林重彦 (Shigehiko Hayashi) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学

J-GLOBAL ID: 201401057406804941
researchmap会員ID: 7000008405

論文

Converting a Light-Driven Proton Pump into a Light-Gated Proton Channel

Keiichi Inoue, Takashi Tsukamoto, Kazumi Shimono, Yuto Suzuki, Seiji Miyauchi, Shigehiko Hayashi, Hideki Kandori, Yuki Sudo

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 137(9) 3291-3299 2015年3月査読有り
新しい酵素を理論的にデザインすることはできるのか－存在の耐えられない複雑さ－

林重彦

現代化学 (2 月号) 25-27 2015年招待有り
Key Chemical Factors of Arginine Finger Catalysis of F-1-ATPase Clarified by an Unnatural Amino Acid Mutation

Ayako Yukawa, Ryota Iino, Rikiya Watanabe, Shigehiko Hayashi, Hiroyuki Noji

BIOCHEMISTRY 54(2) 472-480 2015年1月査読有り
Theoretical Study on Excited States of Bacteriochlorophyll a in Solutions with Density Functional Assessment

Masahiro Higashi, Takahiro Kosugi, Shigehiko Hayashi, Shinji Saito

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 118(37) 10906-10918 2014年9月査読有り
Silencing Neurons with Light

Shigehiko Hayashi

SCIENCE 344(6182) 369-370 2014年4月招待有り
Facile Catch and Release of Fullerenes Using a Photoresponsive Molecular Tube

Norifumi Kishi, Munetaka Akita, Motoshi Kamiya, Shigehiko Hayashi, Hsiu-Fu Hsu, Michito Yoshizawa

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 135(35) 12976-12979 2013年9月査読有り
A Blue-shifted Light-driven Proton Pump for Neural Silencing

Yuki Sudo, Ayako Okazaki, Hikaru Ono, Jin Yagasaki, Seiya Sugo, Motoshi Kamiya, Louisa Reissig, Keiichi Inoue, Kunio Ihara, Hideki Kandori …

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 288(28) 20624-20632 2013年7月査読有り
Adenosine Triphosphate Hydrolysis Mechanism in Kinesin Studied by Combined Quantum-Mechanical/Molecular-Mechanical Metadynamics Simulations

Matthew J. McGrath, I. -F. Will Kuo, Shigehiko Hayashi, Shoji Takada

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 135(24) 8908-8919 2013年6月査読有り
The Reaction Mechanism of Claisen Rearrangement Obtained by Transition State Spectroscopy and Single Direct-Dynamics Trajectory

Izumi Iwakura, Yu Kaneko, Shigehiko Hayashi, Atsushi Yabushita, Takayoshi Kobayashi

MOLECULES 18(2) 1995-2004 2013年2月査読有り
Structural and spectral characterizations of C1C2 channelrhodopsin and its mutants by molecular simulations

Motoshi Kamiya, Hideaki E. Kato, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki, Shigehiko Hayashi

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 556 266-271 2013年1月査読有り
Molecular Mechanism of ATP Hydrolysis in F-1-ATPase Revealed by Molecular Simulations and Single-Molecule Observations

Shigehiko Hayashi, Hiroshi Ueno, Abdul Rajjak Shaikh, Myco Umemura, Motoshi Kamiya, Yuko Ito, Mitsunori Ikeguchi, Yoshihito Komoriya, Ryota Iino, Hiroyuki Noji

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 134(20) 8447-8454 2012年5月査読有り
Crucial Role of Protein Flexibility in Formation of a Stable Reaction Transition State in an alpha-Amylase Catalysis

Takahiro Kosugi, Shigehiko Hayashi

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 134(16) 7045-7055 2012年4月査読有り
Crystal structure of the channelrhodopsin light-gated cation channel

Hideaki E. Kato, Feng Zhang, Ofer Yizhar, Charu Ramakrishnan, Tomohiro Nishizawa, Kunio Hirata, Jumpei Ito, Yusuke Aita, Tomoya Tsukazaki, Shigehiko Hayashi …

NATURE 482(7385) 369-U115 2012年2月査読有り
QM/MM Reweighting Free Energy SCF for Geometry Optimization on Extensive Free Energy Surface of Enzymatic Reaction

Takahiro Kosugi, Shigehiko Hayashi

JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION 8(1) 322-334 2012年1月査読有り
A theoretical study on excited state double proton transfer reaction of a 7-azaindole dimer: an ab initio potential energy surface and its empirical valence bond model

Kohei Ando, Shigehiko Hayashi, Shigeki Kato

PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS 13(23) 11118-11127 2011年査読有り
Local entropy difference upon a substrate binding of a psychrophilic alpha-amylase and a mesophilic homologue

Takahiro Kosugi, Shigehiko Hayashi

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 501(4-6) 517-522 2011年1月査読有り
Protein Collective Motions Coupled to Ligand Migration in Myoglobin

Yasutaka Nishihara, Shigeki Kato, Shigehiko Hayashi

BIOPHYSICAL JOURNAL 98(8) 1649-1657 2010年4月査読有り
Electronic Coulombic Coupling of Excitation-Energy Transfer in Xanthorhodopsin

Kazuhiro J. Fujimoto, Shigehiko Hayashi

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 131(40) 14152-+ 2009年10月査読有り
Proton-Transfer Reactions in Reaction Center of Photosynthetic Bacteria Rhodobacter sphaeroides

Yu Kaneko, Shigehiko Hayashi, Iwao Ohmine

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 113(26) 8993-9003 2009年7月査読有り
Photochemical Reaction Dynamics of the Primary Event of Vision Studied by Means of a Hybrid Molecular Simulation

Shigehiko Hayashi, Emad Taikhorshid, Klaus Schulten

BIOPHYSICAL JOURNAL 96(2) 403-416 2009年1月査読有り

もっとみる

書籍等出版物

Quantum Effects in Biology

Shigehiko Hayashi (担当:分担執筆, 範囲:Chapt. 11 Quantum Biology of Retinal)

Cambridge University Press 2014年
化学フロンティア 23 1 分子ナノバイオ計測－分子から生命システムを探る革新的技術

林重彦 (担当:分担執筆, 範囲:第 6 章ハイブリッド分子シミュレーションと実験研究の接点で見える生体分子機能のメカニズム)

化学同人 2014年
DOJIN BIOSCIENCE 10 揺らぎ・ダイナミクスと生体機能－物理化学的視点からみた生体分子

林重彦 (担当:分担執筆, 範囲:第 7.3 章生体分子系の量子化学)

化学同人 2013年
岩波講座計算科学第 4 巻計算と生命

林重彦 (担当:分担執筆, 範囲:第 3.3 章タンパク質の生物学的機能と化学反応)

岩波書店 2012年
CSJ カレントレヴュー・巨大分子系の計算化学

林重彦 (担当:分担執筆, 範囲:第 17 章酵素反応と生体分子機能の分子シミュレーション)

化学同人 2012年
タンパク質科学‐構造・物性・機能‐

林重彦 (担当:分担執筆, 範囲:第5.3章機能発現とダイナミクスのシミュレーション)

化学同人 2005年

講演・口頭発表等

Crucial Role of Protein Flexibility in Enzymatic Catalysis

Shigehiko Hayashi

4th Indo-German Meeting on Modeling of Chemical and Biological Reactivity (MCBR4) 2015年2月25日招待有り
柔らかいタンパク質の分子機能の理解と設計

林重彦

理研シンポジウム「生体分子系量子化学計算の最前線」 2015年1月23日招待有り
柔らかいタンパク質の分子機能の理解と設計

林重彦

CBI 学会 2014 年大会 2014年10月30日招待有り
Understanding and Designing Color Variants of Retinal Biding Proteins by Molecular Simulations

Shigehiko Hayashi

16th International Conference on Retinal Proteins 2014年10月5日招待有り
柔らかいタンパク質の分子機能の理解と設計

林重彦

第 14 回蛋白質科学会年会公募型シンポジウム 2014年6月27日招待有り
Catalytic mechanism of NTPases

Shigehiko Hayashi

Tokyo ATPase Workshop 2014年6月2日招待有り
Crucial Role of Protein Flexibility in Enzymatic Catalysis

Shigehiko Hayashi

Les Houches-TSRC Workshop on Protein Dynamics 2014年5月20日招待有り
酵素機能における分子の柔らかさの役割

林重彦

日本化学会第 94 春季年会中長期テーマシンポジウム「複雑系のための分子科学－理論研究によるアプローチ」 2014年3月27日招待有り
柔らかいタンパク質の分子機能の理解と設計

林重彦

自然科学研究機構計算科学研究センタースーパーコンピュータワークショップ 2014「計算化学の最新の成果と展開」 2014年1月21日招待有り
Crucial Role of Protein Flexibility in Enzymatic Catalysis

Shigehiko Hayashi

CRC-EC Joint Symposium on Chemical Theory on Complex System 2014年1月9日招待有り
Crucial Role of Protein Flexibility in Enzymatic Catalysis

Shigehiko Hayashi

3rd International Conference on Molecular Simulations 2013年11月20日招待有り
Crucial Role of Protein Flexibility in Enzymatic Catalysis

Shigehiko Hayashi

Telluride Science Research Center Workshop on “Protein Dynamics” 2013年8月8日招待有り
ハイブリッド分子シミュレーションでみる酵素の活性と柔らかさ

林重彦

第 13 回蛋白質科学会ワークショップ「計算科学と計測科学の協働により明らかになる蛋白質構造ダイナミクスの現状と将来」 2013年6月14日招待有り
光受容タンパク質の光吸収・蛍光スペクトルの理論的理解と合理的制御

林重彦

蛋白研セミナー「光の、光による、光のための蛋白質科学」 2013年4月20日招待有り
分子シミュレーションから見た酵素の活性と柔らかさ

林重彦

日本化学会第 93 春季年会中長期テーマシンポジウム「複雑系のための分子科学－複雑さと柔らかさ」 2013年3月22日招待有り
Hybrid molecular simulations toward understanding enzymatic catalysis

Shigehiko Hayashi

Fifth Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences: Experiments and Simulations 2013年2月26日招待有り
ハイブリッド分子シミュレーションで探る酵素活性の分子機構

林重彦

WIAS Top Runners’ Lecture Collection of Science「物質化学におけるコンピュータ利用の最前線」 2012年11月20日招待有り
Hybrid molecular simulations toward understanding enzymatic catalysis

Shigehiko Hayashi

Fifth International Symposium on Atomically Controlled Fabrication Technology 2012年10月24日招待有り
「理論解析」の観点から

林重彦

第4回光操作研究会「動作原理の理解と行動制御への応用」 2012年9月27日招待有り
Hybrid molecular simulations toward understanding enzymatic catalysis

Shigehiko Hayashi

14th International Congress of Quantum Chemistry 2012年6月30日招待有り

もっとみる