小段篤史 (Atsushi Kodan) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学高等研究院特定准教授
: (兼任)学際融合教育推進センター生理化学研究ユニットユニット協力教員

学位: 博士（農学）(京都大学)

J-GLOBAL ID: 201401042230227449
researchmap会員ID: 7000008686

研究キーワード

研究分野

主要な論文

Inward- and outward-facing X-ray crystal structures of homodimeric P-glycoprotein CmABCB1.

Kodan A, Yamaguchi T, Nakatsu T, Matsuoka K, Kimura Y, Ueda K, Kato H

Nature communications 10(1) 88-88 2019年1月査読有り
Structural basis for gating mechanisms of a eukaryotic P-glycoprotein homolog

Atsushi Kodan, Tomohiro Yamaguchi, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Christopher J. Hipolito, Akane Fujioka, Ryo Hirokane, Keiji Ikeguchi, Bunta Watanabe, Jun Hiratake …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 111(11) 4049-4054 2014年3月査読有り
A stilbene synthase from Japanese red pine (Pinus densiflora): Implications for phytoalexin accumulation and down-regulation of flavonoid biosynthesis

A Kodan, H Kuroda, F Sakai

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 99(5) 3335-3339 2002年3月査読有り

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MISC

Direct Visualization of ABCA1 Reconstituted in Nanodisc by High-Speed Atomic Force Microscopy (HS-AFM)

Atsushi Kodan, Romain Amyo, Yasuhisa Kimura, Noriyuki Kodera, Kazumitsu Ueda

ABC2023, the 9th FEBS Special Meeting “ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease” 2023年2月26日筆頭著者
Cryo-EM解析を目指した脂質輸送型ABC蛋白質の生産・調製基盤の構築

小段篤史, 光岡薫, 木村泰久, 木岡紀幸, 植田和光

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2021 2021年筆頭著者
多剤排出ポンプMDR1の薬剤絞り出しメカニズム

小段篤史, 木村泰久, 植田和光

トランスポーター研究会年会抄録集 15th 2020年筆頭著者
多剤排出ポンプMDR1の薬剤絞り出し機構

小段篤史, 木村泰久, 植田和光

ファルマシア(Web) 56(6) 2020年筆頭著者
X 線自由電子レーザーを用いたP糖タンパク質ホモログの連続フェムト秒X線結晶構造解析

大山諒, 潘東青, 中津亨, 佐藤友美, 山口知宏, 小段篤史, 植田和光, 岩田想, 加藤博章

第14回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム 2016年8月28日
高分解能結晶構造に基づいたABCトランスポーターの分子機構

小段篤史

「多様性が切り拓く膜輸送研究の新時代」第11回トランスポーター研究会年会 2016年7月3日招待有り筆頭著者
Serial Femtosecond Crystallography of ABC Transporter

大山諒, 潘東青, 中津亨, 佐藤友美, 山口知宏, 小段篤史, 植田和光, 岩田想, 加藤博章

6th Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases (ABC2016) 2016年3月
Crystallographic study of the ABC transporter CmABCB1 covalently bound to substrate derivatives

松岡敬太, 廣兼諒, 小段篤史, 山口知宏, 中津亨, 植田和光, 加藤博章

6th Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases (ABC2016) 2016年3月
X線自由電子レーザーを用いた新規タンパク質の立体構造決定

山下恵太郎, 潘東青, 奥田智彦, 菅原道泰, 小段篤史, 山口知宏, 村井智洋, 溝端栄一, 鈴木守, 南後恵理子 …

日本薬学会年会要旨集 136年会(2) 249-249 2016年3月
真核生物由来ABC輸送体の分子機構

小段篤史, 植田和光, 加藤博章

日本生化学会大会(Web) 89th ROMBUNNO.3S14‐5 (WEB ONLY) 2016年筆頭著者
シリアル結晶学における重原子誘導体を用いた位相決定

山下恵太郎, 潘東青, 長谷川和也, 菅原道泰, 村井智洋, 小段篤史, 溝端栄一, 鈴木守, 鈴木守, 桝田哲哉 …

日本結晶学会年会講演要旨集 2015 89 2015年10月
X 線自由電子レーザーを用いたタンパク質 X 線結晶構造解析

潘東青, 中津亨, 山口知宏, 小段篤史, 小川和浩, 松嶌一樹, 山下恵太郎, 城地保昌, 登野健介, 矢橋牧名 …

日本薬学会第135年会 2015年3月27日
測定温度の違いがもたらすタンパク質X線結晶構造への影響

村井智洋, 潘東青, 小段篤史, 山下恵太郎, 上野剛, 加藤博章

日本薬学会近畿支部総会 2015年3月25日
SACLAによるABCトランスポーターおよびホタル・ルシフェラーゼのX線結晶構造解析(第2報)

潘東青, 中津亨, 山口知宏, 小段篤史, 小川和浩, 松嶌一樹, 山下恵太郎, 城地保昌, 登野健介, 矢橋牧名 …

平成26年度日本結晶学会年会 14th 2014年11月1日
ABC多剤排出トランスポーターの立体構造の特徴

山口知宏, 小段篤史, 中津亨, 植田和光, 加藤博章

第87回日本生化学会大会 2014年10月15日招待有り
SACLAによるABCトランスポーターおよびホタル・ルシフェラーゼのX線結晶構造解析

潘東青、中津亨、山口知宏、小段篤史、小川和浩、松嶌一樹、城地保昌、登野健介、矢橋牧名、鈴木守、南後恵理子、岩田想、加藤博章

第１４回日本蛋白質科学会年会 14th 2014年6月25日
SACLAおよびSPring-8において得られるタンパク質結晶構造の比較

村井智洋, 潘東青, 山下恵太郎, 菅原道泰, 小段篤史, 山口知宏, 上野剛, 南後恵理子, 登野健介, 城地保昌 …

第15回日本蛋白質科学会年会 2014年6月25日
Crystal structure of an ABC multidrug exporter from Cyanidioschyzon merolae, a thermophilic unicellular eukaryote

Atsushi Kodan, Tomohiro Yamaguchi, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Christopher J. Hipolito, Akane Fujioka, Ryo Hirokane, Yasuhisa Kimura, Hiroaki Suga, Kazumitsu Ueda …

ABC2014, 5th FEBS Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases 2014年3月招待有り筆頭著者
Structure-based functional aspects of the ABC multidrug transporter, CmABCB1 from a thermophilic eukaryote

Tomohiro Yamaguchi, Atsushi Kodan, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Christopher J. Hipolito, Akane Fujioka, Ryo Hirokane, Yasuhisa Kimura, Hiroaki Suga, Kazumitsu Ueda …

ABC2014, 5th FEBS Special Meeting, ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Diseases 2014年3月
ABC多剤排出トランスポーターにおける基質取込の立体構造基盤

山口知宏, 小段篤史, 中津亨, 植田和光, 加藤博章

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM),134th,ROMBUNNO.29PML-047 2014年

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書籍等出版物

B&I バイオサイエンスとインダストリー

小段篤史, 植田和光 (担当:共著, 範囲:脂溶性化合物を“絞り出す”多剤排出ポンプMDR1の分子機構 74(4), 280-283.)

一般財団法人バイオインダストリー協会 2021年7月
ファルマシア

小段篤史, 木村泰久, 植田和光 (担当:分担執筆, 範囲:多剤排出ポンプMDR1の薬剤絞り出し機構 56(6), 1-5.)

日本薬学会 2020年6月1日
膜タンパク質工学ハンドブック

監修津本, 浩平, 浜窪, 隆雄分担執筆, 木村泰久, 小段篤史, 植田和光 (担当:分担執筆, 範囲:第2編膜タンパク質—医学・薬学への展開、第3章トランスポーター、第1節多剤輸送体MDR1(ABCB1) p211-216)

エヌ・ティー・エス 2020年4月 (ISBN: 9784860435370)
未来材料

小段篤史, 木村泰久, 加藤博章, 植田和光 (担当:共著, 範囲:ABC (ATP-binding cassette) タンパク質の構造解析が拓く創薬の未来 6(10), 30-36)

エヌ・ティー・エス 2006年10月10日
ABC蛋白質

編集植田和光, 分担執筆加藤博章、小段篤史、柴田洋之 (担当:分担執筆, 範囲:ABC蛋白質の立体構造研究—現状と課題 p245-274)

学会出版センター 2005年5月 (ISBN: 4762230421)

講演・口頭発表等

Direct Visualization of ABCA1 Reconstituted in Nanodisc by High-Speed Atomic Force Microscopy (HS-AFM)

Atsushi Kodan, Romain Amyo, Yasuhisa Kimura, Noriyuki Kodera, Kazumitsu Ueda

ABC2023, the 9th FEBS Special Meeting “ATP-Binding Cassette (ABC) Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease” Innsbruck, Austria 2023年3月1日
Cryo-EM解析を目指した脂質輸送型ABC蛋白質の生産・調製基盤の構築

小段篤史, 光岡薫, 木村泰久, 木岡紀幸, 植田和光

日本農芸化学大会2021年度大会（オンライン開催） 2021年3月20日
多剤排出ポンプMDR1の薬剤絞り出しメカニズム

小段篤史, 木村泰久, 植田和光

第15回トランスポーター研究会年会（オンライン開催） 2020年10月16日招待有り
Structural basis for gating mechanisms of a eukaryotic ABC transporter

Atsushi Kodan

WPI–iCeMS Industry Advisory Committee Conference 2014年10月14日招待有り
High-resolution crystal structure of an ABC multidrug exporter from Cyanidioschyzon merolae, a thermophilic unicellular eukaryote

Atsushi Kodan

ABC2014, the 5th FEBS Special Meeting “ATP-Binding Cassette Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease” 2014年3月8日招待有り
X-ray crystallographic analysis of an exporter-type ABC transporter.

Atsushi Kodan

4th FEBS Special Meeting on ABC Proteins - ABC2012 2012年3月3日
X-ray crystallographic analysis of an exporter-type ABC transporter

Atsushi Kodan

Kakenhi Kiban (S)/iCeMS Joint International Symposium “ABC2011 in Kyoto -ABC Proteins/Membrane Meso-domains/ES-iPS cells” 2011年11月11日
Stilbene Synthase from Japanese Red Pine – Its Role in Stilbenoid Biosynthesis

A. Kodan, H. Kuroda, F. Sakai

The Third International Wood Science Symposium 2001年11月2日招待有り

担当経験のある科目(授業)

2018年12月 - 現在

横断型研究プログラム大学院講義生理化学概論（集中講義） (京都大学農学研究科薬学研究科)
2015年4月 - 現在

細胞生化学専攻実験 (京都大学農学部農学研究科)
2015年4月 - 現在

細胞生化学専攻演習 (京都大学農学部農学研究科)
2021年4月 - 2023年3月

構造生物学 (京都大学農学部)
2020年4月 - 2020年9月

構造生物学 (京都大学農学部)
2017年12月 - 2017年12月

横断型研究プログラム大学院講義生理化学概論（集中講義） (京都大学農学研究科薬学研究科)

所属学協会

2020年12月 - 現在

公益社団法人日本農芸化学会
2019年 - 現在

SPring-8ユーザー共同体(SPRUC)X線自由電子レーザーXFEL利用研究会会員
2012年8月 - 現在

SPring-8ユーザー共同体(SPRUC)放射光構造生物学研究会
2002年4月 - 現在

公益社団法人日本生化学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

細胞外基質による細胞機能制御機構の包括的理解とその応用基盤の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2021年4月 - 2025年3月

木岡紀幸, 阿部雄一, 長尾耕治郎, 小段篤史
脂質輸送型ABC蛋白質の分子構造と役割の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

小段篤史
ABC輸送体の動作原理の解明と創薬への展開

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

小段篤史, HIPOLITO CHRIS
ＡＢＣ輸送体の分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 若手研究(A) 2012年4月 - 2015年3月

小段篤史
ABC輸送体のX線結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2010年 - 2011年

小段篤史
トランスポーター膜タンパク質の構造生物学的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2005年 - 2007年

加藤博章, 中津亨, 中野博明, 小段篤史, 光岡薫
X線解析を目指した多剤耐性ポンプMDR1の大量発現系の構築と結晶化

日本学術振興会科学研究費助成事業萌芽研究 2004年 - 2005年

加藤博章, 小段篤史

学術貢献活動

Nature Communications

査読

Springer Nature Ltd. 2023年11月21日 - 2024年8月6日
The Journal of Biochemistry

査読

The Japanese Biochemical Society 2020年1月14日 - 2020年1月29日

社会貢献活動

京都大学iCeMSサイエンスフェスティバル2019

出演, パネリスト, 運営参加・支援, 実演

京都大学京都大学iCeMSサイエンスフェスティバル2019 京都大学iCeMS 2019年11月8日 - 2019年11月8日

メディア報道

京大、多剤排出ポンプが薬を輸送するメカニズムを解明

日本経済新聞電子版 2019年1月10日新聞・雑誌
薬効かない再発がん、仕組み解明

読売新聞 17面 2014年3月31日新聞・雑誌
京大グループ、抗がん剤働きを阻害、原因タンパク質を解明、薬剤開発に期待

京都新聞 27面 2014年3月4日新聞・雑誌
「京大と東大、がん化学療法の阻害たんぱく質の類似分子構造を解明」

日刊工業新聞 19面 2014年3月4日新聞・雑誌

小段篤史

基本情報

研究キーワード

研究分野

主要な論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

学術貢献活動

社会貢献活動

メディア報道

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