai6, Takeshi Hayashi, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Yasukazu Nakamura, Tokurou Shimizu, Hiroyoshi Iwata
Plant & Animal Genome Conferenece XXIV W147   2017年1月14日   

Works

 
神沼英里, 鹿島久嗣, 高木利久   その他   2016年7月 - 2016年8月
Eli Kaminuma (Hisashi Kashima, Asao Fujiyama, Yasukazu Nakamura, Takatomo Fujisawa, Yukino Baba, Yoshiki Mochizuki)   Webサービス   2016年6月
Eli Kaminuma   教材   2015年11月
Haruo Suzuki (Yukuto Sato, Riu Yamashita, Makoto Kuroda,Eli Kaminuma)   Webサービス   2015年1月
神沼英里 (主要貢献者:望月孝子,谷沢靖洋)   データベース   2013年3月
神沼英里(主要貢献者:藤澤貴智,谷沢靖洋,坂本直子)   データベース   2012年8月
神沼英里(主要貢献者:長崎英樹,望月孝子,谷沢靖洋,坂本直子)   Webサービス   2009年8月
神沼英里   コンピュータソフト   2007年7月
(MATLAB GUI-based)

競争的資金等の研究課題

 
農林水産省委託プロジェクト研究「多数の遺伝子が関与する形質を改良する新しい育種技術の開発」
研究期間: 2016年4月 - 2018年3月    代表者: 野中圭介(清水徳朗、神沼英里)
JST: CREST H26年度 特定課題調査費
研究期間: 2014年10月 - 2015年3月    代表者: 鹿島久嗣(松原繁夫、森嶋厚行、小山聡、櫻井祐子、大向 一輝、馬場雪乃、神沼英里)
JST: CREST H25年度 特定課題調査費
研究期間: 2013年11月 - 2014年3月    代表者: 鹿島久嗣(松原繁夫、森嶋厚行、小山聡、櫻井祐子、神沼英里、馬場雪乃、王晶晶、張承成)
農林水産省委託プロジェクト研究「多数の遺伝子が関与する形質を改良する新しい育種技術の開発」: 
研究期間: 2013年7月 - 2016年3月    代表者: 清水徳朗 (神沼英里)
日本学術振興会: 科研費基盤研究(C)
研究期間: 2012年4月 - 2015年3月    代表者: 神沼英里

学歴

 
1995年9月
 - 
1999年3月
奈良先端科学技術大学院大学  情報科学研究科 博士課程(博士(工学))
 
1993年4月
 - 
1995年3月
奈良女子大学  理学研究科 修士課程
 
1989年4月
 - 
1993年3月
奈良教育大学  教育学部 高校理科教員養成課程
 

特許

 
特願2017-032011 : 情報処理装置、情報処理方法及び情報処理プログラム
神沼英里
豊田哲郎, 神沼英里, 松井南

社会貢献活動

 
【講師】  国立遺伝学研究所 一般公開  2017年4月8日
クラウドサイエンス体験学習
【助言・指導】  職場体験学習(御殿場南高校1年生6名)  2016年8月4日
クラウドサイエンス体験学習
【助言・指導】  職場体験学習(三島市山田中学校5名)  2015年11月13日
静岡新聞夕刊こち女 リケジョ特集「2児の母"生命の謎"探究」
【インタビュイー】  静岡新聞  2015年10月2日
クラウドサイエンス体験学習
【助言・指導】  職業体験学習(静岡雙葉中学校2名、静岡県立韮山高等学校2名)  2015年8月20日