清水顕史 (Akifumi Shimizu) - マイポータル

基本情報

所属: 滋賀県立大学環境科学部生物資源管理学科准教授

学位: 博士(農学)(京都大学)

J-GLOBAL ID: 200901039262125175
researchmap会員ID: 5000067267

外部リンク: http://www.eonet.ne.jp/~vor-dem-gesetz/index.html

研究キーワード

研究分野

環境・農学 / 遺伝育種科学 /

委員歴

2008年

日本育種学会幹事(2008-)

論文

熱帯アジア地域の問題土壌と農業生産

小林優, 小山博之, 渡部敏裕, 前島恵理子, Anongnat Sriprachote, 落合久美子, 清水顕史, 近藤始彦, 飯泉佳子, 渡辺武 …

土肥誌 88(4) 346-351 2017年招待有り
IV-3 熱帯アジア地域の問題土壌と農業生産連続無施肥水田を利用した、イネ収量形質の全ゲノム関連解析（シンポジウム，2016年度佐賀大会）

清水顕史

日本土壌肥料学会講演要旨集 62 208-208 2016年
Metal accumulation by Arabidopsis halleri subsp gemmifera at a limestone mining site

Aki Kosugi, Jun Tamaru, Kazumi Gotou, Hazuka Y. Furihata, Akifumi Shimizu, Akira Kawabe, Emiko Harada

AUSTRALIAN JOURNAL OF BOTANY 63(1-2) 134-140 2015年査読有り
Genome-wide marker development for the wheat D genome based on single nucleotide polymorphisms identified from transcripts in the wild wheat progenitor Aegilops tauschii.

Julio Cesar, Masaru Iehisa, Akifumi Shimizu, Kazuhiro Sato, Ryo Nishijima, Kouhei Sakaguchi, Ryusuke Matsuda, Shuhei Nasuda, Shigeo Takumi

Theor. Appl. Genet. 127(261) 271 2014年
Discovery of high-confidence SNPs from large-scale de novo analysis of leaf transcripts of Aegilops tauschii, a wild wheat progenitor.

Julio Cesar, Masaru Iehisa, Akifumi Shimizu, Kazuhiro Sato, Shuhei Nasuda, Shigeo Takumi

DNA Research 19 487-497 2012年
Suppression of a NAC-Like Transcription Factor Gene Improves Boron-Toxicity Tolerance in Rice

Kumiko Ochiai, Akifumi Shimizu, Yutaka Okumoto, Toru Fujiwara, Toru Matoh

PLANT PHYSIOLOGY 156(3) 1457-1463 2011年7月査読有り

MISC

The shoot is important for high-affinity, nitrate uptake in Egeria densa, a submerged vascular plant

Takayanagi Shu, Takagi Yuma, Shimizu Akifumi, HASEGAWA Hiroshi

Journal of plant research 125(5) 669-678 2012年9月1日
OryzaExress：イネの機能アノテーションと遺伝子発現ネットワークの統合データベース

濱田和輝, 横山幸治, 土田博子, 佐野和美, 望月孝子, 大木信彦, 堀内陽子, 藤田雅丈, 渡辺正夫, 松岡信 …

日本植物生理学会年会およびシンポジウム講演要旨集 2011 826-826 2011年3月11日
OryzaExpress: An Integrated Database of Gene Expression Networks and Omics Annotations in Rice

Kazuki Hamada, Kohei Hongo, Keita Suwabe, Akifumi Shimizu, Taishi Nagayama, Reina Abe, Shunsuke Kikuchi, Naoki Yamamoto, Takaaki Fujii, Koji Yokoyama …

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 52(2) 220-229 2011年2月
OryzaExpress:イネの遺伝子発現ネットワークとオミックス情報統合データベース

濱田和輝, 本郷耕平, 諏訪部圭太, 清水顕史, 長山大志, 阿部伶奈, 菊地俊介, 山本直樹, 藤井貴朗, 横山幸治 …

育種学研究 13 2011年
GENE DISCOVERY METHODS FROM LARGE-SCALE GENE EXPRESSION DATA

Akifumi Shimizu, Kentaro Yano

QUANTUM BIO-INFORMATICS III: FROM QUANTUM INFORMATION TO BIO-INFORMATICS 26(489) 489-+ 2010年
GENE DISCOVERY METHODS FROM LARGE-SCALE GENE EXPRESSION DATA

Akifumi SHIMIZU, Kentaro YANO

QUANTUM BIO-INFORMATICS III(489) 496 2010年
Rapid Construction of a High-Density Rice Linkage Map by High Efficiency Genome Scanning (HEGS) System

Akifumi SHIMIZU, Shinji KAWASAKI

Rice Science 16(4) 247-253 2009年12月
Rapid Construction of a High-Density Rice Linkage Map by High Efficiency Genome Scanning (HEGS) System

Akifumi SHIMIZU, Shinji KAWASAKI

Rice Science 16(4) 247-253 2009年12月
Changes in the Gene Expression of the White Rot Fungus Phanerochaete chrysosporium Due to the Addition of Atropine

Masahiko Minami, Kazumi Suzuki, Akifumi Shimizu, Tomohiro Hongo, Takaiku Sakamoto, Naoki Ohyama, Hironori Kitaura, Akiho Kusaka, Kenji Iwama, Toshikazu Irie

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 73(8) 1722-1731 2009年8月
Changes in the Gene Expression of the White Rot Fungus Phanerochaete chrysosporium Due to the Addition of Atropine

Masahiko Minami, Kazumi Suzuki, Akifumi Shimizu, Tomohiro Hongo, Takaiku Sakamoto, Naoki Ohyama, Hironori Kitaura, Akiho Kusaka, Kenji Iwama, Toshikazu Irie

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 73(8) 1722-1731 2009年8月
QTL analysis of genetic tolerance to iron toxicity in rice (Oryza Sativa L.) by quantification of bronzing score

Akifumi Shimizu

Journal of New Seeds 10(3) 171-179 2009年7月
QTL analysis of genetic tolerance to iron-toxicity in rice (Oryza sativa L.) by quantification of bronzing score.

Shimizu A

Journal of New Seeds 10(3) 171-179 2009年
Genetic analysis of root elongation induced by phosphorus deficiency in rice (Oryza sativa L.): fine QTL mapping and multivariate analysis of related traits

Akifumi Shimizu, Kenji Kato, Akiko Komatsu, Keiji Motomura, Hiroshi Ikehashi

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS 117(6) 987-996 2008年10月
Genetic analysis of root elongation induced by phosphorus deficiency in rice (Oryza sativa L.): fine QTL mapping and multivariate analysis of related traits

Akifumi Shimizu, Kenji Kato, Akiko Komatsu, Keiji Motomura, Hiroshi Ikehashi

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS 117(6) 987-996 2008年10月
イネのホウ素過剰害耐性遺伝子の単離

落合久美子, 清水顕史, 奥本裕, 間藤徹

日本土壌肥料学会講演要旨集 54 88 2008年9月9日査読有り
Boron toxicity in rice (Oryza sativa L.). I. Quantitative trait locus (QTL) analysis of tolerance to boron toxicity

K. Ochiai, S. Uemura, A. Shimizu, Y. Okumoto, T. Matoh

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS 117(1) 125-133 2008年6月
Boron toxicity in rice (Oryza sativa L.). I. Quantitative trait locus (QTL) analysis of tolerance to boron toxicity

K. Ochiai, S. Uemura, A. Shimizu, Y. Okumoto, T. Matoh

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS 117(1) 125-133 2008年6月
イネのホウ素過剰害機構の解明とホウ素過剰耐性遺伝子の単離

落合久美子, 清水彰史, 植村辰一, 奥本裕, 間藤徹

日本土壌肥料学会講演要旨集 52 56 2006年9月5日
A new method for gene discovery in large-scale microarray data

K Yano, K Imai, A Shimizu, T Hanashita

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 34(5) 1532-1539 2006年
A new method for gene discovery in large-scale microarray data

K Yano, K Imai, A Shimizu, T Hanashita

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 34(5) 1532-1539 2006年

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書籍等出版物

Proceedings of the Final International Meeting for 21th Century Center for Excellence (COE) Program, “Development of New Bioremediation Systems of Acid Sulfate Soil for Agriculture and Forestry"

SHOUKADOH Book Sellers 2008年 (ISBN: 9784879746085)
Brassicas and Legumes. From Genome Structure to Breeding . Biotechnology in Agriculture and Forestry , Vol. 52

Springer 2003年 (ISBN: 9783540427285)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

低肥料で持続可能なイネ生産に役立つ遺伝子探索と、深層学習による新形質分類法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

清水顕史
低肥料環境の収量性限界突破に寄与するイネ遺伝子座および座間相互作用の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

清水顕史
貧栄養ストレス耐性イネ品種開発のためのゲノム解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

清水顕史, 山崎将紀
環境保全型イネのゲノム育種に役立つ、酸性土壌ストレス耐性の遺伝子単離と機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2010年 - 2012年

清水顕史
大規模EST情報からの遺伝子発現パターンを利用した有用遺伝子の探索手法の開発

科学研究費補助金 2007年 - 2008年
地力窒素と土壌固定リンの吸収能力に優れたイネの選抜と育種

受託研究 2008年
酸性適応植物の分子生物学的解析

科学技術振興調整費による中核的研究拠点（ＣＯＥ）育成 2003年 - 2007年
環境保全型農業のための、イネのリン欠乏ストレス応答形質の単離と機能解析

科学研究費補助金 2007年
Molecular biological analysis of acid soil adapted plants

SCF System for Establishment and Support of Center's of Excellence 2003年 - 2006年

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