泊幸秀 (Yukihide Tomari) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学定量生命科学研究所教授
: 新領域創成科学研究科教授

学位: 博士(工学)(東京大学)

研究者番号: 90447368
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-8442-0851
J-GLOBAL ID: 201701006995048298
researchmap会員ID: B000279499

外部リンク: http://www.iqb.u-tokyo.ac.jp/tomari/jp/

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論文

100

Non-gonadal somatic piRNA pathways ensure sexual differentiation, larval growth, and wing development in silkworms.

Takashi Kiuchi, Keisuke Shoji, Natsuko Izumi, Yukihide Tomari, Susumu Katsuma

PLoS genetics 19(9) e1010912 2023年9月
The piRNA cluster torimochi is an expanding transposon in cultured silkworm cells.

Keisuke Shoji, Yusuke Umemura, Susumu Katsuma, Yukihide Tomari

PLoS genetics 19(2) e1010632 2023年2月9日
The mechanisms of siRNA selection by plant Argonaute proteins triggering DNA methylation

Wei Liu, Keisuke Shoji, Masahiro Naganuma, Yukihide Tomari, Hiro-oki Iwakawa

Nucleic Acids Research 50(22) 12997-13010 2022年12月7日
The two Gtsf paralogs in silkworms orthogonally activate their partner PIWI proteins for target cleavage.

Natsuko Izumi, Keisuke Shoji, Takashi Kiuchi, Susumu Katsuma, Yukihide Tomari

RNA (New York, N.Y.) 2022年11月1日
GTSF1 accelerates target RNA cleavage by PIWI-clade Argonaute proteins.

Amena Arif, Shannon Bailey, Natsuko Izumi, Todd A Anzelon, Deniz M Ozata, Cecilia Andersson, Ildar Gainetdinov, Ian J MacRae, Yukihide Tomari, Phillip D Zamore

Nature 608(7923) 618-625 2022年8月
Structure of the Dicer-2-R2D2 heterodimer bound to a small RNA duplex.

Sonomi Yamaguchi, Masahiro Naganuma, Tomohiro Nishizawa, Tsukasa Kusakizako, Yukihide Tomari, Hiroshi Nishimasu, Osamu Nureki

Nature 607(7918) 393-398 2022年7月
The requirement of GW182 in miRNA-mediated gene silencing in Drosophila larval development

Eriko Matsuura-Suzuki, Yukihide Tomari

2022年6月17日
Fusion with heat-resistant obscure (Hero) proteins have the potential to improve the molecular property of recombinant proteins.

Eri Morimoto, Kotaro Tsuboyama, Yukihide Tomari

PloS one 17(6) e0270097 2022年
Revisiting the Glass Treatment for Single-Molecule Analysis of ncRNA Function.

Shuting Shen, Masahiro Naganuma, Yukihide Tomari, Hisashi Tadakuma

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2509 209-231 2022年
Life of RISC: Formation, action, and degradation of RNA-induced silencing complex

Hiro-oki Iwakawa, Yukihide Tomari

Molecular Cell 82(1) 30-43 2022年1月
Cell-free reconstitution reveals the molecular mechanisms for the initiation of secondary siRNA biogenesis in plants

Yuriki Sakurai, Kyungmin Baeg, Andy Y. W. Lam, Keisuke Shoji, Yukihide Tomari, Hiro-oki Iwakawa

Proceedings of the National Academy of Sciences 118(31) e2102889118-e2102889118 2021年8月3日
Functional specialization of monocot DCL3 and DCL5 proteins through the evolution of the PAZ domain

Shirui Chen, Wei Liu, Masahiro Naganuma, Yukihide Tomari, Hiro-oki Iwakawa

Nucleic acids research 50(8) 4669-4684 2021年8月2日
RNase κ promotes robust piRNA production by generating 2',3'-cyclic phosphate-containing precursors.

Megumi Shigematsu, Takuya Kawamura, Keisuke Morichika, Natsuko Izumi, Takashi Kiuchi, Shozo Honda, Venetia Pliatsika, Ryuma Matsubara, Isidore Rigoutsos, Susumu Katsuma …

Nature communications 12(1) 4498-4498 2021年7月23日
Single-molecule analysis of processive double-stranded RNA cleavage by Drosophila Dicer-2.

Masahiro Naganuma, Hisashi Tadakuma, Yukihide Tomari

Nature communications 12(1) 4268-4268 2021年7月13日
Dynamic subcellular compartmentalization ensures fidelity of piRNA biogenesis in silkworms.

Pui Yuen Chung, Keisuke Shoji, Natsuko Izumi, Yukihide Tomari

EMBO reports 22(7) e51342 2021年5月11日
Mechanistic analysis of the enhanced RNAi activity by 6-mCEPh-purine at the 5' end of the siRNA guide strand.

Vincent Brechin, Fumikazu Shinohara, Jun-Ichi Saito, Hervé Seitz, Yukihide Tomari

RNA (New York, N.Y.) 27(2) 151-162 2021年2月
siRNA potency enhancement via chemical modifications of nucleotide bases at the 5'-end of the siRNA guide strand.

Fumikazu Shinohara, Taiji Oashi, Toshimasa Harumoto, Tomoyuki Nishikawa, Yuki Takayama, Hikaru Miyagi, Yuichi Takahashi, Takahiro Nakajima, Takashi Sawada, Yasuo Koda …

RNA (New York, N.Y.) 27(2) 163-173 2021年2月
Ribosome stalling caused by the Argonaute-miRNA-SGS3 complex regulates production of secondary siRNA biogenesis in plants

Hiro-oki Iwakawa, Andy Y.W. Lam, Akira Mine, Tomoya Fujita, Kaori Kiyokawa, Manabu Yoshikawa, Atsushi Takeda, Shintaro Iwasaki, Yukihide Tomari

Cell reports 35(13) 109300-109300 2020年9月11日
A widespread family of heat-resistant obscure (Hero) proteins protect against protein instability and aggregation.

Kotaro Tsuboyama, Tatsuya Osaki, Eriko Matsuura-Suzuki, Hiroko Kozuka-Hata, Yuki Okada, Masaaki Oyama, Yoshiho Ikeuchi, Shintaro Iwasaki, Yukihide Tomari

PLoS biology 18(3) e3000632 2020年3月査読有り
Zucchini consensus motifs determine the mechanism of pre-piRNA production.

Natsuko Izumi, Keisuke Shoji, Yutaka Suzuki, Susumu Katsuma, Yukihide Tomari

Nature 578(7794) 311-316 2020年1月29日査読有り

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