川口修治 (Shuji Kawaguchi) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学大学院附属ゲノム医学センター准教授

J-GLOBAL ID: 201401032678052822
researchmap会員ID: 7000008047

研究分野

ライフサイエンス / ゲノム生物学 /

経歴

京都大学

論文

Proteogenomics in cerebrospinal fluid and plasma reveals new biological fingerprint of cerebral small vessel disease.

Ilana Caro, Daniel Western, Shinichi Namba, Na Sun, Shuji Kawaguchi, Yunye He, Masashi Fujita, Gennady Roshchupkin, Tim D'Aoust, Marie-Gabrielle Duperron …

Nature aging 2025年11月20日査読有り
Whole-genome sequencing of 3135 individuals representing the genetic diversity of the Japanese population.

Koichiro Higasa, Yoichiro Kamatani, Takahisa Kawaguchi, Shuji Kawaguchi, Saori Sakaue, Ta-Yu Yang, Yukinori Okada, Yukihide Momozawa, Izumi Yamaguchi, Dominic Nelson …

Journal of human genetics 2025年11月8日査読有り
IgG4-related disease in the Japanese population: a whole-genome sequencing study.

Yuxun Oswald Zhang, Takeshi Iwasaki, Takahisa Kawaguchi, Hiroki Takahashi, Shuji Kawaguchi, Atsushi Kanno, Izumi Yamaguchi, Kensuke Kubota, Hiroaki Dobashi, Masao Nagasaki …

The Lancet. Rheumatology 2025年11月3日査読有り
Quantitative 1H-NMR spectroscopy identifies metabolites and lipoprotein subclasses associated with intermediate phenotypes of chronic diseases in the Japanese Nagahama Study.

Huiting Ou, Shuji Kawaguchi, François Brial, Kazuhiro Sonomura, Takahisa Kawaguchi, Andrée E Gravel, Sanjoy Kumar Das, Daniel Auld, Yasuharu Tabara, Bertrand J Jean-Claude …

Scientific reports 15(1) 31337-31337 2025年8月26日査読有り
Genomic and transcriptomic profiling of pre- and postneoadjuvant chemotherapy triple negative breast cancer tumors.

Tomomi Nishimura, Ravi Velaga, Norikazu Masuda, Kosuke Kawaguchi, Shuji Kawaguchi, Masahiro Takada, Yurina Maeshima, Sunao Tanaka, Yuichiro Kikawa, Takayuki Kadoya …

Cancer science 2024年10月7日査読有り
Identification of epistatic SNP combinations in rheumatoid arthritis using LAMPLINK and Japanese cohorts.

Mio Shibata, Aika Terada, Takahisa Kawaguchi, Yoichiro Kamatani, Daigo Okada, Kazuhisa Nagashima, Koichiro Ohmura, Fumihiko Matsuda, Shuji Kawaguchi, Jun Sese …

Journal of human genetics 2024年7月16日査読有り責任著者
Proteogenomics in cerebrospinal fluid and plasma reveals new biological fingerprint of cerebral small vessel disease.

Stephanie Debette, Ilana Caro, Daniel Western, Shinichi Namba, Na Sun, Shuji Kawaguchi, Yunye He, Masashi Fujita, Gennady Roshchupkin, Tim D'Aoust …

Research square 2024年7月2日
Protocol for genome-wide association study of human blood metabolites

Takeshi Iwasaki, Yoichiro Kamatani, Kazuhiro Sonomura, Shuji Kawaguchi, Fumihiko Matsuda

STAR Protocols 5(2) 103052-103052 2024年6月査読有り
Comprehensive HLA Typing from a Current Allele Database Using Next-Generation Sequencing Data.

Shuji Kawaguchi, Koichiro Higasa, Ryo Yamada, Fumihiko Matsuda

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2809 67-75 2024年筆頭著者
A phenome-wide association study (PheWAS) to identify the health impacts of 4-cresol sulfate in the Nagahama Study.

Huiting Ou, Shuji Kawaguchi, Kazuhiro Sonomura, Takahisa Kawaguchi, Seri Kitada, Satoshi Yoshiji, François Brial, Dominique Gauguier, Jianguo Xia, Fumihiko Matsuda

Scientific reports 13(1) 13926-13926 2023年8月25日査読有り
Improved genetic prediction of the risk of knee osteoarthritis using the risk factor-based polygenic score.

Yugo Morita, Yoichiro Kamatani, Hiromu Ito, Shiro Ikegawa, Takahisa Kawaguchi, Shuji Kawaguchi, Meiko Takahashi, Chikashi Terao, Shuji Ito, Kohei Nishitani …

Arthritis research & therapy 25(1) 103-103 2023年6月12日査読有り
Identification of risk factors for elevated serum IgG4 levels in subjects in a large-scale health checkup cohort study.

Yoshika Tsuji, Tomohiro Koga, Fumiaki Nonaka, Kenichi Nobusue, Shin-Ya Kawashiri, Hirotomo Yamanashi, Takahiro Maeda, Kazuhiko Arima, Kiyoshi Aoyagi, Meiko Takahashi …

Frontiers in immunology 14 1124417-1124417 2023年査読有り
Genetic influences on human blood metabolites in the Japanese population

Takeshi Iwasaki, Yoichiro Kamatani, Kazuhiro Sonomura, Shuji Kawaguchi, Takahisa Kawaguchi, Meiko Takahashi, Koichiro Ohmura, Taka-Aki Sato, Fumihiko Matsuda

iScience 26(1) 105738-105738 2023年1月査読有り
Systemic Chronic Diseases Coexist with and Affect Locomotive Syndrome: The Nagahama Study.

Yugo Morita, Hiromu Ito, Shuji Kawaguchi, Kohei Nishitani, Shinichiro Nakamura, Shinichi Kuriyama, Tome Ikezoe, Tadao Tsuboyama, Noriaki Ichihashi, Yasuharu Tabara …

Modern rheumatology 33(3) 608-616 2022年5月12日査読有り
Physical and Financial Impacts Caused by the COVID-19 Pandemic Exacerbate Knee Pain: A Longitudinal Study of a Large-Scale General Population.

Yugo Morita, Hiromu Ito, Shuji Kawaguchi, Kohei Nishitani, Shinichiro Nakamura, Shinichi Kuriyama, Yoshihiro Sekine, Yasuharu Tabara, Fumihiko Matsuda, Shuichi Matsuda

Modern rheumatology 33(2) 373-380 2022年3月30日査読有り
Genome wide association study of HTLV-1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis in the Japanese population.

Marina Penova, Shuji Kawaguchi, Jun-Ichirou Yasunaga, Takahisa Kawaguchi, Tomoo Sato, Meiko Takahashi, Masakazu Shimizu, Mineki Saito, Kunihiro Tsukasaki, Masanori Nakagawa …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118(11) 2021年3月16日査読有り筆頭著者
Combination of host immune metabolic biomarkers for the PD-1 blockade cancer immunotherapy.

Ryusuke Hatae, Kenji Chamoto, Young Hak Kim, Kazuhiro Sonomura, Kei Taneishi, Shuji Kawaguchi, Hironori Yoshida, Hiroaki Ozasa, Yuichi Sakamori, Maryam Akrami …

JCI insight 5(2) 2020年1月30日査読有り
High-Definition Genomic Analysis of HLA Genes Via Comprehensive HLA Allele Genotyping.

Shuji Kawaguchi, Fumihiko Matsuda

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2131 31-38 2020年筆頭著者
IgG4-related disease in the Japanese population: a genome-wide association study

Chikashi Terao, Masao Ota, Takeshi Iwasaki, Masahiro Shiokawa, Shuji Kawaguchi, Katsutoshi Kuriyama, Takahisa Kawaguchi, Yuzo Kodama, Izumi Yamaguchi, Kazushige Uchida …

The Lancet Rheumatology 1(1) e14-e22 2019年9月査読有り
Comprehensive HLA Typing from a Current Allele Database Using Next-Generation Sequencing Data.

Kawaguchi S, Higasa K, Yamada R, Matsuda F

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 1802 225-233 2018年筆頭著者

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MISC

次世代シークエンスデータと国際データベースを用いたHLA遺伝子型の決定 (特集バイオインフォマティクスの進展・臨床応用)

川口修治, 日笠幸一郎, 山田亮, 松田文彦

最新醫學 = The medical frontline 74(2) 214-219 2019年2月
HTLV-1高浸淫地域における大規模HLA解析による感染およびHAM/TSP発症リスクの関連解析

川口修治, ペノヴァマリナ, 川口喬久, 清水正和, 高橋めい子, 日笠幸一郎, 日笠幸一郎, 松田文彦

日本HTLV-1学会学術集会 5th 2018年
人工知能を用いたデータマイニングと全ゲノムデータ解析技術の融合によるメンデル遺伝性疾患の新規疾患遺伝子同定への試み

川口修治, 徳増玲太郎, 日笠幸一郎, 日笠幸一郎, 高野敦司, 松田文彦

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集 63rd 2018年
次世代シークエンサーと国際データベースを用いた高効率・高精度なHLA遺伝子群の包括的タイピング技術の確立

川口修治, 日笠幸一郎, 日笠幸一郎, 清水正和, 山田亮, 松田文彦

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集 63rd 2018年
CONTEXTUAL CLUSTERING AND UNMIXING OF GEOSPATIAL DATA BASED ON GAUSSIAN MIXTURE MODELS AND MARKOV RANDOM FIELDS

Sawamura Yoko, 西井龍映, 中元麻紀子, Kawaguchi Shuji, Ozaki Tomohiko

Bulletin of informatics and cybernetics 41 39-49 2009年12月
I-071 MRFモデルに基づいた人工衛星リモートセンシング画像のカテゴリー分類(I.画像認識・メディア理解)

川口修治, 山崎謙介

情報科学技術フォーラム一般講演論文集 3(3) 167-168 2004年8月20日
科学教育と情報教育の融合的教材―WebGISに基づく空間情報eラーニングシステム―

山崎謙介, 蓮沼賢, 川口修治, 栗田勝実, 尾田博仁

情報教育シンポジウム2003論文集 2003(12) 7-14 2003年8月22日

共同研究・競争的資金等の研究課題

高精細化ゲノム情報による難治性疾患の原因遺伝子変異同定および高度解析技術の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

川口修治
難病解明に向けた大規模HLAシークエンスと多重リスク因子の包括的解析法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

川口修治

産業財産権

特開2021-076561 ＨＡＭ／ＴＳＰ発症リスク判定方法

松田文彦, 川口修治
特許6798697 HLA遺伝子のPCRプライマーセット及びそれを用いたシークエンス法

松田文彦, 川口修治, 清水正和, 日笠幸一郎
特開2018-108042 被験者のHLA遺伝子のアレルペアを判定する方法

松田文彦, 川口修治, 日笠幸一郎, 山田亮

川口修治

基本情報

研究分野

経歴

論文

MISC

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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