稲垣宗一 (Soichi Inagaki) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院大学院理学系研究科生物科学専攻准教授

学位: 博士（農学）(2008年3月名古屋大学)

研究者番号: 00597883
J-GLOBAL ID: 201401021042982534
researchmap会員ID: 7000007147

研究分野

経歴

2019年9月 - 現在

東京大学大学院, 大学院理学系研究科生物科学専攻, 准教授
2017年10月 - 2021年3月

国立研究開発法人科学技術振興機構, さきがけ研究者
2012年1月 - 2019年8月

情報・システム研究機構国立遺伝学研究所, 助教

受賞

2020年9月

2020年日本遺伝学会奨励賞, 植物のエピゲノム制御機構の研究, 日本遺伝学会
2018年9月

第90回日本遺伝学会BestPaper賞

稲垣宗一, 高畑信也, 村上洋太, 角谷徹仁
2009年

第８２回遺伝学会Best Paper賞

稲垣宗一, 三浦明日香, 中村みゆき, 小林啓恵, 佐瀬英俊, 角谷徹仁

論文

Arabidopsis SDG proteins mediate Polycomb removal and transcription-coupled H3K36 methylation for gene activation

Nobutoshi Yamaguchi, Wang Yicong, Masato Abe, Yuka Kadoya, Takeru Saiki, Kanae Imai, Xuejing Wang, Taiko To, Soichi Inagaki, Takamasa Suzuki …

2024年3月11日
Cotranscriptional demethylation induces global loss of H3K4me2 from active genes in Arabidopsis

Shusei Mori, Satoyo Oya, Mayumi Takahashi, Kazuya Takashima, Soichi Inagaki, Tetsuji Kakutani

The EMBO Journal 2023年10月18日
Tandemly repeated genes promote RNAi-mediated heterochromatin formation via an antisilencing factor, Epe1, in fission yeast

Takahiro Asanuma, Soichi Inagaki, Tetsuji Kakutani, Hiroyuki Aburatani, Yota Murakami

Genes & Development 2022年12月20日
Transcription-coupled and epigenome-encoded mechanisms direct H3K4 methylation

Satoyo Oya, Mayumi Takahashi, Kazuya Takashima, Tetsuji Kakutani, Soichi Inagaki

Nature Communications 13(1) 2022年8月11日査読有り最終著者責任著者
Transcription-coupled and epigenome-encoded mechanisms direct H3K4 methylation

Satoyo Oya, Mayumi Takahashi, Kazuya Takashima, Tetsuji Kakutani, Soichi Inagaki

bioRxiv 2021年6月3日最終著者責任著者
Alterations in hormonal signals spatially coordinate distinct responses to DNA double-strand breaks in Arabidopsis roots

Naoki Takahashi, Soichi Inagaki, Kohei Nishimura, Hitoshi Sakakibara, Ioanna Antoniadi, Michal Karady, Karin Ljung, Masaaki Umeda

Science Advances 7(25) eabg0993-eabg0993 2021年6月査読有り
H3K27me3 demethylases alter HSP22 and HSP17.6C expression in response to recurring heat in Arabidopsis

Nobutoshi Yamaguchi, Satoshi Matsubara, Kaori Yoshimizu, Motohide Seki, Kouta Hamada, Mari Kamitani, Yuko Kurita, Yasuyuki Nomura, Kota Nagashima, Soichi Inagaki …

Nature Communications 12(1) 3480-3480 2021年6月査読有り
Chromatin-based mechanisms to coordinate convergent overlapping transcription.

Soichi Inagaki, Mayumi Takahashi, Kazuya Takashima, Satoyo Oya, Tetsuji Kakutani

Nature plants 7(3) 295-302 2021年3月査読有り筆頭著者責任著者
Author Correction: RNA interference-independent reprogramming of DNA methylation in Arabidopsis.

Taiko Kim To, Yuichiro Nishizawa, Soichi Inagaki, Yoshiaki Tarutani, Sayaka Tominaga, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Frédéric Berger, Tetsuji Kakutani

Nature plants 7(2) 233-233 2021年2月
RNA interference-independent reprogramming of DNA methylation in Arabidopsis.

Taiko Kim To, Yuichiro Nishizawa, Soichi Inagaki, Yoshiaki Tarutani, Sayaka Tominaga, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Frédéric Berger, Tetsuji Kakutani

Nature plants 6(12) 1455-1467 2020年11月30日査読有り筆頭著者
Removal of repressive histone marks creates epigenetic memory of recurring heat in Arabidopsis

Nobutoshi Yamaguchi, Satoshi Matsubara, Kaori Yoshimizu, Motohide Seki, Kouta Hamada, Mari Kamitani, Yuko Kurita, Soichi Inagaki, Takamasa Suzuki, Eng-Seng Gan …

BioRxiv 2020年5月査読有り
Primed histone demethylation regulates shoot regenerative competency.

Ishihara H, Sugimoto K, Tarr PT, Temman H, Kadokura S, Inui Y, Sakamoto T, Sasaki T, Aida M, Suzuki T …

Nature communications 10(1) 1786 2019年4月査読有り
Histone acetylation orchestrates wound-induced transcriptional activation and cellular reprogramming in Arabidopsis.

Bart Rymen, Ayako Kawamura, Alice Lambolez, Soichi Inagaki, Arika Takebayashi, Akira Iwase, Yuki Sakamoto, Kaori Sako, David S Favero, Momoko Ikeuchi …

Communications biology 2 404-404 2019年査読有り
Gene‐body chromatin modification dynamics mediate epigenome differentiation in Arabidopsis

Soichi Inagaki, Mayumi Takahashi, Aoi Hosaka, Tasuku Ito, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Yoshiaki Tarutani, Tetsuji Kakutani

The {EMBO} Journal 36(8) 970-980 2017年4月査読有り筆頭著者責任著者
DNA damage inhibits lateral root formation by up-regulating cytokinin biosynthesis genes in Arabidopsis thaliana

La Ode Muhammad Muchdar Davis, Nobuo Ogita, Soichi Inagaki, Naoki Takahashi, Masaaki Umeda

GENES TO CELLS 21(11) 1195-1208 2016年11月査読有り
High-Throughput Analysis of T-DNA Location and Structure Using Sequence Capture

Soichi Inagaki, Isabelle M. Henry, Meric C. Lieberman, Luca Comai

PLOS ONE 10(10) e0139672 2015年10月査読有り筆頭著者
Hairy Root Transformation Using Agrobacterium rhizogenes as a Tool for Exploring Cell Type-Specific Gene Expression and Function Using Tomato as a Model

Mily Ron, Kaisa Kajala, Germain Pauluzzi, Dongxue Wang, Mauricio A. Reynoso, Kristina Zumstein, Jasmine Garcha, Sonja Winte, Helen Masson, Soichi Inagaki …

PLANT PHYSIOLOGY 166(2) 455-U42 2014年10月査読有り
What triggers differential DNA methylation of genes and TEs: Contribution of body methylation?

S. Inagaki, T. Kakutani

Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology 77 155-160 2012年招待有り筆頭著者
Programmed induction of endoreduplication by DNA double-strand breaks in Arabidopsis

Sumiko Adachi, Kazunori Minamisawa, Yoko Okushima, Soichi Inagaki, Kaoru Yoshiyama, Youichi Kondou, Eli Kaminuma, Mika Kawashima, Tetsuro Toyoda, Minami Matsui …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 108(24) 10004-10009 2011年6月査読有り
CELL-CYCLE CONTROL AND PLANT DEVELOPMENT

Soichi Inagaki, Masaaki Umeda

INTERNATIONAL REVIEW OF CELL AND MOLECULAR BIOLOGY, VOL 291 291 227-261 2011年査読有り招待有り筆頭著者

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MISC

Dynamics of gene-body histone modifications mediates heterochromatin silencing in Arabidopsis

Soichi Inagaki, Mayumi Takahashi, Tetsuji Kakutani

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 348-348 2016年12月
Transgenerational establishment of CG and non-CG DNA methylation patterns in Arabidopsis

To Taiko, Yoshiaki Tarutani, Kae Kato, Soichi Inagaki, Tasuku Ito, Mayumi Takahashi, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Colot Vincent, Tetsuji Kakutani

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 348-348 2016年12月
腋芽形成に異常を示すシロイヌナズナchestnut変異体の解析

森上敦, 稲垣宗一, 大藤雅章, 塚越啓央, 塚越啓央, 中村研三

日本植物生理学会年会要旨集 55th 2014年
Genome maintenance mechanism in polyploid plants

Soichi Inagaki, Shin Nishigaki, Masaaki Umeda

GENES & GENETIC SYSTEMS 87(6) 403-403 2012年12月
Analysis of function of Arabidopsis TEBICHI gene in meristem and organ development

Soichi Inagaki, Kenzo Nakamura, Atsushi Morikami

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 48 S19-S19 2007年
Response of Arabidopsis TSA1 and TSA1-likeGenes to wounding and jasmonic acid

S Inagaki, M Shamoto, T Suzuki, A Morikami, K Nakamura

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 47 S212-S212 2006年
Functional analysis of Arabidopsis TEBICHEE gene which is involved in both maintenance of meristem structure and cell division.

S Inagaki, T Suzuki, M Ohto, H Urawa, T Horiuchi, K Nakamura, A Morikami

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 46 S133-S133 2005年
Root meristem maintenance and cell division control

A Morikami, T Suzuki, S Inagaki, K Nakamura

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 45 S17-S17 2004年
Characterization of a novel Arabidopsis mutant with disorganized meristem structure

S Inagaki, T Suzuki, M Ohto, K Nakamura, A Morikami

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 44 S182-S182 2003年

講演・口頭発表等

エピゲノムによる植物の環境適応制御

稲垣宗一

日本植物生理学会第62回年会シンポジウム「フィールドでの植物応答の制御に向けた植物環境適応機構の解明」 2021年3月15日招待有り
アンチセンス転写を介したクロマチン制御と植物の環境応答

稲垣宗一

日本植物学会第84回大会シンポジウム「植物環境応答の頑健性と柔軟性」 2020年9月20日招待有り
Control of convergently transcribed genes through modulating gene-body chromatin modification

Soichi Inagaki

Gordon Research Conference on Epigenetics 2019年7月24日招待有り
エピゲノム分化と植物発生に重要な"gene body"クロマチン修飾動態の解析

稲垣宗一

日本発生生物学会秋季シンポジウム 2016年10月20日招待有り
Genetic disseiction of DNA damage response and endopolyploidy in Arabidopsis

Inagaki, S

2012 CSHL Syposium:The Biology of Plants 2012年
Genetics of DNA methylation in genes and transposons in Arabidopsis

Kakutani T, Saze H, Miura A, Inagaki S, Kobayashi A, Nakamura M, Tsukahara S, Fu Y

第３２回分子生物学会年会シンポジウムEmerging power of epigenomics in life science 2009年12月10日
シロイヌナズナのjumonjiドメイン蛋白質が転写されている遺伝子のDNAメチル化を防ぐ

稲垣宗一, 三浦明日香, 中村みゆき, 小林啓恵, 佐瀬英俊, 角谷徹仁

日本遺伝学会第８１回大会 2009年9月16日

共同研究・競争的資金等の研究課題

非コード転写とエピゲノムによる植物の環境応答制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

稲垣宗一
植物の不均一環境変動への応答を支える多層的エピゲノム制御機構

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2020年11月 - 2025年3月

佐瀬英俊, 稲垣宗一
不均一環境変動に対する植物のレジリエンスを支える多層的情報統御の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2020年11月 - 2025年3月

松下智直, 松林嘉克, 壽崎拓哉, 吉田聡子, 木下俊則, 杉本慶子, 芦苅基行, 佐瀬英俊, 打田直行, 関真秀, 花田耕介, 鈴木孝征, 稲垣宗一, 多田安臣, 児玉豊, 望田啓子
遺伝学とナチュラルバリエーションを用いた倍数体植物のDNA ダメージ耐性機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2011年 - 2012年

稲垣宗一

稲垣宗一

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経歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

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