川口一朋 (Kazutomo Kawaguchi) - マイポータル

基本情報

所属: 金沢大学理工研究域数物科学系准教授

学位: 博士（理学）(名古屋大学)

研究者番号: 90402429
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-3387-2492
J-GLOBAL ID: 201801002452807832
researchmap会員ID: B000307825

研究キーワード

研究分野

経歴

2024年1月 - 現在

金沢大学, 理工研究域数物科学系, 准教授
2010年10月 - 2024年1月

金沢大学, 理工研究域数物科学系, 助教
2008年4月 - 2010年9月

名古屋大学, 大学院工学研究科, 博士研究員

学歴

2005年4月 - 2008年3月

名古屋大学大学院, 理学研究科, 物質理学専攻（物理系）博士課程（後期）
2003年4月 - 2005年3月

名古屋大学大学院, 理学研究科, 物質理学専攻（物理系）博士課程（前期）
1999年4月 - 2003年3月

名古屋大学, 理学部, 物理学科

MISC

生体高分子等の各部分の緩和の関係を探るためのモデルによる研究

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 長尾秀実

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 75(1) 2020年
タイプI銅タンパク質の複合体構造と安定性―光合成における電子伝達の理論的研究

川口一朋, 長尾秀実

化学 74(6) 66‐67 2019年6月1日
Hras‐GTP/GDP系での水素結合と構造との動的関連性の分子動力学シミュレーションによる研究

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 長尾秀実

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 74(1) ROMBUNNO.17aS‐PS‐81 2019年3月22日
分子動力学法による静止膜電位に関する研究

川口一朋, 長尾秀実

分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 13th ROMBUNNO.2C07 (WEB ONLY) 2019年
Hras‐GTP/GDP複合体における各所の水素結合と各所の構造の動的関連性の分子動力学法による研究

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 長尾秀実

分子シミュレーション討論会講演要旨集 32nd 196 2018年11月28日
混合脂質膜における脂質分子の膜透過・離脱に関する自由エネルギー曲線

齋藤大明, 森下徹也, 水上卓, 川口一朋, 長尾秀実

分子シミュレーション討論会講演要旨集 32nd 132 2018年11月28日
粗視化シミュレーションを用いたcyclin D3によるCDK4の活性化機構の解明

川口一朋, 長尾秀実

分子シミュレーション討論会講演要旨集 32nd 141 2018年11月28日
Hras‐GTP/GDP系での各所の構造と各所の水素結合との動的関連性の分子動力学法による研究

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 長尾秀実

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 73(2) ROMBUNNO.9pPSB‐30 2018年9月21日
タンパク質複合体のための粗視化モデルの開発と応用

川口一朋

アンサンブル 20(3) 185‐190 2018年7月31日
Hras‐GTP/GDP系でのGTP/GDPの構造の緩和モード間遷移の分子動力学法による研究

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 長尾秀実

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 73(1) ROMBUNNO.25aPS‐120 2018年3月23日
分子動力学法を用いたHras‐GTP/GDP複合体中のGTP/GDPの構造とGTP/GDPと溶媒水分子との水素結合との関連性の研究

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 長尾秀実

分子シミュレーション討論会講演要旨集 31st 122‐123 2017年11月29日
Hras‐GTP/GDP系でのGTP/GDPの構造と水素結合との関係の分子動力学法による研究

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 長尾秀実

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 72(2) ROMBUNNO.24aPS‐120-2854 2017年9月25日
Theoretical studies on dynamics of electron carriers in photosynthesis by a corse-grained model

S. Nakagawa, K. Kawaguchi, I. Kurniawan, A. M. Saleh, K. Kodama, H. Nagao

EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS 46 S225-S225 2017年7月
Theoretical study of protein complex systems by using a coarse-grained model and its development

K. Kawaguchi, S. Nakagawa, I. Kurniawan, A. M. Saleh, K. Kodama, H. Nagao

EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS 46 S219-S219 2017年7月査読有り
Hras‐GTP/GDP系でのHras周辺における水素結合の分子動力学法による研究

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 長尾秀実

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 72(1) ROMBUNNO.20aK‐PS‐49-3271 2017年3月21日
Hras‐GTP/GDP系でのGTP/GDP周辺における水素結合の静的性質と動的性質の分子動力学法による研究

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 長尾秀実

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 71(2) ROMBUNNO.14pBE‐4-3046 2016年9月23日
Hras‐GTP/GDP系でのGTP/GDP周辺における水素結合の動的性質の分子動力学法による研究

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 齋藤大明, 長尾秀実

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 71(1) ROMBUNNO.22APS‐115 2016年3月22日
22aPS-114 疎水性アミノ酸残基間に働く有効相互作用に関する理論的研究

川口一朋, 齋藤大明, 長尾秀実

日本物理学会講演概要集 71 3324-3324 2016年
水溶媒中のHras‐GTP/GDP複合体におけるGTP/GDP周辺の水分子の動き

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 齋藤大明, 長尾秀実

分子シミュレーション討論会講演要旨集 29th 128-129 2015年11月30日
Hras‐GTP/GDP系でのGTP/GDP周辺における水分子の動きの分子動力学法による研究

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 齋藤大明, 長尾秀実

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 70(2) ROMBUNNO.19ACT‐6 2015年9月24日

もっとみる

共同研究・競争的資金等の研究課題

分子動力学計算によるアミノ酸変異タンパク質複合体の結合自由エネルギーシフトの予測

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

川口一朋
光化学反応に於ける光照射ストレス下の電子伝達体ダイナミックスに関する理論的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2014年4月 - 2018年3月

長尾秀実, 齋藤大明, 川口一朋, 中川聖, 兒玉浩一
分子系の引き込み現象可能性に関する理論的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2011年 - 2012年

長尾秀実, 長山雅晴, 岩崎宏, 齋藤大明, 川口一朋

論文

Conformations of Three Types of Ultra-Long-Chain Fatty Acids in Multicomponent Lipid Bilayers

Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao, Hideo Shindou, Hiroshi Noguchi

Journal of Physical Chemistry B 126(45) 9316-9324 2022年11月17日査読有り筆頭著者責任著者
Theoretical Study of Complex Aspirin and Hydroxypropyl-β-cyclodextrin in Solvent Phase

H Jayyinunnisya, L S Solihat, K Sugimori, K Kawaguchi, H Nagao

Journal of Physics: Conference Series 2207(1) 012022-012022 2022年3月1日査読有り
Theoretical Study of Dissociation Process of Plastocyanins by PaCS-MD Simulation

D Fitrasari, M S Arwansyah, K Kawaguchi, A Purqon, Suprijadi, H Nagao

Journal of Physics: Conference Series 2207(1) 012021-012021 2022年3月1日査読有り
Molecular dynamics study of lipid bilayer asymmetry induced by ion concentration gradient and electronic polarizability

Kazutomo Kawaguchi, Seiichiro Ito, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao

Molecular Simulation 1-7 2022年2月2日査読有り筆頭著者責任著者
Conformation of ultra-long-chain fatty acid in lipid bilayer: Molecular dynamics study

Kazutomo Kawaguchi, Koh M. Nakagawa, Satoshi Nakagawa, Hideo Shindou, Hidemi Nagao, Hiroshi Noguchi

The Journal of Chemical Physics 153(16) 165101-165101 2020年10月28日査読有り筆頭著者責任著者
Free energy profiles of lipid translocation across pure POPC and POPC/CHOL bilayer: all-atom molecular dynamics study

Hiroaki Saito, Tetsuya Morishita, Taku Mizukami, Ken-ichi Nishiyama, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao

IOP Conf. Series: Journal of Physics: Conf. Series (1290) 012020 2019年11月査読有り
Theoretical study of conformational transition of CDK4 by association of cyclin D3

Kawaguchi Kazutomo, Arwansyah Muhammad Saleh, Kataoka Tatsuki, Nagao Hidemi

MOLECULAR PHYSICS 117(17) 2355-2361 2019年9月2日査読有り
The Study of the Octanol-Water Partition Coefficient by the Computational Chemistry Method

Koichi KODAMA, Arwan SYAH, Kazutomo KAWAGUCHI, Toru MATSUI, Hidemi NAGAO, Yasuteru SHIGETA

Journal of Computer Chemistry, Japan 18(5) 241-243 2019年
Theoretical studies on electronic structure and properties of type I copper center in copper proteins

KURNIAWAN Isman, Kawaguchi Kazutomo, SUGIMORI Kimikazu, SAKURAI Takeshi, Nagao Hidemi

The Science Reports of Kanazawa University = The Science Reports of Kanazawa University (63) 1-13 2019年
Quantum Chemical Study of Axial Ligand Effect on the Electronic Properties of Type I Copper Protein

Kurniawan Isman, Kawaguchi Kazutomo, Sugimori Kimikazu, Sakurai Takeshi, Nagao Hidemi

CHEMISTRY LETTERS 47(9) 1172-1175 2018年9月査読有り
Theoretical study on interaction of cytochrome f and plastocyanin complex by a simple coarse-grained model with molecular crowding effect

Satoshi Nakagawa, Isman Kurniawan, Koichi Kodama, Muhammad Saleh Arwansyah, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao

Molecular Physics 116(5-6) 666-677 2018年3月19日査読有り
A coarse-grained model of the effective interaction for charged amino acid residues and its application to formation of GCN4-pLI tetramer

Kazutomo Kawaguchi, Satoshi Nakagawa, Isman Kurniawan, Koichi Kodama, Muhammad Saleh Arwansyah, Hidemi Nagao

Molecular Physics 116(5-6) 649-657 2018年3月19日査読有り
A theoretical study on redox potential and pKa of [2Fe-2S] cluster model from iron-sulfur proteins

Isman Kurniawan, Isman Kurniawan, Kazutomo Kawaguchi, Mitsuo Shoji, Toru Matsui, Yasuteru Shigeta, Hidemi Nagao

Bulletin of the Chemical Society of Japan 91(9) 1451-1456 2018年1月1日
Theoretical studies on association/dissociation process of plastocyanin and cytochrome f in photosynthesis

Isman Kurniawan, Takahiro Matsui, Satoshi Nakagawa, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao

XXIXTH IUPAP CONFERENCE ON COMPUTATIONAL PHYSICS CCP2017 1136 2018年
Molecular dynamics study of binary POPC bilayers: molecular condensing effects on membrane structure and dynamics

Hiroaki Saito, Tetsuya Morishita, Taku Mizukami, Ken-ichi Nishiyama, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao

IOP Conf. Series: Journal of Physics: Conf. Series 1136(1136) 012022-012022 2018年査読有り
A simple coarse-grained model for interacting protein complex

Kazutomo Kawaguchi, Satoshi Nakagawa, Shogo Kinoshita, Makoto Wada, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao

MOLECULAR PHYSICS 115(5) 587-597 2017年査読有り
Decomposition analysis of free energy profile for Hsp90-ADP association

Kazutomo Kawaguchi, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao

MOLECULAR SIMULATION 42(11) 896-901 2016年査読有り
A hybrid-type approach with MD and DFT calculations for evaluation of redox potential of molecules

Masashi Iwayama, Isman Kurniawan, Kazutomo Kawaguchi, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao

MOLECULAR SIMULATION 41(10-12) 936-941 2015年8月査読有り
Network of Water Molecules Around Guanine Nucleotide in the Hras–GTP and -GDP Complexes by MD Simulations

宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 斎藤大明, 長尾秀実

JPS Conf. Proc. 1 016006 2014年3月査読有り
Analysis of water molecules around GTP in Hras-GTP complex and GDP in Hras-GDP complex by molecular dynamics simulations

Takeshi Miyakawa, Ryota Morikawa, Masako Takasu, Kimikazu Sugimori, Kazutomo Kawaguchi, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao

MOLECULAR PHYSICS 112(3-4) 526-532 2014年2月

もっとみる

川口一朋

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

MISC

共同研究・競争的資金等の研究課題

論文

メニュー

共著者の一覧