中村保一 (Nakamura Yasukazu) - マイポータル

基本情報

所属: 国立遺伝学研究所情報研究系大量遺伝情報研究室教授 (所長補佐)
: 総合研究大学院大学先端学術院先端学術専攻遺伝学コース教授
: かずさDNA研究所ゲノム情報解析施設特任研究員

学位: 博士（理学）(2001年3月総合研究大学院大学)

通称等の別名: 猫教授
研究者番号: 60370920
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-6782-5715
J-GLOBAL ID: 201001025273786718
researchmap会員ID: 6000022106

外部リンク: http://ynlab.info/yn/

Scopus: https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=8390810700
日本の研究.com: https://research-er.jp/researchers/view/241637
Google Scholar Citations: https://scholar.google.co.jp/citations?user=GVVAQekAAAAJ

※ Google Scholar は常に他の Y Nakamura さんの大量のコンタミが入ってきます。たまにチェックしていますが除き切れていません

論文

189

Gene expression profiles associated with early relapse during first remission induction in canine multicentric high-grade B-cell lymphoma.

Hiroto Toyoda, Akiyoshi Tani, Yuko Goto-Koshino, Tomoki Motegi, Mika Sakamoto, Takako Mochizuki, Kei Harada, Tetsuya Kobayashi, Asuka Setoguchi, Yohei Shizuta …

The Journal of veterinary medical science 86(1) 18-27 2024年1月10日査読有り
DDBJ update in 2023: the MetaboBank for metabolomics data and associated metadata.

Takeshi Ara, Yuichi Kodama, Toshiaki Tokimatsu, Asami Fukuda, Takehide Kosuge, Jun Mashima, Yasuhiro Tanizawa, Tomoya Tanjo, Osamu Ogasawara, Takatomo Fujisawa …

Nucleic acids research 52(D1) D67-D71 2024年1月5日査読有り
Genome Annotation Matters: From Genes to Phylogenetic Inferences.

Chihiro Furumizu, Yasuhiro Tanizawa, Yasukazu Nakamura

Plant & cell physiology 2023年11月30日査読有り
A practical assembly guideline for genomes with various levels of heterozygosity.

Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Takuro Nakayama, Goro Tanifuji, Ryoma Kamikawa, Yasukazu Nakamura

Briefings in bioinformatics 24(6) 2023年9月22日査読有り最終著者責任著者
Establishing a comprehensive web-based analysis platform for Nicotiana benthamiana genome and transcriptome

Ken-ichi Kurotani, Hideki Hirakawa, Kenta Shirasawa, Koya Tagiri, Moe Mori, Yasunori Ichihashi, Takamasa Suzuki, Yasuhiro Tanizawa, Yasukazu Nakamura, Sachiko Isobe …

bioRxiv 2023年9月5日
Plant GARDEN: a portal website for cross-searching between different types of genomic and genetic resources in a wide variety of plant species.

Hisako Ichihara, Manabu Yamada, Mitsuyo Kohara, Hideki Hirakawa, Andrea Ghelfi, Takuro Tamura, Akihiro Nakaya, Yasukazu Nakamura, Sachiko Shirasawa, Samatchaya Yamashita …

BMC plant biology 23(1) 391-391 2023年8月12日査読有り
Large-scale epidemiological study on feline autosomal dominant polycystic kidney disease and identification of novel PKD1 gene variants.

Fumitaka Shitamori, Ayaka Nonogaki, Tomoki Motegi, Yuki Matsumoto, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Yasukazu Nakamura, Tomohiro Yonezawa, Yasuyuki Momoi, Shingo Maeda

Journal of feline medicine and surgery 25(7) 1098612X231185393 2023年7月査読有り
A leaf-emanated signal orchestrates grain size and number in response to maternal resources.

Kim Nhung Ta, Sae Shimizu-Sato, Ayumi Agata, Yuri Yoshida, Ken-Ichiro Taoka, Hiroyuki Tsuji, Takashi Akagi, Yasuhiro Tanizawa, Ryosuke Sano, Misuzu Nosaka-Takahashi …

The Plant journal : for cell and molecular biology 115(1) 175-189 2023年7月査読有り
Plastomes of Garcinia mangostana L. and Comparative Analysis with Other Garcinia Species.

Ching-Ching Wee, Nor Azlan Nor Muhammad, Vijay Kumar Subbiah, Masanori Arita, Yasukazu Nakamura, Hoe-Han Goh

Plants (Basel, Switzerland) 12(4) 2023年2月17日査読有り
A highly contiguous genome assembly of red perilla (Perilla frutescens) domesticated in Japan

Keita Tamura, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Takako Mochizuki, Shuji Matsushita, Yoshihiro Kato, Takeshi Ishikawa, Keisuke Okuhara, Yasukazu Nakamura, Hidemasa Bono

DNA Research 2023年2月1日査読有り
Best Practices for Comprehensive Annotation of Neuropeptides of Gryllus bimaculatus

Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Hitomi Seike, Zhen Zhu, Yi Jun Zhou, Keisuke Fukumura, Shinji Nagata, Yasukazu Nakamura

Insects 14(2) 121-121 2023年1月25日査読有り最終著者責任著者
DNA Data Bank of Japan (DDBJ) update report 2022.

Yasuhiro Tanizawa, Takatomo Fujisawa, Yuichi Kodama, Takehide Kosuge, Jun Mashima, Tomoya Tanjo, Yasukazu Nakamura

Nucleic acids research 51(D1) D101-D105 2023年1月6日最終著者
MarpolBase Expression: A Web-Based, Comprehensive Platform for Visualization and Analysis of Transcriptomes in the Liverwort Marchantia polymorpha.

Shogo Kawamura, Facundo Romani, Masaru Yagura, Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Shohei Yamaoka, Ryuichi Nishihama, Yasukazu Nakamura, Katsuyuki T Yamato, John L Bowman …

Plant & cell physiology 63(11) 1745-1755 2022年11月22日査読有り
Mitochondrial genome of Garcinia mangostana L. variety Mesta.

Ching-Ching Wee, Nor Azlan Nor Muhammad, Vijay Kumar Subbiah, Masanori Arita, Yasukazu Nakamura, Hoe-Han Goh

Scientific reports 12(1) 9480-9480 2022年6月8日査読有り
Repeated translocation of a supergene underlying rapid sex chromosome turnover in Takifugu pufferfish.

Ahammad Kabir, Risa Ieda, Sho Hosoya, Daigaku Fujikawa, Kazufumi Atsumi, Shota Tajima, Aoi Nozawa, Takashi Koyama, Shotaro Hirase, Osamu Nakamura …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(23) e2121469119 2022年6月7日査読有り
Genome evolution of a nonparasitic secondary heterotroph, the diatom Nitzschia putrida.

Ryoma Kamikawa, Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Takuro Nakayama, Ryo Onuma, Ugo Cenci, Daniel Moog, Samuel Speak, Krisztina Sarkozi …

Science advances 8(17) eabi5075 2022年4月29日査読有り
Plant GARDEN: a portal website for accessing plant genome, DNA marker, and SNP information

H. Ichihara, H. Hirakawa, A. Ghelfi, M. Kohara, M. Yamada, T. Tamura, A. Nakaya, Y. Nakamura, S. Shirasawa, E. Sugihara …

Acta Horticulturae (1339) 415-418 2022年4月査読有り
Identification of the sex-determining factor in the liverwort Marchantia polymorpha reveals unique evolution of sex chromosomes in a haploid system.

Miyuki Iwasaki, Tomoaki Kajiwara, Yukiko Yasui, Yoshihiro Yoshitake, Motoki Miyazaki, Shogo Kawamura, Noriyuki Suetsugu, Ryuichi Nishihama, Shohei Yamaoka, Dierk Wanke …

Current biology : CB 31(24) 5522-5532 2021年12月20日査読有り
Genome sequencing of the NIES Cyanobacteria collection with a focus on the heterocyst-forming clade.

Yuu Hirose, Yoshiyuki Ohtsubo, Naomi Misawa, Chinatsu Yonekawa, Nobuyoshi Nagao, Yohei Shimura, Takatomo Fujisawa, Yu Kanesaki, Hiroshi Katoh, Mitsunori Katayama …

DNA research 28(6) 2021年10月11日査読有り
OryzaGenome2.1: Database of Diverse Genotypes in Wild Oryza Species.

Hiromi Kajiya-Kanegae, Hajime Ohyanagi, Toshinobu Ebata, Yasuhiro Tanizawa, Akio Onogi, Yuji Sawada, Masami Yokota Hirai, Zi-Xuan Wang, Bin Han, Atsushi Toyoda …

Rice (New York, N.Y.) 14(1) 24-24 2021年3月4日査読有り

もっとみる

研究分野

経歴

2009年1月 - 現在

かずさDNA研究所, 特任研究員
2009年1月 - 現在

総合研究大学院大学, 生命科学研究科遺伝学専攻, 教授
2009年1月 - 現在

国立遺伝学研究所, 大量遺伝情報研究室, 教授
2006年4月 - 2008年12月

かずさDNA研究所, 植物ゲノム情報研究室, 室長
2003年4月 - 2008年12月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻, 客員准教授
2001年4月 - 2006年3月

かずさDNA研究所, 主任研究員
1996年4月 - 2001年3月

かずさDNA研究所, 研究員

学歴

1994年4月 - 1996年3月

総合研究大学院大学, 大学院生命科学研究科, 遺伝学専攻
1989年4月 - 1991年3月

京都大学, 大学院農学研究科, 農芸化学専攻
1985年4月 - 1989年3月

信州大学, 農学部, 農芸化学科

委員歴

2023年5月 - 現在

The Genome Taxonomy Database (GTDB), Scientific Advisory Board member
2021年12月 - 現在

農研機構基盤技術セグメント検討会, 外部レビュー委員
2020年1月 - 現在

China National Genomics Data Center's Scientific Advisory Board, Scientific Advisor
2019年4月 - 現在

理化学研究所バイオリソース研究センター, 情報検討委員会委員
2018年4月 - 現在

ナショナルバイオリソースプロジェクト「藻類」, 運営委員会委員

MISC

272

生物間相互作用のモデル植物Nicotiana benthamianaの詳細ゲノム解析

黒谷賢一, 平川秀樹, 白澤健太, 谷澤靖洋, 中村保一, 磯部祥子, 野田口理孝

日本植物生理学会年会(Web) 64(2) 248-257 2023年2月9日
微生物バイオインフォマティクスの最前線マイクロバイオーム研究を先導するハブを目指したMicrobiome Datahubの開発

森宙史, 藤澤貴智, 東光一, 中村保一, 山田拓司, 松井求, 内山郁夫

日本細菌学雑誌 78(1) 30-30 2023年2月
様々なヘテロ接合性レベルを持つゲノムで検証された実用的なアセンブリガイドライン

望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 46th 2023年
マイクロバイオーム研究を先導するハブを目指したMicrobiome Datahubの開発

森宙史, 藤澤貴智, 東光一, 中村保一, 山田拓司, 松井求, 内山郁夫

日本細菌学雑誌(Web) 78(1) 2023年
非モデル生物のシークエンス解析・インフォマティクス解析

中村保一

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 87th 2023年
新規遺伝子アノテーションで明らかになるスエヒロタケ複数株におけるゲノム構成の違い

坂本美佳, 松前ひろみ, 小木曽映里, 望月孝子, 谷澤靖洋, KRYUKOV Kirill, 今西規, 豊田敦, 亀井克彦, 細矢剛 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 46th 2023年
植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2023年度・第2四半期版)

市原寿子, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 山田学, 清水武彦, 白澤沙知子, 戸田陽介, 平川英樹, 中村保一, 中村保一 …

育種学研究 25 2023年
生物間相互作用のモデル植物であるNicotiana benthamianaのゲノム解読

黒谷賢一, 平川秀樹, 白澤健太, 谷澤靖洋, 中村保一, 磯部祥子, 野田口理孝

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 87th 2023年
Marpolbase:ゼニゴケのための遺伝子情報および発現量データベースの開発

谷澤靖洋, 川村省吾, ROMANI Facundo, 矢倉勝, 望月孝子, 坂本美佳, 山岡尚平, 西浜竜一, 中村保一, 大和勝幸 …

日本植物生理学会年会(Web) 64th 2023年
植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2022年度・第4四半期版)

市原寿子, 平川英樹, 山田学, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 白澤沙知子, 戸田陽介, 清水武彦, 中村保一, 中村保一 …

育種学研究 25 2023年
モモ25品種の比較ゲノム解析

衣川達己, 谷澤靖洋, 中村保一, 伊藤武彦, 田中裕之, 平川英樹, 篠澤章久, 篠澤章久, 馬場正, 小田賢司 …

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
植物ゲノム統合データベースPlant GARDEN、微生物、メタボローム統合データベース間の連携検索システムの開発

平川英樹, 藤澤貴智, 守屋勇樹, 信定知江, 長崎英樹, 森宙史, 福島敦史, Ghelfi Andrea, 市原寿子, 中村保一 …

トーゴーの日2022 1 2022年10月5日
MicrobeDB.jpからMicrobiome Datahubへ: 微生物・植物・メタボロームのデータ統合と統合微生物データベースの再構築

藤澤貴智, 平川英樹, 守屋勇樹, 信定知江, 金谷重彦, 有田正規, 田畑哲之, 磯部祥子, 東光一, 中村保一 …

トーゴーの日2022 1 2022年10月5日
植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂（2022年度・第２四半期版）

市原寿子, 平川英樹, 山田学, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 白澤沙知子, 戸田陽介, 中村保一, 七夕高也, 田畑哲之 …

トーゴーの日2022 24 1 2022年10月5日
DDBJサービスの統合化を目指して

藤澤貴智, 小笠原理, 中村保一, 有田正規

トーゴーの日2022 2022年10月5日
苔類ゼニゴケの性染色体上の性決定因子の同定

岩崎美雪, 梶原智明, 安居佑季子, 吉竹良洋, 宮崎基, 川村昇吾, 末次憲之, 末次憲之, 西浜竜一, 西浜竜一 …

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 86th 2022年
MarpolBase Expression(MBEX):苔類ゼニゴケにおけるトランスクリプトームの可視化・解析データベース

川村昇吾, ROMANI Facundo, 矢倉勝, 望月孝子, 坂本美佳, 山岡尚平, 西浜竜一, 中村保一, 大和勝幸, BOWMAN John …

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 86th 2022年
Plant GARDENからMi-GARDENへ~公開ゲノム情報とユーザーデータをつなぐ~

磯部祥子, 市原寿子, 山田学, 中村保一, 中村保一, 戸田陽介, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 七夕高也, 平川英樹 …

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 86th 2022年
原核生物ゲノムの自動アノテーションおよびDDBJ登録支援パイプラインDFAST

谷澤靖洋, 藤澤貴智, 有田正規, 中村保一

日本ゲノム微生物学会年会要旨集 16th (Web) 2022年
NIESコレクションのシアノバクテリアのゲノム解析

広瀬侑, 大坪嘉行, 三澤直美, 米川千夏, 長尾信義, 志村遥平, 藤澤貴智, 兼崎友, 加藤浩, 片山光徳 …

日本ゲノム微生物学会年会要旨集 16th (Web) 2022年

もっとみる

講演・口頭発表等

300

Advancements in Nucleotide Sequencing and Genome Analysis: Updates from the DNA Data Bank of Japan

Yasukazu Nakamura

The 8th Big Data Forum for Life and Health Sciences (Beijing) 2023年10月18日招待有り
非モデル生物のシークエンス解析・インフォマティクス解析

中村保一

日本植物学会大会（札幌）シンポジウム 2023年9月7日招待有り
DNA Data Bank of Japan update report

中村保一

The 19th Asian Bioinformatics Consortium Symposium 2022年12月9日
第３回コンパニオンアニマルのゲノム医療研究会（主催）

中村保一, 松本悠貴, 桃沢幸秀

第３回コンパニオンアニマルのゲノム医療研究会 2022年12月4日
生命情報科学による高度先進獣医療

中村保一

千葉市科学館大人が楽しむ科学教室2022 2022年11月5日招待有り
植物の機能向上 DX のためのとりくみ紹介

中村保一

植物バイオテクトロジー学会 S2 植物機能の活用・向上に向けた DX 最前線 2022年9月12日招待有り
第２回コンパニオンアニマルのゲノム医療研究会（主催）

中村保一, 松本悠貴, 桃沢幸秀

第２回コンパニオンアニマルのゲノム医療研究会 2021年12月11日
染色体レベルゲノムアセンブルとそのDB ～MarpolBaseとPlant GARDEN～

中村保一

DDBJing / 植物インフォマティクス研究会講習会 2021年10月5日
DDBJとINSDCならびに遺伝研スパコン紹介

中村保一

DDBJing / 植物インフォマティクス研究会講習会 2021年10月5日
バイオエコノミーに資する染色体レベルゲノム情報の提供

中村保一

植物バイオテクノロジーとデジタル情報解析が牽引するバイオエコノミー社会の実現・第３８回日本植物バイオテクノロジー学会 2021年9月11日招待有り
Complete genomes of plants for smart agriculture

Yasukazu Nakamura

Laser Solutions for Space and the Earth 2021 2021年4月21日招待有り
A chromosome-level assembly of a domestic cat of American Shorthair

Yasukazu Nakamura

Genome Concept Centennial Symposium 2021年2月24日招待有り
植物インフォマティクス講習会

中村保一

植物インフォマティクス講習会 2021年1月27日
イエネコゲノムの完全配列をゲノム医療に役立てるために

中村保一

遺伝研研究会：コンパニオンアニマルのゲノム医療 2020年12月12日招待有り
DDBJ and the INSDC

Yasukazu Nakamura

The annual meeting of the international confernece on genomics; ICG-15 2020年11月27日招待有り
動植物ゲノムの公共データベース

中村保一

明治大学バイオエコノミー講義 2020年10月8日招待有り
遺伝子の水平伝播からゲノム進化を考える（オーガナイザー）

中村保一

第42回日本分子生物学会年会ワークショップ 2AW-14 2019年12月4日
ゲノム科学＋DDBJ入門

中村保一

静岡大学大学院・統合オミックス特論II 2019年11月20日招待有り
How to deal with controlled-access data in DNA Data Bank of Japan

Yasukazu Nakamura

CODATA: the next-generation data-driven science 2019年9月20日招待有り
We are ready to 10 k microbe genomes

Yasukazu Nakamura

A high-level CODATA data policy meeting 2019年9月18日招待有り

もっとみる

担当経験のある科目(授業)

2022年4月 - 現在

進化ゲノム生物学 (総合研究大学院大学生命科学研究科)
2017年4月 - 現在

統合オミックス特論 (静岡大学大学院総合科学技術研究科)
2019年4月 - 2023年3月

バイオエコノミー (明治大学農学部)
2021年10月 - 2022年3月

生命科学特別講義 (京都大学大学院生命科学研究科)
2002年4月 - 2016年3月

バイオインフォマティクス特論 (東京工業大学大学院生命理工学研究科)
2006年4月 - 2009年3月

オーミクス論 (東京大学大学院新領域創成科学研究科情報生命専攻)
2003年4月 - 2006年3月

ゲノムアノテーション (東京大学理学部生物情報科学学部教育特別プログラム)

所属学協会

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

翻訳開始因子DAP5を軸とした腎糸球体障害の病態理解と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2023年4月 - 2028年3月

前田真吾, 柏原直樹, 藤井渉, 中村保一
先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成) 学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成) 2022年4月 - 2028年3月

黒川顕, 川嶋実苗, 豊田敦, 鈴木穣, 林哲也, 中村保一, 森宙史, 野口英樹, 浅井潔, 岩崎渉, 森下真一, 笠原雅弘, 伊藤武彦, 瀬々潤, 中谷明弘, 島村徹平, 波江野洋, 熊谷雄太郎, 高橋弘喜, 平川英樹, 浜田道昭, 山田拓司
ベンサミアナタバコのゲノム解析に基づく植物の接木分子基盤解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

黒谷賢一, 川勝弥一, 中村保一
広島から世界最先端のバイオエコノミー社会を実現するBio×Digital Transformation(バイオDX)産学共創拠点

科学技術振興機構産学が連携した研究開発成果の展開研究成果展開事業共創の場形成支援共創の場形成支援プログラム(COI-NEXT) 共創分野(育成型) 2020年 - 2021年
データサイエンスを加速させる微生物統合データベースの高度実用化開発

JST/NBDC ライフサイエンスデータベース統合推進事業統合化推進プログラム 2017年 - 2021年

黒川顕
個体ゲノム時代に向けた植物ゲノム情報解析基盤の構築

JST/NBDC ライフサイエンスデータベース統合推進事業統合化推進プログラム 2017年 - 2021年

田畑哲之
ゲノム不安定性疾患群を中心とした希少難治性疾患の次世代マルチオミクス診断拠点構築

AMED 難治性疾患実用化研究事業 2017年 - 2021年

荻朋男

もっとみる

中村保一

基本情報

論文

研究分野

経歴

学歴

委員歴

MISC

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

メニュー

共著者の一覧

フォロー一覧