庄村康人 (YASUHITO SHOMURA) - マイポータル

基本情報

所属: 茨城大学理工学研究科（工学野）物質科学工学領域准教授
: (兼任)フロンティア応用原子科学研究センター兼務教員

学位: 博士（理学）(2003年3月京都大学)

研究者番号: 50423900
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-7542-0884
J-GLOBAL ID: 201501072893342601
researchmap会員ID: 7000011103

研究分野

経歴

2015年4月

茨城大学大学院理工学研究科, 准教授
2005年10月 - 2015年3月

兵庫県立大学大学院生命理学研究科, 助手/助教
2003年4月 - 2005年9月

マックスプランク生化学研究所, 博士研究員

学歴

委員歴

2016年1月

日本結晶学会平成28年度年会, 実行委員

論文

Structural basis for spectral red shift and UVA absorption in the microalgal water-soluble astaxanthin-binding protein AstaP-pink1.

Tamaki Mitsui, Yasuhito Shomura, Maiko Furubayashi, Ryuichi Kato, Shinichi Takaichi, Shinji Kawasaki

Journal of structural biology 218(1) 108288-108288 2026年3月査読有り責任著者
An ependymin-related blue carotenoprotein decorates marine blue sponge

Shinji Kawasaki, Takayuki Kaneko, Tomomi Asano, Takashi Maoka, Shinichi Takaichi, Yasuhito Shomura

Journal of Biological Chemistry 299(9) 105110-105123 2023年9月査読有り責任著者
NAD+-reducing [NiFe]-hydrogenase

Y. Shomura, Y. Higuchi

Encyclopedia of Inorganic and Bioinorganic Chemistry 2019年12月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Complete Genome Sequence of a Moderately Thermophilic Facultative Chemolithoautotrophic Hydrogen-Oxidizing Bacterium, Hydrogenophilus thermoluteolus TH-1

Arai H, Shomura Y, Higuchi Y, Ishii M

Microbiol. Resour. Announc. 7(6) e00857-18 2018年査読有り
Redox-dependent conformational changes of a proximal [4Fe-4S] cluster in Hyb-type [NiFe]-hydrogenase to protect the active site from O2

Noor N.D.M, Matsuura H, Nishikawa K, Tai H, Hirota S, Kim J, Kang J, Tateno M, Yoon K-S, Ogo S …

Chem. Commun. 54(87) 12385-12388 2018年査読有り
Rational Design of Domain-Swapping-Based c-Type Cytochrome Heterodimers by Using Chimeric Proteins

Mohan Zhang, Tsukasa Nakanishi, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Sachiko Yanagisawa, Yasuhito Shomura, Naoki Shibata, Takashi Ogura, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota

CHEMBIOCHEM 18(17) 1712-1715 2017年9月査読有り
Structural basis of the redox switches in the NAD+-reducing soluble [NiFe]-hydrogenase

Shomura Y., Taketa M., Nakashima H., Tai H., Nakagawa H., Ikeda Y., Ishii M., Igarashi Y., Nishihara H., Yoon K-S. …

Science 357(6354) 928-932 2017年査読有り筆頭著者責任著者
Construction of Zn-SO4 Cluster-encapsulating Protein Nanocage by Domain Swapping

Takaaki Miyamoto, Mai Kuribayashi, Satoshi Nagao, Yasuhito Shomura, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota

PROTEIN SCIENCE 25 64-65 2016年10月査読有り
Synthesis and Reactivity of a Water-soluble NiRu Monohydride Complex with a Tethered Pyridine Moiety

Takahiro Matsumoto, Koji Yoshimoto, Chunbai Zheng, Yasuhito Shomura, Yoshiki Higuchi, Hidetaka Nakai, Seiji Ogo

CHEMISTRY LETTERS 45(2) 197-199 2016年2月査読有り
Formation of Cytochrome cb562 Oligomers by Domain Swapping

Miyamoto Takaaki, Kuribayashi Mai, Nagao Satoshi, Shomura Yasuhito, Higuchi Yoshiki, Hirota Shun

PROTEIN SCIENCE 24 212-213 2015年10月査読有り
Refined Regio- and Stereoselective Hydroxylation of L-Pipecolic Acid by Protein Engineering of L-Proline cis-4-Hydroxylase Based on the X-ray Crystal Structure

Kento Koketsu, Yasuhito Shomura, Kei Moriwaki, Mikiro Hayashi, Satoshi Mitsuhashi, Ryotaro Hara, Kuniki Kino, Yoshiki Higuchi

ACS Synthetic Biology 4(4) 383-392 2015年4月査読有り
Rational Design of Heterodimeric Protein using Domain Swapping for Myoglobin

Lin Y.W., Nagao S., Zhang M., Shomura Y., Higuchi Y., Hirota S.

Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 54(2) 511-515 2015年査読有り
Crystallization and preliminary X-ray analysis of the NAD(+)-reducing [NiFe] hydrogenase from Hydrogenophilus thermoluteolus TH-1

Midori Taketa, Hanae Nakagawa, Mao Habukawa, Hisao Osuka, Kiyohito Kihira, Hirofumi Komori, Naoki Shibata, Masaharu Ishii, Yasuo Igarashi, Hirofumi Nishihara …

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS 71(Pt1) 96-99 2015年1月査読有り
Oligomerization enhancement and two domain swapping mode detection for thermostable cytochrome c(552) via the elongation of the major hinge loop

Chunguang Ren, Satoshi Nagao, Masaru Yamanaka, Hirofumi Komori, Yasuhito Shomura, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota

MOLECULAR BIOSYSTEMS 11(12) 3218-3221 2015年査読有り
Domain-swapped cytochrome cb(562) dimer and its nanocage encapsulating a Zn-SO4 cluster in the internal cavity

Takaaki Miyamoto, Mai Kuribayashi, Satoshi Nagao, Yasuhito Shomura, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota

CHEMICAL SCIENCE 6(12) 7336-7342 2015年査読有り
Structural and Ligand Binding Properties of Dimeric Horse Myoglobin

Satoshi Nagao, Hisao Osuka, Takuya Yamada, Takeshi Uni, Yasuhito Shomura, Kiyohiro Imai, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota

PROTEIN SCIENCE 23 266-267 2014年7月査読有り
Structural aspects of [NiFe]-hydrogenases

Shomura Yasuhito, Higuchi Yoshiki

REVIEWS IN INORGANIC CHEMISTRY 33(4) 173-192 2013年12月査読有り筆頭著者責任著者
Photosensitivity of the Ni-A state of [NiFe] hydrogenase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F with visible light.

Osuka H, Shomura Y, Komori H, Shibata N, Nagao S, Higuchi Y, Hirota S

Biochemical and biophysical research communications 430(1) 284-288 2013年1月査読有り
Crystal structure analysis of the translation factor RF3 (release factor 3).

Kihira K, Shimizu Y, Shomura Y, Shibata N, Kitamura M, Nakagawa A, Ueda T, Ochi K, Higuchi Y

FEBS letters 586(20) 3705-3709 2012年10月査読有り
Structural and oxygen binding properties of dimeric horse myoglobin.

Nagao S, Osuka H, Yamada T, Uni T, Shomura Y, Imai K, Higuchi Y, Hirota S, Dalton transactions, Cambridge, Engl

41(37) 11378-11385 2012年10月査読有り

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MISC

Crystal structures of the NAD+-reducing soluble [NiFe]-hydrogenase

庄村康人, 樋口芳樹

SPring-8 SACLA リサーチフロンティア 2017 2017 26-27 2018年8月査読有り招待有り
[NiFe]ヒドロゲナーゼがもつ鉄硫黄クラスターによる酸素防御機構

庄村康人,樋口芳樹

生物物理 58(6) 297-302 2018年査読有り招待有り筆頭著者責任著者
NAD+還元[NiFe]ヒドロゲナーゼのレドックススイッチ機構の構造基盤の解明

庄村康人, 樋口芳樹

ライフサイエンス新着レビュー 2017 2017年11月招待有り
Rational Design of Heterodimeric Protein using Domain Swapping for Myoglobin

Lin Ying-Wu, Nagao Satoshi, Zhang Mohan, Shomura Yasuhito, Higuchi Yoshiki, Hirota Shun

2014年11月4日
Preparation of single crystals of Multicopper oxidases for neutron diffraction study

Y. Higuchi, M. Akter, C. Inoue, Y. Shomura, N. Shibata, K. Inaka, K. Kataoka, T. Sakurai, K. Komori

JOURNAL OF BIOLOGICAL INORGANIC CHEMISTRY 19 S324-S324 2014年3月
膜結合型ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明

庄村康人, 樋口芳樹

生物物理 53(2) 82-85 2013年4月査読有り招待有り
Crystal structure of O2-tolerant [NiFe] hydrogenase reveals the mechanism of O2-tolerance attributable to a redox-dependent conformational change of [4Fe-3S] cluster

SHOMURA Yasuhito, HIGUCHI Yoshiki

SPring-8 リサーチフロンティア 2011 2012年7月査読有り招待有り
酸素耐性ヒドロゲナーゼの構造化学的研究－酵素分子に見出された活性保護機構－

樋口芳樹, 庄村康人

燃料電池 11(4) 43-48 2012年4月招待有り
ヒドロゲナーゼの新規酸素耐性機構 -膜結合型[NiFe]ヒドロゲナーゼ

庄村康人, 樋口芳樹

化学 67 70-71 2012年4月招待有り
4Fe-3S］クラスターによる［NiFe］ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の構造基盤

庄村康人, 樋口芳樹

SPring-8利用者情報誌 17(2) 105-110 2012年4月査読有り招待有り
新規の鉄-硫黄クラスターが生み出すヒドロゲナーゼの酸素耐性機構

庄村康人, 樋口芳樹

ライフサイエンス新着レビュー (2011) 2011年10月招待有り
Structural study of H2O2 reductase, rubperoxin

Koji Nishikawa, Yasuhito Shomura, Shinji Kawasaki, Yu Sakai, Youichi Niimura, Shinichi Terawaki, Hirofumi Komori, Naoki Shibata, Yoshiki Higuchi

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 64 C286-C287 2008年
I 代謝系に関わるタンパク質・酵素群のX線構造化学(生体物質構造学I)

庄村康人, 小森博文, 柴田直樹, 樋口芳樹

兵庫県立大学大学院物質理学研究科・生命理学研究科研究一覧 17 108-108 2006年10月10日
I 代謝系に関わるタンパク質・酵素群のX線構造化学(生体物質構造学I,生命理学研究科)

庄村康人, 小森博文, 柴田直樹, 樋口芳樹

兵庫県立大学大学院物質理学研究科・生命理学研究科研究一覧 18 112-112 2006年4月
An engineered chaperonin caging a guest protein: Structural insights and potential as a protein expression tool

Masahiro Furutani, Jun Ichi Hata, Yasuhito Shomura, Keisukeitami, Takao Yoshida, Yoshitaka Izumoto, Akiko Togi, Akira Ideno, Takuo Yasunaga, Kunio Miki …

Protein Science 14(2) 341-350 2005年2月
タンパク質高次構造形成にかかわる生物マシーナリ

庄村康人, 三木邦夫

日本結晶学会誌 45(1) 54-59 2003年

書籍等出版物

ADVANCES IN BIOORGAOMETALLIC CHEMISTRY,Chapter 18 "Structural Insights into the Protective Mechanisms against O2 in the [NiFe]-Hydrogenases"

(担当:共著)

ELSEVIER 2019年
Encyclopedia of Inorganic and Bioinorganic Chemistry,Standard Article "NAD+-reducing [NiFe]-Hydrogenase"

Wiely 2019年
ADVANCES IN BIOORGAOMETALLIC CHEMISTRY Chapter 18 "Structural Insights into the Protective Mechanisms against O2 in the [NiFe]-Hydrogenases"

(担当:共著)

ELSEVIER 2019年
Encyclopedia of Inorganic and Bioinorganic Chemistry Standard Article "NAD+-reducing [NiFe]-Hydrogenase"

Shomura Y, Higuchi Y

Wiely 2019年

講演・口頭発表等

部位特異的変異導入で改変した酸素寛容性可溶性[NiFe]-ヒドロゲナーゼによるNADPH の産生

佐藤帆夏, 長南茂, 西原宏史, 庄村康人

日本農芸化学会2026年度大会 2026年3月10日
水素酸化細菌由来可溶性ヒドロゲナーゼの構造化学的研究

鬼澤麻美, 長南茂, 西原宏史, 庄村康人

第36回日本化学会関東支部茨城地区研究交流会 2025年12月13日
X-ray crystal structure analysis of recombinant Mn-catalase to elucidate the reaction mechanism

10th International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University 2025年10月10日
ヒト由来コラーゲンプロリル4-水酸化酵素の構造生物学的研究

田村透也, 平井純輝, 沼田りこ, 宗田善久, 庄村康人

第23回日本蛋白質科学年会 2023年7月5日
Mn-カタラーゼにおける過酸化水素不均化反応機構の解明に向けて

庄村康人

2022年度iBIX-JAXA-KEK物構研-QST 合同タンパク質研究会 2023年2月27日招待有り
偏性嫌気性細菌由来Mn-カタラーゼ様タンパク質の構造解析

野村葵, 門倉佳輝, 庄村康人

第22回日本蛋白質科学年会 2022年6月7日
Ni 置換型ルブレドキシン変異体の構造機能相関の解明

遠藤啓貴, 横山優花, 松井眞美, 飯塚夏海, 庄村康人

第22回日本蛋白質科学年会 2022年6月7日
Ni置換型ルブレドキシン変異体のX線・中性子結晶子構造解析

遠藤啓貴, 庄村康人

2021年度量子ビームサイエンスフェスタ 2022年3月8日
X-ray crystal structure analysis of the Ni-substituted rubredoxin mutant

Keiki Endo, Yuka Yokoyama, Mami Matsui, Natsumi Iitsuka, Yasuhito Shomura

6th International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University 2022年2月22日
還元型Mn-カタラーゼのX線・中性子結晶構造解析

鈴井美羽,高木夕里圭,高野紗和,高橋果林,山田太郎,庄村康人

令和3年度日本結晶学会年会 2021年11月19日
Clostridium acetobutylicum由来Rubrerythrinの構造解析

伊藤拓未,川崎信治,庄村康人

2020年度量子ビームサイエンスフェスタ 2021年3月10日
高度好熱菌由来Mn-カタラーゼの結晶構造解析

高木夕里圭,高野紗和,高橋果林,山田太郎,庄村康人

2020年度量子ビームサイエンスフェスタ 2021年3月10日
Structure analyses of Rubrerythrin from Clostridium acetobutylicum

Takumi Itoh, Yasuhito Shomura

5th International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University 2020年11月19日
Ni結合型ルブレドキシンの物性・機能相関の解明

庄村康人

2020年度iBIX-JAXA-KEK 物構研-QST 合同タンパク質研究会 2020年11月9日招待有り
Improved hydrogen evolution activity of the Ni-substituted rubredoxin by site-directed mutagenesis

Yasuhito Shomura, Yuka Yokoyama

The 70th JSCC Conference 2020年9月28日錯体化学会招待有り
Mn-カタラーゼへの部位特異的変異導入とその酵素学的解析

高野紗和,高橋果林,山田太郎,庄村康人

第19回日本蛋白質科学年会 2019年6月24日
Ni置換型ルブレドキシンのX線・中性子結晶構造解析

横山優花,庄村康人

2018年度量子ビームサイエンスフェスタ 2019年3月12日
L-アミノ酸リガーゼを用いた生理活性ペプチドのin vivo合成系の確立

清野里々花,矢ヶ崎誠,庄村康人

日本農芸化学会関東支部2018年度大会 2018年10月3日
放線菌由来シトクロムP450の基質特異性の解明

樋澤芽依,纐纈健人,庄村康人

日本農芸化学会関東支部2018年度大会 2018年10月3日
[NiFe]ヒドロゲナーゼがもつ鉄硫黄クラスターの新規機能

庄村康人

第56回日本生物物理学会 2018年9月15日招待有り

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ニッケル置換型ルブレドキシンの水素合成反応機構の解明と高機能化

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2026年4月 - 2029年3月

庄村康人
過酷な生育環境を生き抜く微細藻類が持つユニークな光酸化ストレス防御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2026年3月

川崎信治
グループⅣ[NiFe]ヒドロゲナーゼの水素合成-プロトンポンピング共役機構の解明

科学研究費助成事業基盤研究（C） 2019年 - 2021年
ヒドロゲナーゼと光合成の融合によるエネルギー変換サイクルの創成

日本学術振興会【科学研究費助成事業】特別推進研究 2014年4月 - 2019年3月

小江誠司
真核生物細胞質における鉄硫黄クラスター合成マシーナリーの構造生物学

【科学研究費助成事業】基盤研究(C) 2013年4月 - 2016年3月
水素合成触媒としての応用を視野に入れたヒドロゲナーゼの構造・技術基盤の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年4月 - 2015年3月

庄村康人
新規Ni酵素による水素活性化機構の解明とその利用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2010年 - 2012年

樋口芳樹, 庄村康人
膜内在性[NiFe]ヒドロゲナーゼのX線結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2010年 - 2011年

庄村康人
水素代謝に関与する膜タンパク質複合体の構造化学的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2008年 - 2009年

庄村康人
タンパク質の高次構造形成に重要な分子システムの研究-Hsp110の分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2006年 - 2008年

庄村康人
鉄ニッケル型ヒドロゲナーゼの金属クラスター形成における構造生物学的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2006年 - 2007年

庄村康人

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