柴田武彦 (Takehiko Shibata) - マイポータル

基本情報

所属: 首都大学東京理学研究科分子物質科学専攻客員教授
: 特定国立研究開発法人理化学研究所名誉研究員

学位: 理学博士(東京大学)

J-GLOBAL ID: 200901082161277392
researchmap会員ID: 5000001336

外部リンク: http://www.riken.go.jp/r-world/research/lab/wako/shibata/index.html

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研究分野

経歴

2013年 - 現在

横浜市立大学, 大学院医科学研究科構造エピゲノム科学研究室, 客員研究員
2005年 - 現在

理化学研究所, 名誉研究員
2014年 - 2015年

理化学研究所, 環境資源科学研究センター先進機能触媒研究グループ, 嘱託職員
2015年

現職
2010年 - 2014年

独立行政法人理化学研究所, 遺伝制御科学特別研究ユニット, ユニットﾘｰﾀﾞｰ
2001年 - 2013年

横浜市立大学客員教授
2005年 - 2010年

独立行政法人理化学研究所, 中央研究所, 上席研究員
2010年

特定国立研究開発法人理化学研究所
1986年 - 2005年

理化学研究所主任研究員
1986年 - 2005年

特定国立研究開発法人理化学研究所
2005年

特定国立研究開発法人理化学研究所
1998年 - 2003年

JST戦略的基礎研究推進事業「ゲノムの構造と機能」研究代表者
1989年 - 2002年

埼玉大学客員教授
1989年 - 2001年

Saitama University, Visiting Professor
2001年

横浜市立大学
1977年 - 1980年

エール大学研究員(兼任)
1977年

Yale Medical School Research Scientist
1974年

理化学研究所研究員
1974年

特定国立研究開発法人理化学研究所

学歴

受賞

1983 農芸化学奨励賞

論文

Nonfilament-forming RecA dimer catalyzes homologous joint formation

Shinohara, T, Arai, N, Iikura, Y, Kasagi, M, Masuda-Ozawa, T, Yamaguchi, Y, Suzuki-Nagata, K, Shibata, T, Mikawa, T

Nucleic Acids Research Online 2018年10月査読有り
Phenotypic diversification by enhanced genome restructuring after induction of multiple DNA double-strand breaks.

Muramoto, N, Oda, A, Tanaka, H, Nakamura, T, Kugou, K, Suda, K, Kobayashi, A, Yoneda, S, Ikeuchi, A, Sugimoto, H …

Nature Communications 9 1995 2018年5月査読有り
Rad51 and RecA juxtapose dsDNA ends ready for DNA ligase-catalyzed end-joining under recombinase-suppressive conditions

Naoto Konomura, Naoto Arai, Takeshi Shinohara, Jun Kobayashi, Wakana Iwasaki, Shukuko Ikawa, Kohji Kusano, Takehiko Shibata

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 45(1) 337-352 2017年1月査読有り
Reactive oxygen species stimulate mitochondrial allele segregation toward homoplasmy in human cells

Feng Ling, Rong Niu, Hideyuki Hatakeyama, Yu-ichi Goto, Takehiko Shibata, Minoru Yoshida

MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL 27(10) 1684-1693 2016年5月査読有り
Loop L1 governs the DNA-binding specificity and order for RecA-catalyzed reactions in homologous recombination and DNA repair

Takeshi Shinohara, Shukuko Ikawa, Wakana Iwasaki, Toshiki Hiraki, Takaaki Hikima, Tsutomu Mikawa, Naoto Arai, Nobuo Kamiya, Takehiko Shibata

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 43(2) 973-986 2015年1月査読有り
Functional analyses of the C-terminal half of the Saccharomyces cerevisiae Rad52 protein

Wataru Kagawa, Naoto Arai, Yuichi Ichikawa, Kengo Saito, Shusei Sugiyama, Mika Saotome, Takehiko Shibata, Hitoshi Kurumizaka

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 42(2) 941-951 2014年1月査読有り
A visible assay for meiotic homologous recombination in pollens of rice

Yoshinori Shingu, Yasuko Kanno, Takeshi Tokai, Takehiko Shibata, Kyo Wakasa

PLANT BIOTECHNOLOGY 31(1) 55-+ 2014年査読有り
Putative antirecombinase Srs2 DNA helicase promotes noncrossover homologous recombination avoiding loss of heterozygosity

Tohru Miura, Takehiko Shibata, Kohji Kusano

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 110(40) 16067-16072 2013年10月査読有り
Homologous Pairing Activities of Two Rice RAD51 Proteins, RAD51A1 and RAD51A2

Yuichi Morozumi, Ryohei Ino, Shukuko Ikawa, Naozumi Mimida, Takeshi Shimizu, Seiichi Toki, Hiroaki Ichikawa, Takehiko Shibata, Hitoshi Kurumizaka

PLOS ONE 8(10) e75451 2013年10月査読有り
Din7 and Mhr1 expression levels regulate double-strand-break-induced replication and recombination of mtDNA at ori5 in yeast

Feng Ling, Akiko Hori, Ayako Yoshitani, Rong Niu, Minoru Yoshida, Takehiko Shibata

Nucleic Acids Research 41(11) 5799-5816 2013年6月査読有り
Contribution of histone N-terminal tails to the structure and stability of nucleosomes

Wakana Iwasaki, Yuta Miya, Naoki Horikoshi, Akihisa Osakabe, Hiroyuki Taguchi, Hiroaki Tachiwana, Takehiko Shibata, Wataru Kagawa, Hitoshi Kurumizaka

FEBS OPEN BIO 3 363-369 2013年査読有り
The double-stranded break-forming activity of plant SPO11s and a novel rice SPO11 revealed by a Drosophila bioassay

Yoshinori Shingu, Takeshi Tokai, Yasuo Agawa, Kentaro Toyota, Selina Ahamed, Makiko Kawagishi-Kobayashi, Akira Komatsu, Tsutomu Mikawa, Masa-Toshi Yamamoto, Kyo Wakasa …

BMC MOLECULAR BIOLOGY 13 1 2012年1月査読有り
Comprehensive Structural Analysis of Mutant Nucleosomes Containing Lysine to Glutamine (KQ) Substitutions in the H3 and H4 Histone-Fold Domains

Wakana Iwasaki, Hiroaki Tachiwana, Koichiro Kawaguchi, Takehiko Shibata, Wataru Kagawa, Hitoshi Kurumizaka

BIOCHEMISTRY 50(36) 7822-7832 2011年9月査読有り
Vital Roles of the Second DNA-binding Site of Rad52 Protein in Yeast Homologous Recombination

Naoto Arai, Wataru Kagawa, Kengo Saito, Yoshinori Shingu, Tsutomu Mikawa, Hitoshi Kurumizaka, Takehiko Shibata

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 286(20) 17607-17617 2011年5月査読有り
Enlightenment of Yeast Mitochondrial Homoplasmy: Diversified Roles of Gene Conversion

Feng Ling, Tsutomu Mikawa, Takehiko Shibata

GENES 2(1) 169-190 2011年3月査読有り
A Mechanism for Single-stranded DNA-binding Protein (SSB) Displacement from Single-stranded DNA upon SSB-RecO Interaction

Jin Inoue, Takayuki Nagae, Masaki Mishima, Yutaka Ito, Takehiko Shibata, Tsutomu Mikawa

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 286(8) 6720-6732 2011年2月査読有り
Single-stranded DNA catenation mediated by human EVL and a type I topoisomerase

Motoki Takaku, Daisuke Takahashi, Shinichi Machida, Hiroyuki Ueno, Noriko Hosoya, Shukuko Ikawa, Kiyoshi Miyagawa, Takehiko Shibata, Hitoshi Kurumizaka

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 38(21) 7579-7586 2010年11月査読有り
GEMIN2 promotes accumulation of RAD51 at double-strand breaks in homologous recombination

Yoshimasa Takizawa, Yong Qing, Motoki Takaku, Takako Ishida, Yuichi Morozumi, Takashi Tsujita, Toshiaki Kogame, Kouji Hirota, Masayuki Takahashi, Takehiko Shibata …

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 38(15) 5059-5074 2010年8月査読有り
A DNA-binding surface of SPO11-1, an Arabidopsis SPO11 orthologue required for normal meiosis

Yoshinori Shingu, Tsutomu Mikawa, Mariko Onuma, Takashi Hirayama, Takehiko Shibata

FEBS JOURNAL 277(10) 2360-2374 2010年5月
Analysis of DNA-binding sites on Mhr1, a yeast mitochondrial ATP-independent homologous pairing protein

Tokiha Masuda, Feng Ling, Takehiko Shibata, Tsutomu Mikawa

FEBS JOURNAL 277(6) 1440-1452 2010年3月査読有り

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MISC

Homologous-pairing, and ring- and filament-structure formation activities of the human Xrcc2-Rad51D complex–

J. Biol. Chem.Ì 277(16) 14315-14320 2002年4月
Counteracting regulation of chromatin remodeling at a fission yeast CRE-related recombination hotspot by SAPK, cAMP-dependent kinase, and meiosis regulators

Genetics 159, 1467-1478 2001年
A mutation in a mitochondrial ABC transporter results in mitochondrial dysfunction through oxidative damage of mitochondrial DNA

H. Senbongi, F. Ling, T. Shibata

Molecular and General Genetics 262(3) 426-436 1999年
DNAはどのようにして相同部位を認識し、鎖を交換するか？―相同検索、鎖交換反応のDNA分子構造模型―

蛋白質核酸酵素, 44, 631-342 (1999)
細胞エネルギー供給の知られざる裏方：ミトコンドリアゲノムの安定性を支配するDNA組換え

化学と生物, 34, 643―651 (1996)
相同組換えに特異的なDNA-タンパク質複合体の立体構造

バイオサイエンスとインダストリー, 57, 810-813 (1999)
Site-specific deoxyribonucleases in Bacillus subtilis and other Bacillus strains.

J. Bacteriol., 128, 473-476 (1976)
Roles of processive unwinding in recombination reactions promoted by recA protein of Escherichia coli : a study using a monoclonal antibody

Cold Spring Harbor Symp Quant Biol., 49, 541-551 (1984)
A subunit of yeast site-specific endonuclease SceI is a mitochondrial version of the 70-kDa heat shock protein

J. Biol. Chem., 265, 15189-15197 (1990)
Probing the activation stage of the recA protein by monoclonal IgGs during the pairing of homologous DNA molecules.

J. Biol. Chem., 265, 8957-8965 (1990)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

相同組換え開始とその制御の機構についての遺伝学、生化学、構造生物学

科学研究費補助金 2010年
相同DNA組換え制御技術・標的組換え技術の実現

新技術・新分野創出のための基礎研究推進事業 2004年
相同DNA組換えのミトコンドリアでの機能を明らかにする
The developments of new genome technology using controlled homologous recombination
Biochemical and structural biological studies on the regulation of partner selection and consequence of homologous recombination.
Genetic, biochemical and structural biological studies on the molecular mechanisms of the initiation of homologous recombination

産業財産権

特許第5777081号ヘテロプラスミー細胞をホモプラスミー化する方法

凌楓, 柴田武彦, 牛栄, 吉田稔, 後藤雄一
特許第5441022号 DNA結合能をもつ高等植物のSpo11類縁タンパク質の調製法

新宮良宣, 美川務, 柴田武彦
特許第5319863号体細胞相同組換えの誘発方法

太田邦史, 瀬尾秀宗, 柴田武彦
特許第5051423号改変型の耐熱性RecAタンパク質、及び該タンパク質を用いた核酸増幅方法

重森康司, 美川務, 柴田武彦
特許第4860199号高度好熱菌由来の改変型一本鎖DNA結合タンパク質、及び該タンパク質を用いた核酸の等温増幅方法

重森康司, 柴田武彦, 美川務
特許第4455335号核酸増幅方法及び一塩基多型検出方法

重森康司, 柴田武彦, 美川務, 大石道夫, 小原收
特許第4235908号クロマチン再編成因子の機能改変による相同組換えの制御方法

太田邦史, 水野健一, 柴田武彦
特許第4214234号体細胞相同組換えの促進方法及び特異的抗体の作製方法

太田邦史, 瀬尾秀宗, 柴田武彦
特許第4158920号耐熱性多頻度DNA切断酵素の細胞内活性化によるゲノム再編成の誘発方法

太田邦史, 瀬尾秀宗, 廣田耕志, 柴田武彦
特許第3829226号ビメンチンの切断産物に対する抗体

森島信裕, 中西慶子, 柴田武彦
特許第3624237号エンドヌクレアーゼ

森島信裕, 水村光, 柴田武彦
特許第3603138号細胞死抑制タンパク質

森島信裕, 柴田武彦
WO2004-027060 核酸増幅方法、核酸増幅用試薬キット、一塩基多型検出方法、及び、一塩基多型検出用試薬キット

重森康司, 柴田武彦, 美川務, 大石道夫, 小原收
WO2004-011644 体細胞相同組換えの促進方法及び特異的抗体の作製方法

太田邦史, 瀬尾秀宗, 柴田武彦
特許第3335189号領域指定突然変異導入法

柴田武彦, 池田正幸
特許第2915486号間接固相抗体法

池田正幸, 柴田武彦
特許第2718495号ミトコンドリア相同組換えに働く核染色体の変異遺伝子の検出方法

柴田武彦, 凌楓, 牧島房夫