仁木 宏典

J-GLOBALへ         更新日: 17/07/26 14:35
 
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研究者氏名
仁木 宏典
 
ニキ ヒロノリ
URL
http://www.nig.ac.jp/labs/MicroGen/
所属
国立遺伝学研究所
部署
放射線アイソトープセンター
職名
教授
学位
博士(医学)(熊本大学)
科研費研究者番号
70208122
ORCID ID
0000-0002-5391-6595

研究分野

 
 

学歴

 
 
   
 
熊本大学 医学研究科 
 

論文

 
Niki H
Cold Spring Harbor protocols      2017年7月   [査読有り]
Furuya K, Niki H
Cold Spring Harbor protocols      2017年7月   [査読有り]
Aoki K, Niki H
Cold Spring Harbor protocols      2017年7月   [査読有り]
Aoki K, Furuya K, Niki H
Cold Spring Harbor protocols      2017年7月   [査読有り]
Kawazura T, Matsumoto K, Kojima K, Kato F, Kanai T, Niki H, Shiomi D
Molecular microbiology   104(3) 472-486   2017年5月   [査読有り]
Niki H
Structure (London, England : 1993)   25(4) 569-570   2017年4月   [査読有り]
Ursell T, Lee TK, Shiomi D, Shi H, Tropini C, Monds RD, Colavin A, Billings G, Bhaya-Grossman I, Broxton M, Huang BE, Niki H, Huang KC
BMC biology   15(1) 17   2017年2月   [査読有り]
Nakai R, Fujisawa T, Nakamura Y, Nishide H, Uchiyama I, Baba T, Toyoda A, Fujiyama A, Naganuma T, Niki H
Genome announcements   4(3)    2016年6月   [査読有り]
Yano K, Masuda K, Akanuma G, Wada T, Matsumoto T, Shiwa Y, Ishige T, Yoshikawa H, Niki H, Inaoka T, Kawamura F
Microbiology (Reading, England)   162(1) 35-45   2016年1月   [査読有り]
Nakai R, Fujisawa T, Nakamura Y, Baba T, Nishijima M, Karray F, Sayadi S, Isoda H, Naganuma T, Niki H
Standards in genomic sciences   11 90   2016年   [査読有り]
Nakai R, Baba T, Niki H, Nishijima M, Naganuma T
International journal of systematic and evolutionary microbiology   65(11) 4072-4079   2015年11月   [査読有り]
Monteiro DC, Patel V, Bartlett CP, Nozaki S, Grant TD, Gowdy JA, Thompson GS, Kalverda AP, Snell EH, Niki H, Pearson AR, Webb ME
Chemistry & biology   22(4) 492-503   2015年4月   [査読有り]
Niki H
Yeast (Chichester, England)   31(3) 83-90   2014年3月   [査読有り]
Yano K, Wada T, Suzuki S, Tagami K, Matsumoto T, Shiwa Y, Ishige T, Kawaguchi Y, Masuda K, Akanuma G, Nanamiya H, Niki H, Yoshikawa H, Kawamura F
Microbiology (Reading, England)   159(Pt 11) 2225-2236   2013年11月   [査読有り]
Shiomi D, Niki H
MicrobiologyOpen   2(5) 798-810   2013年10月   [査読有り]
Keyamura K, Sakaguchi C, Kubota Y, Niki H, Hishida T
The Journal of biological chemistry   288(41) 29229-29237   2013年10月   [査読有り]
Synchronous Activation of Cell Division by Light or Temperature Stimuli in the Dimorphic Yeast Schizosaccharomyces japonicus
Okamoto, S., Furuya, K., Nozaki, S., Aoki, K., and Niki, H.
Eukaryotic Cell   12(9) 1235-1243   2013年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Regulation of nuclear envelope dynamics via APC/C is necessary for the progression of semi-open mitosis in Schizosaccharomyces japonicus
AOKI, K.,Shiwa, Y.,Takada, H.,Yoshikawa, H.,Niki,H.
Genes Cells   18 733-752   2013年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Mutations in cell elongation genes mreB, mrdA and mrdB suppress the shape defect of RodZ-deficient cells
Shiomi, D., Toyoda, A., Aizu, T., Ejima, F., Fujiyama, A., Shini, T., Kohara, Y., & Niki, H
Mol Microbiol.      2013年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Formation of a heterooctameric complex between ADC & its cognate activating factor, PanZ, is CoA-dependent
Monteiro, D.C.F., Rugen, M.D., Shepherd, D., Nozaki, S., Niki, H., & Webb, M.E
Biochem Biophys Res. Communications   426 350-355   2012年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Hyphal differentiation induced via a DNA damage checkpoint-dependent pathway engaged in crosstalk with nutrient stress signaling in Schizosaccharomyces japonicus
Furuya, K.,Niki, H.
Current Genetics      2012年   [査読有り]
An activator for pyruvoyl-dependent l-aspartate α-decarboxylase is conserved in a small group of the γ-proteobacteria including Escherichia coli
Nozaki,S., Webb, M.E., & Niki, H
MicrobiologyOpen   1(3) 298-310   2012年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Genome-wide identification and characterization of replication origins by deep sequencing
Xu, J., Yanagisawa, Y., Tsankov, A.M., Hart, C., Aoki, K., Kommajosyula, N., Steinmann, K.E., Bochicchio, J., Russ, C., Regev, A., Rando, O.J., Nusbaum, C., Niki, H., Milos, P., Weng, Z., & Rhind, N
Genome Biology   13    2012年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Construction of an insertion marker collection of Sz. japonicus (IMACS) for genetic mapping & a fosmid library covering its genome.
Furuya, K.,AOKI, K.,Niki, H.
Yeast   29 241-249   2012年   [査読有り]
A mutation of ispA that is involved in isoprenoid biogenesis can improve slow growth of Escherichia coli at low temperature.
Shiomi,D.,and Niki,H.
Microbiol Immunol   55(12) 885-8   2011年   [査読有り]
Visualization of bacteriophage P1 infection by cryo-electron tomography of tiny Escherichia coli.
Liu,J., Chen,CY., Shiomi,D., Niki,H., and Margolin,W.
Virology   417(2) 304-11   2011年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Identification of Escherichia coli ZapC (YcbW) as a component of the division apparatus that binds and bundles FtsZ polymers.
Hale,CA., Shiomi,D., Liu,B., Bernhardt,TG., Margolin,W., Niki,H., and de Boer, PA.
Journal of Bacteriology   193(6) 1393-1404   2011年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Direct PCR amplification of the 16S rRNA gene from single microbial cells isolated from an Antarctic iceberg using laser microdissection microscopy.
Yanagihara, K., Niki, H., and Baba, T.
Polar Science   5(3) 375-382   2011年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Construction of diploid zygotes by interallelic complementation of ade6 in Schizosaccharomyces japonicus.
Furuya, K.,and Niki, H.
Yeast   28 747-754   2011年   [査読有り]
Breakage of the nuclear envelope by an extending mitotic nucleus occurs during anaphase in Schizosaccharomyces japonicus.
AOKI, K.,Hayashi, H.,Furuya, K., Sato, M., Takagi, T., Osumi, M., Kimura, A., and Niki, H.
Genes Cells   16(9) 911-926   2011年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり、総合研究大学院大学の学生発表あり
Comparative functional genomics of the fission yeasts.
Rhind, N.,Chen, Z., Yassour, M., Thompson, D. A., Haas, B. J., Habib, N., Wapinski, I., Roy, S., Lin, M. F., Heiman, D. I., Young, S. K., Furuya, K.,Guo, Y., Pidoux, A., Chen, H. M., Robbertse, B., Goldberg, J. M., Aoki, K., Bayne, E. H., Berlin, A. M., Desjardins, C. A., Dobbs, E., Dukaj, L.,Fan, L., FitzGerald, M. G., French, C., Gujja, S., Hansen, K., Keifenheim, D., Levin, J. Z., Mosher, R. A., Muller, C. A., Pfiffner, J., Priest, M.,Russ, C., Smialowska, A., Swoboda, P., Sykes, S. M., Vaughn, M., Vengrova, S., Yoder, R., Zeng, Q., Allshire, R., Baulcombe, D., Birren, B. W., Brown, W., Ekwall, K., Kellis, M., Leatherwood, J., Levin, H., Margalit, H., Martienssen, R., Nieduszynski, C. A., Spatafora, J. W., Friedman, N., Dalgaard, J. Z., Baumann, P.,Niki, H., Regev, A., and Nusbaum, C.
Science   332 930-936   2011年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
The DNA damage checkpoint regulates a transition between yeast and hyphal growth in Schizosaccharomyces japonicus
Furuya, K.,Niki, H.
Molecular and cellular Biology   30(12) 2909-2917   2010年   [査読有り]
DDK phosphorylates checkpoint clamp component Rad9 and promotes ites release from chromatin
Furuya, K., Miyabe, I., Tsutsui, Y.,,Paderi F., Kakusho, N., Masai, H., ,Niki, H., Carr AM.,
Molecular Cell   24(40) 606-618   2010年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Novel episomal vectors and a highly efficient transformation procedure for the fission yeast Schizosaccharomyces japonicus.
AOKI, K., NAKAJIMA, R., Furuya, K., and Niki, H.
Yeast   27 1049-1060   2010年   [査読有り]
細胞骨格蛋白質による大腸菌尾形態形成機構
塩見 大輔、仁木 宏典
日本微生物形態学会誌   24(2) 51-60   2009年   [査読有り]
総説
Genetic mechanism regulating bacterial cell shape and metabolism
Shiomi, D., Mori, H., and Niki, H.
Communicative & Integrative Biology   2(3) 219-220   2009年
総説
Isolation of heterothallic haploid and auxotrophic mutants of Schizosaccharomyces japonicus.
Furuya, K., and NIKI, H.
Yeast   26(4) 221-233   2009年   [査読有り]
Determination of bacterial rod shape by a novel cytoskeletal membrane protein
Shiomi, D, Sakai, M., Niki, H.
EMBO J.   27(23) 3081-3091   2008年   [査読有り]
Rad3-dependent phosphorylation of the checkpoint clamp regulates repair-pathway choice
Kai M., Furuya, K., Paderi F., Carr AM. Wang TS.
Nature Cell Biology   9(6) 691-697   2007年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Escherichia coli with a linear genome
Cu,i T., Moro-oka, N., Ohsumi K., Kodama, K., Ohshima, T., Ogasawara, N., Mori, H., Wanner, B., Niki, H., and Horiuchi, T.
EMBO Rep   8(2) 181-187   2007年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
The trans-envelope Tol-Pal complex is part of the cell division machinery and required for proper outer-membrane invagination during cell constriction in E. coli.
Gerding, M.A., Ogata, Y., Pecora, N.D., Nik,i H., and de Boer, PA.
Mol Microbiol.   63(4) 1008-1025   2007年   [査読有り]
国立遺伝学研究所以外の共著者あり
Multiplication of a restriction-modification gene complex.
Sadykov M, Asami Y, Niki H, Handa N, Itaya M, Tanokura M, Kobayashi I
Molecular microbiology   48(2) 417-427   2003年4月   [査読有り]
[Dynamic changes in localization of bacterial proteins and DNA according as cell cycle].
Ogata Y, Niki H
Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society   75(2) 137-143   2003年2月   [査読有り]
Amplification of Hot DNA segments in Escherichia coli.
Kodama K, Kobayashi T, Niki H, Hiraga S, Oshima T, Mori H, Horiuchi T
Molecular microbiology   45(6) 1575-1588   2002年9月   [査読有り]

Misc

 
Yamaichi, Y., and Niki, H. (2000) Active segregation by the Bacillus subtilis partitioning system in Escherichia coli.
Proc Natl. Acad. Sci. USA.   97    2000年
Dynamic organization of chromosomal DNA in Escherichia coli
Genes & Dev.   14, 212-223    2000年
Polar localization of the replication origin and terminus in Escherichia coli nucleoids during chromosome partitioning
Genes & Dev.   12, 1036-1045    1998年
Subcellular distribution of actively partitioning F plasmid during the cell division cycle in E. coli.
Cell   90, 951-957    1997年
Shiomi D, Sakai M, Niki H.
EMBO J.   27(23) 3081-3091   2008年

書籍等出版物

 
仁木宏典 大腸菌:ゲノム分配のダイナミクス. ゲノミクス・プロテオミクスの新展開~生物情報の解析と応用~
仁木 宏典
NTS inc.   2004年   
編者名:今中 忠行
分子生物学イラストレイテッド 改訂第3版 原核生物の遺伝要素
柳原克彦、仁木 宏典
羊土社   2009年   ISBN:978-4758120029
編者名:田村 隆明 , 山本 雅
蛋白質核酸酵素3月増刊 染色体の分配とM期制御
青木敬太、仁木宏典
共立出版   2009年   
編者名:正井久雄、升方久夫、釣本敏樹、仁木宏典、篠原彰

講演・口頭発表等

 
An active partitioning mechanism of F plasmid; what is the motive force for bipolar migration of the plasmid?
Hatano, T., Niki, H.
Keystone Symposia ; Mechanisms of DNA replicaiton and recombination   2005年1月5日   
Guidance of actively partitioning plasmid by a helical structure of the ATPase, SopA [招待有り]
Hatano, T.,Niki, H.
5th 3R Symposium   2005年11月13日   
Guidance of actively partitioning plasmid by a helical structure of the ATPase, SopA [招待有り]
Niki, H.
RIKKYO Internatinal Symposium: From Bacteria to Organella   2005年8月25日   
Guidance of actively partitioning plasmid by a helical structure of the ATPase, SopA
Hatano, T.,Niki, H.
Internatinal Symposium on Ran and Cell Cycle   2005年10月2日   
Walker型ATPase, SopAタンパク質によるプラスミドDNAの移動・分配の分子機構
波田野俊之,仁木宏典
第22回染色体ワークショップ   2005年1月27日   

競争的資金等の研究課題

 
バクテリアの染色体分配機構

社会貢献活動

 
モデル生物大腸菌の統合的理解にむけて
【その他】  仁木 宏典  21世紀大腸菌研究会-2005-  (志摩)  2005年6月23日
国立遺伝学研究所以外との共同開催あり
染色体の高次機能領域
【その他】  仁木宏典  第28回日本分子生物学会年会 ワークショップ  (福岡)  2005年12月10日
会議等主催
【その他】  仁木 宏典  第6回 21世紀大腸菌研究会  (熱海)  2009年11月6日
国立遺伝学研究所以外との共同開催あり
会議等主催
【その他】  Niki, H.  International Symposium on Chromosome Dynamics in Ise, 2008  (Shima, Mie)  2008年
国立遺伝学研究所以外との共同開催あり
Chromosome Dynamics
【その他】  NIKI, H.  第3回遺伝研国際シンポジウム  (Mishima)  2008年