藤井知実 (Tomomi Fujii) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学化学研究所附属先端ビームナノ科学センター助手

学位: 理学修士
理学博士

J-GLOBAL ID: 200901086359209193
researchmap会員ID: 1000162763

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /

論文

The crystal structure of maleylacetate reductase from Rhizobium sp strain MTP-10005 provides insights into the reaction mechanism of enzymes in its original family

Tomomi Fujii, Ai Sato, Yuko Okamoto, Takae Yamauchi, Shiro Kato, Masahiro Yoshida, Tadao Oikawa, Yasuo Hata

PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS 84(8) 1029-1042 2016年8月査読有り
Crystallographic studies of aspartate racemase from Lactobacillus sakei NBRC 15893

Tomomi Fujii, Takae Yamauchi, Makoto Ishiyama, Yoshitaka Gogami, Tadao Oikawa, Yasuo Hata

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS 71 1012-1016 2015年8月査読有り
Crystal Structure Analysis of GraE Protein from the Gene Cluster of γ-Resorcylate Catabolic System

T. Yamauchi, T. Fujii, T. Oikawa, Y. Hata

SPring-8 / SACLA Research Report 3(2) 329-332 2015年査読有り
Crystal Structures of Bacterial Flavin Reductase GraD and Its Complex with NADH

Yamauchi, T, Fujii, T, Yoshida, M, Oikawa, T, Hata, Y

Acta Cryst. A70 C448 2014年査読有り
Crystal Structure Analyses of Oxygenase Component of Resorcinol Hydroxylase

Fujii, T, Kobayashi, K, Yamauchi, T, Yoshida, M, Oikawa, T, Hata, Y

Acta Cryst. C448 2014年査読有り
Structural Features and Low-Temperature Adaptation of Aspartate Racemase

Hata, Y, Fujii, T, Yamauchi, T, Gogami, Y, Oikawa, T

Acta Cryst. A70 C1055 2014年査読有り
Crystal Structure of Flavin Reductase from Rhizobium sp. strain MTP-10005

Hata, Y, Yamauchi, T, Fujii, T, Yoshida, M, Oikawa, T

Abstract of AsCA’13 P-020 2013年査読有り
Structural Studies on Thermostability of Aspartate Racemase

Hata, Y, Fujii, T, Yamauchi, T, Gogami, Y, Oikawa, T

Abstract of AsCA 12 316 2012年査読有り
Crystal Structure of Aspartate Rasemase from Lactobacillus sakei NBRC-15893

Hata, Y, Fujii, T, Ishiyama, M, Yamauchi, T, Gogami, Y, Oikawa, T

Acta Cryst. A67 C782-C783 2011年査読有り
Crystal Structure of Flavin Reductase from Rhizobium sp. Strain MTP-10005

Yamauchi, T, Fujii, T, Yoshida, M, Oikawa, T, Hata, Y

Acta Cryst. A67 C779 2011年査読有り
Structure and Reaction Mechanism of Maleylacetate Reductase.

Hata Y, Fujii T, Yoshida M, Oikawa T

Abstract of Pacifichem 2010 Honolulu. 2010年査読有り
Crystal Structure Analysis of the Oxygenase Component (GraA) of a Resorcinol Hydroxylase.

Hata Y, Fujii T, Kobayashi K, Yoshida M, Oikawa T

Abstract of AsCA2010 Busan. 2010年査読有り
Structure of Maleylacetate Reductase from Rhizobium sp. strain MTP-10005

Hata Y, Fujii T, Yoshida M, Oikawa T

Abstract of AsCA'9 Beijing 2009年査読有り
Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of maleylacetate reductase from Rhizobium sp strain MTP-10005

Tomomi Fujii, Yuko Goda, Masahiro Yoshida, Tadao Oikawa, Yasuo Hata

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 64 737-739 2008年8月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of tetrameric malate dehydrogenase from the novel Antarctic psychrophile Flavobacterium frigidimaris KUC-1

Tomomi Fujii, Tadao Oikawa, Ikuo Muraoka, Kenji Soda, Yasuo Hata

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 63 983-986 2007年11月査読有り
Structure of the carboxypeptidase Y inhibitor I-C in complex with the cognate proteinase reveals a novel mode of the proteinase-protein inhibitor interaction

J Mima, M Hayashida, T Fujii, Y Narita, R Hayashi, M Ueda, Y Hata

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 346(5) 1323-1334 2005年3月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray analysis of carboxypeptidase Y inhibitor I-C complexed with the cognate proteinase

J Mima, M Hayashida, T Fujii, Y Hata, R Hayashi, M Ueda

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 60 1622-1624 2004年9月査読有り
Structures of two lectins from the roots of pokeweed (Phytolacca americana)

T Fujii, M Hayashida, M Hamasu, M Ishiguro, Y Hata

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 60 665-673 2004年4月査読有り
Similarity between protein-protein and protein-carbohydrate interactions, revealed by two crystal structures of lectins from the roots of pokeweed

M Hayashida, T Fujii, M Hamasu, M Ishiguro, Y Hata

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 334(3) 551-565 2003年11月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray analysis of lectin C from the roots of pokeweed (Phytolacca americana)

M Hayashida, T Fujii, M Hamasu, M Ishiguro, Y Hata

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 59 1249-1252 2003年7月査読有り

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MISC

Thermococcus litoralis DSM 5473由来アスパラギナーゼのＸ線結晶構造

藤井知実, 山内貴恵, 加藤志郎, 老川典夫, 畑安雄

2017年度生命科学系学会合同年次大会 2017年
Thermococcus litralis DSM 5473由来アスパラギナーゼのX線結晶構造解析

山内貴恵, 藤井知実, 加藤志郎, 老川典夫, 畑安雄

日本農芸化学会2016年度大会 2016年3月
Thermococcus litoralis DSM 5473由来アスパラギナーゼの結晶構造解析

藤井知実, 山内貴恵, 加藤志郎, 老川典夫, 畑安雄

日本結晶学会平成28年度年会 2016年
レゾルシノール水酸化酵素オキシゲナーゼコンポーネントの結晶構造

藤井知実, 小林一隆, 山内貴恵, 吉田雅博, 老川典夫, 畑安雄

第86回日本生化学会大会, 横浜 2013年
レゾルシノール水酸化酵素オキシゲナーゼコンポーネントの結晶構造解析

藤井知実, 小林一隆, 山内貴恵, 吉田雅博, 老川典夫, 畑安雄

日本結晶学会平成２５年度年会, 熊本 2013年
微生物由来アスパラギン酸ラセマーゼのX線結晶構造解析

山内貴恵, 藤井知実, 郷上佳孝, 老川典夫, 畑安雄

日本農芸化学会2013年度大会 2013年
耐熱性アスパラギン酸ラセマーゼの結晶構造解析

藤井知実, 細見卓, 山内貴恵, 郷上佳孝, 老川典夫, 畑安雄

日本結晶学会年会2012 ,仙台 2012年10月26日査読有り
超好熱性古細菌Thermococcus litoralis DSM 5473由来アスパラギン酸ラセマーゼの結晶構造

藤井知実, 細見卓, 山内貴恵, 郷上佳孝, 老川典夫, 畑安雄

第85回日本生化学会大会, 福岡 2012年
レゾルシノールヒドロキシラーゼの構造-機能解析

山内貴恵, 小林一隆, 藤井知実, 吉田雅博, 老川典夫, 畑安雄

第59回日本生化学会近畿支部例会 2012年
Rhizobium sp. strain MTP-10005由来フラビン還元酵素のX線結晶構造解析

山内貴恵, 藤井知実, 吉田雅博, 老川典夫, 畑安雄

日本農芸化学会2012年度大会 2012年
Crystal Structure of Maleylacetate Reductase

Hata, Y, Fujii,T, Yoshida, M, Oikawa, T

Pacific Protein Association Conference 2011年
好冷細菌Flavobacterium frigidimaris KUC-1由来マレートデヒドロゲナーゼの部位特異的変異導入及び分子動力学計算による低温適応機構の解析

郷上佳孝, 茨木将, 藤井知実, 畑安雄, 老川典夫

第2回近畿地区ビタミン懇話会, 神戸 2011年
根粒菌由来フラビン還元酵素のX線結晶構造解析

山内貴恵, 藤井知実, 吉田雅博, 老川典夫, 畑安雄

日本農芸化学会2011年度大会, 京都 2011年
Structure of Maleylacetate Reductase from Rhizobium sp. strain MTP-10005

Hata Y, Fujii T, Yoshida M, Oikawa T

The 2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2010年
マレイル酢酸還元酵素のX線結晶構造解析

藤井知実, 老川典夫, 畑安雄

日本結晶学会 2010年度大会, 大阪 2010年
マレイル酢酸還元酵素の結晶構造

藤井知実, 山内貴恵, 老川典夫, 畑安雄

日本生化学会 2010年度大会, 神戸 2010年
A Psychrophilic Tetrameric Malate Dehydrogenase Has No Intersubunit Ion-pairs

Hata Y, Fujii T, Oikawa T, Soda K

Abstract of ABA Symposium 2009年査読有り
Crystal Structure of Tetrameric Malate Dehydrogenase from Antarctic Psychrophile

Fujii T, Oikawa T, Muraoka I, Soda K, Hata Y

XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography ,Osaka 2008年8月29日査読有り
「耐熱性アスパルターゼの結晶」

畑安雄, 藤井知実

国内特許公開, (特開2005-137218) 2005 年 2005年査読有り
アメリカヤマゴボウ由来レクチンの立体構造解析

畑安雄, 藤井知実, 林田稔, 水田悟史, 濱洲三加, 麻生陽一, 石黒正恒

日本農芸化学会 , 2002年3月26日査読有り

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講演・口頭発表等

耐熱性アスパラギン酸ラセマーゼの結晶構造解析

日本結晶学会年会2012 2012年10月26日仙台
Crystal Structure of Tetrameric Malate Dehydrogenase from Antarctic Psychrophile

XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography 2008年8月29日
アメリカヤマゴボウ由来レクチンの立体構造解析

日本農芸化学会 2002年3月26日
活性硫黄と活性型セレンの生成を担う酵素

日本生化学会 2001年10月25日京都
耐熱性アスパルターゼの結晶構造と機能部位探索

日本結晶学会 2001年10月3日名古屋
耐熱性アスパルターゼの結晶構造

日本農芸化学会 2001年3月25日
質量分析の活用：２ハロ酸デハロゲナーゼによる立体反転反応触媒の現場を見る

日本生化学会 1999年10月8日神奈川
大腸菌 NIFS 相同酵素の立体構造特性

日本農芸化学会 1999年3月31日
大腸菌由来NIFS相同酵素の結晶構造

日本結晶学会 1998年11月22日神奈川
大腸菌由来システインスルフィン酸デスルフィナーゼIIの結晶構造解析

日本農芸化学会 1998年4月2日
中間体構造に基づくL-2-ハロ酸デハロゲナーゼの触媒反応機構解析

日本農芸化学会 1998年4月1日
L-2-ハロ酸デハロゲナーゼの反応機構解析-エステル中間体の構造

日本結晶学会 1997年11月1日茨木
L-2ハロ酸デハロゲナーゼの立体構造と反応機能

日本農芸化学会 1997年4月4日
Pseudomonas sp. YL株由来L-2-ハロ酸デハロゲナーゼ：基質複合体のX線結晶解析

日本農芸化学会 1997年4月3日
C2-キラルピロリジンによるアントロンと置換マレイミドとの不斉環状付加反応

日本農芸化学会 1997年4月1日
L-2-ハロ酸デハロゲナーゼの結晶構造

日本結晶学会 1995年10月7日名古屋
古細菌由来フェレドキシンの結晶構造解析

日本結晶学会 1994年11月26日大阪

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