冨田勝 (Tomita Masaru) - マイポータル

基本情報

所属: 慶應義塾大学環境情報学部教授
: 医学部慶應義塾大学医学部兼担教授
: School of Medicine 慶應義塾大学医学部兼担教授

学位: Ph.D （コンピュータ科学）(カーネギー・メロン大学)
博士（工学）(京都大学)
博士（医学）(慶應義塾)
博士（政策・メディア）(慶應義塾)
Ph.D in Computer Science(Carnegie Mellon University)
Ph.D in Electrical Engineering(Kyoto University)
Ph.D in Molecular Biology(Keio University)
Ph.D in Media and Governance(Keio University)

研究者番号: 60227626
J-GLOBAL ID: 200901058398415287
researchmap会員ID: 1000315028

経歴

2017年4月 - 現在

Spiber 株式会社社外取締役, 社外取締役
2003年7月 - 現在

ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ株式会社創業者,技術顧問, 創業者、技術顧問
2003年7月 - 現在

ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ株式会社取締役
2001年10月 - 現在

大学院政策・メディア研究科学習指導委員
2001年10月 - 現在

大学環境情報学部長補佐
2001年4月 - 現在

大学先端生命科学研究所所長
1997年4月 - 現在

大学教授(環境情報学部)
1994年4月 - 現在

大学院政策・メディア研究科委員
2005年10月 - 2007年9月

大学環境情報学部学部長
2001年10月

大学院政策･ﾒﾃﾞｨｱ研究科学習指導委員
2001年4月 - 2001年9月

大学院政策・メディア研究科学習指導委員
2001年4月 - 2001年9月

大学院政策･ﾒﾃﾞｨｱ研究科学習指導委員
1999年10月 - 2001年9月

大学国際センター副所長
1999年10月 - 2001年9月

大学環境情報学部運営委員
1990年6月 - 1997年3月

大学助教授(環境情報学部)
1994年4月

大学院政策･ﾒﾃﾞｨｱ研究科委員
1987年7月 - 1990年5月

カーネギーメロン大学 ,助教授
1987年7月 - 1990年5月

ｶｰﾈｷﾞｰﾒﾛﾝ大学 ,助教授

学歴

1985年5月

カーネギー・メロン大学, コンピューター科学科
1983年5月

カーネギー・メロン大学, コンピューター科学科
1981年9月 - 1983年5月

カーネギー・メロン大学, コンピューター科学部
1981年3月

慶應義塾, 工学部, (数理工学科)
1976年4月 - 1981年3月

慶應義塾, 工学部, (数理工学科)

委員歴

2012年11月 - 現在

全塾評議員会, 評議員
2012年4月 - 現在

京都大学化学研究所, 客員教授
2011年4月 - 現在

信濃町慶應医学賞, 委員
2011年 - 現在

先端生命科学研究所, 所長
2007年9月 - 現在

スパイバー株式会社, 顧問
2007年5月 - 現在

情報計算化学生物学会（CBI学会）, 役員
2003年7月 - 現在

Human Metabolome Technologies Inc., Director
2001年 - 現在

日本人工知能学会, 評議委員
2001年 - 現在

Special Interest Group of Biological Simulation, Chairman
2001年 - 現在

International Society for Computational Biology, Board of Director
2015年 - 2018年3月

㈱ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ, 技術顧問
2003年4月 - 2004年9月

東京都, 東京都専門委員会
2002年10月 - 2004年9月

理化学研究所, 客員主管研究員
2000年 - 2002年

日本バイオインフォマティクス学会, 評議委員

受賞

2021年10月

第5回バイオインダストリー大賞, システムバイオロジーの先駆的研究とその産業化による地域振興, 一般財団法人バイオインダストリー協会
2019年

第68回河北文化賞, 公益財団法人河北文化事業団
2019年

第68回河北文化賞, 東北の研究施設として最先端の研究成果を上げ、地域産業の活性化に寄与, 公益財団法人河北文化事業団
2017年11月

山形県特別功労賞, 山形県
2017年6月

国際メタボローム学会終身名誉フェロー, 国際メタボローム学会
2016年12月

WIRED Audi INNOVATION AWARD 2016
2016年10月

鶴岡市市政功労者, 山形県鶴岡市
2016年10月

山形県鶴岡市市政功労者, 山形県鶴岡市

慶應義塾大学先端生命科学研究所
2015年

Thomson Reuters Highly Cited Researcher
2014年

大学発ベンチャー表彰特別賞, 科学技術振興機構

慶應義塾大学先端生命科学研究所, スパイバー株式会社
2014年

Award for Academic Startups
2014年

大学発ベンチャー表彰特別賞, 科学技術振興機構
2009年11月

平成21年度福澤賞
2009年11月

福澤賞

冨田勝
2009年11月

福澤賞

冨田勝
2009年9月

国際メタボローム学会功労賞, 国際メタボローム学会
2009年9月

国際メタボローム学会功労賞

冨田勝
2009年9月

国際メタボローム学会功労賞

冨田勝
2007年4月

平成19年度文部科学大臣表彰科学技術賞, 文部科学省
2007年4月

文部科学大臣表彰科学技術賞(2007)

冨田勝

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論文

851

Hao1 Is Not a Pathogenic Factor for Ectopic Ossifications but Functions to Regulate the TCA Cycle In Vivo.

Kimura A, Hirayama A, Matsumoto T, Sato Y, Kobayashi T, Ikeda S, Maruyama M, Kaneko M, Shigeta M, Ito E …

Metabolites 12(1) 82-82 2022年1月15日
Metabolic profiling of charged metabolites in association with menopausal status in Japanese community-dwelling midlife women: Tsuruoka Metabolomic Cohort Study.

Watanabe K, Iida M, Harada S, Kato S, Kuwabara K, Kurihara A, Takeuchi A, Sugiyama D, Okamura T, Suzuki A …

Maturitas 155 54-62 2022年1月
Meta-analysis of transcriptional regulatory networks for lipid metabolism in neural cells from schizophrenia patients based on an open-source intelligence approach.

Okamoto L, Watanabe S, Deno S, Nie X, Maruyama J, Tomita M, Hatano A, Yugi K

Neuroscience research 175 82-97 2021年12月31日
Decoding gut microbiota by imaging analysis of fecal samples.

Furusawa C, Tanabe K, Ishii C, Kagata N, Tomita M, Fukuda S

iScience 24(12) 103481-103481 2021年12月17日
TGF-β-dependent reprogramming of amino acid metabolism induces epithelial–mesenchymal transition in non-small cell lung cancers

Nakasuka F, Tabata S, Sakamoto T, Hirayama A, Ebi H, Yamada T, Umetsu K, Ohishi M, Ueno A, Goto H …

Communications Biology 4(1) 2021年12月
Reprogramming of glutamine metabolism via glutamine synthetase silencing induces cisplatin resistance in A2780 ovarian cancer cells

Guo J, Satoh K, Tabata S, Mori M, Tomita M, Soga T

BMC Cancer 21(1) 174-174 2021年12月
Reliability of urinary charged metabolite concentrations in a large-scale cohort study using capillary electrophoresis-mass spectrometry

Ishibashi Y, Harada S, Takeuchi A, Iida M, Kurihara A, Kato S, Kuwabara K, Hirata A, Shibuki T, Okamura T …

Scientific Reports 11(1) 2021年12月
Multiomics study of a heterotardigrade, Echinisicus testudo, suggests the possibility of convergent evolution of abundant heat-soluble proteins in Tardigrada.

Murai Y, Yagi-Utsumi M, Fujiwara M, Tanaka S, Tomita M, Kato K, Arakawa K

BMC genomics 22(1) 813 2021年11月11日
The evidence of temporary social parasitism by Polyrhachis lamellidens (Hymenoptera, Formicidae) in a Camponotus obscuripes colony (Hymenoptera, Formicidae)

Iwai H, Kurihara Y, Kono N, Tomita M, Arakawa K

Insectes Sociaux 68(4) 375-382 2021年11月
Urinary metabolome analyses of patients with acute kidney injury using capillary electrophoresis-mass spectrometry

Saito R, Hirayama A, Akiba A, Kamei Y, Kato Y, Ikeda S, Kwan B, Pu M, Natarajan L, Shinjo H …

Metabolites 11(10) 2021年10月
Multicomponent nature underlies the extraordinary mechanical properties of spider dragline silk

Kono N, Nakamura H, Mori M, Yoshida Y, Ohtoshi R, Malay A.D, Pedrazzoli Moran D.A, Tomita M, Numata K, Arakawa K

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118(31) e2107065118-e2107065118 2021年8月3日
RNA sequencing data for gamma radiation response in the extremotolerant tardigrade Ramazzottius varieornatus.

Yoshida Y, Horikawa DD, Sakashita T, Yokota Y, Kobayashi Y, Tomita M, Arakawa K

Data in brief 36 107111 2021年6月
Quality assessment of untargeted analytical data in a large-scale metabolomic study

Saito R, Sugimoto M, Hirayama A, Soga T, Tomita M, Takebayashi T

Journal of Clinical Medicine 10(9) 1826-1826 2021年5月1日
A metabolomic profile predictive of new osteoporosis or sarcopenia development

Miyamoto K, Hirayama A, Sato Y, Ikeda S, Maruyama M, Soga T, Tomita M, Nakamura M, Matsumoto M, Yoshimura N …

Metabolites 11(5) 2021年5月
Erratum: Charged metabolite biomarkers of food intake assessed via plasma metabolomics in a population-based observational study in Japan (PLoS ONE (2021) 16:2 (e0246456) DOI: 10.1371/journal.pone.0246456)

Shibutami E, Ishii R, Harada S, Kurihara A, Kuwabara K, Kato S, Iida M, Akiyama M, Sugiyama D, Hirayama A …

PLoS ONE 16(4 April) e0250864 2021年4月
Xanthurenic acid is the main pigment of trichonephila clavata gold dragline silk

Fujiwara M, Kono N, Hirayama A, Malay A.D, Nakamura H, Ohtoshi R, Numata K, Tomita M, Arakawa K

Biomolecules 11(4) 2021年4月
Metabolomic analysis of small extracellular vesicles derived from pancreatic cancer cells cultured under normoxia and hypoxia

Hayasaka R, Tabata S, Hasebe M, Ikeda S, Ohnuma S, Mori M, Soga T, Tomita M, Hirayama A

Metabolites 11(4) 2021年4月
Upregulation of Thymidylate Synthase Induces Pemetrexed Resistance in Malignant Pleural Mesothelioma.

Sato Y, Tomita M, Soga T, Ochiai A, Makinoshima H

Frontiers in pharmacology 12 718675-718675 2021年
Quantitative and Molecular Similarity Analyses of the Metabolites of Cold- A nd Hot-Natured Chinese Herbs

Guo J, Wang J, Iino K, Tomita M, Soga T

Evidence-based Complementary and Alternative Medicine 2021 6646507 2021年
Relationship between standard uptake values of positron emission tomography/computed tomography and salivary metabolites in oral cancer: A pilot study

Ishikawa S, Hiraka T, Kirii K, Sugimoto M, Shimamoto H, Sugano A, Kitabatake K, Toyoguchi Y, Kanoto M, Nemoto K …

Journal of Clinical Medicine 9(12) 1-8 2020年12月

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MISC

Publisher Correction: Base editors for simultaneous introduction of C-to-T and A-to-G mutations (Nature Biotechnology, (2020), 38, 7, (865-869), 10.1038/s41587-020-0509-0)

Sakata R.C, Ishiguro S, Mori H, Tanaka M, Tatsuno K, Ueda H, Yamamoto S, Seki M, Masuyama N, Nishida K …

Nature Biotechnology 38(7) 901 2020年7月1日
Detecting A-to-I RNA editing in RNA-Seq data

Galipon Josephine(ガリポン・ジョセフィーヌ, 石黒宗, 富田勝, 程久美子

NGS Professional シリーズRNA-Seqマスターブック 2016年4月
Detecting A-to-I RNA editing in RNA-Seq data

Galipon Josephine(ガリポン・ジョセフィーヌ, 石黒宗, 富田勝, 程久美子

NGS Professional シリーズRNA-Seqマスターブック 2016年4月
The application of omics technologies in the functional evaluation of inulin and inulin-containing prebiotics dietary supplementation

M. Tsurumaki, M. Kotake, M. Iwasaki, M. Saito, K. Tanaka, W. Aw, S. Fukuda, M. Tomita

NUTRITION & DIABETES 5 e185 2015年11月
Erratum: Commensal microbe-derived butyrate induces the differentiation of colonic regulatory T cells (Nature (2013) 504 (446-450) DOI: 10.1038/nature12721)

Furusawa Y, Obata Y, Fukuda S, Endo T.A, Nakato G, Takahashi D, Nakanishi Y, Uetake C, Kato K, Kato T …

Nature 506(7487) 2014年2月20日
Erratum: Gene expression waves. Cell cycle independent collective dynamics in cultured cells (FEBS Journal (2007) 274 (2878-2886))

Tsuchyia M, Wong S, Yeo Z, Colosimo A, Palumbo M, Farina L, Crescenzi M, Mazzola A, Negri R, Bianchi M …

FEBS Journal 274(12) 2007年6月
Overview

Tomita M

Metabolomics: The Frontier of Systems Biology 1-6 2005年
Preface

Tomita M, Nishioka T

Metabolomics: The Frontier of Systems Biology 2005年

書籍等出版物

High-quality overlapping paired-end reads for the detection of A-to-I editing on small RNA

Galipon J, Ishii R, Ishiguro S, Suzuki Y, Kondo S, Okada-Hatakeyama M, Tomita M, Ui-Tei K

Methods in Molecular Biology 2018年
Advances in Systems Immunology and Cancer

Tomita, M, Selvarajoo, K, Tsuchiya, M

Frontiers 2014年
E-Cell System : Basic Concepts and Applications

Satya Nanda Vel ArjunanPawan, K. DharMasaru Tomita (担当:共著)

Springer 2013年
E-Cell System : Basic Concepts and Applications.

冨田勝 (担当:共著)

Springer 2013年
Metabolomics: A new omics technology for traditional herbal medicine analysis

Iino K, Sugimoto M, Soga T, Tomita M

Chinese Medicine: Acupuncture, Herbal Medicine and Therapies 2012年3月 (ISBN: 9781620815298)
Metabolomics: A new paradigm for cancer biomarker discovery

Sugimoto M, Soga T, Tomita M

Cancer Biomarkers 2011年12月 (ISBN: 9781617613029)
Salivary metabolomics for oral cancer detection

Sugimoto M, Wong D, Soga T, Tomita M

Oral Cancer: Causes, Diagnosis and Treatment 2011年4月 (ISBN: 9781612093055)
Multi-omics data-driven systems biology of E. coli

Ishii N, Tomita M

Systems Biology and Biotechnology of Escherichia coli 2009年12月 (ISBN: 9781402093937)
In silico models for metabolic systems

Selvarajoo K, Vel Arjunan S.N, Tomita M

The Metabolic Pathway Engineering Handbook: Tools and Applications 2009年1月1日 (ISBN: 9781420077650)
Metabolomics-A Powerful Tool in Systems Biology-(vol.18)

Martin, R, Soga, T, Tomita, M (担当:共著, 範囲:189-234)

Springer 2007年
最新医学臨床遺伝子学’07－ゲノム科学の臨床へのインパクト―

曽我朋義, 大橋由明, 冨田勝 (担当:共著, 範囲:56-63,)

最新医学社 2007年
バイオインフォマティクス事典

櫻田剛史, 冨田勝

共立出版 2006年
バイオインフォマティクスの基礎 : ゲノム解析プログラミングを中心に

斎藤輪太郎, 冨田勝

サイエンス社 2005年
ここまで進んだゲノム医科学と疾患研究

大岸治行, 曽我朋義, 冨田勝 (担当:共著)

羊土社 2005年
The genome-based E-cell modeling (GEM) system

Arakawa K, Yamada Y, Shinoda K, Nakayama Y, Tomita M

Metabolomics: The Frontier of Systems Biology 2005年 (ISBN: 9784431251217)
「ここまで進んだゲノム医科学と疾患研究」

大岸治行, 曽我朋義, 冨田勝 (担当:共著)

羊土社 2005年
Metabolomics: The frontier of systems biology

Tomita M, Nishioka T (担当:共著)

Springer 2005年 (ISBN: 4431251219)
ゲノムミクス・プロテオミクスの新展開

柚木克之, 冨田勝 (担当:共著, 範囲:920-929)

株式会社エヌ・ティー・エス 2004年
メタボローム研究の最前線

冨田勝, 西岡孝明編

シュプリンガー・フェアラーク東京 2003年11月30日
『メタボローム研究の最前線』 (SPRINGER REVIEWS)

冨田勝, 西岡孝明編

シュプリンガー・フェアラーク東京 2003年11月30日

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講演・口頭発表等

985

ラクトフェリンはダニ抽出液で誘導したアトピー性皮膚炎様症状を軽減し,脾臓由来細胞のIL‐17産生を抑制する

冨田勝, 森下聡, 尾林裕子, 小野知二, 村越倫明, 森下聡, 小野知二, 村越倫明, 村越倫明, 岡田直子, 松本健治, 福田真嗣, 藤島浩

日本フードファクター学会学術集会 2017年12月2日
越冬時における赤カブ‘温海かぶ’の胚軸の成分プロファイルの変化

冨田勝

第11回メタボロームシンポジウム 2017年11月13日
Euglena gracilisの葉緑体欠損変異株の遺伝子発現変動解析

冨田勝

生命情報科学若手の会第9回研究会 2017年10月6日
配列類似性ネットワークに基づくHIV-1 Pol上のサブタイプ分化と対応する領域の解析

冨田勝

生命情報科学若手の会第9回研究会 2017年10月6日
修復関連タンパクを用いたハイスループット変異検出手法の開発

冨田勝

生命情報科学若手の会第9回研究会 2017年10月6日
Euglena gracilisの葉緑体欠損変異株の遺伝子発現変動解析

冨田勝

生命情報科学若手の会第9回研究会 2017年10月6日
Genome analysis of Tepidibacillus sp. HK-1: an arsenic-metabolizing bacterium.

冨田勝

第６回生命医薬情報学連合大会 2017年9月27日
Microbial communities of university campuses in Japan.

冨田勝

第６回生命医薬情報学連合大会 2017年9月27日
ゲノム解析によって明らかとなったクマムシの乾眠機構と系統関係

冨田勝

日本動物学会第88回富山大会 2017 2017年9月22日
イネ葉身の登熟期間における代謝変化

冨田勝

日本作物学会第244回講演会 2017年9月14日岐阜大学応用生物科学部
イネ葉身の登熟期間における代謝変化

冨田勝, 北吉朗, 若山正隆, 門脇里恵, 鶴巻萌, 曽我朋義, 阿部洋平

日本作物学会講演会 2017年9月13日
Evaluation of various pre-treatments for seaweed metabolomics

冨田勝

日本植物学会第81回大会 2017年9月8日
緑藻類モデル生物 Chlamydomonas reinhardtii と近縁株の系統解析

冨田勝

日本植物学会第81回大会 2017年9月8日
緑藻類モデル生物Chlamydomonas reinhardtiiと近縁株の系統解析

冨田勝, 土田雄大, 仲田崇志

日本植物学会大会 2017年9月1日
有穀藻類ファコツス科に近縁な新規クラミドモナス類(緑藻類,オオヒゲマワリ目)

冨田勝, 仲田崇志

日本植物学会大会 2017年9月1日
Evaluation of various pretreatments for seaweed metabolomics

冨田勝

日本植物学会大会 2017年9月1日
米ぬか摂取による大腸炎抑制機構の解明

冨田勝

慶應ライフサイエンスシンポジウム 2017年8月28日
大腸菌熱ストレス回復時におけるオミクス解析: 熱ショック受容後に各タンパク質群が差時的に発現し機能することで回復期に向かう

冨田勝

慶應ライフサイエンスシンポジウム 2017年8月28日
Pre-tRNAスプライシングに関わるClp1タンパク質の大規模分子進化解析

冨田勝

慶應ライフサイエンスシンポジウム 2017年8月28日
バクテリアにおけるグループⅡイントロンの大規模進化解析

冨田勝

慶應ライフサイエンスシンポジウム 2017年8月28日

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

追悼父・冨田勲は親バカでした

2016年7月その他
2002年度研究活動による受賞 ISMB Best Poster Award

冨田勝

2002年11月25日その他
2002年度研究活動による受賞第16回日本IBM科学賞

冨田勝

2002年8月8日その他

共同研究・競争的資金等の研究課題

「先端生命科学」

山形県研究教育補助金第２期 2006年 - 2010年
「In vivoヒト代謝システム生物学拠点」

グローバルCOEプログラム 2007年 - 2009年
「メタボローム解析のための計測技術開発とそれを用いた代謝経路推定」

科研費・特定領域研究「生命システム情報」公募研究A02 2006年 - 2009年
「システムバイオロジーのためのモデリング・シミュレーション環境の構築」

戦略的創造研究推進事業（CREST）「シミュレ-ション技術の革新と実用化基盤の構築」研究領域 2004年 - 2009年
「システム生物学による生命機能の理解と制御」

２１世紀ＣＯＥプログラム（生命科学分野） 2005年 - 2007年
「細胞モデリング技術の開発」

産業技術振興費（NEDO）・生物機能活用型循環産業システム創造プログラム・生物機能を活用した生産プロセスの基盤技術 2001年 - 2005年
「先端生命科学」

山形県研究教育補助金第１期 2001年 - 2005年
「細菌細胞のコンピュータシミュレーション」

科研費・特定領域研究（２）「細胞システムの情報学的構築に向けた研究」計画研究A02 2003年 - 2004年
「イネゲノム非コード配列中の遺伝子制御情報の抽出」

イネ・ゲノムシミュレーターの開発（独・農業生物資源研究所） 2001年 - 2003年
「e-Rice」イネ個体シミュレーションモデル構築とそのソフトウェア基盤の開発」

イネ・ゲノムシミュレーターの開発（独・農業生物資源研究所） 2001年 - 2003年
「Ｅ－ＣＥＬＬ：ゲノム情報に基づく細胞の再構築」

ACT-JST計算科学技術活用型特定研究開発推進事業 1998年 - 2001年
"Artificial Intelligence and Natural Language Processing"

National Science Foundation (USA) 1988年 - 1993年

社会貢献活動

山形ブランド特命大使

その他

2016年3月 - 現在
経産省・産業構造審議会商務流通情報分科会バイオ小委員会

その他

2016年3月 - 現在
横浜市立横浜サイエンスフロンティア高等学校科学技術顧問

その他

2013年4月 - 現在
鶴岡ふるさと観光大使

その他

2010年4月 - 現在
㈱ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ

その他

2003年7月 - 現在
理化学研究所環境資源科学研究センター

その他

2002年10月 - 2018年3月
特定非営利活動法人全脳アーキテクチャ・イニシアティブ顧問

その他

2015年9月 - 2017年6月
東京都

その他

2003年4月 - 2004年9月

その他

(No title)

2015年5月 - 2015年5月

KAUST Computational Bioscience Research Center Scientific Advisory Board Meeting (Jeddah, Saudi Arabia) にて座長を務める
KAUST Computational Bioscience Research Center Scientific Advisory Board Meeting (Jeddah, Saudi Arabia) にて座長を務める

2015年5月 - 2015年5月