町田晋一 (Shinichi Machida) - マイポータル

基本情報

所属: 国立健康危機管理研究機構国立国際医療研究所ウイルス構造機能研究部テニュアトラック部長
: 熊本大学大学院医学教育部非常勤講師 (客員教授)

学位: 博士(理学）(2014年9月早稲田大学)

J-GLOBAL ID: 201401036153153747
researchmap会員ID: 7000007475

研究キーワード

研究分野

経歴

2025年4月 - 現在

熊本大学, 大学院医学教育部, 非常勤講師 (客員教授)
2022年9月 - 現在

国立研究開発法人国立国際医療研究センター, ウイルス構造機能研究部, テニュアトラック部長
2020年12月 - 2022年8月

Institute of Human Genetics (CNRS), Molecular Virology Lab, 博士研究員
2019年12月 - 2020年11月

Institute of Human Genetics (CNRS), Molecular Virology Lab, 早石修記念海外留学助成
2017年12月 - 2019年11月

Institute of Human Genetics (CNRS), Molecular Virology Lab, 日本学術振興会海外特別研究員
2017年3月 - 2017年11月

早稲田大学, 理工学術院, 次席研究員（研究員助教）
2015年4月 - 2017年3月

早稲田大学, 理工学術院, 助教
2014年4月 - 2015年3月

早稲田大学, 先進理工学部, 助手
2012年4月 - 2014年3月

早稲田大学, 大学院先進理工学研究科, 日本学術振興会特別研究員（DC1）

学歴

2011年9月 - 2014年9月

早稲田大学, 大学院先進理工学研究科, 電気・情報生命専攻博士課程
2008年4月 - 2010年3月

早稲田大学, 大学院先進理工学研究科, 電気・情報生命専攻修士課程
2004年4月 - 2008年3月

早稲田大学, 理工学部, 電気・情報生命工学科

受賞

論文

Structural basis of the hepatitis B virus X protein in complex with DDB1.

Hiroki Tanaka, Joao Diogo Dias, Basile Jay, Shunsuke Kita, Mina Sasaki, Hiroyuki Takeda, Naoki Kishimoto, Shunsuke Sasaki, Shogo Misumi, Masashi Mizokami …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 122(24) e2421325122 2025年6月17日責任著者
Unintegrated HIV-1 DNA recruits cGAS via its histone-binding domain to escape innate immunity.

Cyprien Jahan, Lucie Bonnet-Madin, Shinichi Machida, Bijan Sobhian, Suzie Thenin-Houssier, Monsef Benkirane

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 122(11) e2424465122 2025年3月18日
A Novel AGR2 Variant Causing Aberrant Monomer-Dimer Equilibrium Leading to Severe Respiratory and Digestive Symptoms.

Sanami Takada, Silvanna Gallo, Sebastian Silva, Hiroki Tanaka, Oscar Pincheira, Juan Zúñiga, Marcela Villarroel, Ximena Hidalgo, Joel Melo-Tanner, Hidefumi Suzuki …

Journal of clinical immunology 45(1) 55-55 2024年12月14日
POLE3 is a repressor of unintegrated HIV-1 DNA required for efficient virus integration and escape from innate immune sensing

Suzie Thenin-Houssier, Shinichi Machida (co-first author), Cyprien Jahan, Lucie Bonnet-Madin, Scarlette Abbou, Heng-Chang Chen, Robel Tesfaye, Olivier Cuvier, Monsef Benkirane

Science Advances 9(44) 2023年11月3日筆頭著者
GRL-142 binds to and impairs HIV-1 integrase nuclear localization signal and potently suppresses highly INSTI-resistant HIV-1 variants.

Manabu Aoki, Hiromi Aoki-Ogata, Haydar Bulut, Hironori Hayashi, Nobutoki Takamune, Naoki Kishimoto, Hiroki Tanaka, Nobuyo Higashi-Kuwata, Shin-Ichiro Hattori, Debananda Das …

Science advances 9(28) eadg2955 2023年7月14日
Combined direct/indirect detection allows identification of DNA termini in diverse sequencing datasets and supports a multiple-initiation-site model for HIV plus-strand synthesis.

William Wang, Karen L Artiles, Shinichi Machida, Monsef Benkirane, Nimit Jain, Andrew Z Fire

bioRxiv : the preprint server for biology 2023年6月13日
Faithful to the Marseille tradition: Unique and intriguing-that's how Marseillevirus packs its DNA.

Shinichi Machida, Joao Diogo Dias, Monsef Benkirane

Molecular cell 82(23) 4401-4402 2022年12月1日筆頭著者
Exploring histone loading on HIV DNA reveals a dynamic nucleosome positioning between unintegrated and integrated viral genome.

Shinichi Machida, David Depierre, Heng-Chang Chen, Suzie Thenin-Houssier, Gaël Petitjean, Cecile M Doyen, Motoki Takaku, Olivier Cuvier, Monsef Benkirane

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117(12) 6822-6830 2020年3月24日筆頭著者責任著者
H3K14 ubiquitylation promotes H3K9 methylation for heterochromatin assembly.

Eriko Oya, Reiko Nakagawa, Yuriko Yoshimura, Mayo Tanaka, Gohei Nishibuchi, Shinichi Machida, Atsuko Shirai, Karl Ekwall, Hitoshi Kurumizaka, Hideaki Tagami …

EMBO reports 20(10) e48111 2019年10月4日
Intrabody-based FRET probe to visualize endogenous histone acetylation.

Chan-I Chung, Yuko Sato, Yuki Ohmuro-Matsuyama, Shinichi Machida, Hitoshi Kurumizaka, Hiroshi Kimura, Hiroshi Ueda

Scientific reports 9(1) 10188-10188 2019年7月15日
Author Correction: CHD3 helicase domain mutations cause a neurodevelopmental syndrome with macrocephaly and impaired speech and language.

Lot Snijders Blok, Justine Rousseau, Joanna Twist, Sophie Ehresmann, Motoki Takaku, Hanka Venselaar, Lance H Rodan, Catherine B Nowak, Jessica Douglas, Kathryn J Swoboda …

Nature communications 10(1) 2079-2079 2019年5月2日
Mitotic phosphorylation of HP1α regulates its cell cycle-dependent chromatin binding.

Gohei Nishibuchi, Shinichi Machida, Reiko Nakagawa, Yuriko Yoshimura, Kyoko Hiragami-Hamada, Yusuke Abe, Hitoshi Kurumizaka, Hideaki Tagami, Jun-Ichi Nakayama

Journal of biochemistry 165(5) 433-446 2019年5月1日
Author Correction: CHD3 helicase domain mutations cause a neurodevelopmental syndrome with macrocephaly and impaired speech and language.

Lot Snijders Blok, Justine Rousseau, Joanna Twist, Sophie Ehresmann, Motoki Takaku, Hanka Venselaar, Lance H Rodan, Catherine B Nowak, Jessica Douglas, Kathryn J Swoboda …

Nature communications 10(1) 883-883 2019年2月15日
CHD3 helicase domain mutations cause a neurodevelopmental syndrome with macrocephaly and impaired speech and language.

Lot Snijders Blok, Justine Rousseau, Joanna Twist, Sophie Ehresmann, Motoki Takaku, Hanka Venselaar, Lance H Rodan, Catherine B Nowak, Jessica Douglas, Kathryn J Swoboda …

Nature communications 9(1) 4619-4619 2018年11月5日
Cryo-EM structure of the nucleosome containing the ALB1 enhancer DNA sequence.

Yoshimasa Takizawa, Hiroki Tanaka, Shinichi Machida, Masako Koyama, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Paul A Wade, Matthias Wolf, Hitoshi Kurumizaka

Open biology 8(3) 2018年3月
Structural Basis of Heterochromatin Formation by Human HP1.

Machida S, Takizawa Y, Ishimaru M, Sugita Y, Sekine S, Nakayama J, Wolf M, Kurumizaka H

Molecular Cell 69(3) 385-397 2018年2月1日査読有り筆頭著者
Structural Basis of Heterochromatin Formation by Human HP1.

Shinichi Machida, Yoshimasa Takizawa, Masakazu Ishimaru, Yukihiko Sugita, Satoshi Sekine, Jun-Ichi Nakayama, Matthias Wolf, Hitoshi Kurumizaka

Molecular cell 69(3) 385-397 2018年2月1日筆頭著者
Methods for Preparing Nucleosomes Containing Histone Variants.

Tomoya Kujirai, Yasuhiro Arimura, Risa Fujita, Naoki Horikoshi, Shinichi Machida, Hitoshi Kurumizaka

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 1832 3-20 2018年
Phosphorylation of CBX2 controls its nucleosome-binding specificity.

Takayuki Kawaguchi, Shinichi Machida, Hitoshi Kurumizaka, Hideaki Tagami, Jun-Ichi Nakayama

Journal of biochemistry 162(5) 343-355 2017年11月1日
Histone H3 Methylated at Arginine 17 Is Essential for Reprogramming the Paternal Genome in Zygotes.

Yuki Hatanaka, Takeshi Tsusaka, Natsumi Shimizu, Kohtaro Morita, Takehiro Suzuki, Shinichi Machida, Manabu Satoh, Arata Honda, Michiko Hirose, Satoshi Kamimura …

Cell reports 20(12) 2756-2765 2017年9月19日

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MISC

分裂酵母のヘテロクロマチンを制御するヒストン修飾のクロストーク

大屋恵梨子, 中川れい子, 吉村ゆり子, 田中万葉, 西淵剛平, 町田晋一, 胡桃坂仁志, 田上英明, 中山潤一

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 91st 2019年
パイオニア転写因子の標的となるALB1ヌクレオソームの解析

田中大貴, 滝沢由政, 町田晋一, 小山昌子, 前原一満, 大川恭行, Wade Paul A., Wolf Matthias, 胡桃坂仁志

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 91回 [1T12e-245)] 2018年9月
Architecture of the Heterochromatin Unit Revealed by Cryo-EM

Takizawa Yoshimasa, Machida Shinichi, Ishimaru Masakazu, Sekine Satoshi, Sugita Yukihiko, Nakayama Jun-ichi, Kurumizaka Hitoshi, Wolf Matthias

BIOPHYSICAL JOURNAL 114(3) 563A 2018年2月査読有り
高次クロマチン構造形成におけるヒストン修飾のクロストーク

大屋恵梨子, 田中万葉, 西淵剛平, 中川れい子, 町田晋一, 胡桃坂仁志, 田上英明, 中山潤一

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th 2016年
GATA3 modulates chromatin structure to establish active enhancers in breast cancer cells

Motoki Takaku, Sara A. Grimm, Takashi Shimbo, Lalith Perera, Shinichi Machida, Hitoshi Kurumizaka, Paul A. Wade

CANCER RESEARCH 75 2015年8月
HP1のリン酸化はH3K9me3nucleosomeに対する結合特異性を制御している

西淵剛平, 町田晋一, 越阪部晃永, 村越大夢, 浜田京子, 中川れい子, WOLFGANG Fischle, 胡桃坂仁志, 田上英明, 中山潤一

日本生化学会大会(Web) 87th 2014年
リンカーヒストンを含む高次クロマチン構造における相同組換え機構

町田晋一, 高久誉大, 井倉正枝, 孫継英, 鈴木秀和, 小林航, 木野村愛子, 越阪部晃永, 立和名博昭, 浦聖恵 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 2013年
相同組換えにおける高次クロマチンの動的な制御

町田晋一, 高久誉大, 井倉正枝, SUN Jiying, 鈴木秀和, 小林航, 越阪部晃永, 立和名博昭, 浦聖恵, 田代聡 …

日本生化学会大会(Web) 86th 2013年
ヘテロクロマチンタンパク質HP1による高次クロマチン構造形成のメカニズム

西淵剛平, 町田晋一, 越阪部晃永, 中川れい子, 須賀則之, 胡桃坂仁志, 中山潤一

日本生化学会大会(Web) 86th 2013年
ヘテロクロマチンタンパク質HP1のリン酸化修飾と高次クロマチン構造形成のダイナミクス

西淵剛平, 町田晋一, 越坂部晃永, 中川れい子, 胡桃坂仁志, 中山潤一

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 2013年
クロマチン高次構造上における相同組換え反応の解析

町田晋一, 高久誉大, 小林航, 越阪部晃永, 立和名博昭, 鈴木秀和, 浦聖恵, 井倉正枝, 井倉毅, 田代聡 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 2012年
再構成系によるクロマチンでの相同組換え機構の解析

高久誉大, 町田晋一, 小林航, 林田亮太, 鈴木秀和, 井倉正枝, 越阪部晃永, 立和名博昭, 浦聖恵, 田代聡 …

日本生化学会大会(Web) 85th 2012年
新規RAD51B相互作用タンパク質EVLの相同組換えにおける機能

高久誉大, 細谷紀子, 滝沢由政, 町田晋一, 井川粛子, 柴田武彦, 宮川清, 胡桃坂仁志

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 81回・31回 2T4-2 2008年11月
Identification of a novel Rad51B-interacting protein

M. Takaku, Y. Takizawa, S. Nakayama, S. Machida, H. Kurumizaka

FEBS JOURNAL 275 116-116 2008年6月

書籍等出版物

あなたのタンパク質精製、大丈夫ですか? : 貴重なサンプルをロスしないための達人の技

胡桃坂, 仁志, 有村, 泰宏 (担当:分担執筆, 範囲:第5章1,3および第6章１)

羊土社 2018年9月 (ISBN: 9784758122382)
がん基盤生物学 : 革新的シーズ育成に向けて : 次世代がん戦略研究update

清木, 元治, 秋山, 徹, 石川, 冬木, 内海, 潤, 近藤, 豊, 中山, 敬一, 平尾, 敦 (担当:分担執筆, 範囲:６相同組換え関連因子を標的にしたがん治療薬研究 (p179-185))

南山堂 2013年10月 (ISBN: 9784525420918)

講演・口頭発表等

Characterization of unintegrated HIV-1 DNA silencing

The 2021 Cold Spring Harbor meeting: Retroviruses 2021年5月27日
Preparation of histones by chemical ligation methods for structural studies

J-PARC WORKSHOP (Deuterated Materials Enhancing Neutron Science for Structure Function Applications) 2017年10月招待有り
ヘテロクロマチンの立体構造解析

第11回日本エピジェネティクス研究会年会 2017年5月
H3K9me3を含むクロマチンとHP1により形成されるヘテロクロマチンの解析

第34回染色体ワークショップ、第15回核ダイナミクス研究会 2017年1月
The homologous pairing reaction in higher-ordered chromatin containing linker histone H1.

Cold Spring Harbor Asia (DNA Metabolism, Genomic Stability and Human Disease) 2016年6月
The biochemical analyses of the chromatin containing mono-ubiquitinated nucleosomes

Chromatin Structure, Dynamics, and Function 2015年8月
リンカーヒストンを含む高次クロマチン構造における相同組換え機構

第36回日本分子生物学会年会 2014年12月
Nap1 is required for the homologous recombination reaction in higher-order chromatin containing histone H1

THE 4D NUCLEOME 2014年12月
リンカーヒストンバリアントH1Tの相同組換えにおける機能

第87回日本生化学会大会 2014年11月
Biochemical analyses of the RAD51-mediated homologous pairing in chromatin containing the linker histone variant, H1T

3R Symposium 2014年11月
高次クロマチンにおける相同組換えの反応機構

第22 回DNA 複製・組換え・修復ワークショップ 2013年11月
相同組換えにおける高次クロマチンの動的な制御

第86回日本生化学会大会 2013年9月招待有り

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

B型肝炎ウイルスの転写メカニズムに関する包括的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

町田晋一
B型慢性肝炎の機能的治癒を目指した革新的免疫治療開発に資する研究

国立研究開発法人日本医療研究開発機構Ｂ型肝炎創薬実用化等研究事業 2025年4月 - 2028年3月

五十川正記
B肝炎ウイルスの病原性発生の機序解明と創薬基盤開発

国立研究開発法人日本医療研究開発機構Ｂ型肝炎創薬実用化等研究事業 2025年4月 - 2028年3月

村松正道
キャプシド複合体の構造機能解析によるHIV治療法開発基盤の構築

国立研究開発法人日本医療研究開発機構エイズ対策実用化研究事業 2025年4月 - 2028年3月

町田晋一
B型肝炎ウイルスXタンパク質（HBx）の構造機能研究に基づく抗ウイルス治療基盤開発

国立研究開発法人日本医療研究開発機構Ｂ型肝炎創薬実用化等研究事業 2025年4月 - 2028年3月

町田晋一
B型肝炎治療法開発に向けたB 型肝炎ウイルスX タンパク質(HBx)の構造機能研究

公益財団法人武田科学振興財団医学系研究助成 2024年10月 - 2026年9月

町田晋一
構造機能学的アプローチによるHIV 複製メカニズムの基本原理解明

三菱財団自然科学研究助成(若手助成) 2024年9月 - 2025年9月

町田晋一
新規抗HIV薬開発に向けたHIV複製反応の時空間的解析

加藤記念バイオサイエンス振興財団加藤記念研究助成 2023年4月 - 2025年3月

町田晋一
クライオ電子顕微鏡を用いたHIV複製メカニズムの解析

上原記念生命科学財団研究奨励金 2023年2月 - 2024年4月

町田晋一
HIV 感染制御に向けたunintegrated HIV DNA サイレンシングの解析

公益財団法人持田記念医学薬学振興財団持田記念研究助成金 2022年12月 - 2023年12月

町田晋一
unintegrated HIV DNAサイレンシングのHIV複製サイクルにおける意義

山田科学振興財団海外研究援助 2021年4月 - 2022年3月

町田晋一
クロマチンによるHIV 病原性発現制御メカニズムの解明

日本生化学会早石修記念海外留学助成 2019年12月 - 2020年11月

町田晋一
ヒストンバリアントによるクロマチン構造制御がHIVの病原性発現に及ぼす影響の解析

JSPS 日本学術振興会(JSPS) 海外特別研究員 2017年12月 - 2019年11月

町田晋一
ヘテロクロマチンの基盤構造の構造生物学的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2016年4月 - 2018年3月

町田晋一
高次クロマチンにおける相同組換え反応の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援研究活動スタート支援 2014年8月 - 2016年3月

町田晋一
RAD51及びRAD51相互作用因子によるヌクレオソーム上での組換え反応の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2012年 - 2014年3月

町田晋一

町田晋一

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研究分野

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学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

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