小川直人 (Ogawa Naoto) - マイポータル

基本情報

所属: 静岡大学農学部 - 応用生命科学科教授

学位: 博士(農学)(2000年11月東京大学)

J-GLOBAL ID: 200901060486517566
researchmap会員ID: 0000050026

研究キーワード

研究分野

委員歴

2021年3月 - 2025年2月

日本農芸化学会, 和文誌編集委員
2022年1月 - 2023年12月

日本土壌微生物学会, 学会事務局幹事長
2018年4月 - 2020年3月

日本土壌肥料学会会誌編集委員会地域担当委員（中部）
2017年4月 - 2019年3月

日本土壌肥料学会土壌教育委員会委員
2016年4月 - 2018年3月

日本土壌肥料学会中部支部・支部長
2010年4月 - 2014年3月

日本土壌肥料学会中部支部・評議委員
2011年6月 - 2013年5月

日本土壌微生物学会・評議員
2010年1月 - 2011年12月

日本土壌微生物学会・企画委員
2007年10月 - 2011年9月

日本土壌肥料学会・英文誌Soil Science and Plant Nutrition編集委員
2009年6月 - 2011年5月

日本土壌微生物学会・評議員
2008年1月 - 2009年12月

日本土壌微生物学会・企画委員
2007年6月 - 2009年5月

日本土壌微生物学会・評議員
2006年4月 - 2007年3月

平成18年度国家公務員採用I種試験(理工IV)試験問題作成委員

論文

Isolation and Genomic Analysis of 3-Chlorobenzoate-Degrading Bacteria from Soil

Ifat Ara, Ryota Moriuchi, Hideo Dohra, Kazuhide Kimbara, Naoto Ogawa, Masaki Shintani

Microorganisms 11(7) 2023年6月査読有り
Manuka honey reduces the virulence of Pectobacterium brasiliense by suppressing genes that encode plant cell wall-degrading enzymes

Sheila Ava, Siti Subandiyah, Muhammad Saifur Rohman, Naoto Ogawa, Tri Joko

ASEAN Journal on Science & Technology for Development (AJSTD) (3) 119-124 2022年12月査読有り
The structure-function relationship of bacterial transcriptional regulators as a target for enhanced biodegradation of aromatic hydrocarbons

Rhitu Kotoky, Naoto Ogawa, Piyush Pandey

Microbiological Research 262 2022年6月査読有り
Complete Genome Sequence of Caballeronia sp. Strain NK8 (MAFF311271), a Chlorobenzoate-Degrading Bacterium

Kimiko Yamamoto-Tamura, Ryota Moriuchi, Naoto Ogawa

Microbiology Resource Announcements 10(1) 2021年8月査読有り
Crystal structure of the full-length LysR-type transcription regulator CbnR in complex with promoter DNA

Evdokia-Anastasia Giannopoulou, Miki Senda, Maharani Pertiwi Koentjoro, Naruhiko Adachi, Naoto Ogawa, Toshiya Senda

The FEBS Journal (15) 4560-4575 2021年8月査読有り
Transcriptome differences between Cupriavidus necator NH9 grown with 3-chlorobenzoate and that grown with benzoate

Ryota Moriuchi, Hideo Dohra, Yu Kanesaki, Naoto Ogawa

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 85(6) 1546-1561 2021年6月査読有り
Complete genome sequence of 3-chlorobenzoate-degrading bacterium Cupriavidus necator NH9 and reclassification of the strains of the genera Cupriavidus and Ralstonia based on phylogenetic and whole-genome sequence analyses

Ryota Moriuchi, Hideo Dohra, Yu Kanesaki, Naoto Ogawa

Frontiers in Microbiology 10(133) 1-21 2019年2月査読有り
Structural studies of transcriptional regulation by LysR-type transcriptional regulators in bacteria

Maharani Pertiwi Koentjoro, Naoto Ogawa

Reviews in Agricultural Science 6 105-118 2018年12月査読有り
Crystal structure of the DNA-binding domain of the LysR-type transcriptional regulator CbnR in complex with a DNA fragment of the recognition-binding site in the promoter region

Maharani Pertiwi Koentjoro, Naruhiko Adachi, Miki Senda, Naoto Ogawa, Toshiya Senda

FEBS Journal 285(5) 977-989 2018年3月1日査読有り
Amino acid residues critical for DNA binding and inducer recognition in CbnR, a LysR-type transcriptional regulator from Cupriavidus necator NH9

Ryota Moriuchi, Kaori Takada, Masae Takabayashi, Yuko Yamamoto, Jun Shimodaira, Naoko Kuroda, Emiko Akiyama, Mayumi Udagawa, Ryoichi Minai, Masao Fukuda …

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 81(11) 2119-2129 2017年査読有り
A putative porin gene of Burkholderia sp. NK8 involved in chemotaxis toward beta-ketoadipate

Kimiko Yamamoto-Tamura, Ikuro Kawagishi, Naoto Ogawa, Takeshi Fujii

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 79(6) 926-936 2015年6月査読有り
Regional distribution of styrene analogues generated from polystyrene degradation along the coastlines of the North-East Pacific Ocean and Hawaii

Bum Gun Kwon, Katsuhiko Saido, Koshiro Koizumi, Hideto Sato, Naoto Ogawa, Seon -Yong Chung, Takashi Kusui, Yoichi Kodera, Kazuhio Kogure

ENVIRONMENTAL POLLUTION 188 45-49 2014年5月査読有り
A 2,4-dichlorophenoxyacetic acid degradation plasmid pM7012 discloses distribution of an unclassified megaplasmid group across bacterial species

Yoriko Sakai, Naoto Ogawa, Yumi Shimomura, Takeshi Fujii

MICROBIOLOGY-SGM 160(3) 525-536 2014年3月査読有り
New analytical method for the determination of styrene oligomers formed from polystyrene decomposition and its application at the coastlines of the North-West Pacific Ocean

Katsuhiko Saido, Koshiro Koizumi, Hideto Sato, Naoto Ogawa, Bum Gun Kwon, Seon-Yong Chung, Takashi Kusui, Masahiko Nishimura, Yoichi Kodera

SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT 473 490-495 2014年3月査読有り
Isolation and Structural Determination of Makinolide B from Streptomyces sp MK-19

Michitaka Hidaki, Mitsuru Yoshida, Naoto Ogawa, Shinya Kodani

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 77(9) 1964-1966 2013年9月査読有り
Isolation of soil bacteria that decolorize Reactive Red 141, a major industrial textile dye used in Thailand

責任著者]Naoto Ogawa, 共著者]Sukumal Boonurapeepinyo, Nanako Koga, Niramol Sakkayawong, Naoto Ogawa

土と微生物 67(1) 10-13 2013年4月査読有り
Laboratory tests on sorption and transformation of the insecticide flubendiamide in Japanese tea field soil

責任著者]Robert Kreuzig, 共著者]Susen Hartung, Masahide Iwasaki, Naoto Ogawa, Robert Kreuzig

Science of the Total Environment 443((num)) 904-909 2013年1月査読有り
Specific gene responses of a gram-positive polychlorinated-biphenyl degrader, Rhodococcus jostii RHA1 during growth in soil

責任著者]Masao Fukuda, 共著者]Toju Iino, Yong Wang, Keisuke Miyauchi, Naoto Ogawa, Masao Fukuda

Applied and Environmental Microbiology 78(19) 6954-6962 2012年10月査読有り
Response of rhizobacterial communities in watermelon to infection with cucumber green mottle mosaic virus as revealed by cultivation-dependent RISA

Tri Joko, Maharani Pertiwi Koentjoro, Susamto Somowiyarjo, Muhammad Saifur Rohman, Alin Liana, Naoto Ogawa

Archives of Phytopathology and Plant Protection 45(15) 1810-1818 2012年9月査読有り
沖縄沿岸における漂流・漂着ポリスチレン由来のスチレンオリゴマー汚染の分析

責任著者, 道祖土勝彦, 共著者, 道祖土勝彦, 雨宮恵司, 佐藤秀人, 小川直人, 釜谷保志

分析化学 61(7) 629-636 2012年7月査読有り

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MISC

LysRタイプ転写調節因子CbnRのDNA結合ドメインとDNAとの複合体構造

千田美紀, 安達成彦, 千田俊哉, Maharani Pertiwi Koentjoro, 小川直人

日本結晶学会誌 60(2-3) 135-141 2018年6月
細菌による芳香族化合物の分解と遺伝子発現調節機構

小川直人

分離技術 47(2) 92-96 2017年2月
土壌中の細菌ゲノムの発現をとらえる(総説)

責任著者, 小川直人, 共著者, 小川直人, 福田雅夫

日本生物工学会誌 87(9) 428-430 2009年9月
土壌抽出RNAを用いた土壌微生物の遺伝子発現解析.(解説)

責任著者, 藤井毅, 共著者]藤井毅, 宮坂知芳, 王勇, 森本晶, 小川直人

植物防疫 62(11) 607-610 2008年11月
環境での遺伝子発現ネットワークを探る(総説)

責任著者, 福田雅夫, 共著者, 福田雅夫, 小川直人

化学と生物 45(11) 792-797 2007年11月1日
水田土壌から分離した2,4-D分解菌の分解遺伝子はメガプラスミドに存在する

責任著者, 酒井順子, 共著者, 小川直人, 藤井毅, 長谷部亮

農業環境研究成果情報 22 2006年3月
環境汚染物質分解に関与するLysR型転写調節因子の構造と機能

責任著者, 千田俊哉, 共著者, 小川直人

蛋白質核酸酵素 50(12) 1535-1540 2005年10月
Detection of 3-chlorobenzoate degrading bacteria in soil by PCR-DGGE

責任著者]S. Morimoto, 共著者]N. Ogawa, A. Hasebe,T. Fujii

Annual Report of National Institute for Agro-Environmental Sciences 53-54 2005年3月
クロロカテコール分解酵素の基質特異性は3つのアミノ酸によって決定される

責任著者, 小川直人, 共著者, 藤井毅, 長谷部亮

農業環境研究成果情報 21 20-21 2005年3月
分散型データベースによる「微生物インベントリー」の構築とWeb公開

責任著者, 對馬誠也, 共著者, 月星隆雄, 吉田重信, 篠原弘亮, 長谷部亮, 酒井順子, 小川直人, 土屋健一

インベントリー (3) 13 2004年4月
Microbial genes and enzymes in the degradation of chlorinated compounds (Review)

責任著者]Naoto Ogawa, 共著者]Naoto Ogawa, Kiyotaka Miyashita, A. M. Chakrabarty

The Chemical Records 3(3) 158-171 2003年7月
芳香族塩素化合物分解と分子生態解析（総説）

小川直人

日本土壌肥料学雑誌 73(5) 543-548 2002年10月
Burkholderia 属細菌のクロロ安息香酸分解遺伝子群発現の調節因子による制御

責任著者, 小川直人, 共著者, 小川直人, 長谷部亮

農業環境研究成果情報 18 10-11 2002年3月
3-クロロ安息香酸分解プラスミドの構造と分解遺伝子の増幅

責任著者, 小川直人, 共著者, 小川直人, 宮下清貴, 加藤邦彦

農業環境研究成果情報 8 37-38 1992年9月

書籍等出版物

日本の土壌事典－分布・生成から食料生産・保全管理まで－

小川直人, 浅川晋, 渡邉彰, 高田裕介 (担当:共編者(共編著者), 範囲:第8章中部地方)

朝倉書店 2023年10月
The Soils of Japan (World Soils Book Series)

Naoto Ogawa, Susumu Asakawa, Jun Murase, Akira Watanabe, Hirotatsu Murano, Hidetaka Sasaki, Kouichi Hosokawa, Masashi Saitou, Minako Kanda, Fumio Uno, Jun Koike, Hitoshi Watanabe, Masahiro Kasuya, Yuhei Hirono, Masayuki Hara (担当:共編者(共編著者), 範囲:Chapter 8 Chubu Region (Hokuriku/Tokai) 共同編集)

Springer 2021年2月
土壌生化学（実践土壌学シリーズ3）

小川直人 (担当:分担執筆, 範囲:合成有機物（第4章炭素の循環－土壌有機物の分解と炭素化合物の代謝－）)

朝倉書店 2019年2月
Plasmid Biology

Naoto Ogawa, A. M. Chakrabarty, Olga Zaborina (担当:共著)

American Society for Microbiology 2004年4月
遺伝生態情報の可能性（東北大学遺伝生態研究センターIGEシリーズ23）

宮下清貴, 藤井毅, 小川直人 (担当:共著)

東北大学遺伝生態研究センター 1996年12月

講演・口頭発表等

環境細菌の3-ヒドロキシ安息香酸分解遺伝子群のLysR-type 転写調節因子MhbRの解析

廣怜奈, Noor Febryani, 宮丸真央, 小川直人

日本土壌微生物学会2023年度千葉大会 2023年6月10日
Isolation of 3-chlorobenzoate degrading bacteria from soils of Shizuoka region

Rituparna Chetia、Asahi Kurokawa, Reina Hiro, Ryota Moriuchi, Kiyotaka Miyashita, Naoto Ogawa

日本土壌微生物学会2023年度千葉大会 2023年6月10日
Isolation and identification of 3-chlorobenzoic acid (3-CBA) degrading bacteria from soil in Shizuoka

ARA IFAT, Ryota Moriuchi, Hideo Dhora, Kazuhide Kimbara, Naoto Ogawa, Masaki Shintani

日本農芸化学会2023年度大会 2023年3月14日
環境細菌の3-ヒドロキシ安息香酸分解遺伝子群のLysRタイプ転写調節因子の解析

廣怜奈, Noor Febryani, 小川直人

第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム 2023年3月5日
3-クロロ安息香酸分解細菌の分解遺伝子群発現に関わる転写関連タンパク質の精製

良知拓実, 長瀬里沙, 宮崎剛亜, 千田俊哉, 小川直人

第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム 2023年3月5日
3-クロロ安息香酸分解細菌Cupriavidus necator NH9株のRNAポリメラーゼ精製用菌株の作製

島田結衣, 海野聖貴, 本多優衣, 良知拓実, 小川直人

第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム 2023年3月5日
植物病原性細菌Dickeya dadantii 3937株のLacIタイプ転写調節因子LfaRの解析

鹿沼奈緒子, 良知拓実, Dina Istiqomah, Tri Joko, 小川直人

第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム 2023年3月5日
細菌のLacI タイプ転写調節因子LfaR と被制御プロモーターの相互作用及び発現の解析

良知拓実, Dina Istiqomah, Tri Joko, 森内良太, 小川直人

日本土壌微生物学会2022年度大会 2022年6月19日
Transcriptional regulation of the degradation genes of 3-hydroxybenzoate of Burkholderia multivorans ATCC17616

Noor Febryani, Naoto Ogawa

日本土壌微生物学会2021年度大会 2021年6月18日
ゲノム情報を用いたCupriavidus属とRalstonia属細菌の再分類の提案

森内良太, 道羅英夫, 兼崎友, 小川直人

第13回日本ゲノム微生物学会年会 2019年3月7日
3-クロロ安息香酸分解細菌の全ゲノム配列とCupriavidus属及びRalstonia属細菌の再分類に関する研究

森内良太, 道羅英夫, 兼崎友, 小川直人

日本土壌肥料学会中部支部第97回例会講演要旨集 2018年11月29日
Burkholderia multivorans ATCC17616株の芳香族化合物トランスポーター遺伝子群の解析

小川直人, 岩崎滉平, 前田慶, 峯田三寿々, 石塚結実子

日本土壌肥料学会2018年度神奈川大会 2018年8月31日
東海・北陸地方における持続可能な土壌管理

小川直人, 宇野史生, 小池潤, 神田美奈子, 廣野祐平, 糟谷真宏

日本土壌肥料学会2018年度神奈川大会 2018年8月30日
LTTR-DNA複合体のMR-native SAD法による結晶構造解析

千田美紀, Maharani Koentjoro, 安達成彦, 小川直人, 千田俊哉

2017年度生命科学系学会合同年次大会 2017年12月
LysRタイプ転写調節因子-DNA複合体のＸ線結晶構造解析

千田美紀, Maharani Pertiwi Koentjoro, 安達成彦, 小川直人, 千田俊哉

日本結晶学会平成29年度年会 2017年11月招待有り
Crystal structure of DNA-Binding Domain-CbnR with its promoter reveals the basis of the LysR-Type Transcriptional Regulator recognition

Maharani Pertiwi Koentjoro, Naruhiko Adachi, Miki Senda, Naoto Ogawa, Toshiya Senda

14th International Conference on Structural Biology 2017年9月
クロロ安息香酸分解細菌における転写調節機構の包括的解明に向けたトランスクリプトーム解析

森内良太, 道羅英夫, 小川直人

環境微生物系学会合同大会2017 2017年8月
LysR型転写調節因子ネットワーク解明のための3-クロロ安息香酸分解土壌細菌Cupriavidus necator NH9株のドラフトゲノム解析

小川直人, 森内良太, 道羅英夫

日本土壌肥料学会中部支部第96回例会 2017年3月
果樹園酸性土壌から選抜されたリン溶解菌の施用効果

小杉徹, 小川直人, 森田明雄, 福島務, 高橋和彦

日本土壌肥料学会中部支部第96回例会 2017年3月
果樹園酸性土壌からのリン溶解菌の選抜

小杉徹, 小川直人, 森田明雄, 福島務, 高橋和彦

日本土壌肥料学会2016年大会 2016年9月

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担当経験のある科目(授業)

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

LysRタイプ転写調節因子による転写活性化初期機構の解明

日本学術振興会基盤研究(C) 基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

小川直人
細菌の芳香族化合物トランスポーターネットワーク

日本学術振興会基盤研究(C) 基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

小川直人
LysRタイプ転写調節因子による遺伝子発現調節機構と自己認識基盤の解明

日本学術振興会基盤研究(C) 基盤研究(C) 2010年4月 - 2013年3月

小川直人