荒川和晴 (Arakawa Kazuharu) - マイポータル

基本情報

所属: 慶應義塾政策・メディア研究科教授

学位: 政策・メディア(2006年3月慶應義塾大学)

研究者番号: 40453550
J-GLOBAL ID: 200901082417103648
researchmap会員ID: 6000007474

外部リンク: http://bioinformatician.org/glab/

研究キーワード

研究分野

経歴

2017年4月 - 現在

慶應義塾大学環境情報学部, 准教授
2014年4月 - 2017年3月

慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科, 特任准教授
2009年4月 - 2014年3月

慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科特任講師
2009年4月 - 2014年3月

慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科, 特任講師
2007年4月 - 2009年3月

慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科, 特別研究助教
2007年4月 - 2009年3月

慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科特別研究助教

委員歴

受賞

2016年10月

Oxford Journals - Japanese Society for Bioinformatics Prize, 細胞内ダイナミクスのマルチオミクス解析, 日本バイオインフォマティクス学会

荒川和晴
2008年10月

Mathup Award 4th: Google賞, Genome Projector

荒川和晴
2008年10月

Mathup Award 4th: Google賞, Genome Projector

H荒川和晴, HR
2003年9月

CBI学会優秀ポスター賞

H荒川和晴, HR
2003年9月

CBI学会優秀ポスター賞

荒川和晴
2003年3月

慶應義塾塾長賞, ゲノム解析ソフトウェアG-language

H荒川和晴, HR
2003年3月

慶應義塾塾長賞, ゲノム解析ソフトウェアG-language

荒川和晴
2002年8月

ISMB Best Poster Award, G-language Genome Analysis Environment

H荒川和晴, HR
2002年8月

ISMB Best Poster Award, G-language Genome Analysis Environment

荒川和晴

論文

Publisher Correction: Base editors for simultaneous introduction of C-to-T and A-to-G mutations (Nature Biotechnology, (2020), 38, 7, (865-869), 10.1038/s41587-020-0509-0)

Sakata R.C, Ishiguro S, Mori H, Tanaka M, Tatsuno K, Ueda H, Yamamoto S, Seki M, Masuyama N, Nishida K …

Nature Biotechnology 38(7) 901-901 2020年7月1日
Complete Genome Sequence of Bifidobacterium longum Strain Jih1, Isolated from Human Feces

Inoue H, Shibata S, Ii K, Inoue J, Fukuda S, Arakawa K

Microbiology Resource Announcements 9(22) 2020年5月28日
Complete genome sequence of halomonas meridiana strain eplume2, isolated from a hydrothermal plume in the northeast pacific ocean

Kurihara Y, Kawai S, Sakai A, Galipon J, Arakawa K

Microbiology Resource Announcements 9(20) 2020年5月14日
Distribution of Macrobiotus shonaicus Stec, Arakawa & Michalczyk, 2018 (Tardigrada: Eutardigrada: Macrobiotidae) in Japan

Sugiura K, Arakawa K, Matsumoto M

Zootaxa 4767(1) 56-70 2020年4月23日
Complete Genome Sequences of Two Cutibacterium acnes Strains Isolated from an Orthopedic Surgical Site

Kaito Seo, Kazuki Tanaka, Shinji Fukuda, Kazuharu Arakawa

Microbiology Resource Announcements 9(17) 2020年4月23日
Complete genome sequence of halomonas meridiana strain Slthf1, isolated from a deep-sea thermal vent

Takahashi Y, Takahashi H, Galipon J, Arakawa K

Microbiology Resource Announcements 9(16) 2020年4月16日
Complete genome sequence of Bacillus sp. Strain KH172Yl63, isolated from deep-sea sediment

Murai Y, Masuda T, Onuma Y, Evans-Yamamoto D, Takeuchi N, Mori H, Masuyama N, Ishiguro S, Yachie N, Arakawa K

Microbiology Resource Announcements 9(16) 2020年4月16日
Complete genome sequence of halomonas hydrothermalis strain slthf2, a halophilic bacterium isolated from a deep-sea hydrothermal-vent environment

Takeyama N, Huang M, Sato K, Galipon J, Arakawa K

Microbiology Resource Announcements 9(15) 2020年4月9日
The unique antimicrobial recognition and signaling pathways in tardigrades with a comparison across ecdysozoa

Mapalo M.A, Arakawa K, Baker C.M, Persson D.K, Mirano-Bascos D, Giribet G

G3: Genes, Genomes, Genetics 10(3) 1137-1148 2020年3月1日
Simultaneous metabarcoding of eukaryotes and prokaryotes to elucidate the community structures within tardigrade microhabitats

Arakawa K

Diversity 12(3) 2020年3月1日
A new redescription of Richtersius coronifer, supported by transcriptome, provides resources for describing concealed species diversity within the monotypic genus Richtersius (Eutardigrada)

Stec D, Krzywański Ł, Arakawa K, Michalczyk Ł

Zoological Letters 6(1) 2020年2月5日
Pre-treatment with D942, a furancarboxylic acid derivative, increases desiccation tolerance in an anhydrobiotic tardigrade Hypsibius exemplaris

Kondo K, Mori M, Tomita M, Arakawa K

FEBS Open Bio 10(9) 1774-1781 2020年
BioHackathon 2015: Semantics of data for life sciences and reproducible research.

Rutger A Vos, Toshiaki Katayama, Hiroyuki Mishima, Shin Kawano, Shuichi Kawashima, Jin-Dong Kim, Yuki Moriya, Toshiaki Tokimatsu, Atsuko Yamaguchi, Yasunori Yamamoto …

F1000Research 9 136-136 2020年
Comparison of the transcriptomes of two tardigrades with different hatching coordination

Yoshida Y, Sugiura K, Tomita M, Matsumoto M, Arakawa K

BMC Developmental Biology 19(1) 24-24 2019年12月9日
AMPK activity is required for the induction of anhydrobiosis in a tardigrade Hypsibius exemplaris, and its potential up-regulator is PP2A

Kondo K, Mori M, Tomita M, Arakawa K

Genes to Cells 24(12) 768-780 2019年12月1日
The bagworm genome reveals a unique fibroin gene that provides high tensile strength

Kono N, Nakamura H, Ohtoshi R, Tomita M, Numata K, Arakawa K

Communications Biology 2(1) 148 2019年12月1日査読有り
Orb-weaving spider Araneus ventricosus genome elucidates the spidroin gene catalogue

Kono N, Nakamura H, Ohtoshi R, Moran D, Shinohara A, Yoshida Y, Fujiwara M, Mori M, Tomita M, Arakawa K

Scientific Reports 9(1) 8380 2019年12月1日査読有り
Patterns of population structure and complex haplotype sharing among field isolates of the green alga Chlamydomonas reinhardtii

Craig R.J, Böndel K.B, Arakawa K, Nakada T, Ito T, Bell G, Colegrave N, Keightley P.D, Ness R.W

Molecular Ecology 28(17) 3977-3993 2019年9月1日
Complete genome sequence of halophilic deep-sea bacterium halomonas axialensis strain Althf1

Tsurumaki M, Deno S, Galipon J, Arakawa K

Microbiology Resource Announcements 8(31) 2019年8月1日
Complete genome sequence of halomonas sulfidaeris strain esulfide1 isolated from a metal sulfide rock at a depth of 2,200 meters, obtained using nanopore sequencing

Saito M, Nishigata A, Galipon J, Arakawa K

Microbiology Resource Announcements 8(23) 2019年6月6日

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MISC

Base editors for simultaneous introduction of C-to-T and A-to-G mutations

Sakata R.C, Ishiguro S, Mori H, Tanaka M, Tatsuno K, Ueda H, Yamamoto S, Seki M, Masuyama N, Nishida K …

Nature Biotechnology 38(7) 901-901 2020年
Tardigrades in space

Arakawa K, Blaxter M

Biologist 65(1) 14-17 2018年2月

書籍等出版物

オープンソースで学ぶバイオインフォマティクス

H荒川和晴, HR (担当:共著, 範囲:250)

東京電機大学出版 2008年3月 (ISBN: 4501622601)
RとBioconductorを用いたバイオインフォマティクス

R.ジェントルマン, V.J.カリー, W.フーバー, R.A.イリザリー, S.ドュドイト著, 荒川和晴, 粕川雄也, 川路英哉, 河野信, 神田将和ほか訳 (担当:共訳)

シュプリンガー・ジャパン 2007年7月 (ISBN: 9784431734642)
ゲノム配列に基づいた全代謝パスウェイモデルの自動生成

H荒川和晴, HR

慶應義塾大学湘南藤沢学会 2006年4月 (ISBN: 4877621571)

講演・口頭発表等

複製によって形成されたバクテリアゲノム構造の解析

H荒川和晴, HR

日本進化学会 2010年8月3日
G-language Bookmarklet: a gateway for Semantic Web, Linked Data, and Web Services

H荒川和晴, HR

Bioinformatics Open Source Conference 2010年7月9日
The tardigrade genome of an anhydrobiotic extremotolerant species, Ramazzottius varieornatus

H荒川和晴, HR

11th International Symposium on Tardigrada 2009年8月
Draft genome sequence assembly and preliminary annotations of Ramazzottius varieornatus genome

H荒川和晴, HR

11th International Symposium on Tardigrada, 2009 2009年8月
Comparative metabolome profiling of active and anhydrobiotic states of Tardigrade Ramazzottius varieornatus

H荒川和晴, HR

ISEPEP3 2009年8月
The tardigrade genome of an anhydrobiotic extremotolerant species, Ramazzottius varieornatus

荒川和晴

ISEPEP3 2009年8月
Comparative metabolome profiling of active and anhydrobiotic states of Tardigrade Ramazzottius varieornatus

荒川和晴

ISEPEP3 2009年8月
G-language Genome Analysis Environment Version 2: Integrated workbench for computational genome sequence analysis

H荒川和晴, HR

ISMB 2009 2009年7月
Web Service Interface for G-language Genome Analysis Environment

H荒川和晴, HR

BOSC 2009 2009年6月
仮説推論・検証型生命情報科学のためのソフトウェアとインタフェース - G-language・GEM System・Genome Projector・E-Cell 3D -

H荒川和晴, HR, 冨田勝

第一回生命情報科学若手の会 2009年4月
G-language Project:BioHackathon 2009のサマリー

H荒川和晴, HR, 木戸信博, 大下和希, 冨田勝

第１１回オープンバイオ研究会 2009年3月

担当経験のある科目(授業)

115

2024年4月 - 2025年3月

生命システム (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

特別研究プロジェクトＢ (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

土壌生物資源学 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

研究会Ｂ (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

微生物学 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

修士研究会 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

日本学特論 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

特別研究 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

卒業プロジェクト２ (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

卒業プロジェクト１ (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

ゲノム工学実習 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

遺伝学 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

総合技術論 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

食品微生物学 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

環境情報学 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

フードシステム論 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

基礎生態学 (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

先端研究（ＢＩ） (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

アカデミックプロジェクト（先端生命科学Ｂ） (慶應義塾)
2024年4月 - 2025年3月

アカデミックプロジェクト（先端生命科学Ａ） (慶應義塾)

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所属学協会

2004年 - 現在

オープンバイオ研究会
2001年 - 現在

International Society for Computational Biology
1999年 - 現在

日本バイオインフォマティクス学会
1999年 - 現在

日本分子生物学会
2008年12月 - 2014年

生命情報科学若手の会

Works(作品等)

【いま、生命科学と医学研究の明日を考えようブレークスルーはあなたの中に!】基礎研究の入口かつ出口としての好奇心

谷内江望

2017年8月その他
座談会地域に生きる、地域を生かす (特集タウンキャンパスの未来)

髙橋健彦, 宮田裕章, 荒川和晴, 武林亨

その他

共同研究・競争的資金等の研究課題

クマムシ特異的非ドメイン型タンパク質の探索と機能解析

文部科学省・日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2026年3月

荒川和晴
マルチオミクス解析によるクマムシ乾眠機構の全体像の解明

文部科学省・日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年4月 - 2021年3月

荒川和晴