中尾光輝 (Mitsuteru Nakao) - マイポータル

基本情報

所属: エーザイ株式会社エンタープライズIT部

学位: 理学博士(2005年京都大学)

J-GLOBAL ID: 201101073277737381
researchmap会員ID: B000000911

外部リンク: http://www.linkedin.com/in/nakaomitsuteru

研究キーワード

研究分野

情報通信 / 生命、健康、医療情報学 /

論文

Implementation of linked data in the life sciences at BioHackathon 2011

Kiyoko F Aoki-Kinoshita, Akira R Kinjo, Mizuki Morita, Yoshinobu Igarashi, Yi-an Chen, Yasumasa Shigemoto, Takatomo Fujisawa, Yukie Akune, Takeo Katoda, Anna Kokubu …

Journal of Biomedical Semantics 6 3 2015年1月査読有り
BioHackathon series in 2011 and 2012: penetration of ontology and linked data in life science domains.

Katayama T, Wilkinson MD, Aoki-Kinoshita KF, Kawashima S, Yamamoto Y, Yamaguchi A, Okamoto S, Kawano S, Kim JD, Wang Y …

Journal of biomedical semantics 5 5 2014年査読有り
CyanoBase and RhizoBase: databases of manually curated annotations for cyanobacterial and rhizobial genomes.

Takatomo Fujisawa, Shinobu Okamoto, Toshiaki Katayama, Mitsuteru Nakao, Hidehisa Yoshimura, Hiromi Kajiya-Kanegae, Sumiko Yamamoto, Chiyoko Yano, Yuka Yanaka, Hiroko Maita …

Nucleic acids research 42(Database issue) D666-70 2014年1月査読有り
The 3rd DBCLS BioHackathon: improving life science data integration with Semantic Web technologies

Toshiaki Katayama, Mark D. Wilkinson, Gos Micklem, Shuichi Kawashima, Atsuko Yamaguchi, Mitsuteru Nakao, Yasunori Yamamoto, Shinobu Okamoto, Kenta Oouchida, Hong-Woo Chun …

JOURNAL OF BIOMEDICAL SEMANTICS 4 6 2013年2月査読有り
Complete genome sequence of Bradyrhizobium sp. S23321: insights into symbiosis evolution in soil oligotrophs.

Takashi Okubo, Takahiro Tsukui, Hiroko Maita, Shinobu Okamoto, Kenshiro Oshima, Takatomo Fujisawa, Akihiro Saito, Hiroyuki Futamata, Reiko Hattori, Yumi Shimomura …

Microbes and environments 27(3) 306-15 2012年査読有り
The 2nd DBCLS BioHackathon: interoperable bioinformatics Web services for integrated applications.

Toshiaki Katayama, Mark D Wilkinson, Rutger Vos, Takeshi Kawashima, Shuichi Kawashima, Mitsuteru Nakao, Yasunori Yamamoto, Hong-Woo Chun, Atsuko Yamaguchi, Shin Kawano …

Journal of biomedical semantics 2 4-4 2011年8月2日査読有り
The DBCLS BioHackathon: standardization and interoperability for bioinformatics web services and workflows

T Katayama, K Arakawa, M Nakao, K Ono, KF Aoki-Kinoshita

Journal of biomedical semantics 1 (1), 8 1(1) 1-19 2010年12月査読有り
BioRuby: bioinformatics software for the Ruby programming language

Naohisa Goto, Pjotr Prins, Mitsuteru Nakao, Raoul Bonnal, Jan Aerts, Toshiaki Katayama

BIOINFORMATICS 26(20) 2617-2619 2010年10月査読有り
The DBCLS BioHackathon: standardization and interoperability for bioinformatics web services and workflows. The DBCLS BioHackathon Consortium*.

Toshiaki Katayama, Kazuharu Arakawa, Mitsuteru Nakao, Keiichiro Ono, Kiyoko F Aoki-Kinoshita, Yasunori Yamamoto, Atsuko Yamaguchi, Shuichi Kawashima, Hong-Woo Chun, Jan Aerts …

Journal of biomedical semantics 1(1) 8-8 2010年8月21日査読有り
TogoWS: integrated SOAP and REST APIs for interoperable bioinformatics Web services

Toshiaki Katayama, Mitsuteru Nakao, Toshihisa Takagi

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 38 W706-W711 2010年7月査読有り
CyanoBase: the cyanobacteria genome database update 2010.

Mitsuteru Nakao, Shinobu Okamoto, Mitsuyo Kohara, Tsunakazu Fujishiro, Takatomo Fujisawa, Shusei Sato, Satoshi Tabata, Takakazu Kaneko, Yasukazu Nakamura

Nucleic acids research 38(Database issue) D379-81-81 2010年1月査読有り
Natural Language Query Processing for Life Science Knowledge Position Paper

Jin-Dong Kim, Yasunori Yamamoto, Atsuko Yamaguchi, Mitsuteru Nakao, Kenta Oouchida, Hong-Woo Chun, Toshihisa Takagi

ACTIVE MEDIA TECHNOLOGY 6335 158-+ 2010年査読有り
Low conservation and species-specific evolution of alternative splicing in humans and mice: comparative genomics analysis using well-annotated full-length cDNAs

Jun-ichi Takeda, Yutaka Suzuki, Ryuichi Sakate, Yoshiharu Sato, Masahide Seki, Takuma Irie, Nono Takeuchi, Takuya Ueda, Mitsuteru Nakao, Sumio Sugano …

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 36(20) 6386-6395 2008年11月査読有り
Genome structure of the legume, Lotus japonicus.

Shusei Sato, Yasukazu Nakamura, Takakazu Kaneko, Erika Asamizu, Tomohiko Kato, Mitsuteru Nakao, Shigemi Sasamoto, Akiko Watanabe, Akiko Ono, Kumiko Kawashima …

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 15(4) 227-39 2008年8月査読有り
Genome Structure of the Legume.

Sato, S, Nakamura, Y, Kaneko, T, Asamizu, E, Kato, T, Nakao, M, Sasamoto, S, Watanabe, A, Ono, A, Kawashima, K …

DNA Res. 2008年5月査読有り
The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts

Chisato Yamasaki, Katsuhiko Murakami, Yasuyuki Fujii, Yoshiharu Sato, Erimi Harada, Jun-Ichi Takeda, Takayuki Taniya, Ryuichi Sakate, Shingo Kikugawa, Makoto Shimada …

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 36 D793-D799 2008年1月査読有り
H-DBAS: Alternative splicing database of completely sequenced and manually annotated full-length cDNAs based on H-Invitational

Jun-ichi Takeda, Yutaka Suzuki, Mitsuteru Nakao, Tsuyoshi Kuroda, Sumio Sugano, Takashi Gojobori, Tadashi Imanishi

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 35 D104-D109 2007年1月査読有り
Large-scale identification and characterization of alternative splicing variants of human gene transcripts using 56 419 completely sequenced and manually annotated full-length cDNAs

Jun-ichi Takeda, Yutaka Suzuki, Mitsuteru Nakao, Roberto A. Barrero, Kanako O. Koyanagi, Lihua Jin, Chie Motono, Hiroko Hata, Takao Isogai, Keiichi Nagai …

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 34(14) 3917-3928 2006年査読有り
Large-scale analysis of human alternative protein isoforms: pattern classification and correlation with subcellular localization signals

M Nakao, RA Barrero, Y Mukai, C Motono, M Suwa, K Nakai

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 33(8) 2355-2363 2005年査読有り
DBTBS: database of transcriptional regulation in Bacillus subtilis and its contribution to comparative genomics

Y Makita, M Nakao, N Ogasawara, K Nakai

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 32 D75-D77 2004年1月査読有り

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MISC

最新解析手法とウェブツール・ソフトウェア 1.解析プラットフォーム紹介

中尾光輝, 藤澤貴智

実験医学 29(15) 2516-2521 2011年9月10日
微生物ゲノム基盤情報の高度化と統合のためのシステム

岡本忍, 中尾光輝, 藤澤貴智, 中村保一

日本ゲノム微生物学会年会要旨集 4th 47 2010年3月4日
KazusaMart:RhizoBaseのデータ統合と管理

藤澤貴智, 岡本忍, 中尾光輝, 金子貴一, 佐藤修正, 中村保一

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集 19th (JA)85,(EN)85-86 2010年3月
RhizoBaseの新機能

岡本忍, 中尾光輝, 藤澤貴智, 佐藤修正, 中村保一, 金子貴一

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集 19th (JA)30,(EN)31 2010年3月
かずさアノテーションスイート:多様なゲノムアノテーションのための協働作業手法とツールの開発

岡本忍, 中尾光輝, 藤澤貴智, 佐藤修正, 金子貴一, 吉村英尚, 中平有香, 阿久津智子, 鐘ケ江弘美, 笠井真 …

生化学 ROMBUNNO.4P-1171 2010年
文献情報に基づくゲノムリアノテーション

藤澤貴智, 岡本忍, 中尾光輝, 金子貴一, 田畑哲之, 中村保一

生化学 ROMBUNNO.4P-1172 2010年
DBCLS Galaxy:生物データ解析,共有,公開のためのウェブフレームワーク

山口敦子, 中尾光輝, KIM Jin‐Dong, 山本泰智, 高木利久

生化学 ROMBUNNO.4P-1173 2010年
生命情報学が直面する大規模ゲノムデータ時代の課題 1 分散データの統合とセマンティックWeb

中尾光輝, 片山俊明

情報処理 50(9) 836-844 2009年9月15日
1 分散データの統合とセマンティックWeb(<小特集>生命情報学が直面する大規模ゲノムデータ時代の課題)

中尾光輝, 片山俊明

情報処理 50(9) 836-844 2009年9月15日
かずさアノテーション:オープンアノテーションデータベースとその利用方法~根粒菌とミヤコグサでの実証実験~

岡本忍, 中尾光輝, 佐藤修正, 藤澤貴智, 中村保一

植物微生物研究会研究交流会講演要旨集 18th 32 2009年3月
かずさアノテーションを用いた分散型ゲノムアノテーションの実証実験

岡木忍, 岡本忍, 中尾光輝, 藤沢貴智, 佐藤修正, 金子貴一, 中村保一

日本分子生物学会年会講演要旨集 32nd(Vol.2) 19 2009年
KazusaMart:植物および関連微生物のゲノムデータ統合

藤澤貴智, 岡本忍, 中尾光輝, 中村保一

日本分子生物学会年会講演要旨集 32nd(Vol.2) 54 2009年
DBCLS Galaxy:生物データ処理の対話的ツール組み台わせインタフェイス

山口敦子, CHUN Hong‐Woo, 中尾光輝, 大内田賢太, 山本泰智, 高木利久

日本分子生物学会年会講演要旨集 32nd(Vol.2) 52 2009年
Kazusa Annotation:ゲノム情報へのアノテーションを支援するシステム

岡本忍, 中尾光輝, 中村保一

日本植物生理学会年会要旨集 49th 77 2008年3月15日
KazusaAnnotation Suite:植物関連生物ゲノム情報統合の試み

岡本忍, 中尾光輝, 藤澤貴智, 中村保一

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 10th 2008年
かずさアノテーション:持続可能な遺伝子アノテーション整備のための新型システム

中尾光輝, 岡本忍, 藤澤貴智, 中村保一

生化学 4P-1003 2008年
Gene Indexing: KazusaAnnotationによる遺伝子注釈実証実験

岡本忍, 中尾光輝, 藤澤貴智, 中村保一

生化学 4P-1001 2008年
KazusaWiki:ゲノムデータベースにおけるWikiの活用

藤澤貴智, 岡本忍, 中尾光輝, 中村保一

生化学 4P-1002 2008年
小回りが利いて役に立つゲノム情報データベースの提案

中村保一, 岡本忍, 中尾光輝, 藤澤貴智

日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集 26th 45 2008年
BioRuby + ChemRuby:バイオインフォマティクスとケモインフォマティクスの統合ライブラリ

後藤直久, 田中伸也, 中尾光輝, 片山俊明

日本分子生物学会年会講演要旨集 28th 351 2005年11月25日

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書籍等出版物

RとBioconductorを用いたバイオインフォマティクス

Gentleman Robert, Carey Vincent J, Huber Wolfgang, Irizarry Rafael A, Dudoit Sandrine, 荒川和晴, 粕川雄也, 川路英哉, 河野信, 神田将和, 鈴木治夫, 田中伸也, 中尾光輝, 長嶋剛史, 二階堂愛, 宮本真理

丸善出版 2012年 (ISBN: 9784621062500)
WEB+DB PRESS Vol.59

竹内真, 猪狩丈治, 矢野りん, 中島拓, 伊藤敬彦, 角田直行, はまちや, 柄沢聡太郎, 田中正裕, 梶原大輔, 藤本真樹, 増井俊之, 加藤幹生, 藤澤瑞樹, 木村俊也, 永井幸輔, 中尾光輝, 平田雄一, 渡辺智暁, 藤吾郎, 原悠, 浜本階生, 八柳幹太郎, uupaa, 塙与志夫, ミック, 大沢和宏, 中島聡, WEB+DB PRESS編集部 (担当:共著)

技術評論社 2010年10月23日 (ISBN: 4774143898)
セマンティックWeb プログラミング

Toby Segaran, Colin Evans, Jamie Taylor, 大向一輝, 加藤文彦, 中尾光輝, 山本泰智, 玉川竜司

オライリージャパン 2010年6月26日 (ISBN: 4873114527)
RとBioconductorを用いたバイオインフォマティクス

R. ジェントルマン, V.J. カリー, W. フーバー, R.A. イリザリー, S. ドュドイト, 荒川和晴, 粕川雄也, 川路英哉, 河野信, 神田将和, 鈴木治夫, 田中伸也, 中尾光輝, 長嶋剛史, 二階堂愛, 宮本真理 (担当:共訳) (原著:R.ジェントルマン)

シュプリンガー・ジャパン株式会社 2007年7月9日 (ISBN: 4431734643)

所属学協会

日本バイオインフォマティクス学会

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