佐甲靖志 (Yasushi Sako) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所開拓研究本部主任研究員

学位: 理学博士(京都大学)

J-GLOBAL ID: 201801011905909096
researchmap会員ID: B000311579

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /

論文

125

TRPV4-dependent Ca2+ influx determines cholesterol dynamics at the plasma membrane

Yutaro Kuwashima, Masataka Yanagawa, Masashi Maekawa, Mitsuhiro Abe, Yasushi Sako, Makoto Arita

Biophysical Journal 2024年3月
Comprehensive identification of potentially functional genes for transposon mobility in theC. elegansgenome

Yukinobu Arata, Peter Jurica, Nicholas Parrish, Yasushi Sako

2023年8月11日
Quantitative Imaging Analysis of NF-κB for Mathematical Modeling Applications

Johannes Nicolaus Wibisana, Takehiko Inaba, Yasushi Sako, Mariko Okada

Computational Modeling of Signaling Networks (Springer US) 253-266 2023年4月20日査読有り招待有り
Two closed conformations of CRAF require the 14-3-3 binding motifs and cysteine-rich domain to be intact in live cells

Kenji Okamoto, Yasushi Sako

Journal of Molecular Biology 167989-167989 2023年2月
Heterotrimeric Gq proteins act as a switch for GRK5/6 selectivity underlying β-arrestin transducer bias

Kouki Kawakami, Masataka Yanagawa, Suzune Hiratsuka, Misaki Yoshida, Yuki Ono, Michio Hiroshima, Masahiro Ueda, Junken Aoki, Yasushi Sako, Asuka Inoue

Nature Communications 13(1) 2022年12月
Two closed conformations of CRAF require the 14-3-3 binding motifs and cysteine-rich domain to be intact in live cells

Kenji Okamoto, Yasushi Sako

2022年10月21日
Threonine phosphorylation regulates the molecular assembly and signaling of EGFR in cooperation with membrane lipids

Ryo Maeda, Hiroko Tamagaki-Asahina, Takeshi Sato, Masataka Yanagawa, Yasushi Sako

Journal of Cell Science 135(15) 2022年8月1日
A novel sterol-binding protein reveals heterogeneous cholesterol distribution in neurite outgrowth and in late endosomes/lysosomes

Akiko Yamaji-Hasegawa, Motohide Murate, Takehiko Inaba, Naoshi Dohmae, Masayuki Sato, Fumihiro Fujimori, Yasushi Sako, Peter Greimel, Toshihide Kobayashi

Cellular and Molecular Life Sciences 79(6) 2022年6月
Enhanced transcriptional heterogeneity mediated by NF-κB super-enhancers.

Johannes N Wibisana, Takehiko Inaba, Hisaaki Shinohara, Noriko Yumoto, Tetsutaro Hayashi, Mana Umeda, Masashi Ebisawa, Itoshi Nikaido, Yasushi Sako, Mariko Okada

PLoS genetics 18(6) e1010235 2022年6月1日
Insulin signaling shapes fractal scaling of C. elegans behavior

Yukinobu Arata, Itsuki Shiga, Yusaku Ikeda, Peter Jurica, Hiroshi Kimura, Ken Kiyono, Yasushi Sako

Scientific Reports 12(1) 2022年6月査読有り
Assessing transfer entropy from biochemical data

Takuya Imaizumi, Nobuhisa Umeki, Ryo Yoshizawa, Tomoyuki Obuchi, Yasushi Sako, Yoshiyuki Kabashima

Physical Review E 105(3) 2022年3月8日
Amyloid conformation-dependent disaggregation in a reconstituted yeast prion system

Yoshiko Nakagawa, Howard C.-H. Shen, Yusuke Komi, Shinju Sugiyama, Takaaki Kurinomaru, Yuri Tomabechi, Elena Krayukhina, Kenji Okamoto, Takeshi Yokoyama, Mikako Shirouzu …

Nature Chemical Biology 2022年2月17日
Scanning Two-Dimensional Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy: Conformational Dynamics of DNA Holliday Junction from Microsecond to Subsecond

Wooseok Heo, Kazuto Hasegawa, Kenji Okamoto, Yasushi Sako, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara

The Journal of Physical Chemistry Letters 1249-1257 2022年1月28日
PMP2/FABP8 induces PI(4,5)P2-dependent transbilayer reorganization of sphingomyelin in the plasma membrane

Mitsuhiro Abe, Asami Makino, Motohide Murate, Françoise Hullin-Matsuda, Masataka Yanagawa, Yasushi Sako, Toshihide Kobayashi

Cell Reports 37(6) 109935-109935 2021年11月
Comparative Analysis of Single-Molecule Dynamics of TRPV1 and TRPV4 Channels in Living Cells

Yutaro Kuwashima, Masataka Yanagawa, Mitsuhiro Abe, Michio Hiroshima, Masahiro Ueda, Makoto Arita, Yasushi Sako

International Journal of Molecular Sciences 22(16) 8473-8473 2021年8月6日
p52Shc regulates the sustainability of ERK activation in a RAF-independent manner.

Ryo Yoshizawa, Nobuhisa Umeki, Akihiro Yamamoto, Mariko Okada, Masayuki Murata, Yasushi Sako

Molecular biology of the cell mbcE21010007 2021年7月14日
Imaging and single cell sequencing analyses of super-enhancer activation mediated by NF-κ B in B cells

Johannes Nicolaus Wibisana, Takehiko Inaba, Hisaaki Shinohara, Noriko Yumoto, Tetsutaro Hayashi, Mana Umeda, Masashi Ebisawa, Itoshi Nikaido, Yasushi Sako, Mariko Okada

2021年7月13日
DNA-based Synthetic Growth Factor Surrogates with Fine-tuned Agonism.

Momoko Akiyama, Ryosuke Ueki, Masataka Yanagawa, Mitsuhiro Abe, Michio Hiroshima, Yasushi Sako, Shinsuke Sando

Angewandte Chemie (International ed. in English) 2021年6月17日
Single-molecule Imaging of GPCRs: An Application to the Drug Evaluation and Pharmacology

Masataka YANAGAWA, Yasushi SAKO

Seibutsu Butsuri 61(6) 366-369 2021年
Workflows of the Single-Molecule Imaging Analysis in Living Cells: Tutorial Guidance to the Measurement of the Drug Effects on a GPCR

Masataka Yanagawa, Yasushi Sako

Methods in Molecular Biology 391-441 2021年

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MISC

119

Gαタンパク質を起点したGRK-βアレスチン機能制御機構

川上耕季, 柳川正隆, 平塚寿々音, 佐甲靖志, 井上飛鳥

GPCR研究会プログラム・抄録集 17th 2022年
樹状細胞に対する炎症収束性メディエーターResolvinE3の作用の検討

佐藤真季子, 齋藤悠, 鶴巻寛朗, 矢冨正清, 古賀康彦, 砂長則明, 前野敏孝, 石塚全, 柳川正隆, 佐甲靖志 …

アレルギー 69(臨時増刊号) 296-296 2020年10月
バキュロウイルス核膜タンパク質Bm5/Ac13の局在機構解析

永峰俊弘, 稲葉岳彦, 佐甲靖志

日本蚕糸学会大会・蚕糸・昆虫機能学術講演会講演要旨集 88th 63 2018年3月19日
細胞膜受容体の1分子イメージング

柳川正隆, 佐甲靖志

生体の科学 68(5) 386-387 2017年10月招待有り
バキュロウイルス感染細胞核抽出液によるチューブ状リポソームの形成誘導

永峰俊弘, 稲葉岳彦, 佐甲靖志

日本蚕糸学会大会・蚕糸・昆虫機能学術講演会講演要旨集 87th 45 2017年3月17日
細胞内シグナルのアナログ・デジタル変換

新土優樹, 小迫英尊, 佐甲靖志, 高橋恒一

生物物理 Vol.56(No.6) 334-336 2016年9月9日
Ras‐RalGDS相互作用の1分子蛍光イメージング

梅木伸久, 吉澤亮, 中村由樹, 稲葉岳彦, 前田亮, 柳川正隆, 佐甲靖志

日本生化学会大会(Web) 88th 3P0178 (WEB ONLY)-[3P0178] 2015年12月
9pAR-6 細胞内情報処理反応の1分子計測(9pAR 領域12,領域11合同招待講演,領域12(ソフトマター物理・化学物理・生物物理))

佐甲靖志

日本物理学会講演概要集 69(2) 223-223 2014年8月22日
細胞内情報処理反応の1分子計測：タンパク質ダイナミクスと分子認識

佐甲靖志, 廣島通夫, 日比野佳代

「１分子ナノバイオ計測」野地博行編化学同人 180-189 2014年
特定の糖鎖構造を持つ標的タンパク質の蛍光イメージングと細胞内動態解析

芳賀淑美, 石井久美子, 日比野佳代, 佐甲靖志, 伊藤幸成, 谷口直之, 鈴木匡

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 86回 2P-002 2013年9月
個体の生物物理学分子・細胞・個体にブリッジ動物の発生におけるPAR/aPKC細胞極性システムの計測に基づいた数理モデル化(Biophysics toward In Vivo work Measurement-based mathematical modeling of PAR/aPKC-dependent cell polarization in animal development)

荒田幸信, 廣島通夫, 白燦基, 小林徹也, 柴田達夫, 佐甲靖志

生物物理 53(Suppl.1-2) S104-S104 2013年9月
Localization Microscopyの原理と受容体イメージングへの応用 (特集超解像顕微鏡)

山本明弘, 廣島通夫, 佐甲靖志

光技術コンタクト = Optical and electro-optical engineering contact 51(4) 33-40 2013年4月
3SDA-01 動物の発生におけるPAR/aPKC細胞極性システムの計測に基づいた数理モデル化(3SDA 個体の生物物理学-分子・細胞・個体にブリッジ-,新学術領域「ナノメディシン分子科学」共催,シンポジウム,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

荒田幸信, 廣島通夫, 白燦基, 小林徹也, 柴田達夫, 佐甲靖志

生物物理 53(1) S104 2013年
光と情報処理が拓くバイオイメージング分子・細胞から固体まで 1分子計測から見える細胞の反応調節機構

廣島通夫, 佐甲靖志

バイオイメージング 21(2) 94-95 2012年8月
細胞内情報処理反応とそのゆらぎ--蛋白質の1分子反応計測 (特集ゆらぎ)

佐甲靖志

光アライアンス 22(10) 8-11 2011年10月
Preface

Yasushi Sako, Masahiro Ueda

Cell Signaling Reactions: Single-Molecular Kinetic Analysis v-vi 2011年
細胞内1分子計測とシステムズバイオロジー (特集動き出す次世代システムズバイオロジー--研究が広がる定量的データ取得と解析)

日比野佳代, 白燦基, 佐甲靖志

細胞工学 29(4) 344-348 2010年
1P320 1YA1100 ラマン分光による生体システムおよび生細胞の非侵襲的計測および分析(計測,日本生物物理学会若手奨励賞選考会,若手招待講演,第48回日本生物物理学会年会)

盛田伸一, 高根沢聡太, 廣島通夫, 三井敏之, 佐甲靖志

生物物理 50(2) S76 2010年
蛍光相関分光で見る生体系の情報伝達(6)G‐APDを用いた新しい生体イメージング装置の開発

滝澤慶之, 川崎賀也, 佐甲靖志, 岡本憲二, 武藤悦子, 箕浦逸史, 渡邊康, 丑田公規

蛍光相関分光で見る生体系の情報伝達6 理研シンポジウム平成21年 2-4 2009年
1YP1-06 情報伝達タンパク質Ras、RAF間の分子認識と細胞内信号伝達制御(1YP1 日本生物物理学会若手奨励賞選考会,第47回日本生物物理学会年会)

日比野佳代, 佐甲靖志

生物物理 49 S1-S2 2009年

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書籍等出版物

低分子量GTP結合蛋白質の情報伝達反応の細胞内時空間1分子解析

佐甲靖志

[佐甲靖志] 2006年
蛋白質分子間認識の細胞内1分子計測法の開発と細胞内情報伝達研究への応用

佐甲靖志

[佐甲靖志] 2002年
細胞内1分子計測顕微鏡の開発と細胞内情報伝達研究への応用

佐甲靖志

[佐甲靖志] 2002年
超高速・超高感度微小変位計測装置の開発と細胞膜蛋白質研究への応用

佐甲靖志

[大阪大学医学部] 1999年
細胞膜のドメイン構造の解明 : 膜裏打ちタンパク質とレセプター分子との相互作用

佐甲靖志

佐甲靖志 1994年

共同研究・競争的資金等の研究課題

細胞膜・膜脂質環境動態と共役した受容体機能制御の包括的理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2019年6月 - 2024年3月

佐甲靖志
核内転写因子集積点形成の１粒子ダイナミクスと機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2019年6月 - 2022年3月

佐甲靖志
膜構造・膜脂質ダイナミクスと共起する細胞膜受容体の情報伝達

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2019年4月 - 2020年3月

佐甲靖志
1細胞ダイナミクスと相空間モデルによる情報処理ネットワーク解析法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年4月 - 2019年3月

佐甲靖志
１細胞化学状態の分布とゆらぎ

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2019年3月

佐甲靖志
細胞膜情報処理装置の再構成

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年7月 - 2019年3月

佐甲靖志
情報蛋白質のリン酸化による細胞記憶の新たな分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2015年4月 - 2019年3月

佐甲靖志, 日比野佳代, 岡本憲二
細胞膜受容体の動的会合体形成と分子認識反応

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2016年4月 - 2018年3月

佐甲靖志
細胞膜受容体の動的会合体形成と分子認識反応

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年4月 - 2016年3月

佐甲靖志
細胞質内単粒子運動の直接観察

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2015年3月

佐甲靖志
天然変性構造を持つＥＧＦ受容体分子認識ドメインの１分子構造ダイナミクス解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2012年4月 - 2014年3月

佐甲靖志
構造ダイナミクスに基くＧ蛋白質共役型受容体の活性化メカニズムの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2011年4月 - 2014年3月

今元泰, 七田芳則, 山下高廣, 佐甲靖志, 岡俊彦
ラマンスペクトル計測による細胞分化ダイナミクスの検出

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2011年 - 2012年

佐甲靖志, 盛田伸一
電子顕微鏡法によるテロメア超構造の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2008年 - 2012年

眞木さおり, 米倉功治, 佐甲靖志, 廣島通夫
天然変性構造を持つEGF受容体分子認識ドメインの1分子構造ダイナミクス解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2010年 - 2011年

佐甲靖志
生体分子カイネティクスを解明するナノ光計測

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2009年 - 2011年

井上康志, 佐甲靖志, 神隆
ErbB受容体システムによる細胞外情報の検出と統合

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2009年 - 2010年

佐甲靖志
細胞システムにおける反応ゆらぎの計測とその特性・役割の理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2007年 - 2010年

佐甲靖志
細胞内情報伝達の再構成系における非線形反応の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2008年 - 2009年

佐甲靖志
膜受容体の動的会合体形成と多状態性を利用した多義的情報変換

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2007年 - 2008年

佐甲靖志

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