沖 真弥
オキ シンヤ (Shinya OKI)
更新日: 03/31
基本情報
- 所属
- 熊本大学 生命資源研究・支援センター 教授
- 学位
-
博士(医学)(2007年12月 大阪大学)
- 連絡先
- okishinyakumamoto-u.ac.jp
- 研究者番号
- 90452713
- ORCID ID
- https://orcid.org/0000-0002-4767-3259
- J-GLOBAL ID
- 201501040753326194
- researchmap会員ID
- B000244090
- 外部リンク
世界中で行われたChIP-seq実験などのエピゲノミクスデータを統合したデータベース、ChIP-Atlas を開発している。その十数万件ものオミクス実験データを統合的に分析することにより、細胞分化制御や遺伝性疾患のしくみの解明、および創薬ターゲットの探索などをおこなっている。
また最近では、光学と化学を融合させた新規オミクス技術、Photo-Isolation Chemistry (PIC) を開発している。これは、様々な細胞タイプが混在する組織において「関心領域」に特定波長の光を照射すると、そのエリアだけのオミクス情報を引き出せる技術である。局所的な細胞集団のプロファイリングが可能となるこの新技術と、上述のデータ解析手法を駆使した多元的アプローチにより、器官形成や先天異常の原理を解き明かしたい。
最新の研究内容の講演動画はこちら。
研究キーワード
8経歴
7-
2024年4月 - 現在
-
2023年10月 - 2024年3月
-
2020年4月 - 2024年3月
-
2019年10月 - 2023年3月
-
2019年2月 - 2020年3月
-
2007年2月 - 2019年2月
-
2005年4月 - 2007年2月
学歴
3-
2002年 - 2007年
-
2000年 - 2002年
-
1996年 - 2000年
委員歴
4-
2018年4月 - 現在
-
2022年4月 - 2024年3月
-
2020年4月 - 2021年3月
-
2020年4月 - 2020年9月
主要な論文
43-
Epigenetics & Chromatin 16(1) 34 2023年9月25日 査読有り最終著者責任著者
-
BMC Bioinformatics 23(1) 51-51 2022年12月 査読有り最終著者責任著者
-
Nucleic Acids Research 50(W1) W175-W182 2022年3月 査読有り最終著者責任著者
-
Nature Communications 12(1) 4416-4416 2021年12月 査読有り筆頭著者責任著者
-
EMBO Reports 19(12) e46255 2018年11月 査読有り筆頭著者責任著者
MISC
6-
JSBi Bioinformatics Review 4(1) 1-9 2023年6月 査読有り招待有り
-
日本薬学会年会要旨集(Web) 141st 2021年
-
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
-
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
-
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
-
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st 2018年
書籍等出版物
12-
生物工学会誌 2022年
-
月刊「細胞」 2022年
-
生物物理 2022年
-
Practical Guide to Life Science Databases 2021年
-
実験医学 2021年
-
実験医学別冊:クロマチン解析実践プロトコール 2020年
-
実験医学 2019年
-
THE LUNG perspectives 2019年
-
実験医学 2014年
-
福岡医学雑誌 2010年
-
細胞工学 2008年
講演・口頭発表等
123-
学術変革領域研究(A)適応回路センサス第3回領域会議 2023年6月22日 招待有り
-
第16回日本エピジェネティクス研究会年会 2023年6月19日 招待有り
-
ACT-X「生命と化学」主催:第 1 回 研究者交流会議 2023年5月10日 招待有り
-
IMGC 2023 RIKEN Symposium 2023年3月30日 招待有り
-
第100回日本生理学会大会 2023年3月16日 招待有り
-
東北大学分子代謝病態学Webセミナー 2023年1月17日 招待有り
-
第67回日本人類遺伝学会 2022年12月15日 招待有り
-
第45回日本分子生物学会 2022年12月2日 招待有り
-
ExCELLSセミナー 2022年11月15日 招待有り
-
NGS EXPO 2022 2022年10月19日 招待有り
-
東京慈恵会医科大学 医学研究の基礎を語り合う集い 2022年10月11日 招待有り
-
シングルセルゲノミクス研究会2022 2022年8月30日 招待有り
-
株式会社セツロテック コラボWebセミナー 2022年8月4日 招待有り
-
第25回小児心血管分子医学研究会 2022年7月21日 招待有り
-
徳島大学 医学研究科セミナー 2022年7月6日 招待有り
-
京都大学 先端バイオメディシン解析技術室シンポジウム 2022年6月30日 招待有り
-
第74回日本細胞生物学会大会 2022年6月29日 招待有り
-
京都大学医学研究科・神経科学教育コース 2022年6月27日 招待有り
-
第127回日本解剖学会 2022年3月27日 招待有り
-
東京大学 理学系研究科 生物情報科学科・黒田研セミナー 2022年2月10日 招待有り
担当経験のある科目(授業)
5所属学協会
4主要なWorks(作品等)
2共同研究・競争的資金等の研究課題
21-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 学術変革領域研究(A) 2023年4月 - 2028年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費 特別研究員奨励費 2023年4月 - 2025年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月
-
JST さきがけ「多細胞」 2019年10月 - 2023年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月
-
日本医療研究開発機構 老化メカニズムの解明・制御プロジェクト 2017年10月 - 2022年3月
-
JST NBDC 統合化推進プログラム 2017年4月 - 2022年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 基盤研究(B) 2018年7月 - 2021年3月
-
徳島大学先端酵素学研究所「共同利用・共同研究」 共同利用・共同研究 2018年4月 - 2021年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2016年6月 - 2021年3月
-
加藤記念難病研究助成基金 2017年10月 - 2018年10月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究 2015年4月 - 2018年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 2014年4月 - 2018年3月
-
JST NBDC 統合化推進プログラム(統合データ解析トライアル) 2015年4月 - 2016年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年7月 - 2014年3月
-
文部科学省 科学研究費補助金(若手研究(B)) 若手研究(B) 2013年 - 2014年
-
文部科学省 科学研究費補助金(若手研究(B)) 若手研究(B) 2011年 - 2012年
-
文部科学省 科学研究費補助金(挑戦的萌芽研究) 挑戦的萌芽研究 2009年 - 2010年
社会貢献活動
2