中田栄司 (Nakata Eiji) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学エネルギー理工学研究所准教授

学位: 博士(工学)(九州大学)

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-9564-6805
J-GLOBAL ID: 201101096710018727
Researcher ID: G-5523-2013
researchmap会員ID: B000001708

外部リンク: http://www.iae.kyoto-u.ac.jp/material/a-12_j.html

研究キーワード

研究分野

経歴

2017年5月 - 現在

京都大学, エネルギー理工学研究所, 准教授
2010年10月 - 2017年4月

京都大学, エネルギー理工学研究所, 講師
2007年4月 - 2010年10月

徳島大学, 大学院ソシオテクノサイエンス研究部, 助教
2006年12月 - 2007年9月

スイス工科大学ローザンヌ校(EPFL), 日本学術振興会海外特別研究員
2006年4月 - 2006年11月

京都大学, 工学研究科, 博士研究員
2005年9月 - 2006年3月

九州大学, 日本学術振興会特別研究員（PD）
2004年4月 - 2005年8月

九州大学, 日本学術振興会特別研究員（DC2）

受賞

2017年3月

平成28年度研究所長賞, エネルギー理工学研究所

中田栄司
2016年10月

化学・生物素材研究開発奨励賞, 一般財団法人バイオインダストリー協会

中田栄司
2016年9月

第10回バイオ関連化学シンポジウム講演賞

中田栄司
2016年5月

第5回新化学技術研究奨励賞, 新化学技術推進協会

中田栄司
2013年11月

第7回ナノメディシン国際シンポジウムポスター賞, Best Poster Award, 日本ナノメディシン交流協会

中田栄司
2013年3月

研究奨励賞, 京都大学エネルギー理工学研究所

中田栄司
2010年

第10回エンジニアリングフェスティバル優秀賞

中田栄司
2003年

10. 生体機能関連部会若手の会最優秀ポスター賞

中田栄司
2003年

International Symposium on Biomolecular Chemistry (ISBC) 2003 Poster Award

中田栄司

論文

107

An Artificial Liposome Compartment with Size Exclusion Molecular Transport

Shiwei Zhang, Eiji Nakata, Peng Lin, Takashi Morii

Chemistry – A European Journal 2023年10月17日
Near Quantitative Ligation Results in Resistance of DNA Origami Against Nuclease and Cell Lysate

Kirankumar Krishnamurthy, Arivazhagan Rajendran, Eiji Nakata, Takashi Morii

Small Methods 2023年9月21日
A Ratiometric Fluorescent Probe for pH Measurement over a Wide Range Composed of Three Types of Fluorophores Assembled on a DNA Scaffold

Eiji Nakata, Khongorzul Gerelbaatar, Mashal Asif, Hiroaki Konishi, Yuya Shibano, Peng Lin, Takashi Morii

Chemistry 2023年8月17日
Macropinoscope: Real-Time Simultaneous Tracking of pH and Cathepsin B Activity in Individual Macropinosomes.

Hisaaki Hirose, Eiji Nakata, Zhengxiao Zhang, Yuya Shibano, Masashi Maekawa, Takashi Morii, Shiroh Futaki

Analytical chemistry 95(30) 11410-11419 2023年8月1日
Dynamic Assembly of Cascade Enzymes by the Shape Transformation of a DNA Scaffold

Peng Lin, Huyen Dinh, Yuki Morita, Eiji Nakata, Takashi Morii

Advanced Functional Materials 2215023-2215023 2023年1月17日
Controlled Assembly of Fluorophores inside a Nanoliposome

Hiroaki Konishi, Eiji Nakata, Futa Komatsubara, Takashi Morii

Molecules 28(2) 2023年1月
Enzyme Cascade Reactions on DNA Origami Scaffold

Eiji Nakata, Huyen Dinh, Peng Lin, Takashi Morii

Methods in Molecular Biology 2639 275-299 2023年
Circularly polarised luminescence from excimer emission of anthracene derivatives complexed with γ-cyclodextrin in the solid state

Yuna Kamimoto, Ryoya Ikemura, Yoshitane Imai, Norimitsu Tohnai, Shoko Yamazaki, Eiji Nakata, Hiroshi Takashima

RSC Advances 13 1914-1922 2023年1月査読有り
Octahedrons of 1,10-phenanthroline and 4'-chloro-2,2':6',2 ''-terpyridine induced by protonation of nitrogen atoms: Synthesis and analysis

Naokazu Yoshikawa, Shoko Yamazaki, Shiori Eguchi, Ayaka Nishiyama, Yuki Yamashita, Norimitsu Tohnai, Eiji Nakata, Hiroshi Takashima

JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE 1271 2023年1月
Stimuli-Responsible SNARF Derivatives as a Latent Ratiometric Fluorescent Probe.

Eiji Nakata, Khongorzul Gerelbaatar, Futa Komatsubara, Takashi Morii

Molecules (Basel, Switzerland) 27(21) 2022年10月24日
FRET-Based Cathepsin Probes for Simultaneous Detection of Cathepsin B and D Activities

Zhengxiao Zhang, Eiji Nakata, Yuya Shibano, Takashi Morii

CHEMBIOCHEM 23(19) 2022年10月
Mechanistic Aspects for The Modulation of Enzyme Reactions on the DNA Scaffold

Peng Lin, Hui Yang, Eiji Nakata, Takashi Morii

Molecules 27(19) 2022年9月
Ultrasound-dependent RNAi using TatU1A-rose bengal conjugate.

Nanako Sumi, Shota Nagahiro, Eiji Nakata, Kazunori Watanabe, Takashi Ohtsuki

Bioorganic & medicinal chemistry letters 68 128767-128767 2022年7月15日
A two-step screening to optimize the signal response of an auto-fluorescent protein-based biosensor.

Shunsuke Tajima, Eiji Nakata, Reiko Sakaguchi, Masayuki Saimura, Yasuo Mori, Takashi Morii

RSC advances 12(24) 15407-15419 2022年5月17日
Topologically-Interlocked Minicircles as Probes of DNA Topology and DNA-Protein Interactions.

Arivazhagan Rajendran, Kirankumar Krishnamurthy, Seojeong Park, Eiji Nakata, Youngjoo Kwon, Takashi Morii

Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) 28(22) e202200108 2022年4月19日
Topologically-Interlocked Minicircles as Probes of DNA Topology and DNA-Protein Interactions.

Arivazhagan Rajendran, Kirankumar Krishnamurthy, Seojeong Park, Eiji Nakata, Youngjoo Kwon, Takashi Morii

Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) 28(22) e202200839 2022年4月19日
The Methods to Assemble Functional Proteins on DNA Scaffold and their Applications

Eiji Nakata, Shiwei Zhang, Huyen Dinh, Peng Lin, Takashi Morii

DNA Origami 261-280 2022年4月18日
Tuning the Reactivity of a Substrate for SNAP-Tag Expands Its Application for Recognition-Driven DNA-Protein Conjugation.

Zhengxiao Zhang, Eiji Nakata, Huyen Dinh, Masayuki Saimura, Arivazhagan Rajendran, Kazunari Matsuda, Takashi Morii

Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) 27(72) 18118-18128 2021年12月23日
Augmentation of an Engineered Bacterial Strain Potentially Improves the Cleanup of PCB Water Pollution.

Tomijiro Hara, Yumiko Takatsuka, Eiji Nakata, Takashi Morii

Microbiology spectrum 9(3) e0192621 2021年12月22日
Structures, Atomic Charges, Emission Properties and DFT studies of Biquinoline Derivatives Induced by Protonation of a Nitrogen Atom

Naokazu Yoshikawa, Shoko Yamazaki, Ayaka Nishiyama, Yuki Yamashita, Nobuko Kanehisa, Norimitsu Tohnai, Eiji Nakata, Hiroshi Takashima

Journal of Molecular Structure 131990-131990 2021年11月

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MISC

135

木質バイオマスの選択的分解反応のためのリグニン認識ペプチドの開発

中谷祐也, 中谷祐也, 高谷光, 高谷光, 林一広, 中田栄司, 森井孝, 中村正治, 中村正治

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 100th 2020年
DNAオリガミを鋳型にしたリポソームの形成

小西宏明, DINH Huyen, 脇阪智彦, 中田栄司, 仲野瞬, 森井孝

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 99th ROMBUNNO.4G4‐08 2019年3月1日
酵素を“1分子ずつ“狙った場所に配置したDNAナノリアクターの創製

中田栄司, 森井孝

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 73(1) ROMBUNNO.24pK605‐4-3048 2018年3月23日
効率的な多段階酵素反応を実現する分子コンビナート

中田栄司, 森井孝

バイオサイエンスとインダストリー 76(1) 46‐48-48 2018年1月10日
小型中性子源を用いたBNCT薬物動態評価のための新規分析法

Bakr Mahmoud, 増田開, 高橋佳之, 中田栄司, 宇都義浩, 中村教泰, Taleyarkhan Rusi P

RUDGS : 研究成果報告書 61-64 2018年
ナノレベル間隔で異なる酵素を並べる!―複雑な多段階反応を可能にする分子コンビナートへの挑戦

中田栄司, 森井孝

化学 72(11) 23‐28-28 2017年11月1日
音増感剤を用いた超音波依存的なペプチドの細胞質内導入法

大槻高史, 稲葉優樹, 北松瑞生, 中田栄司, 原田敦史, 渡邉和則

日本DDS学会学術集会プログラム予稿集 33回 172-172 2017年6月
DNAオリガミを利用したナノリポソーム

小西宏明, 中田栄司, 仲野瞬, 森井孝

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 97th ROMBUNNO.4C4‐45 2017年3月3日
蛍光タンパク質を基本骨格とした一酸化窒素センサーの構築

田嶋竣介, 中田栄司, 才村正幸, 森井孝

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 97th ROMBUNNO.3C3‐35 2017年3月3日
組み換えラッカーゼによるPCB分解の検討

泉咲綾, 青澤理恵, 家藤治幸, 原富次郎, 高塚由美子, 中田栄司, 森井孝, 渡辺誠也

日本農芸化学会2017年度大会, 京都市, 2017.3.17-20 2017年
変異型ビフェニルジオキシゲナーゼを用いたPCB分解特性改変の検討

青澤理恵, 泉咲綾, 高塚由美子, 原富次郎, 中田栄司, 森井孝, 渡辺誠也

日本農芸化学会2017年度大会, 京都市, 2017.3.17-20 2017年
Enzymatic cascade reactions on the DNA scaffold

中田栄司, H. Dinh, T. Nguyen, 才村正幸, 森井孝

日本化学会第97 春季年会, 東京都, 2017.3.16-20 2017年
Orthogonal modular adaptors for assembling multiple enzymes on DNA scaffold

T. NGUYEN, 中田栄司, 才村正幸, 森井孝

日本化学会第97 春季年会, 東京都, 2017.3.16-20 2017年
Activity of spatially organized enzyme on DNA scaffold

H. Dinh, 中田栄司, 森井孝

日本化学会第97 春季年会, 東京都, 2017.3.16-20 2017年
Topologically interlocked DNA nanostructures inside a DNA origami

A. Rajendran, S. Park, 中田栄司, Y. Kwon, 森井孝

日本化学会第97 春季年会, 東京都, 2017.3.16-20 2017年
『診る』バイオマテリアル自己集合を利用した蛍光プローブのユニークな活用法―洗浄操作を必要としない細胞内レシオイメージングへの応用―

中田栄司

バイオマテリアル 34(3) 198‐203-203 2016年7月20日
自己集合を利用した蛍光プローブのユニークな活用法 : 洗浄操作を必要としない細胞内レシオイメージングへの応用 (特集『診る』バイオマテリアル)

中田栄司

バイオマテリアル = Journal of Japanese Society for Biomaterials : 生体材料 34(3) 198-203 2016年7月
Evaluation of orthogonal modular adaptors for assembling proteins on DNA scaff old

T.M. Nguyen, 中田栄司, 才村正幸, 森井孝

Asian 3 Roundtable on Nucleic Acids and Chemical Probe Research Hub, Fukuoka 2016, ,福岡市, 2016.9.22-24 2016年
Assembling enzymes on a DNA scaffold

中田栄司, 森井孝

Asian 3 Roundtable on Nucleic Acids and Chemical Probe Research Hub, Fukuoka 2016, 福岡市, 2016.9.22-24 2016年
蛍光タンパク質を基本骨格とした一酸化窒素センサー

田嶋竣介, 中田栄司, 才村正幸, 森井孝

第10回バイオ関連化学シンポジウム, 金沢市, 2016.9.7-9 2016年

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書籍等出版物

酵素を“1分子ずつ”狙った場所に配置する -多段階反応を効率的に進行させる分子コンビナートをつくる

中田栄司, 森井孝

Academist Journal 2018年
若手研究者からのメッセージ

中田栄司

バイオテクノロジー部会 NEWS LETTER 2017 2017年1月
DNAナノ構造体に酵素を配置した分子スイッチボード

中田栄司

生体機能関連化学部会 NEWS LETTER 2016 2016年12月
自己集合を利用した蛍光プローブのユニークな活用法－洗浄操作を必要としない細胞内レシオイメージングへの応用－

中田栄司

バイオマテリアル 2016年
SNARF誘導体の自己集合化戦略に基づいた外部刺激応答性のレシオ型蛍光pHプローブの開発

中田栄司

ナノ学会会報 2014年
細胞内レシオ型蛍光pHプローブ開発のための自己集合化ナノプローブの合理的設計戦略

中田栄司

和光純薬時報 2014年
タンパク質ベースの蛍光バイオセンサー

中田栄司, 森井孝

ここまで進んだバイオセンシング・イメージング（分担執筆），日本化学会編著, 東京 2012年11月
がんの特異的な検出を目指した蛍光イメージング法の最近の展開

中田栄司, 森井孝, 宇都義浩, 堀均

放射線生物研究 46(２)，2011, 145 ～ 157 2011年
レクチンチップ

浜地格, 中田栄司

バイオチップ実用化ハンドブック（分担執筆）, pp. 187-195, 株式会社エヌ・ティー・エス, 東京. 2010年
次世代動物実験系としての腫瘍移植鶏卵の構築と放射線照射による腫瘍成長阻害活性

安部千秋, 宇都義浩, 遠藤良夫, 新元優也, 中島宏一郎, 佐野圭一郎, 佐々木有紀, 皆巳和賢, 前澤博, 増永慎一郎, 中田栄司, 堀均

放射線生物研究, Vol.44, No.2, 233〜241頁, 2009年6月 2009年6月
ハイポキシアを標的とした抗癌剤

宇都義浩, 中田栄司, 永澤秀子, 堀均

実験医学増刊癌と微小環境（分担執筆），株式会社羊土社, 東京, 2009年2月 2009年2月
酸化ストレスを標的とした薬剤・治療法

堀均, 中田栄司, 宇都義浩, 永澤秀子

酸化ストレスの医学（分担執筆），株式会社診断と治療社, 東京, 2008年6月 2008年6月
蛍光異方性測定

中田栄司, 浜地格

生命化学研究レター, Vol.27, 24〜29頁, 2008年6月 2008年6月
解糖系代謝のエネルギー源となる単糖に対するがん細胞特異性:糖ハイブリッド低酸素細胞放射線増感剤/制癌剤の分子設計-Pharmacokinetic drug designのすすめ-,

宇都義浩, 中江崇, 永澤秀子, 中田栄司, 堀均

放射線生物研究, Vol.43, No.1, 68〜79頁, 2008年3月. 2008年3月
有機化学が拓く蛋白質の機能化―レクチンタンパク質から新規バイオセンサーを創る―

古志洋一郎, 中田栄司, 浜地格

現代化学, Vol. 407, pp. 55-60, 2005. 2005年
テーラーメイドな機能を有する半合成蛋白質の創成を目指して－P-PALMによる蛋白質エンジニアリング－

中田栄司

生命化学研究会レター, No. 14, pp. 11-13, 2004. 2004年
ナノマテリアルとしてのタンパク質

中田栄司, 浜地格

工業材料, Vol. 51, No. 6, pp. 61-64, 2003. 2003年

講演・口頭発表等

231

タンパク質を1分子ずつ制御して並べる技術

中田栄司, 森井孝

生体分子材料研究会セミナー 2023年3月7日招待有り
DNAナノ構造体に酵素を一分子ずつ配置する

中田栄司, 森井孝

発動分子科学サロン 2023年1月24日招待有り
DNA Binding Adaptors to Locate Multiple Enzymes on DNA scaffold

E. Nakata, T. Morii

The 7th Annual Meeting of LIA/IRP-CNPA 2022年11月4日招待有り
Expanding the detectable pH range of DNA nanostructure-based fluorescent pH sensors

K. Gerelbaatar, E. Nakata, H. Hirose, S. Futaki, T. Morii

日本化学会第102春季年会 2022年3月24日
Stabilization of DNA origami nanostructures by chemical ligation

日本化学会第102春季年会 2022年
Cosolvent improves the enzymatic ligation of DNA origami

A. Rajendran, K. Krishnamurthy, E. Nakata, T. Morii

日本化学会第102春季年会
蛍光タンパク質を用いた一酸化窒素バイオセンサーにおける蛍光応答増幅

田嶋竣介, 中田栄司, 坂口怜子, 才村正幸, 森泰生, 森井孝

日本化学会第102春季年会
Effect of the ordered hydration layer for the enzymatic reactions on DNA scaffold

P. Lin, H. Dinh, E. Nakata, T. Morii

日本化学会第102春季年会
Orthogonal FRET reporters on dextran for the real-time sensing of lysosomal proteases

Z. Zhang, E. Nakata, H. Hirose, S. Futaki, T. Morii

日本化学会第102春季年会
3次元DNAナノ構造体を用いたCO2固定化酵素の集積化

小西宏明, H. Dinh, 中田栄司, 森井孝, 跡見晴幸

日本化学会第102春季年会
DNA origami as a scaffold to assemble membrane proteins on an artificial compartment

S. Zhang, E. Nakata, T. Morii

日本化学会第102春季年会
補酵素受容体の近傍配置による酵素逐次反応の制御

馬場大芽, 田嶋竣介, P. Lin, 小西宏明, 中田栄司, 森井孝

日本化学会第102春季年会
DNA-タンパク質の集合体に内包された酵素の活性評価

Zhang Yaqi, 中田栄司, 森井孝

日本化学会第102春季年会
Direct observation of the r(CUG) repeats in DM1 and MBNL1 aggregation complexes

W. Hou, S. Nakano, S. Tajima, M. Shimizu, M. Saimura, E. Nakata, T. Morii

日本化学会第102春季年会
Ligation of DNA Origami Nanostructures by Enzymatic and Chemical Approach

K. Krishnamurthy, A. Rajendran, E. Nakata, T. Morii

The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2021
Development of DNA nanostructure-based ratiometric fluorescent pH sensor

K. Gerelbaatar, E. Nakata, Z. Zhang, T. Morii

The Internationl Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2021
Enzyme cascade reactions on a DNA scaffold with shape transformation

P. Lin, H. Dinh, E. Nakata, T. Morii

The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
Synthesis enhancing the stability of 2D DNA origami by enzymatic ligation

K. Krishnamurthy, A. Rajendaran, E. Nakata, T. Morii

The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
Design of DNA sequence-specific modular adaptors by tuning the reactivity of protein-tag substrate

Z. Zhang, E. Nakata, H. Dinh, M. Saimura, K. Matsuda, T. Morii

The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
DNA nanostructure-based fluorescent pH sensor for cellular pH change

K. Gerelbaatar, E. Nakata, H. Hirose, S. Futaki, T. Morii

The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry

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共同研究・競争的資金等の研究課題

DNA-タンパク質間相互作用を介したタンパク質ポリマーのプログラム合成

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2022年6月 - 2024年3月

中田栄司
DNAを構造ビルディングブロックとした酵素の集積状態の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 学術変革領域研究(A) 2022年6月 - 2024年3月

中田栄司
DNAナノ構造体の階層的自己組織化による高効率な酵素連続反応場の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2024年3月

中田栄司
酵素間距離を制御する分子コンビナートを用いた非天然化合物合成システムの創製

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年4月 - 2021年3月

中田栄司
組成比を制御したヘテロ多量体調製技術による人工フィコビリソームの創製

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2018年6月 - 2020年3月

中田栄司
分子コンビナートよる非天然化合物合成システムの創製

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年4月 - 2019年3月

中田栄司
DNAナノリアクターで構築する高効率な人工光合成システム

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 若手研究(A) 2015年4月 - 2018年3月

中田栄司
基質認識に伴う構造変化を必要としない革新的なバイオセンサーの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2016年3月

中田栄司
自己集合型ナノキャリアの創製

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年4月 - 2016年3月

中田栄司
Sonochemical internalization法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2015年3月

大槻高史, 原田敦史, 中田栄司, 中田栄司
自己集合型ナノプローブによる細胞内酵素反応のリアルタイム解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2012年4月 - 2014年3月

中田栄司
核酸ナノ構造体で構築したタンパク質ネットワークを利用した新規ナノリアクターの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2012年4月 - 2014年3月

中田栄司
癌特有の微小環境に応答する蛍光性小分子プローブの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2009年 - 2011年

中田栄司
ダイナミック・コンビ化学を用いたテーラーメイド型糖質バイオセンサーの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2004年 - 2005年

中田栄司

学歴

- 2005年8月

九州大学大学院工学府, 博士後期課程物質創造工学専攻

産業財産権

特開2014-185083 セミナフトローダフルオル誘導体および蛍光プローブ

中田栄司, 森井孝
特許第5578517号ナノ集合体

中田栄司, 掘均, 宇都義浩, 行待芳浩
特開2013-099277 RNA高精度検出用蛍光プローブ

森井孝, 中田栄司, 松本桂彦
特開2011-256112 ナノ集合体

中田栄司, 堀均, 宇都義浩, 行待芳浩
特開2011-162486 蛍光プローブ

中田栄司, 掘均, 宇都義浩

社会貢献活動

三重県立上野高等学校見学会

その他

京都大学エネルギー理工学研究所 2022年11月18日 - 2022年11月18日
滋賀県立彦根東高等学校見学会

その他

京都大学エネルギー理工学研究所 2022年8月20日 - 2022年8月20日
宇治市教育委員会中学生理科教室

講師, 実演

宇治市教育委員会 2022年8月3日 - 2022年8月3日
東京都立国立高等学校見学会

その他

京都大学エネルギー理工学研究所 2022年8月2日 - 2022年8月2日

中田栄司

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

学歴

産業財産権

社会貢献活動

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