山崎由紀子 (Yukiko Yamazaki) - マイポータル

基本情報

所属: 情報・システム研究機構国立遺伝学研究所

J-GLOBAL ID: 201401066832470057
researchmap会員ID: 7000007142

論文

Transcription profile of Escherichia coli: genomic SELEX search for regulatory targets of transcription factors

Akira Ishihama, Tomohiro Shimada, Yukiko Yamazaki

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 44(5) 2058-2074 2016年3月査読有り
TOMATOMA Update: Phenotypic and Metabolite Information in the Micro-Tom Mutant Resource

Masahito Shikata, Ken Hoshikawa, Tohru Ariizumi, Naoya Fukuda, Yukiko Yamazaki, Hiroshi Ezura

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 57(1) e11 2016年1月査読有り
NIG_MoG: a mouse genome navigator for exploring intersubspecific genetic polymorphisms

Toyoyuki Takada, Atsushi Yoshiki, Yuichi Obata, Yukiko Yamazaki, Toshihiko Shiroishi

MAMMALIAN GENOME 26(7-8) 331-337 2015年8月査読有り
Novel Essential Gene Involved in 16S rRNA Processing in Escherichia coli

Tatsuaki Kurata, Shinobu Nakanishi, Masayuki Hashimoto, Masato Taoka, Yukiko Yamazaki, Toshiaki Isobe, Jun-ichi Kato

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 427(4) 955-965 2015年2月査読有り
The Whole Set of Constitutive Promoters Recognized by RNA Polymerase RpoD Holoenzyme of Escherichia coli

Tomohiro Shimada, Yukiko Yamazaki, Kan Tanaka, Akira Ishihama

PLOS ONE 9(3) 2014年3月査読有り
The plant ontology as a tool for comparative plant anatomy and genomic analyses

Laurel Cooper, Ramona L. Walls, Justin Elser, Maria A. Gandolfo, Dennis W. Stevenson, Barry Smith, Justin Preece, Balaji Athreya, Christopher J. Mungall, Stefan Rensing …

Plant and Cell Physiology 54(2) e1 2013年2月査読有り
Purification and characterization of two phospho-beta-galactosidases, LacG1 and LacG2, from Lactobacillus gasseri ATCC33323(T)

Hiroyuki Honda, Seiji Nagaoka, Yasushi Kawai, Rober Kemperman, Jan Kok, Yukiko Yamazaki, Yoshio Tateno, Haruki Kitazawa, Tadao Saito

JOURNAL OF GENERAL AND APPLIED MICROBIOLOGY 58(1) 11-17 2012年2月査読有り
Nomenclature report on rice WRKY’s – Conflict regarding gene names and its solution

Rice WRKY, Working Group

Rice 5(3) 2012年査読有り
"TOMATOMA": A Novel Tomato Mutant Database Distributing Micro-Tom Mutant Collections

Saito, T, Ariizumi, T, Okabe, Y, Asamizu, E, Tanase, K, Yamazaki, Y, Fukuda, N, Aoki, Ezura

Plant and Cell Physiology 2011年査読有り
NBRP, National Bioresource Project of Japan and plant bioresource management

Nori Kurata, Hikaru Satoh, Hidemi Kitano, Yasuo Nagato, Takashi Endo, Kazuhiro Sato, Ryo Akashi, Hiroshi Ezura, Makoto Kusaba, Masatomo Kobayashi …

BREEDING SCIENCE 60(5) 461-468 2010年12月査読有り
Oryzabase: an integrated information resource for rice science

Yukiko Yamazaki, Shingo Sakaniwa, Rie Tsuchiya, Ken-Ichi Nonomura, Nori Kurata

BREEDING SCIENCE 60(5) 544-548 2010年12月査読有り
Identification of a new adhesin-like protein from Lactobacillus mucosae ME-340 with specific affinity to the human blood group A and B antigens

M. Watanabe, H. Kinoshita, M. Nitta, R. Yukishita, Y. Kawai, K. Kimura, N. Taketomo, Y. Yamazaki, Y. Tateno, K. Miura …

JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY 109(3) 927-935 2010年9月査読有り
NBRP databases: databases of biological resources in Japan

Yukiko Yamazaki, Ryo Akashi, Yutaka Banno, Takashi Endo, Hiroshi Ezura, Kaoru Fukami-Kobayashi, Kazuo Inaba, Tadashi Isa, Katsuhiko Kamei, Fumie Kasai …

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 38(D) D26-D32 2010年1月査読有り
National BioResource Project Information Center

Yukiko Yamazaki, Hideaki Sugawara

EXPERIMENTAL ANIMALS 58(2) 75-84 2009年4月査読有り
Development of 5006 full-length CDNAs in barley: a tool for accessing cereal genomics resources.

Kazuhiro Sato, Tadasu Shin-I, Motoaki Seki, Kazuo Shinozaki, Hideya Yoshida, Kazuyoshi Takeda, Yukiko Yamazaki, Matthieu Conte, Yuji Kohara

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 16(2) 81-9 2009年4月査読有り
Evolutionary dynamics of wheat mitochondrial gene structure with special remarks on the origin and effects of RNA editing in cereals

Koichiro Tsunewaki, Yoshihiro Matsuoka, Yukiko Yamazaki, Yasunari Ogihara

GENES & GENETIC SYSTEMS 83(4) 301-320 2008年8月査読有り
beta-Galactosidase, phospho-beta-galactosidase and phospho-beta-glucosidase activities in lactobacilli strains isolated from human faeces

H. Honda, F. Kataoka, S. Nagaoka, Y. Kawai, H. Kitazawa, H. Itoh, K. Kimura, N. Taketomo, Y. Yamazaki, Y. Tateno …

LETTERS IN APPLIED MICROBIOLOGY 45(5) 461-466 2007年11月査読有り
Ethylmethanesulfonate (EMS) mutagenesis of Solanum lycopersicum cv. Micro-Tom for large-scale mutant screens

Shin Watanabe, Tsuyoshi Mizoguchi, Koh Aoki, Yasutaka Kubo, Hitoshi Mori, Shunsuke Imanishi, Yukiko Yamazaki, Daisuke Shibata, Hiroshi Ezura

PLANT BIOTECHNOLOGY 24(1) 33-38 2007年3月査読有り
Tissue expression map of a large number of expressed sequence tags and its application to in silico screening of stress response genes in common wheat

Keiichi Mochida, Kanako Kawaura, Etsuo Shimosaka, Naoto Kawakami, Tadasu Shin-, Yuji Kohara, Yukiko Yamazaki, Yasunari Ogihara

MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS 276(3) 304-312 2006年9月査読有り
Transcriptome analysis of salinity stress responses in common wheat using a 22k oligo-DNA microarray

Kanako Kawaura, Keiichi Mochida, Yukiko Yamazaki, Yasunari Ogihara

Functional and Integrative Genomics 6(2) 132-142 2006年3月査読有り

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MISC

Oryzabase (Integrated Rice Database) in 2004,

Rice Genetics Newsletter 20 9-10 2004年
Discovering Motifs in Amino Acid Sequences using a Modified PrefixSpan Method.

Currents in Computational Molecular Biology 96-97 2002年
Modified PrefixSpan Method for Motif Discovery in Sequence Databases.

PRICAI 2002, LNAI 2417 482-491 2002年

書籍等出版物

今日から使える！データベース・ウエブツール細胞バンクのデータベース

山崎由紀子 (担当:分担執筆, 範囲:164-168)

2014年12月
今日から使える！データベース・ウエブツール NBRPデータベース

山崎由紀子 (担当:分担執筆, 範囲:162-163)

羊土社 2014年12月
実験医学：使えるデータベース・ウエブツール NBRPデータベースの現状と将来展望

山崎由紀子

羊土社・東京都千代田区神田小川町2-5-1 2011年 (ISBN: 9784758103176)
細胞工学：バイオリソース＆データベース活用術バイオリソース（生物遺伝資源）情報センター

山崎由紀子

秀潤社・東京都千代田区神田錦町3-5-1 2009年 (ISBN: 9784879623850)
Methods in Molecular Biology Profiling of Escherichia coli Chromosome Database

Yamazaki, Y, Niki, H, Kato, J

Humana Press, Totowa, New Jersey 2008年 (ISBN: 9781597453219)
バイオデータベースとウエブツールの手とり足とり活用法 ATCC The Global Bioresource Center

山崎由紀子, 西村順子

羊土社 2007年
バイオデータベースとウエブツールの手とり足とり活用法 National BioResource Project: NBRP

山崎由紀子

羊土社 2007年
細胞工学バイオリソース（生物遺伝資源）情報センター

山崎由紀子

秀潤社 2007年
Rice Functional Genomics Informatics Resources for Rice Functional Genomics.

Baltazar A. Antonio, C.Robin Buell, Yukiko Yamazaki, Immanuel Yap, Christophe Perin, d Richard Bruskiewich

Springer 2007年
細胞工学使ってみたい！バイオリソース大集合

山崎由紀子

秀潤社 2006年
遺伝まるごと生物大特集-バイオリソースプロジェクト-情報

山崎由紀子

エヌ・テイー・エス 2006年
細胞工学 Gene Ontology (GO) データベース

山崎由紀子

2005年
モデル動物の作製と維持保存・供給機関一覧および関連データベース

山崎由紀子

エル・アイ・シー 2004年
蛋白質核酸酵素バイオリソースセンター

山崎由紀子

共立出版 2004年
ゲノミクス・プロテオミクスの新展開大腸菌ゲノムデータベース

荒武, 山崎由紀子

エヌ・テイー・エス 2004年

講演・口頭発表等

New Service of BioResource World - Search by Disease

Watanabe, T, Kimura, G, Matsuda, M, Watanabe, H, Matsuno, K, Yamazaki, Y

PAG Asia 2013年3月17日
Towards Efficient Use of Image Resources in Oryzabase

Yamazaki, Y, Kimura, G, Tsuchiya, R

Plant and Animal Genome 2013 2013年1月12日
National BioResource Project-Tomato: Collection of 'Micro-Tom' Mutants, Genome Sequences and Full-Length cDNAs.

Hoshikawa, K, Hirai, T, Ariizumi, T, Yamazaki, Y, Fukuda, N, Kanayama, Y, Kubo, Y, Aoki, K, Ezura, H

Plant and Animal Genome XXI 2013年1月11日
ナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP)情報センターの活動紹介

山崎由紀子

生薬学会シンポジウム「生薬インフォマテイクスーデータベースとオミックスー 2012年9月18日招待有り
Introduction of GBIF Japan and Utilization of GBIF Data

Matsuura, K, Hosoya, T, Ebihara, A, Jinbo, U, Sugawara, H, Yamazaki, Y, Ito, M

APRU Research Symposium on University Museums 2012年9月11日
Journal annotation pipeline in Oryzabase

Yamazaki, Y, Tsuchiya, R, Kimura, G, Shidahara, Y, Asanuma, T

Biocuration 2012 2012年
Improvement to Oryzabase: Integrated Rice Science Database

Takahashi, Y, Tsuchiya, R, Saito, M, Yamakawa, T

Plant & Animal Genomes XIX Conference 2011年1月15日
Extension of Bioresource World Search - from Journals to Biological Resources -

Watanabe, T, Kimura, G, Sakaniwa, S, Saito, M, Yamakawa, T, Yamazaki, Y

Plant & Animal Genomes XIX Conference 2011年1月15日
Improvement to Oryzabase: Integrated Rice Science Database

Watanabe, T, Takahashi, Y, Sakaniwa, S, Tsuchiya, R, Saito, M, Yamakawa, T

Plant & Animal Genomes XIX Conference 2011年1月15日
Future Outlook for Databases from the perspective of Bioresources Databases

Yamazaki, Y

National Institute of Genetics International Symposium 2010年10月11日招待有り
バイオリソースデータベース：15年の歩みと将来展望

山崎由紀子

ライフサイエンスの未来へ～10年先のデータベースを考える～ 2010年10月5日招待有り
Oryzabase Ver.4: Data-Rich Rice Database With Rich User Interface

Sakaniwa, S, Takahashi, Y, Tsuchiya, R, Saito, M, Yamakawa, T

Plant & Animal Genomes XVIII Conference 2010年1月9日
An Improved Version of "BioResource World"

Kimura, G, Watanabe, T, Sakaniwa, S, Saito, M, Yamakawa, T, Yamazaki, Y

Plant & Animal Genomes XVIII Conference 2010年1月9日
Rice Phenotype Information in Oryzabase

Yukiko Yamazaki

Plant & Animal Genomes XVIII Conference 2010年1月9日
NBRP(tmp)

山崎由紀子

情報・システム研究機構シンポジウム 2009年11月30日
CMAP(tmp)

Tsuchiya, R, Yamazaki, Y

育種学会研究集会 2009年11月25日
Bioresource databases in Japan(tmp)

Yamazaki, Y

ANNRRC Meeting 2009年9月22日招待有り
ナショナルバイオリソースプロジェクト情報整備プログラムの成果と展望

山崎由紀子

統合データベースプロジェクトシンポジウム 2009年6月12日
Direct submission system and literature annotation of rice genes in Oryzabase

Yamazaki, Y, Tsuchiya, R, Asanuma, T, Shidahara, Y, Sakaniwa, S

Biocuration 2009 2009年4月17日
植物バイオリソース情報-整備状況と利用方法について-

山崎由紀子

新しい作物科学を支えるバイオリソース 2009年3月28日

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