西原 秀典

J-GLOBALへ         更新日: 16/11/08 02:48
 
アバター
研究者氏名
西原 秀典
 
ニシハラ ヒデノリ
ハンドル
西原
URL
http://kaken.nii.ac.jp/ja/r/10450727
所属
東京工業大学
部署
生命理工学院
職名
助教
学位
博士(理学)(東京工業大学)

プロフィール

哺乳類特有の形態進化とゲノム多様性の研究をしています。

研究分野

 
 

経歴

 
2007年
   
 
東京工業大学 大学院生命理工学研究科 助教
 
2006年
   
 
大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター) システム研 研究員
 
 
 - 
2005年9月
東京工業大学 大学院生命理工学研究科 博士(理学)取得
 

受賞

 
2010年2月
手島精一記念研究賞 研究論文賞 Retroposon analysis and recent geological data suggest near-simultaneous divergence of the three superorders of mammals
 

論文

 
Takezaki N, Nishihara H
Genome biology and evolution      2016年3月   [査読有り]
Nishihara H, Plazzi F, Passamonti M, Okada N
Genome biology and evolution   8(3) 528-539   2016年2月   [査読有り]
Kuramoto T, Nishihara H, Watanabe M, Okada N
Genome biology and evolution   7(12) 3180-3189   2015年11月   [査読有り]
Brawand D, Wagner CE, Li YI, Malinsky M, Keller I, Fan S, Simakov O, Ng AY, Lim ZW, Bezault E, Turner-Maier J, Johnson J, Alcazar R, Noh HJ, Russell P, Aken B, Alfoldi J, Amemiya C, Azzouzi N, Baroiller JF, Barloy-Hubler F, Berlin A, Bloomquist R, Carleton KL, Conte MA, D'Cotta H, Eshel O, Gaffney L, Galibert F, Gante HF, Gnerre S, Greuter L, Guyon R, Haddad NS, Haerty W, Harris RM, Hofmann HA, Hourlier T, Hulata G, Jaffe DB, Lara M, Lee AP, MacCallum I, Mwaiko S, Nikaido M, Nishihara H, Ozouf-Costaz C, Penman DJ, Przybylski D, Rakotomanga M, Renn SC, Ribeiro FJ, Ron M, Salzburger W, Sanchez-Pulido L, Santos ME, Searle S, Sharpe T, Swofford R, Tan FJ, Williams L, Young S, Yin S, Okada N, Kocher TD, Miska EA, Lander ES, Venkatesh B, Fernald RD, Meyer A, Ponting CP, Streelman JT, Lindblad-Toh K, Seehausen O, Di Palma F
Nature   513(7518) 375-381   2014年9月   [査読有り]
Kawashima Y, Nishihara H, Akasaki T, Nikaido M, Tsuchiya K, Segawa S, Okada N
Molecular phylogenetics and evolution   69(3) 980-993   2013年12月   [査読有り]
Nikaido M, Noguchi H, Nishihara H, Toyoda A, Suzuki Y, Kajitani R, Suzuki H, Okuno M, Aibara M, Ngatunga BP, Mzighani SI, Kalombo HW, Masengi KW, Tuda J, Nogami S, Maeda R, Iwata M, Abe Y, Fujimura K, Okabe M, Amano T, Maeno A, Shiroishi T, Itoh T, Sugano S, Kohara Y, Fujiyama A, Okada N
Genome research   23(10) 1740-1748   2013年10月   [査読有り]
Higasa K, Nikaido M, Saito TL, Yoshimura J, Suzuki Y, Suzuki H, Nishihara H, Aibara M, Ngatunga BP, Kalombo HW, Sugano S, Morishita S, Okada N
Gene   505(2) 324-332   2012年9月   [査読有り]
Nakanishi A, Kobayashi N, Suzuki-Hirano A, Nishihara H, Sasaki T, Hirakawa M, Sumiyama K, Shimogori T, Okada N
PloS one   7(8) e43785   2012年   [査読有り]
Yuzawa Y, Nishihara H, Haraguchi T, Masuda S, Shimojima M, Shimoyama A, Yuasa H, Okada N, Ohta H
DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes   19 91-102   2012年   [査読有り]
Yoshida K, Terai Y, Mizoiri S, Aibara M, Nishihara H, Watanabe M, Kuroiwa A, Hirai H, Hirai Y, Matsuda Y, Okada N
PLoS genetics   7 e1002203   2011年8月   [査読有り]
Nagai H, Terai Y, Sugawara T, Imai H, Nishihara H, Hori M, Okada N
Molecular biology and evolution   28(6) 1769-1776   2011年6月   [査読有り]
Tashiro K, Teissier A, Kobayashi N, Nakanishi A, Sasaki T, Yan K, Tarabykin V, Vigier L, Sumiyama K, Hirakawa M, Nishihara H, Pierani A, Okada N
PloS one   6 e28497   2011年   [査読有り]
Okada N, Sasaki T, Shimogori T, Nishihara H
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   15 801-812   2010年8月   [査読有り]
Akasaki T, Nikaido M, Nishihara H, Tsuchiya K, Segawa S, Okada N
Gene   454(1-2) 8-19   2010年4月   [査読有り]
Hirakawa M, Nishihara H, Kanehisa M, Okada N
Gene   441(1-2) 100-110   2009年7月   [査読有り]
Nishihara H, Maruyama S, Okada N
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   106(13) 5235-5240   2009年3月   [査読有り]
Matsuura M, Nishihara H, Onimaru K, Kokubo N, Kuraku S, Kusakabe R, Okada N, Kuratani S, Tanaka M
Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists   237 1581-1589   2008年6月   [査読有り]
Sasaki T, Nishihara H, Hirakawa M, Fujimura K, Tanaka M, Kokubo N, Kimura-Yoshida C, Matsuo I, Sumiyama K, Saitou N, Shimogori T, Okada N
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   105(11) 4220-4225   2008年3月   [査読有り]
Munemasa M, Nikaido M, Nishihara H, Donnellan S, Austin CC, Okada N
Gene   407(1-2) 176-185   2008年1月   [査読有り]
Nishihara H, Okada N
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)   422 201-225   2008年   [査読有り]
Nishihara H, Kuno S, Nikaido M, Okada N
Gene   400(1-2) 98-103   2007年10月   [査読有り]
Ichiyanagi K, Nishihara H, Duvernell DD, Okada N
Molecular biology and evolution   24(9) 2009-2015   2007年9月   [査読有り]
Matveev V, Nishihara H, Okada N
Molecular biology and evolution   24(8) 1656-1666   2007年8月   [査読有り]
Nishihara H, Okada N, Hasegawa M
Genome biology   8 R199   2007年   [査読有り]
Nishihara H, Smit AF, Okada N
Genome research   16 864-874   2006年7月   [査読有り]
Nishihara H, Hasegawa M, Okada N
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   103(26) 9929-9934   2006年6月   [査読有り]
Nishihara H, Satta Y, Nikaido M, Thewissen JG, Stanhope MJ, Okada N
Molecular biology and evolution   22 1823-1833   2005年9月   [査読有り]
Nikaido M, Nishihara H, Hukumoto Y, Okada N
Molecular biology and evolution   20 522-527   2003年4月   [査読有り]
Characterization of novel Alu- and tRNA-related SINEs from the tree shrew and evolutionary implications of their origins.
Nishihara H, Terai Y, Okada N
Molecular biology and evolution   19 1964-1972   2002年11月   [査読有り]

競争的資金等の研究課題

 
文部科学省: 科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型))
研究期間: 2011年 - 2011年    代表者: 西原秀典
文部科学省: 科学研究費補助金(若手研究(B))
研究期間: 2010年 - 2011年    代表者: 西原秀典
文部科学省: 科学研究費補助金(基盤研究(S))
研究期間: 2009年 - 2011年    代表者: 岡田典弘
1)種分化研究光受容体が生息する光環境に適応していることを明らかにするために、ビクトリア湖内のほぼすべての環境に生息する様々な種を用いて、光受容体遺伝子の配列決定を行った。また、それらの配列からタンパク質を産生し、視物質の再構築をA1ばかりでなくA2レチナールを用いて行い、その吸収波長を測定した。視物質の吸収からシクリッドの種は光受容体を光環境に適応させていることが明らかになった。また婚姻色も適応した光受容体に感度良く受容される色に進化してきたことが示唆された。2)哺乳類特異的に保存された...
文部科学省: 科学研究費補助金(基盤研究(A))
研究期間: 2009年 - 2009年    代表者: 岡田典弘
1)種分化研究光受容体が生息する光環境に適応していることを明らかにするために、ビクトリア湖内のほぼすべての環境に生息する様々な種を用いて、光受容体遺伝子の配列決定を行った。また、それらの配列からタンパク質を産生し、視物質の再構築を行いその吸収波長を測定した。視物質の吸収からシクリッドの種は光受容体を光環境に適応させていることの一部が明らかになった。2)哺乳類特異的に保存されたSINE由来エンハンサーの網羅的探索哺乳類特異的に保存されたAmnSINE1配列の中で現在約100遺伝子座が未解析で...
文部科学省: 科学研究費補助金(若手研究(B))
研究期間: 2007年 - 2007年    代表者: 西原秀典