本田信治 (Shinji HONDA) - マイポータル

基本情報

所属: 福井大学学術研究院医学系部門看護学領域准教授

研究者番号: 90632167
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-1584-4156
J-GLOBAL ID: 200901037722072331
researchmap会員ID: 1000325711

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 遺伝学 /

経歴

2023年4月 - 現在

福井大学, 学術研究院医学系部門基盤看護学分野生命基礎科学領域, 准教授（主任教員）
2016年4月 - 2023年3月

福井大学, 生命情報医科学講座染色体機能学, 助教（主任教員）
2012年6月 - 2016年3月

福井大学, テニュアトラック推進本部, 助教（テニュアトラック教員）
2012年4月 - 2012年5月

福井大学, テニュアトラック推進本部, 特命助教（テニュアトラック教員）
2011年 - 2012年

オレゴン大学, 分子生物学研究所, Research Associate
2011年 - 2012年

Department of Biology and Institute of Molecular Biology, University of Oregon, Research Associate
2005年 - 2011年

オレゴン大学, 分子生物学研究所, Postdoctoral fellow
2005年 - 2011年

Department of Biology and Institute of Molecular Biology, University of Oregon, Postdoctoral fellow
2006年

財団法人上原記念生命科学財団
2003年 - 2005年

日本学術振興会, 特別研究員
2001年 - 2003年

東京工業大学, 生命理工学研究科, Research Assistant
1999年 - 2001年

東京工業大学, 生命理工学研究科, Teaching Assistant

学歴

2001年4月 - 2004年3月

東京工業大学, 生命理工学研究科, 生体システム専攻
1999年4月 - 2001年3月

東京工業大学, 生命理工学研究科, バイオサイエンス専攻
1995年4月 - 1999年3月

東京工業大学, 生命理工学部, 生体機構学科

受賞

2014年

文部科学大臣表彰若手科学者賞

本田信治
2010年

Perkins fund award

本田信治

論文

RNA Editing of Genomic Neighbors Controls Antiviral Response in Fungi

Shinji Honda, Ayumi Yokoyama, Nobuhiro Suzuki

2023年4月筆頭著者責任著者
255

Establishment of Neurospora crassa as a model organism for fungal virology.

Shinji Honda, Ana Eusebio-Cope, Shuhei Miyashita, Ayumi Yokoyama, Annisa Aulia, Sabitree Shahi, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

Nature communications 11(1) 5627-5627 2020年11月6日査読有り筆頭著者
LSD1 prevents aberrant heterochromatin formation in Neurospora crassa.

William K Storck, Vincent T Bicocca, Michael R Rountree, Shinji Honda, Tereza Ormsby, Eric U Selker

Nucleic acids research 48(18) 10199-10210 2020年10月9日査読有り
Normal Patterns of Histone H3K27 Methylation Require the Histone Variant H2A.Z in Neurospora crassa.

Abigail J Courtney, Masayuki Kamei, Aileen R Ferraro, Kexin Gai, Qun He, Shinji Honda, Zachary A Lewis

Genetics 216(1) 51-66 2020年9月査読有り
129

Nucleosome Positioning by an Evolutionarily Conserved Chromatin Remodeler Prevents Aberrant DNA Methylation in Neurospora

Klocko AD, Uesaka M, Ormsby T, Rountree MR, Wiles ET, Adhvaryu KK, Honda S, Selker EU

Genetics 211(2) 563-578 2019年2月査読有り
179

ASH1-catalyzed H3K36 methylation drives gene repression and marks H3K27me2/3-competent chromatin

Bicocca VT, Ormsby T, Adhvaryu KK, Honda S, Selker EU

Elife 7 e41497 2018年11月査読有り
Telomere repeats induce domains of H3K27 methylation in Neurospora

Kirsty Jamieson, Kevin J. McNaught, Tereza Ormsby, Neena A. Leggett, Shinji Honda, Eric U. Selker

eLife 7 e31216 2018年1月3日査読有り
Normal chromosome conformation depends on subtelomeric facultative heterochromatin in Neurospora crassa

Andrew D. Klocko, Tereza Ormsby, Jonathan M. Galazka, Neena A. Leggett, Miki Uesaka, Shinji Honda, Michael Freitag, Eric U. Selker

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 113(52) 15048-15053 2016年12月査読有り
Dual chromatin recognition by the histone deacetylase complex HCHC is required for proper DNA methylation in Neurospora crassa

Shinji Honda, Vincent T. Bicocca, Jordan D. Gessaman, Michael R. Rountree, Ayumi Yokoyama, Eun Y. Yu, Jeanne M. L. Selker, Eric U. Selker

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 113(41) E6135-E6144 2016年10月査読有り
Neurospora chromosomes are organized by blocks of importin alpha-dependent heterochromatin that are largely independent of H3K9me3

Jonathan M. Galazka, Andrew D. Klocko, Miki Uesaka, Shinji Honda, Eric U. Selker, Michael Freitag

GENOME RESEARCH 26(8) 1069-1080 2016年8月査読有り
The Cullin-4 Complex DCDC Does Not Require E3 Ubiquitin Ligase Elements To Control Heterochromatin in Neurospora crassa

Keyur K. Adhvaryu, Jordan D. Gessaman, Shinji Honda, Zachary A. Lewis, Paula L. Grisafi, Eric U. Selker

EUKARYOTIC CELL 14(1) 25-28 2015年1月査読有り
The common ancestral core of vertebrate and fungal telomerase RNAs

Xiaodong Qi, Yang Li, Shinji Honda, Steve Hoffmann, Manja Marz, Axel Mosig, Joshua D. Podlevsky, Peter F. Stadler, Eric U. Selker, Julian J. -L. Chen

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 41(1) 450-462 2013年1月
Heterochromatin protein 1 forms distinct complexes to direct histone deacetylation and DNA methylation

Shinji Honda, Zachary A. Lewis, Kenji Shimada, Wolfgang Fischle, Ragna Sack, Eric U. Selker

NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY 19(5) 471-U24 2012年5月
DNA Methylation and Normal Chromosome Behavior in Neurospora Depend on Five Components of a Histone Methyltransferase Complex, DCDC

Zachary A. Lewis, Keyur K. Adhvaryu, Shinji Honda, Anthony L. Shiver, Marijn Knip, Ragna Sack, Eric U. Selker

PLOS GENETICS 6(11) e1001196 2010年11月
Identification of DIM-7, a protein required to target the DIM-5 H3 methyltransferase to chromatin

Zachary A. Lewis, Keyur K. Adhvaryu, Shinji Honda, Anthony L. Shiver, Eric U. Selker

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 107(18) 8310-8315 2010年5月
The DMM complex prevents spreading of DNA methylation from transposons to nearby genes in Neurospora crassa

Shinji Honda, Zachary A. Lewis, Maite Huarte, Lucy Y. Cho, Larry L. David, Yang Shi, Eric U. Selker

GENES & DEVELOPMENT 24(5) 443-454 2010年3月
Tools for Fungal Proteomics: Multifunctional Neurospora Vectors for Gene Replacement, Protein Expression and Protein Purification

Shinji Honda, Eric U. Selker

GENETICS 182(1) 11-23 2009年5月
A Novel Potential Role for Gametogenetin-Binding Protein 1 (GGNBP1) in Mitochondrial Morphogenesis During Spermatogenesis in Mice

Takeshi Aihara, Nobuhiro Nakamura, Shinji Honda, Shigehisa Hirose

BIOLOGY OF REPRODUCTION 80(4) 762-770 2009年4月
Relics of repeat-induced point mutation direct heterochromatin formation in Neurospora crassa

Zachary A. Lewis, Shinji Honda, Tamir K. Khlafallah, Jennifer K. Jeffress, Michael Freitag, Fabio Mohn, Dirk Schuebeler, Eric U. Selker

GENOME RESEARCH 19(3) 427-437 2009年3月
Direct interaction between DNA methyltransferase DIM-2 and HP1 is required for DNA methylation in Neurospora crassa

Shinji Honda, Eric U. Selker

MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY 28(19) 6044-6055 2008年10月