竹田一旗 (Kazuki Takeda) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学准教授 (博士（理学）)

researchmap会員ID: 7000008406

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /

主要な論文

Structural characterization of green fluorescent protein in the I-state.

Ryota Takeda, Erika Tsutsumi, Kei Okatsu, Shuya Fukai, Kazuki Takeda

Scientific reports 14(1) 22832-22832 2024年10月1日査読有り責任著者
Structure of a putative immature form of a Rieske-type iron-sulfur protein in complex with zinc chloride.

Erika Tsutsumi, Satomi Niwa, Ryota Takeda, Natsuki Sakamoto, Kei Okatsu, Shuya Fukai, Hideo Ago, Satoshi Nagao, Hiroshi Sekiguchi, Kazuki Takeda

Communications Chemistry 6(1) 190 2023年9月9日査読有り責任著者
Detailed analysis of distorted retinal and its interaction with surrounding residues in the K intermediate of bacteriorhodopsin

Shoun Taguchi, Satomi Niwa, Hoang-Anh Dao, Yoshihiro Tanaka, Ryota Takeda, Shuya Fukai, Kazuya Hasegawa, Kazuki Takeda

Communications Biology 6(1) 190 2023年2月17日査読有り責任著者
X-ray crystal structure of a cyclic-PIP–DNA complex in the reverse-binding orientation

Abe, Katsuhiko, Hirose, Yuki, Eki, Haruhiko, Takeda, Kazuki, Bando, Toshikazu, Endo, Masayuki, Sugiyama, Hiroshi

Journal of the American Chemical Society 142(23) 10544-10549 2020年6月10日査読有り責任著者
Subatomic resolution X-ray structures of green fluorescent protein

Kiyofumi Takaba, Yang Tai, Haruhiko Eki, Hoang-Anh Dao, Yuya Hanazono, Kazuya Hasegawa, Kunio Miki, Kazuki Takeda

IUCrJ 6(3) 387-400 2019年5月1日査読有り責任著者
X-ray structure analysis of bacteriorhodopsin at 1.3 Å resolution

Nagayuki Hasegawa, Hideyuki Jonotsuka, Kunio Miki, Kazuki Takeda

Scientific Reports 8 2018年9月3日査読有り責任著者
Charge-density analysis of an iron-sulfur protein at an ultra-high resolution of 0.48 Å

Hirano Y, Takeda K, Miki K

Nature 534(7606) 281-+ 2016年6月査読有り筆頭著者
Structure of the LH1-RC complex from Thermochromatium tepidum at 3.0 Å.

Niwa S, Yu LJ, Takeda K, Hirano Y, Kawakami T, Wang-Otomo ZY, Miki K

Nature 508(7495) 228-+ 2014年4月査読有り筆頭著者
Crystal structure of the M intermediate of bacteriorhodopsin: Allosteric structural changes mediated by sliding movement of a transmembrane helix

K Takeda, Y Matsui, N Kamiya, S Adachi, H Okumura, T Kouyama

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 341(4) 1023-1037 2004年8月査読有り筆頭著者
Crystal structures of bacterial lipoprotein localization factors, LolA and LolB

K Takeda, H Miyatake, N Yokota, S Matsuyama, H Tokuda, K Miki

EMBO JOURNAL 22(13) 3199-3209 2003年7月査読有り筆頭著者
A novel three-dimensional crystal of bacteriorhodopsin obtained by successive fusion of the vesicular assemblies

K Takeda, H Sato, T Hino, M Kono, K Fukuda, Sakurai, I, T Okada, T Kouyama

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 283(2) 463-474 1998年10月査読有り筆頭著者

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MISC

高分解能中性子結晶構造解析によるペプチド結合平面性の再検証

平野優, 平野優, 花園祐矢, 花園祐矢, 花園祐矢, 竹田一旗, 日下勝弘, 玉田太郎, 三木邦夫

日本中性子科学会年会講演概要集 22nd 2022年
高分解能中性子構造から明らかになったペプチド結合の非平面性

花園祐矢, 花園祐矢, 花園祐矢, 平野優, 平野優, 竹田一旗, 日下勝弘, 玉田太郎, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2022 2022年
磁場配向を用いたリゾチーム微結晶のX線結晶構造解析

小竹聡美, 花園祐矢, 竹田一旗, 木村史子, 木村恒久, 高橋弘紀, 渡辺和雄, 野尻浩之

東北大学金属材料研究所強磁場超伝導材料研究センター年次報告 2016 174‐175 2017年6月
緑色蛍光タンパク質の電荷密度解析

高場圭章, たい洋, 花園祐矢, 長谷川和也, 三木邦夫, 竹田一旗

日本結晶学会年会講演要旨集 2017 2017年
ジチオナイト還元型NADH-cytochrome b₅reductaseの高分解能結晶構造解析

高場圭章, 三木邦夫, 竹田一旗

SPring-8/SACLA利用研究成果集(Web) 5(1) 2017年
TOF‐Laue法中性子線回折データのスケーリング方法の開発

花園祐矢, 竹田一旗, 平野優, 玉田太郎, 日下勝弘, 三木邦夫

日本中性子科学会年会講演概要集 17th 75 2017年
タンパク質の高分解能中性子構造における水素原子の構造

平野優, 玉田太郎, 栗原和男, 日下勝弘, 大野拓, 竹田一旗, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2015 90 2015年10月17日
NADH‐シトクロムb₅還元酵素の超高分解能構造解析

高場圭章, 竹田一旗, 玉田太郎, 三木邦夫

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 15th 62 2015年5月26日
緑色蛍光タンパク質の低損傷高分解能構造解析

高場圭章, たい洋, 竹田一旗, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2015 2015年
X線自由電子レーザーを利用した球殻構造体の単粒子解析への取り組み

日比真仁, 竹田一旗, 富崎友理子, 花園祐矢, 高場圭章, 東浦彰史, 村上満里奈, 岩崎憲治, 山下栄樹, 中川敦史 …

日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム予稿集 27th 98 2014年1月11日
緑色蛍光タンパク質における放射線損傷追跡

高場圭章, 竹田一旗, 三木邦夫

物構研サイエンスフェスタ要旨集 2013 2014年
NADH‐シトクロムb₅還元酵素の中性子構造解析

平野優, 山田貢, 栗原和男, 正山祥生, 黒木良太, 日下勝弘, 木村成伸, 竹田一旗, 三木邦夫, 玉田太郎

日本結晶学会年会講演要旨集 2014 112 2014年
高電位鉄硫黄タンパク質の高分解能中性子回折データ収集条件の検討

平野優, 竹田一旗, 栗原和男, 玉田太郎, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2013 43 2013年10月12日
X線自由電子レーザーを用いた球状生体超分子複合体の単粒子構造解析への取り組み

東浦彰史, 村上満理奈, 岩崎憲治, 山下栄樹, 竹田一旗, 花園祐矢, 高場圭章, 日比真仁, 富崎友理子, 三木邦夫 …

日本結晶学会年会講演要旨集 2013 93 2013年10月12日
シトクロムb₅還元酵素の超高分解能構造解析におけるX線損傷の抑制

小杉正幸, 竹田一旗, 大野拓, 高場圭章, 玉田太郎, 黒木良太, 三木邦夫

物構研サイエンスフェスタ要旨集 1st 54 2013年
NADHシトクロムb₅還元酵素超高分解能結晶構造解析による水素と外殻電子の観察

高場圭章, 竹田一旗, 小杉正幸, 玉田太郎, 黒木良太, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2012 66 2012年10月25日
シトクロムb₅還元酵素反応中間体のX線結晶構造解析

山田貢, 玉田太郎, 松本富美子, 竹田一旗, 木村成伸, 黒木良太, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2012 30 2012年10月25日
シトクロムb₅還元酵素反応中間体のX線結晶構造解析

山田貢, 玉田太郎, 松本富美子, 竹田一旗, 木村成伸, 黒木良太, 三木邦夫

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 12th 114 2012年5月31日
Crystal structure and nucleotide bound states of V1-ATPase.

N. Numoto, T. Kuranaga, Y. Nagamatsu, Y. Hasegawa, A. Kita, K. Takeda, K. Miki

XXII Congress of the International Union of Crystallography 2011年8月
Crystal structure and rotation mechanism of V1-ATPase

Nobutaka Numoto, Yu Hasegawa, Kazuki Takeda, Kunio Miki

The 10th Conference of the Asian Crystallographic Association 2010年

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講演・口頭発表等

106

タンパク質微結晶の凍結三次元磁場配向体の構造解析への可能性

白浜あやの, 花園祐矢, 竹田一旗, 木村史子, 木村恒久, 高橋弘紀, 吉村政人

応用物理学会春季学術講演会講演予稿集(CD-ROM) 2018年3月5日
緑色蛍光タンパク質の電荷密度解析

高場圭章, たい洋, 花園祐矢, 長谷川和也, 三木邦夫, 竹田一旗

日本結晶学会年会講演要旨集 2017年11月23日
バクテリオロドプシンの高分解能X線結晶構造解析

竹田一旗, 長谷川修之, 城塚秀之, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2017年11月23日
新生タンパク質のフォールディングにおける近距離相互作用の影響

花園祐矢, 竹田一旗, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2017年11月23日
生体高分子微結晶の配向度における磁場強度依存の検討

小竹聡美, 花園裕也, 竹田一旗, 木村史子, 木村恒久, 高橋弘紀, 吉村政人

日本磁気科学会年会プログラム・要旨集 2017年11月14日
緑色蛍光タンパク質の発色団における構造多型の高分解能解析

浴晴彦, 高場圭章, タイヨウ, 花園祐矢, 竹田一旗, 三木邦夫

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 2017年5月22日
完全重水素化GFPのX線結晶構造解析及び中性子線データ測定

TAI Y, 花園祐矢, 高場圭章, 三木邦夫, 竹田一旗

日本中性子科学会年会講演概要集 2017年
TOF‐Laue法中性子線回折データのスケーリング方法の開発

花園祐矢, 竹田一旗, 平野優, 玉田太郎, 日下勝弘, 三木邦夫

日本中性子科学会年会講演概要集 2017年
凝集タンパク質を元に戻す分子シャペロンHsp104の構造解析

篠原恭介, 井上耀介, 花園祐矢, 野井健太郎, 川本晃大, 竹田一旗, 岩政菜津紀, 野口恵一, 難波啓一, 小椋光, 三木邦夫, 養王田正文

臨床ストレス応答学会大会抄録集 2017年
好熱性真菌由来の脱凝集因子Hsp104の機能構造解析

篠原恭介, 井上耀介, 花園祐矢, 野井健太郎, 川本晃大, 竹田一旗, 岩政菜津紀, 野口惠一, 難波啓一, 小椋光, 三木邦夫, 養王田正文

日本生化学会大会(Web) 2017年
超高分解能でタンパク質を見てみよう

竹田一旗

日本生化学会大会(Web) 2017年
緑色蛍光タンパク質のB型発色団の高分解能X線構造解析

たい洋, 高場圭章, 花園祐矢, 竹田一旗, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2016年11月17日
ヘムA合成酵素のX線結晶構造解析

丹羽智美, 小野真嗣, 小杉正幸, 茂木立志, 北潔, 竹田一旗, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2016年11月17日
酸化型高電位鉄硫黄タンパク質の超高分解能構造解析

辻中智考, 大野拓, 竹田一旗, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2016年11月17日
完全重水素化高電位鉄硫黄タンパク質の中性子線解析

花園祐矢, 竹田一旗, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2016年11月17日
X線結晶解析法による新生タンパク質のフォールディング機構の解明

花園祐矢, 竹田一旗, 三木邦夫

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 2016年5月19日
βシートタンパク質のco‐translational folding中間体はヘリックス構造を持つ

花園祐矢, 竹田一旗, 三木邦夫

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 2016年5月19日
放射光によるタンパク質の超高分解能構造解析と中性子線回折との連携

竹田一旗

日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム予稿集 2016年1月9日
緑色蛍光タンパク質の低損傷高分解能構造解析

高場圭章, たい洋, 竹田一旗, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2015年10月17日
完全重水素化高電位鉄硫黄タンパク質のX線結晶構造解析

花園祐矢, 竹田一旗, 三木邦夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2015年10月17日

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共同研究・競争的資金等の研究課題

電位依存性チャネルの膜電位負荷構造：膜電位負荷合成膜と単粒子構造解析法の開拓

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(開拓) 2024年6月 - 2027年3月

老木成稔, 鈴木宏明, 竹田一旗, 岩本真幸, 米倉功治
タンパク質による水分子の配位状態制御

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2020年4月 - 2022年3月

竹田一旗
緑色蛍光タンパク質の超精密構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

竹田一旗
超高精度結晶構造解析によるプロトン輸送タンパク質の全水素原子位置決定

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2013年4月 - 2016年3月

竹田一旗
金属含有タンパク質における原子別酸化還元状態決定法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2011年 - 2012年

竹田一旗
大腸菌エンベロープ形成機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2007年 - 2011年

徳田元, 松山伸一, 西山賢一, 成田新一郎, 垰和之, 竹田一旗
結晶中における生体高分子ダイナミクスの精密計測

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2008年 - 2010年

竹田一旗
NADH-キノン酸化還元酵素(呼吸鎖複合体I)の構造プロテオミクス

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2004年 - 2005年

竹田一旗
高エネルギーX線によるXe,Csを用いた多波長異常分散(MAD)法

日本学術振興会科学研究費助成事業萌芽研究 2002年 - 2002年

三木邦夫, 竹田一旗, 宮武秀行, 喜田昭子

竹田一旗

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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