阿久津達也 (Tatsuya Akutsu) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学化学研究所教授

学位: 工学博士(東京大学)

J-GLOBAL ID: 201401096521596568

外部リンク: http://www.bic.kyoto-u.ac.jp/takutsu/members/takutsu/japanese.html

[略歴]
1989年3月東京大学大学院工学系研究科情報工学専攻博士課程修了（工学博士）
1989年4月～1994年3月通商産業省工業技術院機械技術研究所研究員
1994年4月～1996年3月群馬大学工学部情報工学科助教授
1996年4月～2001年9月東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター助教授
2001年2月～2001年8月カリフォルニア大学バークレー校客員研究員
2001年11月～2003年3月京都大学大学院情報学研究科知能情報学専攻併任教授
2001年10月～京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター教授
[研究分野]
バイオインフォマティクス
離散アルゴリズム
複雑ネットワーク

研究分野

経歴

2001年10月 - 現在

京都大学化学研究所附属バイオインフォマティクスセンター教授
1996年4月 - 2001年9月

東京大学医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター助教授
1994年4月 - 1996年3月

群馬大学工学部情報工学科助教授
1989年4月 - 1994年3月

通商産業省工業技術院機械技術研究所研究員

学歴

論文

A New Integer Linear Programming Formulation to the Inverse QSAR/QSPR for Acyclic Chemical Compounds Using Skeleton Trees.

Fan Zhang, Jianshen Zhu, Rachaya Chiewvanichakorn, Aleksandar Shurbevski, Hiroshi Nagamochi, Tatsuya Akutsu

Proc. 33rd International Conference on Industrial, Engineering and Other Applications of Applied Intelligent Systems (IEA/AIE 2020) 433 - 444 2020年9月査読有り
Comprehensive review and assessment of computational methods for predicting RNA post-transcriptional modification sites from RNA sequences.

Zhen Chen 0009, Pei Zhao, Fuyi Li, Yanan Wang, Alexander Ian Smith, Geoffrey I. Webb, Tatsuya Akutsu, Abdelkader Baggag, Halima Bensmail, Jiangning Song

Briefings Bioinform. 21(5) 1676 - 1696 2020年9月査読有り
Network control principles for identifying personalized driver genes in cancer.

Weifeng Guo, Shaowu Zhang 0001, Tao Zeng, Tatsuya Akutsu, Luonan Chen

Briefings Bioinform. 21(5) 1641 - 1662 2020年9月査読有り
Comparison of pseudoknotted RNA secondary structures by topological centroid identification and tree edit distance

Wang F, Akutsu T, Mori T

Journal of Computational Biology 27 1 - 9 2020年9月査読有り
A comprehensive review and performance evaluation of bioinformatics tools for HLA class I peptide-binding prediction.

Shutao Mei, Fuyi Li, André Leier, Tatiana T. Marquez-Lago, Kailin Giam, Nathan P. Croft, Tatsuya Akutsu, Alexander Ian Smith, Jian Li, Jamie Rossjohn, Anthony W. Purcell, Jiangning Song

Briefings Bioinform. 21(4) 1119 - 1135 2020年7月査読有り

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MISC

シングルセルデータを用いた共発現遺伝子ネットワークと排他的発現遺伝子の推定手法

仲嶋なつ, 阿久津達也, 中戸隆一郎

細胞 52(13) 758 - 760 2020年11月招待有り
Analysis of Boolean Networks and Boolean Models of Metabolic Networks

Tatsuya Akutsu

Application of Omics, AI and Blockchain in Bioinformatics Research (Book Chapter) 2019年11月招待有り
On the minimum number of genes required for discriminating steady states under a Boolean model

Cheng Xiaoqing, Tamura Takeyuki, Ching Wai-Ki, Akutsu Tatsuya

情報処理学会第51回バイオ情報学研究会 2017年9月
A short review of methods for Caspase cleavage site prediction.

情報処理学会第51回バイオ情報学研究会 2017年9月
最小支配集合に基づく有向生体ネットワーク解析のための高速アルゴリズム

石塚雅之, 阿久津達也, ナチェルホセ

情報処理学会バイオ情報学研究会 2017年6月

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書籍等出版物

バイオインフォマティクス : Pythonによる実践レシピ

阿久津, 達也, 竹本, 和広(共訳)

朝倉書店 2020年8月 (ISBN: 9784254122541)
Algorithms for Analysis, Inference, and Control of Boolean Networks

阿久津達也

World Scientific 2018年4月
Sequence alignment algorithms: Applications to glycans and trees and tree-like structures

Akutsu T

Handbook of Chemoinformatics Algorithms , , 363-381 2010年
バイオインフォマティクスー配列データ解析と構造予測ー

阿久津達也

朝倉書店 2007年5月
バイオインフォマティクスの数理とアルゴリズム

丸山修, 阿久津達也(担当:共著)

共立出版 2007年2月

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講演・口頭発表等

A Novel Method for the Inverse QSAR/QSPR based on Artificial Neural Networks and Mixed Integer Linear Programming with Guaranteed Admissibility

Naveed Ahmed AzamRachaya Chiewvanichakorn, Fan Zhang, Aleksandar Shurbevski, Hiroshi Nagamochi, Tatsuya Akutsu

13th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies (BIOSTEC 2020) 2020年2月24日
Breast cancer subtype by imbalanced omics data through a deep learning fusion model

J. Zeng, H. Cai, T. Akutsu

10th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics (ICBBB 2020) 2020年1月21日
Procleave: A Bioinformatic Approach for Protease-specific Substrate Cleavage Site Prediction by Combining Sequence and Structural Information

Fuyi Li, Tatsuya Akutsu, Jian Li, Jiangning Song

10h International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics (ICBBB2020) 2020年1月21日
A method for the inverse QSAR/QSPR based on artificial neural networks and mixed integer linear programming

R. ChiewvanichakornC. Wang, Z. Zhang, A. Shurbevski, H. Nagamochi, T. Akutsu

10th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics (ICBBB 2020) 2020年1月20日
Boolean Network-Based Approaches towards Precisions Medicine

阿久津達也

Workshop on Precision Network Medicine in the era of big data! (ICSB 2019) 2019年10月31日招待有り

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阿久津達也

基本情報

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学歴

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

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