西村 善文
ニシムラ ヨシフミ (Yoshifumi Nishimura)
更新日: 01/31
基本情報
- 所属
- 横浜市立大学 大学院生命医科学研究科 特任教授
- 学位
-
Ph.D.(The University of Tokyo)Master of Pharmaceutical Sciences(The University of Tokyo)
- J-GLOBAL ID
- 200901055310348284
- researchmap会員ID
- 1000054448
- 外部リンク
専門:NMRによる構造生物学.
特にエピゲノムに関連するクロマチン関連因子を中心とした核内タンパク質の構造機能解析。
ヘテロクロマチンタンパク質Chp1のヒストンH3K9meとの複合体におけるncRNAとの相互作用構造、基本転写因子TFIIHのp62サブユニットと相互作用する①基本転写因子TFIIEαサブユニットのC末酸性ドメイン、②がん抑制遺伝子産物p53の酸性転写活性化ドメイン、③ヌクレオチド除去修復因子XPCの酸性ドメイン、④細胞周期転写因子DP1の酸性ドメイン等の伸びた紐用構造による認識機構、ヘテロクロマチンタンパク質HP1のリン酸化クロモドメインとヒストンH3K9meとの間の伸びた紐様構造による絡みあい認識機構、遊離したヒストンH2AH2Bの単独の溶液構造解析とヒストンシャペロンhNAP1のC末酸性ドメインによる認識機構など、クロマチン関連タンパク質中の天然変性領域の伸びた紐用構造どのように認識しているのかをNMRを用いた動的構造解析で明らかにしている。
特にエピゲノムに関連するクロマチン関連因子を中心とした核内タンパク質の構造機能解析。
ヘテロクロマチンタンパク質Chp1のヒストンH3K9meとの複合体におけるncRNAとの相互作用構造、基本転写因子TFIIHのp62サブユニットと相互作用する①基本転写因子TFIIEαサブユニットのC末酸性ドメイン、②がん抑制遺伝子産物p53の酸性転写活性化ドメイン、③ヌクレオチド除去修復因子XPCの酸性ドメイン、④細胞周期転写因子DP1の酸性ドメイン等の伸びた紐用構造による認識機構、ヘテロクロマチンタンパク質HP1のリン酸化クロモドメインとヒストンH3K9meとの間の伸びた紐様構造による絡みあい認識機構、遊離したヒストンH2AH2Bの単独の溶液構造解析とヒストンシャペロンhNAP1のC末酸性ドメインによる認識機構など、クロマチン関連タンパク質中の天然変性領域の伸びた紐用構造どのように認識しているのかをNMRを用いた動的構造解析で明らかにしている。
研究分野
1経歴
7-
2019年4月 - 現在
-
2018年4月 - 現在
-
2015年4月 - 2018年3月
-
2013年4月 - 2015年3月
-
1989年4月 - 2013年3月
-
1977年9月 - 1989年3月
-
1976年3月 - 1977年8月
学歴
3-
1973年4月 - 1976年3月
-
1971年6月 - 1973年3月
-
1967年4月 - 1971年5月
委員歴
4-
2009年12月 - 2011年11月
-
2007年9月 - 2009年8月
-
1992年
-
1992年
受賞
2-
2012年6月
-
1982年
論文
82-
Bioscience Reports 43(7) 2023年7月13日
-
Journal of Molecular Biology 168189-168189 2023年6月
-
Journal of Molecular Biology 435(4) 167936-167936 2023年1月 責任著者
-
Communications biology 5(1) 814-814 2022年8月13日
-
Current opinion in structural biology 75 102436-102436 2022年7月18日
-
Nuclear Medicine and Biology 110-111 47-58 2022年7月
-
iScience 25(3) 103937-103937 2022年3月
-
Scientific Reports 11(1) 2021年12月 査読有り
-
BMC Molecular and Cell Biology 22(1) 3-3 2021年12月 査読有り
-
Nucleic Acids Research 2021年7月16日
-
Journal of Molecular Biology 433(15) 167110-167110 2021年7月 最終著者
-
Nucleic Acids Research 49(5) 2916-2930 2021年3月18日 最終著者
-
iScience 23(10) 101641-101641 2020年10月 査読有り
-
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117(33) 19661-19663 2020年8月3日 査読有り
-
Bioscience Reports 40(2) 2020年2月28日 査読有り
-
Scientific Reports 9(1) 10183-10183 2019年12月 査読有り
-
Analytical Chemistry 90(13) 8217-8226 2018年7月3日 査読有り
-
iScience 3 50-62 2018年5月 査読有り
MISC
182-
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
-
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 58th (CD-ROM) 2019年
-
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
-
日本細胞生物学会大会(Web) 71st ROMBUNNO.2P‐019(2SDa‐04) (WEB ONLY) 2019年
-
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 57th 2018年
-
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st ROMBUNNO.2P‐0110 (WEB ONLY) 2018年
-
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st ROMBUNNO.1P‐0161 (WEB ONLY) 2018年
-
BIOPHYSICAL JOURNAL 112(3) 488A-488A 2017年2月
-
日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 16th 2016年
-
質量分析総合討論会講演要旨集 62nd 18 2014年5月7日
-
BIOPHYSICAL JOURNAL 106(2) 464A-464A 2014年1月
-
日本生化学会大会(Web) 87th 3P-488 (WEB ONLY) 2014年
-
質量分析総合討論会講演要旨集 61st 145 2013年9月2日
-
質量分析総合討論会講演要旨集 61st 93 2013年9月2日
-
Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn 51st 318-319 2012年10月22日
-
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 2012年
-
Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 51st 2012年
-
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 2P-0073 (WEB ONLY) 2012年
-
日本生化学会大会(Web) 85th 3P-742 (WEB ONLY) 2012年
-
JOURNAL OF MASS SPECTROMETRY 45(10) 1232-1232 2010年10月
書籍等出版物
26-
2011年
-
㈱羊土社 2007年
-
2005年
-
学会出版センター 2004年
-
㈱東京化学同人 2001年
-
㈱クバプロ 1999年
-
秀潤社 1997年
-
秀潤社 1997年
-
秀潤社 1997年
-
秀潤社 1997年
-
秀潤社 1997年
-
SBS実行委員会 1995年
-
丸善 1993年
-
学会出版センター 1992年
-
南江堂 1990年
講演・口頭発表等
129-
第65回ワークショップ よこはまNMR研究会 2020年10月22日
-
第37回染色体ワークショップ;回核ダイナミクス研究会 2019年12月22日
-
よこはまNMR研究会 第62回ワークショップ「令和最初のNMR」 2019年6月28日
-
2017年度生命科学系学会合同年次大会 2017年12月8日
-
2017 Taiwan-Japan Biomedical Symposium on Magnetic Resonance 2017年10月 招待有り
-
第17回日本蛋白質科学会年会 2017年6月20日
-
よこはまNMR構造生物学研究会 第49回ワークショップ 「高磁場NMRの応用」 2014年3月20日
-
新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」 2014年2月
-
よこはまNMR構造生物学研究会第47回ワークショップ「創薬等プラットフォーム」 2013年7月3日
-
第13回日本蛋白質科学会年会 2013年6月
-
MRによるエピゲノム関連タンパク質の機能解析 2013年3月22日
-
日本薬学会 第132年会 一般シンポジウム「創薬を目指す核磁気共鳴(NMR):現況と展望」“NMR aim at Drug Discovery :Present and Future" 2013年3月
-
新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」 2013年1月
-
平成24年度日本分光学会年次講演会 2012年11月
-
International Workshop on Pharmaceutical NMR 2012年10月30日
-
Yokohama NMR The 3rd International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR 2012年10月
-
Symposium on the Structure and Folding of Disease Related Proteins 2012年7月 招待有り
-
天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現 第3回領域会議 2012年5月
-
Bio tech2012アカデミックフォーラム 2012年4月
-
第34回日本分子生物学会年会 2011年12月
共同研究・競争的資金等の研究課題
55-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年7月 - 2014年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年7月 - 2014年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年7月 - 2014年3月
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(S) 2008年 - 2012年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究 2003年 - 2009年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(A) 2008年 - 2008年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究 2007年 - 2008年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 2005年 - 2007年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究 2005年 - 2006年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究 2005年 - 2005年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究 2004年 - 2004年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究 2003年 - 2003年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B) 2001年 - 2003年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究 2002年 - 2002年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究(C) 2001年 - 2001年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(A) 1999年 - 2001年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究(A) 1998年 - 2001年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究(A) 1998年 - 2001年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究(C) 2000年 - 2000年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特定領域研究(A) 2000年 - 2000年