共同研究・競争的資金等の研究課題

2015年4月 - 2017年3月

MD-NSE法による新規タンパク質ダイナミクス解析法の開発

日本学術振興会  科学研究費助成事業 若手研究(B)  若手研究(B)

課題番号
15K18515
体系的課題番号
JP15K18515
配分額
(総額)
4,290,000円
(直接経費)
3,300,000円
(間接経費)
990,000円

蛋白質のドメイン運動は蛋白質が有する固有の機能に深く関与していると知られていたが、精度良くその運動を探知し更に解析する手法が確立していなかった。そこで、申請者は中性子スピンエコー法 (NSE) とMDシミュレーションを組み合わせたMD-NSE法により蛋白質のドメイン運動の記述を試みた。NSE測定から得られた拡散定数のQ依存性 (D(Q))をMD シミュレーションのtrajectoryから計算されたD(Q)と比較すると回転拡散のみならず、ドメイン運動に由来する運動の組み合わせで記述できた。更に、ドメイン運動を詳細に解析すると主にドメインの開閉に対応した運動であることが分かった。

リンク情報
Kaken Url
https://kaken.nii.ac.jp/file/KAKENHI-PROJECT-15K18515/15K18515seika.pdf
KAKEN
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15K18515
ID情報
  • 課題番号 : 15K18515
  • 体系的課題番号 : JP15K18515