北海道において住宅に被害を与える代表的な木材腐朽菌であるナミダタケをDNAレベルで検出・同定するために種特異的領域の増幅を行うPCR分析を試みた。分析のターゲットとしてrDNAのITS領域を選定した。鋳型DNAの抽出にあたり、プロテナーゼKを用いた比較的迅速かつ簡易な手法を採用したが、標的となるDNA領域は全ての供試菌において良好に増幅された。心材木粉(ベイツガ、エゾマツ、トドマツ)と凍結乾燥菌糸の夾雑条件、およびナミダタケによって腐朽した木材から抽出した鋳型DNAについてもナミダタケに特異的な領域の増幅が確認された。以上の結果から、比較的簡易なDNA抽出法とPCR分析を用いることにより腐朽木材に存在するナミダタケを迅速にDNAレベルで検出・同定できることが示された。