池上貴久 (Takahisa Ikegami) - マイポータル

基本情報

所属: 横浜市立大学理学部理学科生命医科学研究科生命医科学専攻教授

学位: 博士（理学）(1999年3月大阪大学)

研究者番号: 20283939
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-1429-1844
J-GLOBAL ID: 200901033538821520
Researcher ID: I-9626-2017
researchmap会員ID: 5000026262

外部リンク: http://www-mls.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/lab/stbiol.html

蛋白質（特に同種多量体）の立体構造やダイナミクス、また蛋白質と巨大な固体基質との相互作用を核磁気共鳴（溶液 NMR）で測定し解析しています。また、クリアでない微妙な信号データを解析することが多いため、できるだけアーティファクトの少ないパルス系列を組み立てたり、解析用のソフトウェアを自作することも行っています。

研究キーワード

研究分野

経歴

2014年4月 - 現在

横浜市立大学, 理学部理学科生命医科学研究科, 教授
2022年4月 - 2023年3月

新潟大学, 農学部, 非常勤講師
2020年11月 - 2021年3月

筑波大学, 大学院理工情報生命学術院, 非常勤講師
2002年3月 - 2014年3月

大阪大学, 蛋白質研究所, 准教授（助教授）
2012年6月 - 2013年3月

新潟大学, 自然科学研究科, 非常勤職員
2012年4月 - 2013年3月

京都大学, エネルギー理工学研究所, 客員准教授
2009年4月 - 2010年3月

広島大学, 生物生産学部, 非常勤職員
2005年6月 - 2005年6月

北海道大学, 理学部, 非常勤講師
2001年10月 - 2002年3月

マックスプランク研究所, 生物物理化学（ゲッティンゲン）, 日本学術振興会海外特別研究員
2001年10月 - 2002年3月

Max-Planck Institute in Goettingen, Prof. C. Griesinger's group, JSPS Postdoctoral Fellowship
1997年4月 - 2002年3月

奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助手
2000年11月 - 2001年9月

フランクフルト大学, 有機化学研究所, 日本学術振興会海外特別研究員
2000年11月 - 2001年9月

Frankfurt University, Prof. C. Griesinger's group, JSPS Postdoctoral Fellowship
1996年4月 - 1997年3月

奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教務職員
1991年4月 - 1994年3月

日立製作所, 計測器事業部, 電子顕微鏡のソフトウェア開発
1991年4月 - 1994年3月

Hitachi, Ltd., Engineer of electron microscopy

学歴

1994年4月 - 1996年3月

大阪大学, 理学研究科, 生物化学
1987年4月 - 1991年3月

大阪大学, 理学部, 生物学科

委員歴

2022年4月 - 現在

日本核磁気共鳴学会, 機関誌編集委員
2003年 - 現在

日本核磁気共鳴学会, 学会員
2023年4月 - 2025年3月

京都大学エネルギー理工学研究所, 共同利用運営委員会委員
2014年4月 - 2023年3月

京都大学エネルギー理工学研究所, 共同利用・共同研究計画委員副委員長
2020年4月 - 2022年3月

日本核磁気共鳴学会, 学会長
2012年4月 - 2022年3月

日本核磁気共鳴学会, 理事
2008年4月 - 2022年3月

日本核磁気共鳴学会, 評議員
2021年3月 - 2021年12月

ISMAR-APNMR-NMRSJ-SEST2021 合同会議, プログラム委員会委員・総務委員会委員
2003年4月 - 2021年7月

日本生物物理学会, 学会員
2018年4月 - 2020年3月

日本核磁気共鳴学会, 機関誌編集委員長
2018年4月 - 2020年3月

日本核磁気共鳴学会, 副学会長
2017年4月 - 2019年3月

大阪大学蛋白質研究所, 専門委員会委員
2012年4月 - 2018年3月

日本核磁気共鳴学会, 機関誌編集副委員長
2013年8月 - 2016年12月

第27回生体系磁気共鳴国際会議 ICMRBS, 組織委員・実行委員幹事
2014年4月 - 2016年3月

大阪大学蛋白質研究所, 超高磁場NMR共同利用・共同研究専門部会委員
2012年4月 - 2014年3月

日本生物物理学会, 会誌編集委員
2011年4月 - 2014年3月

京都大学エネルギー理工学研究所, 共同利用・共同研究計画委員
2005年4月 - 2013年3月

日本生化学会, 近畿支部幹事

受賞

1991年

大阪大学楠本賞
1991年

Kusumoto-chancellor Prize

論文

106

GAS41 promotes H2A.Z deposition through recognition of the N terminus of histone H3 by the YEATS domain.

Masaki Kikuchi, Shohei Takase, Tsuyoshi Konuma, Kota Noritsugu, Saaya Sekine, Takahisa Ikegami, Akihiro Ito, Takashi Umehara

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 120(43) e2304103120 2023年10月24日査読有り
CPMG pulse sequence for relaxation dispersion that cancels artifacts independently of spin states.

Tsuyoshi Konuma, Jun-Ichi Kurita, Takahisa Ikegami

Journal of magnetic resonance 352 107489-107489 2023年5月21日査読有り
Structural basis for the unique multifaceted interaction of DPPA3 with the UHRF1 PHD finger.

Keiichi Hata, Naohiro Kobayashi, Keita Sugimura, Weihua Qin, Deis Haxholli, Yoshie Chiba, Sae Yoshimi, Gosuke Hayashi, Hiroki Onoda, Takahisa Ikegami …

Nucleic acids research 50(21) 12527-12542 2022年11月28日査読有り
Chemical Conformation of the Essential Glutamate Site of the c-Ring within Thermophilic Bacillus FoF1-ATP Synthase Determined by Solid-State NMR Based on its Isolated c-Ring Structure.

Yasuto Todokoro, Su-Jin Kang, Toshiharu Suzuki, Takahisa Ikegami, Masatsune Kainosho, Masasuke Yoshida, Toshimichi Fujiwara, Hideo Akutsu

Journal of the American Chemical Society 144(31) 14132-14139 2022年8月10日査読有り
Sensitivity enhancement by sequential data acquisition for 13C-direct detection NMR.

Kyoko Furuita, Toshihiko Sugiki, Mika Takamuku, Yoshikazu Hattori, Masatomo So, Yasushi Kawata, Takahisa Ikegami, Toshimichi Fujiwara, Chojiro Kojima

Journal of magnetic resonance (San Diego, Calif. : 1997) 322 106878-106878 2021年1月査読有り
Crystal structure of higher plant heme oxygenase-1 and its mechanism of interaction with ferredoxin

Rei Tohda, Hideaki Tanaka, Risa Mutoh, Xuhong Zhang, Young-Ho Lee, Tsuyoshi Konuma, Takahisa Ikegami, Catharina T Migita, Genji Kurisu

Journal of Biological Chemistry 2020年12月21日査読有り
The structure of SeviL, a GM1b/asialo-GM1 binding R-type lectin from the mussel Mytilisepta virgata.

Kenichi Kamata, Kenji Mizutani, Katsuya Takahashi, Roberta Marchetti, Alba Silipo, Christine Addy, Sam-Yong Park, Yuki Fujii, Hideaki Fujita, Tsuyoshi Konuma …

Scientific reports 10(1) 22102-22102 2020年12月16日査読有り
Screening of protein-ligand interactions under crude conditions by native mass spectrometry

Kotaro Takano, Shunsuke Arai, Seiji Sakamoto, Hiroshi Ushijima, Takahisa Ikegami, Kazumi Saikusa, Tsuyoshi Konuma, Itaru Hamachi, Satoko Akashi

Analytical and Bioanalytical Chemistry 412(17) 4037-4043 2020年4月23日査読有り
Calcium sensing via EF-hand 4 enables thioredoxin activity in the sensor-responder protein calredoxin in the green alga Chlamydomonas reinhardtii

Ratana Charoenwattanasatien, Karen Zinzius, Martin Scholz, Susann Wicke, Hideaki Tanaka, Johann S. Brandenburg, Giulia M. Marchetti, Takahisa Ikegami, Takashi Matsumoto, Takashi Oda …

Journal of Biological Chemistry 295(1) 170-180 2020年1月3日査読有り
Structural adaptations of photosynthetic complex I enable ferredoxin-dependent electron transfer.

Schuller JM, Birrell JA, Tanaka H, Konuma T, Wulfhorst H, Cox N, Schuller SK, Thiemann J, Lubitz W, Sétif P …

Science (New York, N.Y.) 363(6424) 257-260 2018年12月査読有り
A novel chitin‐binding mode of the chitin‐binding domain of chitinase A1 from Bacillus circulans WL ‐12 revealed by solid‐state NMR

Hiroki Tanaka, Hideo Akutsu, Izumi Yabuta, Masashi Hara, Hayuki Sugimoto, Takahisa Ikegami, Takeshi Watanabe, Toshimichi Fujiwara

FEBS Letters 592(18) 3173-3182 2018年9月1日査読有り
Spatial Overlap of Claudin- and Phosphatidylinositol Phosphate-Binding Sites on the First PDZ Domain of Zonula Occludens 1 Studied by NMR

Hidekazu Hiroaki, Kaori Satomura, Natsuko Goda, Yukako Nakakura, Minami Hiranuma, Takeshi Tenno, Daizo Hamada, Takahisa Ikegami

Molecules 23(10) 2018年9月査読有り
Analysis of Artifacts Caused by Pulse Imperfections in CPMG Pulse Trains in NMR Relaxation Dispersion Experiments

Takahisa Ikegami

Magnetochemistry 4(3) 33-33 2018年7月査読有り
X-ray structure of an asymmetrical trimeric ferredoxin-photosystem I complex.

Kubota-Kawai H, Mutoh R, Shinmura K, Sétif P, Nowaczyk MM, Rögner M, Ikegami T, Tanaka H, Kurisu G

Nature plants 4(4) 218-224 2018年4月査読有り
Association of Ferredoxin:NADP+ oxidoreductase with the photosynthetic apparatus modulates electron transfer in Chlamydomonas reinhardtii.

Mosebach L, Heilmann C, Mutoh R, Gäbelein P, Steinbeck J, Happe T, Ikegami T, Hanke G, Kurisu G, Hippler M

Photosynthesis research 134(3) 291-306 2017年6月査読有り
Non-covalent forces tune the electron transfer complex between ferredoxin and sulfite reductase to optimize enzymatic activity.

Kim JY, Kinoshita M, Kume S, Gt H, Sugiki T, Ladbury JE, Kojima C, Ikegami T, Kurisu G, Goto Y …

The Biochemical journal 473(21) 3837-3854 2016年8月査読有り
The cyanobacterial cytochrome b6f subunit PetP adopts an SH3 fold in solution.

Veit S, Nagadoi A, Rögner M, Rexroth S, Stoll R, Ikegami T

Biochimica et biophysica acta 1857(6) 705-714 2016年3月査読有り
NOE distance and dihedral angle restraints to calculate the solution structure of the NDH-1 complex subunit CupS from Thermosynechococcus elongatus.

Korste A, Wulfhorst H, Ikegami T, Nowaczyk MM, Stoll R

Data in brief 6 249-252 2015年12月査読有り
X-ray Structure and Nuclear Magnetic Resonance Analysis of the Interaction Sites of the Ga-Substituted Cyanobacterial Ferredoxin.

Mutoh R, Muraki N, Shinmura K, Kubota-Kawai H, Lee YH, Nowaczyk MM, Rögner M, Hase T, Ikegami T, Kurisu G

Biochemistry 54(39) 6052-61 2015年9月査読有り
Functional conformer of c-Myb DNA-binding domain revealed by variable temperature studies.

Inaba S, Maeno A, Sakurai K, Narayanan SP, Ikegami T, Akasaka K, Oda M

The FEBS journal 282(23) 4497-4514 2015年9月査読有り

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MISC

199

解糖系moonlighting蛋白質GAPDHの環境変化に対応した立体構造変化の解析

鈴木陽茉梨, 牧山ユキ, 元田容子, 小沼剛, 池上貴久

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 23rd (CD-ROM) 2023年
NMR講座:NMR基礎講座ベクトルモデルはどのぐらい信じてよいのか?

池上貴久

NMR (Web) 13(1) 2023年
AX3スピン系は訳分からないけど,やはり「メチル基」様様

池上貴久

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 61st 2022年
核磁気共鳴NMRで飲み物を味わう

池上貴久

化学と教育 68(12) 2020年
高等植物型ヘムオキシゲナーゼの構造・相互作用解析

東田怜, 東田怜, 田中秀明, 田中秀明, 武藤梨沙, 張旭紅, 李映昊, 李映昊, 李映昊, 小沼剛 …

日本結晶学会年会講演要旨集 2020 (CD-ROM) 2020年
光合成型複合体Ⅰがフェレドキシン依存的に循環型電子伝達を行う構造基盤

栗栖源嗣, 田中秀明, 小沼剛, 池上貴久, Schuller Jan M., Nowaczyk Marc M.

光合成研究 = News letter 29(3) 242-246 2019年12月
パルス不完全性を補償する¹⁵N/¹³C-CPMG-HSQCパルス系列の開発

池上貴久, 小沼剛, 栗田順一, 長土居有隆

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 58th (CD-ROM) 2019年
asialo-GM1に特異的に結合する二枚貝由来レクチンSeviLの構造解析

鎌田健一, 高橋捷也, 水谷健二, 藤井佑樹, 藤田英明, 小沼剛, 池上貴久, 大関泰裕, TAME Jeremy R.H.

日本糖質学会年会要旨集 38th 2019年
好熱菌H⁺-ATP合成酵素サブユニットcリングの膜内構造の精密化

戸所泰人, KANG Su-jin, KANG Su-jin, 鈴木俊治, 吉田賢右, 池上貴久, 藤原敏道, 阿久津秀雄, 阿久津秀雄

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 58th (CD-ROM) 2019年
光合成型複合体Iがフェレドキシン依存性を示す構造基盤

栗栖源嗣, 田中秀明, 小沼剛, 池上貴久, SCHULLER Jan M., NOWACZYK Marc M.

日本生化学会大会(Web) 92nd 2019年
時計タンパク質Kai複合体の機能と構造解析

岩戸将貴, 飯田高広, 三島正規, 池上貴久, 武藤梨沙

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
腸球菌のバンコマイシン耐性の原因蛋白質VanXの二量体構造の解析

土屋智恵子, 小沼剛, 西田真之, 長土居有隆, 池上貴久

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 58th (CD-ROM) 2019年
NDH様複合体とフェレドキシンの相互作用機構の解明

田中秀明, 濱岡紀之, 三角裕子, 金宙妍, 小沼剛, 池上貴久, ENGEL Benjamin D., NOWACZYC Marc M., 栗栖源嗣

日本生化学会大会(Web) 92nd 2019年
光化学系I-アナログフェレドキシン複合体の構造解析

武藤梨沙, 河合(久保田) 寿子, 池上貴久

生物物理 59(1) 32-34 2019年
光化学系I-アナログフェレドキシン複合体の構造解析

武藤梨沙, 河合(久保田, 寿子, 池上貴久

生物物理(Web) 59(1) 032‐034(J‐STAGE)-34 2019年
溶液NMRにおける生体高分子の核超偏極技術の開発

大木出, 藤咲貴大, 池上貴久, 白川昌宏, 水落憲和

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 57th 106‐107 2018年9月3日
長いT₁を持つ分子の高感度溶液NMR測定法の開発

古板恭子, 服部良一, 池上貴久, 服部良一, 池上貴久, 藤原敏道, 児嶋長次郎, 児嶋長次郎

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 57th 104‐105 2018年9月3日
循環型電子伝達に関わるNDH‐1複合体の構造および相互作用解析

田中秀明, 梅野恵太, 三角裕子, KIM Ju Yaen, ROEGNER Matthias, 池上貴久, NOWACZYK Marc, 栗栖源嗣

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 18th 88 2018年5月23日
緩和分散CPMG法におけるスピン状態に依存したアーティファクト削減の解析

長土居有隆, 池上貴久

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 56th 134‐135 2017年11月14日
生体系の溶液NMRにおける超偏極技術の新たな展開

大木出, 藤咲貴大, 池上貴久, 白川昌宏

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 56th 128‐129 2017年11月14日

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書籍等出版物

化学便覧基礎編改訂6版

日本化学会, 篠原, 久典 (担当:分担執筆, 範囲:二次元および多次元NMR)

丸善出版 2021年1月15日 (ISBN: 4621305212)
Encyclopedia of Biophysics "Protein NMR Resonance Assignment"

Ikegami, T, Inagaki, F (担当:分担執筆)

https://doi.org/10.1007/978-3-642-35943-9_312-1 2021年
化学と教育「核磁気共鳴NMRで飲み物を味わう」

池上貴久 (担当:分担執筆)

日本化学会 2020年
生物物理「光化学系I-アナログフェレドキシン複合体の構造解析」

武藤梨沙, 河合(久保田, 寿子, 池上貴久 (担当:共著)

日本生物物理学会 2019年
無敵のバイオテクニカルシリーズ「タンパク質実験ノート（上、改訂第４版）タンパク質をとり出そう（抽出・精製・発現編）

池上貴久 (担当:分担執筆, 範囲:高次構造解析のためのタンパク質の調製（NMR解析のためのタンパク質調製法）)

羊土社 2011年9月
やさしい原理からはいるタンパク質科学実験法２「タンパク質をみる –構造と挙動-」

池上貴久, 藤原敏道 (担当:分担執筆, 範囲:タンパク質の同位体ラベルとNMR分光法)

化学同人 2009年8月
分光測定入門シリーズ第８巻「核磁気共鳴分光法」（日本分光学会編）

池上貴久 (担当:分担執筆, 範囲:タンパク質のNMR)

講談社 2009年7月
タンパク質の事典

池上貴久 (担当:分担執筆, 範囲:NMRの原理, タンパク質の重水素化)

朝倉書店 2008年7月
Zinc Finger Proteins -From Atomic Contact To Cellular Function

池上貴久 (担当:分担執筆, 範囲:The Role of XPA in DNA Repair)

Landes Bioscience, Kluwer Academic Pub. 2005年3月
無敵のバイオテクニカルシリーズ「タンパク質実験ノート（上）抽出, 分離と組換えタンパク質の発現」

池上貴久 (担当:分担執筆, 範囲:高次構造解析のためのタンパク質の調製（NMR解析のためのタンパク質調製法）)

羊土社 2004年4月
わかる実験医学シリーズ「タンパク質がわかる」

池上貴久, 中川敦史 (担当:分担執筆, 範囲:原子レベルでの高次構造解析)

羊土社 2003年8月
シリーズ分子生物学６巻「構造生物学」

白川昌宏, 池上貴久 (担当:分担執筆, 範囲:DNA結合タンパク質のタンパク質工学)

朝倉書店 1998年2月
分子細胞生物学辞典

池上貴久 (担当:分担執筆, 範囲:βターン, βバレル構造, チョウファスマン法, 310ヘリックス, ロスマンフォールド)

東京化学同人 1997年3月