工藤俊章 (Kudo Toshiaki) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所名誉研究員

J-GLOBAL ID: 201501015835779060
researchmap会員ID: B000245419

外部リンク: https://kaken.nii.ac.jp/d/r/80109793.ja.html

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 応用微生物学 /

経歴

2009年 - 現在

理化学研究所, 名誉研究員
2014年 - 2020年

北里大学, 海洋生命科学部, 特任教授
2011年 - 2013年3月

長崎大学大学院, 教授
2007年9月 - 2011年

長崎大学水産学部, 教授
2001年 - 2007年8月

横浜市大ー理研連携大学院(理研鶴見キャンパス), 客員教授
1975年4月 - 2007年8月

特定国立研究開発法人理化学研究所, 研究員、副主任研究員、主任研究員等
1999年3月 - 2004年3月

J S T国際共同研究バイオリサイクルプロジェクト, 代表研究者
1979年 - 1981年

UC Davis, researcher

学歴

委員歴

受賞

論文

274

Seasonal and annual changes in the microbial communities of Ofunato Bay, Japan, based on metagenomics.

Atsushi Kobiyama, Jonaira Rashid, Md Shaheed Reza, Yuri Ikeda, Yuichiro Yamada, Toshiaki Kudo, Nanami Mizusawa, Saki Yanagisawa, Daisuke Ikeda, Shigeru Sato …

Scientific reports 11(1) 17277-17277 2021年8月26日
Diversity and functions of bacterial communities in water and sediment from the watershed of the Tama River flowing a highly urbanized area

Nanami Mizusawa, Md. Shaheed Reza, Chiharu Oikawa, Satomi Kuga, Mariko Iijima, Atsushi Kobiyama, Yuichiro Yamada, Yuri Ikeda, Daisuke Ikeda, Kazuho Ikeo …

Fisheries Science 2021年8月24日
Taxonomic profiles in metagenomic analyses of free-living microbial communities in the Ofunato Bay

Md Shaheed Reza, Atsushi Kobiyama, Yuichiro Yamada, Yuri Ikeda, Daisuke Ikeda, Nanami Mizusawa, Kazuho Ikeo, Shigeru Sato, Takehiko Ogata, Mitsuru Jimbo …

Gene 665 192-200 2018年7月30日査読有り
Basin-scale seasonal changes in marine free-living bacterioplankton community in the Ofunato Bay

Md Shaheed Reza, Atsushi Kobiyama, Yuichiro Yamada, Yuri Ikeda, Daisuke Ikeda, Nanami Mizusawa, Kazuho Ikeo, Shigeru Sato, Takehiko Ogata, Mitsuru Jimbo …

Gene 665 185-191 2018年7月30日査読有り
Seasonal changes in the abundance of bacterial genes related to dimethylsulfoniopropionate catabolism in seawater from Ofunato Bay revealed by metagenomic analysis

Toshiaki Kudo, Atsushi Kobiyama, Jonaira Rashid, Md Shaheed Reza, Yuichiro Yamada, Yuri Ikeda, Daisuke Ikeda, Nanami Mizusawa, Kazuho Ikeo, Shigeru Sato …

Gene 665 174-184 2018年7月30日査読有り
Seasonal changes in the communities of photosynthetic picoeukaryotes in Ofunato Bay as revealed by shotgun metagenomic sequencing

Jonaira Rashid, Atsushi Kobiyama, Md Shaheed Reza, Yuichiro Yamada, Yuri Ikeda, Daisuke Ikeda, Nanami Mizusawa, Kazuho Ikeo, Shigeru Sato, Takehiko Ogata …

Gene 665 127-132 2018年7月30日査読有り
Metagenome-based diversity analyses suggest a strong locality signal for bacterial communities associated with oyster aquaculture farms in Ofunato Bay

Atsushi Kobiyama, Kazuho Ikeo, Md Shaheed Reza, Jonaira Rashid, Yuichiro Yamada, Yuri Ikeda, Daisuke Ikeda, Nanami Mizusawa, Shigeru Sato, Takehiko Ogata …

Gene 665 149-154 2018年7月30日査読有り
Metagenomic analysis using 16S ribosomal RNA genes of a bacterial community in an urban stream, the Tama River, Tokyo

Md Shaheed Reza, Nanami Mizusawa, Ayaka Kumano, Chiharu Oikawa, Daisuke Ouchi, Atsushi Kobiyama, Yuichiro Yamada, Yuri Ikeda, Daisuke Ikeda, Kazuho Ikeo …

Fisheries Science 84(3) 563-577 2018年5月1日査読有り
Rapid adaptation to near extinction in microbial experimental evolution

Michael Travisano, Michihisa Maeda, Fumie Fuji, Toshiaki Kudo

Journal of Bioeconomics 20(1) 141-152 2018年4月査読有り
Identification of 9α-hydroxy-17-oxo-1,2,3,4,10,19-hexanorandrost-6-en-5-oic acid and β-oxidation products of the C-17 side chain in cholic acid degradation by Comamonas testosteroni TA441.

Horinouchi M, Hayashi T, Koshino H, Malon M, Hirota H, Kudo T

The Journal of steroid biochemistry and molecular biology 143 306-322 2014年9月査読有り
Draft genome sequences of cyclodextrin-producing alkaliphilic Bacillus strains JCM 19045, JCM 19046, and JCM 19047

Toshiaki Kudo, Kazuaki Sakamoto, Masashi Akinaga, Ayumi Kawauchi, Tomomi Nakahara, Xiaochi Zhang, Akinori Yamada, Kenshiro Oshima, Wataru Suda, Hirokazu Kuwahara …

Genome Announcements 2(2) 2014年査読有り
Draft genome sequences of Psychrobacter strains JCM 18900, JCM 18901, JCM 18902, and JCM 18903, isolated preferentially from frozen aquatic organisms

Toshiaki Kudo, Akihiro Kidera, Muneaki Kida, Ayumi Kawauchi, Ryo Shimizu, Tomomi Nakahara, Xiaochi Zhang, Akinori Yamada, Masao Amano, Yuki Hamada …

Genome Announcements 2(2) 2014年査読有り
Draft genome sequences of Geomicrobium sp. strains JCM 19037, JCM 19038, JCM 19039, and JCM 19055, isolated from aquatic samples

Toshiaki Kudo, Tomomi Nakahara, Xiaochi Zhang, Shigeto Taniyama, Osamu Arakawa, Shinji Murase, Hideaki Nakata, Kenshiro Oshima, Wataru Suda, Keiko Kitamura …

Genome Announcements 2(3) 2014年査読有り
Draft genome sequences of Vibrio sp. strains isolated from tetrodotoxin-bearing scavenging gastropod

Toshiaki Kudo, Ayumi Kawauchi, Tomomi Nakahara, Xiaochi Zhang, Shigeto Taniyama, Tomohiro Takatani, Osamu Arakawa, Kenshiro Oshima, Wataru Suda, Keiko Kitamura …

Genome Announcements 2(3) 2014年査読有り
Identification of 9α-hydroxy-17-oxo-1,2,3,4,10,19-hexanorandrostan-5-oic acid in steroid degradation by Comamonas testosteroni TA441 and its conversion to the corresponding 6-en-5-oyl coenzyme A (CoA) involving open reading frame 28 (ORF28)- and ORF30-enc

Horinouchi M, Hayashi T, Koshino H, Malon M, Hirota H, Kudo T

Journal of bacteriology 196(20) 3598-3608 2014年査読有り
Physiological characterization of aerobic culturable bacteria in the intestine of the sea cucumber Apostichopus japonicus

Xiaochi Zhang, Tomomi Nakahara, Shinji Murase, Hideaki Nakata, Tetsushi Inoue, Toshiaki Kudo

Journal of General and Applied Microbiology 59(1) 1-10 2013年3月22日査読有り
Heterologous expression and characterization of a glycoside hydrolase family 45 endo-β-1,4-glucanase from a symbiotic protist of the lower termite, Reticulitermes speratus.

Otagiri M, Lopez CM, Kitamoto K, Arioka M, Kudo T, Moriya S

Applied biochemistry and biotechnology 169(6) 1910-1918 2013年3月査読有り
Diversity and function of aerobic culturable bacteria in the intestine of the sea cucumber holothuria leucospilota

Xiaochi Zhang, Tomomi Nakahara, Masayuki Miyazaki, Yuichi Nogi, Shigeto Taniyama, Osamu Arakawa, Tetsushi Inoue, Toshiaki Kudo

Journal of General and Applied Microbiology 58(6) 447-456 2013年1月査読有り
Sporomusa intestinalis sp. nov., a homoacetogenic bacterium isolated from the gut of a higher termite, Termes comis (Termitinae)

Satoshi Hattori, Yuichi Hongoh, Takashi Itoh, Pinsurang Deevong, Savitr Trakulnaleamsai, Napavarn Noparatnaraporn, Toshiaki Kudo, Moriya Ohkuma

Journal of General and Applied Microbiology 59(4) 321-324 2013年査読有り
Steroid degradation in Comamonas testosteroni

Masae Horinouchi, Toshiaki Hayashi, Toshiaki Kudo

Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology 129(1-2) 4-14 2012年3月査読有り

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MISC

171

多摩川中流域河川水の細菌叢解析と環境要因の関係

渡邊真愛矢, 水澤奈々美, REZA Md. Shaheed, 久我聡美, 飯島真理子, 山田雄一郎, 小檜山篤志, 池田有里, 池田大介, 池尾一穂 …

日本水産学会大会講演要旨集(CD-ROM) 2021 2021年
ショットガンメタゲノム細菌叢解析からみた多摩川河川水への人間活動の影響について

水澤奈々美, REZA Md. Shaheed, 及川千晴, 久我聡美, 飯島真理子, 大内大輔, 山田雄一郎, 小檜山篤志, 池田有里, 池田大介 …

日本水産学会大会講演要旨集(CD-ROM) 2021 2021年
2018年の多摩川中流域における河川水および河床砂泥の微生物叢の季節変動

水澤奈々美, 久我聡美, REZA Md. Shaheed, 大内大輔, 飯島真理子, 山田雄一郎, 小檜山篤志, 池田有里, 池田大介, 池尾一穂 …

日本水産学会大会講演要旨集 2019 2019年
メタゲノム解析による多摩川中流域河川水の微生物叢の季節変動の調査

水澤奈々美, 吉澤星斗, REZA Md. Shaheed, 大内大輔, 山田雄一郎, 小檜山篤志, 池田有里, 池田大介, 池尾一穂, 緒方武比古 …

日本水産学会大会講演要旨集 2018 75 2018年3月26日
三陸海域に棲息する魚介類腸内細菌のメタゲノム解析

工藤俊章, 水澤奈々美, 佐藤繁, 池田有里, JONAIRA Rashid, REZA Md. Shaheed, 小檜山篤志, 山田雄一郎, 池田大介, 緒方武比古 …

日本水産学会大会講演要旨集 2018 2018年
メタゲノム解析による多摩川上,中,下流域の河川水および底泥中の細菌叢の比較

水澤奈々美, 及川千晴, 飯島真理子, REZA Md. Shaheed, 大内大輔, 山田雄一郎, 小檜山篤志, 池田有里, 池田大介, 池尾一穂 …

日本水産学会大会講演要旨集 2018 2018年
三陸大船渡湾における主な微生物群のメタゲノム機能解析

工藤俊章, 小檜山篤志, JONAIRA Rashid, REZA Md. Shaheed, 山田雄一郎, 池田有里, 池田大介, 水澤奈々美, 池尾一穂, 佐藤繁 …

日本水産学会大会講演要旨集 2017 87 2017年3月26日
2015および2016年の大船渡湾における微生物群集組成のメタゲノム解析による比較

小檜山篤志, JONAIRA Rashid, REZA Md. Shaheed, 山田雄一郎, 池田有里, 池田大介, 水澤奈々美, 池尾一穂, 佐藤繁, 神保充 …

日本水産学会大会講演要旨集 2017 87 2017年3月26日
メタゲノム解析による多摩川中流域の河川水における微生物叢の季節変動の解明

水澤奈々美, REZA Md. Shaheed, 及川千晴, 大内大輔, 小檜山篤志, 山田雄一郎, 池田有里, 池田大介, 池尾一穂, 佐藤繁 …

日本水産学会大会講演要旨集 2017 88 2017年3月26日
岩手県大船渡湾海底泥のメタゲノム解析による微生物叢の解析と評価

池田有里, JONAIRA Rashid, REZA Md. Shaheed, 小檜山篤志, 山田雄一郎, 池田大介, 水澤奈々美, 佐藤繁, 緒方武比古, 神保充 …

日本水産学会大会講演要旨集 2017 87 2017年3月26日
ショットガン・メタゲノム配列データに基づく多摩川微生物叢の解析

REZA Md Shaheed, 水澤奈々美, 及川千晴, 大内大輔, 高橋良広, 小檜山篤志, 山田雄一郎, 池田有里, 池田大介, 池尾一穂 …

日本水産学会大会講演要旨集 2016 34 2016年9月8日
ショットガンメタゲノミクスを用いた大船渡湾における微生物群集の変動解析と環境要因との相関

小檜山篤志, REZA Md. Shaheed, JONAIRA Rashid, 山田雄一郎, 池田有里, 池田大介, 水澤奈々美, 池尾一穂, 佐藤繁, 緒方武比古 …

日本水産学会大会講演要旨集 2016 35 2016年9月8日
16S rRNA配列による多摩川河川水の微生物叢の解析

REZA Md Shaheed, 水澤奈々美, 小檜山篤志, 山田雄一郎, 池田有里, 池田大介, 池尾一穂, 佐藤繁, 緒方武比古, 工藤俊章 …

マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集 18th 77 2016年5月28日
フナクイムシ由来のセルロース分解菌の探索

井上徹志, 張筱墀, 池田彩花, 河野祥子, 勝山一朗, 山田昌郎, 金子元, 渡部終五, 山田明徳, 工藤俊章

木材保存 40(6) 261-268 2014年
Diversity and function of aerobic culturable bacteria in the intestine of deep-sea holothurian

Zhang Xiaochi, Nakahara Tomomi, Ochiai Nozomi, Kawauchi Ayumi, Hashimoto Jun, Inoue Tetsushi, Kudo Toshiaki

極限環境生物学会誌 11(2) 49-58 2013年2月
バイオエタノール研究動向生態系サービスを読み解くという文脈におけるバイオマス糖化研究~シロアリによるセルロースの新規糖化メカニズム~

守屋繁春, 工藤俊章

バイオエタノール通信 (7) 28-32 2011年9月12日
好塩細菌Halomonas sp.H11株より単離した新規α‐グルコシダーゼの諸性質

小島晃代, 佐分利亘, 山本健, 工藤俊章

日本生物工学会大会講演要旨集 63rd 138-138 2011年8月25日
シロアリ腸内共生系由来キシラナーゼの麹菌A.oryzaeを用いた生産とその応用に向けた研究

笹川哲裕, 守屋繁春, 工藤俊章, 北本勝ひこ, 有岡学

日本農芸化学会大会講演要旨集 2010 89 2010年3月5日
酵母での分泌発現に適したシロアリ原生生物セルラーゼ遺伝子のスクリーニング

戸高眠, 石田亘広, 守屋繁春, 大熊盛也, 工藤俊章, 高橋治雄

日本生物工学会大会講演要旨集 61st 17-17 2009年8月25日
麹菌Aspergillus oryzaeによるシロアリ腸内共生原生生物由来キシラナーゼの生産

笹川哲裕, 有岡学, 守屋繁春, 工藤俊章, 北本勝ひこ

日本生物工学会大会講演要旨集 61st 15-15 2009年8月25日

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