眞貝洋一 (Yoichi Shinkai) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所開拓研究本部眞貝細胞記憶研究室主任研究員

学位: 医学博士(順天堂大学)
医科学修士(筑波大学)

研究者番号: 20211972
J-GLOBAL ID: 200901085421585753
researchmap会員ID: 1000258222

外部リンク: http://shinkai.riken.jp/

研究キーワード

研究分野

経歴

2015年4月 - 現在

国立研究開発法人理化学研究所, 眞貝細胞記憶研究室, 主任研究員
2012年4月 - 2015年3月

独立研究開発法人理化学研究所, 眞貝細胞記憶研究室, 主任研究員
2011年4月 - 2012年3月

独立行政法人理化学研究所, 基幹研究所・眞貝細胞記憶研究室, 招聘主任研究員
2003年7月 - 2012年3月

京都大学, ウイルス研究所, 教授
1998年6月 - 2003年6月

京都大学, ウイルス研究所, 準教授
1995年7月 - 1998年5月

日本ロシュ(株)研究所・主幹研究員
1995年 - 1998年

Nippon Roche. Research Center, Senior Scientist
1991年10月 - 1995年6月

ハーバード大学リサーチフェロー
1991年 - 1995年

ハーバード大学
1990年4月 - 1991年9月

コロンビア大学, リサーチフェロー
1990年 - 1991年

コロンビア大学

学歴

1986年4月 - 1990年3月

順天堂大学, 大学院医学研究科, 免疫学
1984年4月 - 1986年3月

筑波大学, 大学院修士課程, 医科学研究科
1980年4月 - 1984年3月

山形大学, 理学部, 生物学科

論文

122

Histidine N1-position-specific methyltransferase CARNMT1 targets C3H zinc finger proteins and modulates RNA metabolism

Tadahiro Shimazu, Rei Yoshimoto, Kaoru Kotoshiba, Takehiro Suzuki, Shogo Matoba, Michiko Hirose, Mai Akakabe, Yoshihiro Sohtome, Mikiko Sodeoka, Atsuo Ogura …

Genes & Development 2023年8月23日
Epigenetic plasticity safeguards heterochromatin configuration in mammals

Kei Fukuda, Takeshi Shimi, Chikako Shimura, Takao Ono, Takehiro Suzuki, Kenta Onoue, Satoko Okayama, Hisashi Miura, Ichiro Hiratani, Kazuho Ikeda …

Nucleic Acids Research 2023年5月13日
A specific G9a inhibitor unveils BGLT3 lncRNA as a universal mediator of chemically induced fetal globin gene expression

Shohei Takase, Takashi Hiroyama, Fumiyuki Shirai, Yuki Maemoto, Akiko Nakata, Mayumi Arata, Seiji Matsuoka, Takeshi Sonoda, Hideaki Niwa, Shin Sato …

Nature Communications 14(1) 23-23 2023年1月12日
Mammalian HEMK1 methylates glutamine residue of the GGQ motif of mitochondrial release factors.

Qi Fang, Yusuke Kimura, Tadahiro Shimazu, Takehiro Suzuki, Ayumi Yamada, Naoshi Dohmae, Shintaro Iwasaki, Yoichi Shinkai

Scientific reports 12(1) 4104-4104 2022年3月8日
Propargylic Se-adenosyl-l-selenomethionine: A Chemical Tool for Methylome Analysis

Yoshihiro Sohtome, Tadahiro Shimazu, Yoichi Shinkai, Mikiko Sodeoka

Accounts of Chemical Research 54(20) 3818-3827 2021年10月19日
Erratum: Derepression of inflammation-related genes link to microglia activation and neural maturation defect in a mouse model of Kleefstra syndrome.

Yamada A, Hirasawa T, Nishimura K, Shimura C, Kogo N, Fukuda K, Kato M, Yokomori M, Hayashi T, Umeda M …

iScience 2021年10月
DMRT1-mediated reprogramming drives development of cancer resembling human germ cell tumors with features of totipotency.

Jumpei Taguchi, Hirofumi Shibata, Mio Kabata, Masaki Kato, Kei Fukuda, Akito Tanaka, Sho Ohta, Tomoyo Ukai, Kanae Mitsunaga, Yosuke Yamada …

Nature communications 12(1) 5041-5041 2021年8月19日
METTL18-mediated histidine methylation on RPL3 modulates translation elongation for proteostasis maintenance

Eriko Matsuura-Suzuki, Tadahiro Shimazu, Mari Takahashi, Kaoru Kotoshiba, Takehiro Suzuki, Kazuhiro Kashiwagi, Yoshihiro Sohtome, Mai Akakabe, Mikiko Sodeoka, Naoshi Dohmae …

2021年7月29日
Derepression of inflammation-related genes link to microglia activation and neural maturation defect in a mouse model of Kleefstra syndrome.

Ayumi Yamada, Takae Hirasawa, Kayako Nishimura, Chikako Shimura, Naomi Kogo, Kei Fukuda, Madoka Kato, Masaki Yokomori, Tetsutaro Hayashi, Mana Umeda …

iScience 24(7) 102741-102741 2021年7月23日
A loss-of-function variant in SUV39H2 identified in autism-spectrum disorder causes altered H3K9 trimethylation and dysregulation of protocadherin β-cluster genes in the developing brain.

Shabeesh Balan, Yoshimi Iwayama, Tetsuo Ohnishi, Mikiko Fukuda, Atsuko Shirai, Ayumi Yamada, Sara Weirich, Maren Kirstin Schuhmacher, Kalarickal Vijayan Dileep, Toshihiro Endo …

Molecular psychiatry 26(12) 7550-7559 2021年7月15日
Regulation of mammalian 3D genome organization and histone H3K9 dimethylation by H3K9 methyltransferases.

Kei Fukuda, Chikako Shimura, Hisashi Miura, Akie Tanigawa, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Ichiro Hiratani, Yoichi Shinkai

Communications biology 4(1) 571-571 2021年5月13日
The methyltransferase METTL9 mediates pervasive 1-methylhistidine modification in mammalian proteomes.

Erna Davydova, Tadahiro Shimazu, Maren Kirstin Schuhmacher, Magnus E Jakobsson, Hanneke L D M Willemen, Tongri Liu, Anders Moen, Angela Y Y Ho, Jędrzej Małecki, Lisa Schroer …

Nature communications 12(1) 891-891 2021年2月9日
Inhibition of histone methyltransferase G9a attenuates liver cancer initiation by sensitizing DNA-damaged hepatocytes to p53-induced apoptosis.

Takuma Nakatsuka, Keisuke Tateishi, Hiroyuki Kato, Hiroaki Fujiwara, Keisuke Yamamoto, Yotaro Kudo, Hayato Nakagawa, Yasuo Tanaka, Hideaki Ijichi, Tsuneo Ikenoue …

Cell death & disease 12(1) 99-99 2021年1月19日
A cost efficient protocol to introduce epitope tags by CRISPR-Cas9 mediated gene knock-in with asymmetric semi-double stranded template.

Qi Fang, Yoichi Shinkai

MethodsX 8 101365-101365 2021年
The fibronectin type-III (FNIII) domain of ATF7IP contributes to efficient transcriptional silencing mediated by the SETDB1 complex.

Takeshi Tsusaka, Kei Fukuda, Chikako Shimura, Masaki Kato, Yoichi Shinkai

Epigenetics & chromatin 13(1) 52-52 2020年11月30日
H3K9 Demethylases JMJD1A and JMJD1B Control Prospermatogonia to Spermatogonia Transition in Mouse Germline.

Shunsuke Kuroki, Ryo Maeda, Masashi Yano, Satsuki Kitano, Hitoshi Miyachi, Mikiko Fukuda, Yoichi Shinkai, Makoto Tachibana

Stem cell reports 15(2) 424-438 2020年8月11日査読有り
G9a is involved in the regulation of cranial bone formation through activation of Runx2 function during development.

Hisashi Ideno, Kazuhisa Nakashima, Koichiro Komatsu, Ryoko Araki, Masumi Abe, Yoshinori Arai, Hiroshi Kimura, Yoichi Shinkai, Makoto Tachibana, Akira Nifuji

Bone 137 115332-115332 2020年8月査読有り
SETDB1-Mediated Silencing of Retroelements.

Kei Fukuda, Yoichi Shinkai

Viruses 12(6) 2020年5月30日査読有り
Deletion of Histone Methyltransferase G9a Suppresses Mutant Kras-driven Pancreatic Carcinogenesis

HIROYUKI KATO, KEISUKE TATEISHI, HIROAKI FUJIWARA, HIDEAKI IJICHI, KEISUKE YAMAMOTO, TAKUMA NAKATSUKA, MIWAKO KAKIUCHI, MAKOTO SANO, YOTARO KUDO, YOKU HAYAKAWA …

Cancer Genomics - Proteomics 17(6) 695-705 2020年
ATF7IP regulates SETDB1 nuclear localization and increases its ubiquitination.

Takeshi Tsusaka, Chikako Shimura, Yoichi Shinkai

EMBO reports 20(12) e48297 2019年12月5日

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MISC

181

ヘテロクロマチンの核内空間制御におけるクロマチン修飾の役割

福田渓, 志村知古, 志見剛, 木村宏, 眞貝洋一

日本生化学会大会(Web) 95th 2S16e-06 2022年11月
内在性レトロウイルスの活性化機構と自然免疫反応

竹本経緯子, 加藤雅紀, 眞貝洋一

第41回日本分子生物学会年会 2018年11月
Histone Methyltransferase G9a Promotes Hepatocarcinogenesis By Regulating p53 Transactivity during DNA Damage Response

Takuma Nakatsuka, Keisuke Tateishi, Hiroyuki Kato, Hiroaki Fujiwara, Keisuke Yamamoto, Yotaro Kudo, Yasuo Tanaka, Hideaki Ijichi, Yoichi Shinkai, Kazuhiko Koike

HEPATOLOGY 68 1248A-1248A 2018年10月
Targeted re-sequencing of genes involved in H3K9 methylation machinery in autism spectrum disorders reveal a loss of function variant in SUV39H2

Shabeesh Balan, Yoshimi Iwayama, Mikiko Fukuda, Atsuko Shirai, Kaoru Kotoshiba, Motoko Maekawa, Tomoko Toyota, Tetsuo Ohnishi, Manabu Toyoshima, Yoichi Shinkai …

HUMAN GENOMICS 12 2018年3月
Setdb1 による内在性レトロウイルスの制御は体細胞でも続いている

竹本経緯子, 加藤, 雅紀, 眞貝洋一

日本分子生物学会年会 2017年12月
ヒストンメチル化酵素G9aは卵子形成と初期発生を制御する

歐陽允健, Julie Brind'Amour, 波多野裕, Matthew Lorincz, 山縣一夫, 立花誠, 眞貝洋一, 佐々木裕之

第40回日本分子生物学会 2017年12月
H3K9脱メチル化酵素Kdm3aによる肝癌幹細胞の制御機構

中塚拓馬, 立石敬介, 工藤洋太郎, 山本恵介, 中川勇人, 田中康雄, 酒井寿郎, 立花誠, 油谷浩幸, 眞貝洋一 …

エピゲノムはどこまで操れるようになったか第11回日本エピジェネティクス研究会年会プログラム集理研シンポジウム平成29年 2017年
メチル化酵素の新規標的分子の網羅的解析

島津忠広, 五月女宜裕, 袖岡幹子, 眞貝洋一

実験医学別冊エピジェネティクス実験スタンダード: もう悩まない！ゲノム機能制御の読み解き方 379-388 2017年招待有り
Identification of factors involved in provirus silencing by CRISPR-Cas9 system

Kei Fukuda, Kosuke Yusa, Yoichi Shinkai

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 346-346 2016年12月
The histone lysine methyltransferase G9a maintains the transcriptional profile of mature CD8 T cells

Daniel Verbaro, Byungil Kim, Chun Chou, Yoichi Shinkai, Takeshi Egawa

JOURNAL OF IMMUNOLOGY 196 2016年5月
Silencing of endogenous retroviruses (ERVs) mediated by Setdb1

Masaki Kato, Keiko Takemoto, Siok-Lay Tan, Ryoichiro Kageyama, Yoichi Shinkai

GENES & GENETIC SYSTEMS 90(6) 370-370 2015年12月
ヒストンメチル化酵素G9a遺伝子欠損による腱の形成阻害

和田悟史, 出野尚, 島田明美, 上運天太一, 中村芳樹, 中島和久, 木村宏, 眞貝洋一, 立花誠, 二藤彰

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 88回・38回 [3P1000]-[3P1000] 2015年12月
ヒストンメチル化酵素Setdb1は造血幹前駆細胞のエネルギー代謝に必須である

小出周平, 田久保圭誉, 大島基彦, 宮城聡, 更屋敦則, 青山和正, 王長山, 松井啓隆, 木村宏, 眞貝洋一 …

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 88回・38回 [1T25p-15(1P0599)] 2015年12月
HISTONE METHYLTRANSFERASE SETDB1 REGULATES ENERGY METABOLISM IN HEMATOPOIETIC STEM AND PROGENITOR CELLS

Shuhei Koide, Keiyo Takubo, Motohiko Oshima, Satoru Miyagi, Atsunori Saraya, Changshan Wang, Hirotaka Matsui, Hiroshi Kimura, Yoichi Shinkai, Toshio Suda …

EXPERIMENTAL HEMATOLOGY 43(9) S73-S73 2015年9月
Setdb1 is required for germline development and silencing of H3K9me3-marked endogenous retroviruses in primordial germ cells (vol 28, pg 2041, 2014)

Sheng Liu, Julie Brind'Amour, Mohammad M. Karimi, Kenjiro Shirane, Aaron Bogutz, Louis Lefebvre, Hiroyuki Sasaki, Yoichi Shinkai, Matthew C. Lorincz

GENES & DEVELOPMENT 29(1) 108-108 2015年1月
Epigenetic Regulation of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells By the Eset Histone Methyltranferas

Shuhei Koide, Keiyo Takubo, Motohiko Oshima, Satoru Miyagi, Hirotaka Matsui, Hiroshi Kimura, Changshan Wang, George R. Wendt, Shogo Yabata, Yoichi Shinkai …

BLOOD 124(21) 2014年12月
Inhibition of histone H3K9 methyltransferases by gliotoxin and related epipolythiodioxopiperazines (vol 65, pg 263, 2012)

Masanari Takahashi, Yasushi Takemoto, Tadahiro Shimazu, Hisashi Kawasaki, Makoto Tachibana, Yoichi Shinkai, Motoki Takagi, Kazuo Shin-Ya, Yasuhiro Igarashi, Akihiro Ito …

JOURNAL OF ANTIBIOTICS 67(10) 737-738 2014年10月
Proviral silencing in embryonic stem cells requires the histone methyltransferase ESET (vol 464, pg 927, 2010)

Toshiyuki Matsui, Danny Leung, Hiroki Miyashita, Irina A. Maksakova, Hitoshi Miyachi, Hiroshi Kimura, Makoto Tachibana, Matthew C. Lorincz, Yoichi Shinkai

NATURE 513(7516) 128-128 2014年9月
Silencing of endogenous retroviruses (ERVs) mediated by SetDB/Eset

竹本経緯子

RIKEN EPIGENETICS in KOBE 2014年2月
Essential roles of the histone methyltransferase ESET in the epigenetic control of neural progenitor cells during development

Siok Lay Tan, Toshiyuki Matsui, Toshiyuki Ohtsuka, Yoichi Shinkai, Ryoichiro Kageyama

NEUROSCIENCE RESEARCH 71 E65-E65 2011年

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ヘテロクロマチン形成・維持の分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2022年4月 - 2025年3月

眞貝洋一
受精/初期発生の場としての卵管：その生理機能の分子論的検証と臨床応用への基盤構築

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2018年10月 - 2023年3月

荒木慶彦, 小倉淳郎, 眞貝洋一, 藤原浩, 鏡京介
細胞分化にともなうクロマチンポテンシャルの変化とその分子基盤

文部科学省新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年4月 - 2023年3月

眞貝洋一
ヒストンH3K9メチル化修飾による転写抑制の包括的理解

文部科学省科学研究費補助金（基盤研究(A)） 2018年4月 - 2022年3月

眞貝洋一
細胞移植治療に向けた細胞アイデンティティー制御

独立行政法人科学技術振興機構国際科学技術共同研究推進事業（戦略的国際共同研究プログラム） 2013年4月 - 2018年3月

山田泰広
ヒストンリジンメチル化制御系に基づく脳機能の理解と治療戦略への展開

独立行政法人科学技術振興機構戦略的創造研究推進事業 2012年4月 - 2018年3月

眞貝洋一
H3K9メチル化による転写抑制の実体の解明

文部科学省科学研究費補助金（基盤研究(A)） 2014年4月 - 2017年3月

眞貝洋一
エピゲノム変化による肥満・インスリン抵抗性の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2010年4月 - 2016年3月

酒井寿郎, 川村猛, 油谷浩幸, 眞貝洋一, 桜井武
ヒト内在性レトロウイルス発現制御機構の解明

文部科学省科学研究費補助金（基盤研究(B)） 2011年4月 - 2014年3月

眞貝洋一
ヒストンメチル化ダイナミクスの制御と生殖系列での機能

文部科学省科学研究費補助金（特定領域研究） 2008年4月 - 2013年3月

眞貝洋一
ヒストン脱メチル化酵素Jmjd1aによる糖脂質代謝調節

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2009年 - 2012年

稲垣毅, 酒井寿郎, 眞貝洋一, 立花誠, 油谷浩幸, 児玉龍彦, 川村猛, 岡村均, 土居雅夫
蛋白質リジンメチル化のプロテオミクス解析システムの確立

文部科学省科学研究費補助金（挑戦的萌芽研究） 2010年4月 - 2011年3月

眞貝洋一
ヒストンメチル化酵素複合体による転写抑制機構の分子基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2008年 - 2009年

立花誠, 眞貝洋一
細胞の老化と不死化の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2001年 - 2005年

眞貝洋一, 立花誠
エピジェネティックス複合体因子の同定とその機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2002年 - 2003年

加藤宏幸, 真貝洋一
遺伝子改変モデル動物を用いた雌性生殖管の受精時における分子制御機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2002年 - 2003年

荒木慶彦, 眞貝洋一
狂牛病感染しない牛作成のためのプリオン遺伝子欠損牛体細胞株の樹立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2002年 - 2003年

眞貝洋一, 千代豊
哺乳類テロメア維持の新たな分子機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(C) 2000年 - 2000年

真貝洋一, 立花誠
抗原レセプター対立形質排除の破綻したマウスの作製

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 2000年 - 2000年

真貝洋一, 山田秀一
遺伝子改変マウスを用いた卵管特異糖蛋白質の生殖生物学的生理活性の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 1999年 - 2000年

真貝洋一, 武田祐司

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