北原亮 (Ryo Kitahara) - マイポータル

基本情報

所属: 立命館大学薬学部創薬科学科教授
: (兼任)総合科学技術研究機構創薬科学研究センター

学位: 博士（理学）(2002年3月神戸大学)

J-GLOBAL ID: 200901076796947327
researchmap会員ID: 6000017423

外部リンク: http://www.ritsumei.ac.jp/pharmacy/kitahara/kitahara_lab.html

研究キーワード

タンパク質、圧力、立体構造、準安定構造、構造揺らぎ

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

2006年11月

生物物理学会若手奨励賞, 日本生物物理学会
2005年11月

ＮＭＲ討論会ポスター賞

論文

Phase separation by biopolymers: Basics and applications.

Ryo Kitahara, Tomoshi Kameda

Biophysics and physicobiology 19 e190028 2022年
Pressure-Jump Kinetics of Liquid–Liquid Phase Separation: Comparison of Two Different Condensed Phases of the RNA-Binding Protein, Fused in Sarcoma

Ryo Kitahara, Ryota Yamazaki, Fumika Ide, Shujie Li, Yutaro Shiramasa, Naoya Sasahara, Takuya Yoshizawa

Journal of the American Chemical Society 143(47) 19697-19702 2021年12月1日
Pressure and Temperature Phase Diagram for Liquid-Liquid Phase Separation of the RNA-Binding Protein Fused in Sarcoma

Shujie Li, Takuya Yoshizawa, Ryota Yamazaki, Ayano Fujiwara, Tomoshi Kameda, Ryo Kitahara

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 125(25) 6821-6829 2021年7月
Dynamic aspects of pressure and temperature-stabilized intermediates of outer surface protein A.

Takuro Wakamoto, Soichiro Kitazawa, Tomoshi Kameda, Ryo Kitahara

Proteins 88(11) 1423-1433 2020年11月
Volumetric Properties for the Binding of 1,4-Dioxane to Amide Naphthotubes in Water.

Shujie Li, Huan Yao, Tomoshi Kameda, Wei Jiang, Ryo Kitahara

The journal of physical chemistry. B 124(41) 9175-9181 2020年10月15日
How internal cavities destabilize a protein

Mengjun Xue, Takuro Wakamoto, Camilla Kejlberg, Yuichi Yoshimura, Tania Acquits Nielsen, Michael Wulff Risor, Kristian Weise Sanggaard, Ryo Kitahara, Frans AA Mulder

Proc. Natl. Acad. Sci. USA 116(42) 21031-21036 2019年10月
Paramagnetic relaation enhancement-assisted structural characterization of a partially disordered conformation of ubiquitin

Takuro Wakamoto, Teppei Iseya, Soichiro Kitazawa, Nicola J. Baxter, Mike P. Williamson, Ryo Kitahara

Protein Science 28(11) 1993-2003-2003 2019年10月
Pressure accelerates the circadian clock of cyanobacteria.

Ryo Kitahara, Katsuaki Oyama, Takahiro Kawamura, Keita Mitsuhashi, Soichiro Kitazawa, Kazuhiro Yasunaga, Natsuno Sagara, Megumi Fujimoto, Kazuki Terauchi

Scientific reports 9(1) 12395-12395 2019年8月27日
Gene delivery to cone photoreceptors by subretinal injection of rAAV2/6 in the mouse retina.

Tesshu Hori, Masashi Fukutome, Chiseto Maejima, Hiroki Matsushima, Kensuke Kobayashi, Soichiro Kitazawa, Ryo Kitahara, Katsunori Kitano, Kenta Kobayashi, Satoru Moritoh …

Biochemical and biophysical research communications 515(1) 222-227 2019年7月12日
Rational design using sequence information only produces a peptide that binds to the intrinsically disordered region of p53.

Kiyoto Kamagata, Eriko Mano, Yuji Itoh, Takuro Wakamoto, Ryo Kitahara, Saori Kanbayashi, Hiroto Takahashi, Agato Murata, Tomoshi Kameda

Scientific reports 9(1) 8584-8584 2019年6月28日
Characterization of low-lying exited states of proteins by high-pressure NMR spectroscopy

Mike P. Williamson, Ryo Kitahara

BBA Proteins and Proteomics 1867 350-358 2019年3月
Water-protein interactions coupled with protein conformational transition

Soichiro Kitazawa, Yu Aoshima, Takuro Wakamoto, Ryo Kitahara

Biophysical Journal 115 981-987 2018年9月
How and why internal cavities destabilize proteins

Mulder Frans A. A, Xue Mengjun, Yoshimura Yuichi, Kitahara Ryo

FASEB JOURNAL 32(1) 2018年4月査読有り
Nuclear magnetic resonance-based determination of dioxygen binding sites in protein cavities

Ryo Kitahara, Shun Sakuraba, Tomoshi Kameda, Sanshiro Okuda, Mengjun Xue, Frans A.A. Mulder

Protein Science 27(3) 769-779 2018年3月1日
NMR法で観る圧力によるタンパク質の構造変化

北原亮

応用糖質科学 7(4) 204-209 2017年12月
Interactions Controlling the Slow Dynamic Conformational Motions of Ubiquitin

Soichiro Kitazawa, Maho Yagi-Utsumi, Koichi Kato, Ryo Kitahara

MOLECULES 22(9) 1414 2017年9月
Analysis of O-2-binding Sites in Proteins Using Gas-Pressure NMR Spectroscopy: Outer Surface Protein A

Takahiro Kawamura, Takuro Wakamoto, Soichiro Kitazawa, Shun Sakuraba, Tomoshi Kameda, Ryo Kitahara

BIOPHYSICAL JOURNAL 112(9) 1820-1828 2017年5月
静水圧及びガス圧NMR法を用いたタンパク質の動的性質の研究

北原亮

高圧力の科学と技術 27(1) 13-17 2017年
Aberrant increase of NMR signal in hydrogen exchange experiments. Observation and explanation

Mengjun Xue, Ryo Kitahara, Yuichi Yoshimura, Frans A. A. Mulder

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 478(3) 1185-1188 2016年9月
Modeling N-15 NMR chemical shift changes in protein backbone with pressure

Giovanni La Penna, Yoshiharu Mori, Ryo Kitahara, Kazuyuki Akasaka, Yuko Okamoto

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 145(8) 085104 2016年8月

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MISC

Rational Design of Peptide Targeting Intrinsically Disordered Protein p53-Regulation of Function and Phase Separation

Kiyoto Kamagata, Ryo Kitahara, Tomoshi Kameda

BIOPHYSICAL JOURNAL 118(3) 492A-493A 2020年2月
NMR explorations of biomolecular systems with rapid conformational exchanges

M. Yagi-Utsumi, T. Yamaguchi, R. Kitahara, K. Kato

Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions (M. Terazima, M. Kataoka, R. Ueoka, and Y. Okamoto eds), Springer 87-103 2016年
ガス圧NMR法によるタンパク質内部キャビティーと気体分子の相互作用研究

北原亮, 吉村優一, XUE Mengjun, 亀田倫史, MULDER Frans A.A

高圧討論会講演要旨集 56th 63 2015年10月27日
Design Strategy for High Free-Energy States of Proteins Based on High-Pressure NMR Study: Alternatively Folded Conformation of Ubiquitin

Ryo Kitahara, Soichiro Kitazawa, Maho Yagi-Utsumi, Akemi Ido, Makoto Urushitani, Kenji Sugase, Koichi Kato

BIOPHYSICAL JOURNAL 102(3) 25A-25A 2012年1月
Analysis of fluctuating protein structure - Approach from variable pressure NMR

Ryo Kitahara, Kazuyuki Akasaka

Review of High Pressure Science and Technology/Koatsuryoku No Kagaku To Gijutsu 17(1) 32-41 2007年
2P052 Ubiquitinとユビキチン様蛋白質NEDD8に共通の構造揺らぎ(蛋白質 B) 構造・機能相関))

北原亮, 坂田絵理, 粕谷武史, 山口芳樹, 加藤晃一, 田中啓二, 横山茂之, 赤坂一之

生物物理 45(1) S132 2005年10月19日
High-pressure NMR spectroscopy for characterizing folding intermediates and denatured states of proteins

YO Kamatari, R Kitahara, H Yamada, S Yokoyama, K Akasaka

METHODS 34(1) 133-143 2004年9月
High pressure NMR study of dihydrofolate reductase from a deep-sea bacterium Moritella profunda

K Hata, R Kono, M Fujisawa, R Kitahara, YO Kamatari, K Akaska, Y Xu

CELLULAR AND MOLECULAR BIOLOGY 50(4) 311-316 2004年6月
Close identity of a pressure-stabilized intermediate with a kinetic intermediate in protein folding

R Kitahara, K Akasaka

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 100(6) 3167-3172 2003年3月
High-pressure H-1 NMR study of pressure-induced structural changes in the heme environments of metcyanomyoglobins

R Kitahara, M Kato, Y Taniguchi

PROTEIN SCIENCE 12(2) 207-217 2003年2月
Equilibrium and pressure-jump relaxation studies of the conformational transitions of P13(MTCP1)

R Kitahara, C Royer, H Yamada, M Boyer, JL Saldana, K Akasaka, C Roumestand

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 320(3) 609-628 2002年7月
High pressure NMR reveals that apomyoglobin is an equilibrium mixture from the native to the unfolded

R Kitahara, H Yamada, K Akasaka, PE Wright

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 320(2) 311-319 2002年7月
Two folded conformers of ubiquitin revealed by high-pressure NMR

R Kitahara, H Yamada, K Akasaka

BIOCHEMISTRY 40(45) 13556-13563 2001年11月
High pressure NMR reveals active-site hinge motion of folate-bound Escherichia coli dihydrofolate reductase

R Kitahara, S Sareth, H Yamada, E Ohmae, K Gekko, K Akasaka

BIOCHEMISTRY 39(42) 12789-12795 2000年10月

書籍等出版物

Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions [NMR explorations of biomolecular systems with rapid conformational exchanges]

M. Terazima, M. Kataoka, R. Ueoka, Y. Okamoto eds, Yagi-Utsumi, M, Yamaguchi, T, Kitahara, R, Kato, K

Springer 2016年3月 (ISBN: 9784431558385)
High Pressure Bioscience [High pressure NMR discloses functional sub-states of ubiquitin and ubiquitin-like proteins]

Akasaka K, Matsuki H. Eds, Ryo Kitahara

Springer 2015年8月 (ISBN: 9789401799171)
「揺らぎ・ダイナミクスと生体機能」寺嶋正秀編

化学同人 2013年9月 (ISBN: 9784759815108)
広がるＮＭＲの世界(朝倉哲郎編) 「高圧力NMRで見る蛋白質の高エネルギー構造の世界」の１トピックス

朝倉哲郎

コロナ社 2011年4月

講演・口頭発表等

152

Water-protein interactions coupled with protein conformational transition

第５７回日本生物物理学会年会 2019年9月26日
Rational design of peptide targeting intrinsically disordered protein p53-reguation of function and phase-phase separation-

第５７回日本生物物理学会年会 2019年9月25日
Pressure accelerates the circadian clock of cyanobacteria

第５７回日本生物物理学会年会 2019年9月24日
Current trend of phase separation

第５７回日本生物物理学会年会 2019年9月24日
High-pressure NMR study of the locally disordered conformation of outer surface protein A (OspA)

8th Asia-Pacific NMR Symposium 2019 2019年7月5日
High-pressure NMR spectroscopy as a tool for studying protein dynamics

8th Asia-Pacific NMR Symposium 2019 2019年7月4日
シアノバクテリアの生物時計は高圧力下でどうなる？

第１９回蛋白質科学会年会 2019年6月25日
High-Pressure CLEANX-PM NMR法によるUbiquitinの構造ゆらぎに伴う水和環境の変化

第１９回蛋白質科学会年会 2019年6月25日
常磁性緩和促進法によるOuter surface protein Aの局所変性状態の立体構造解析

第１９回蛋白質科学会年会 2019年6月24日
Pressure accelerates the circadian clock of cyanobacteria

10th International conference on high pressure bioscience and biotechnology 2018年9月19日
High-pressure NMR study of the locally disordered conformation of outer surface protein A (OspA)

10th International conference on high pressure bioscience and biotechnology 2018年9月19日
リン酸化ユビキチンの２つのコンフォメーションの構造変化

第５７回NMR討論会 2018年9月18日
High-pressure NMR spectroscopy: Tools for studying protein dynamics

ICMRBS2018 2018年8月21日
High-pressure NMR reveals water-protein interactions coupled with protein conformational transition

ICMRBS2018 2018年8月20日
ライム病に関わるボレリア菌の表層蛋白質Outer surface protein A (OspA)の変性中間体の立体構造解析

第６５回日本生化学会近畿支部例会 2018年5月26日
高圧力NMR法による蛋白質の変性中間体の立体構造解析：ライム病に関わるボレリア菌Outer surface protein A(OspA)

日本薬学会第１３８会年会 2018年3月27日
ガス圧NMR法によるタンパク質における酸素結合部位の決定

第５６回NMR討論会 2017年11月14日
高圧力NMR法によるユビキチンの局所変性状態の立体構造決定

第５６回NMR討論会 2017年11月14日
リン酸化ユビキチンの２つのコンフォメーションの立体構造決定と圧力効果

第５６回NMR討論会 2017年11月14日
ガス圧NMR法によるタンパク質と溶存酸素の相互作用解析

日本分光学会ＮＭＲ分光部会講習会ーNMRで見る生体分子の運動・平衡状態・活性化状態ー 2017年10月6日

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担当経験のある科目(授業)

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所属学協会

Works(作品等)

特別講演

2007年1月その他
seminar: A new paradigm of protein structures

2006年2月その他
seminar:Exploring the entire conformational space of proteins by high pressure NMR

2004年7月その他

共同研究・競争的資金等の研究課題

冬眠する細胞が持つ圧力耐性－新たな網膜疾患治療戦略への展開

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2023年6月 - 2026年3月

小池千恵子, 前田亜希子, 北原亮, 高橋政代, 川村晃久
分子夾雑と生物時計

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2020年4月 - 2022年3月

北原亮
生物時計の圧力応答研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

北原亮
創薬への応用に向けたrasがん遺伝子産物の構造ダイナミクスの分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

島扶美, 田中成典, 熊坂崇, 片岡徹, 松本篤幸, 北原亮
変性中間体を標的とした構造生物学の新展開

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

北原亮
ＡＬＳ発症に関わるＴＤＰ４３分子内標的の同定と抗体医療への応用研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2011年4月 - 2014年3月

漆谷真, 北原亮, 伊東秀文
高エネルギー構造の解明による蛋白質構造揺らぎの可視化

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2013年3月

北原亮
高圧力NMR法によるポリユビキチンの高次構造変化の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2010年 - 2011年

北原亮
TDP-43分子の構造的ゆらぎに着目した筋萎縮性側索硬化症の新たな病態探索

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2010年 - 2011年

漆谷真, 北原亮
圧力・温度摂動ＮＭＲ法による蛋白質の構造揺らぎ研究

財団法人サントリー生物有機科学研究所研究奨励金 2009年 - 2011年
高圧力NMR法による蛋白質の準安定状態にもとづいた構造・機能相関

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年 - 2010年

北原亮
高圧ＮＭＲ法による広い構造空間における蛋白質の構造解析

2002年 - 2005年

産業財産権

6332723 TDP-43の凝集体が蓄積する疾患を治療及び／又は予防するための化合物のスクリーニング方法

北原亮

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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