関山直孝 (Naotaka Sekiyama) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学理学研究科助教

学位: 博士

J-GLOBAL ID: 201501064299030885
researchmap会員ID: 7000011361

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

論文

Interaction modes of human orexin 2 receptor with selective and nonselective antagonists studied by NMR spectroscopy.

Kayo Imamura, Ken-Ichi Akagi, Yohei Miyanoiri, Hirokazu Tsujimoto, Takatsugu Hirokawa, Hideo Ashida, Kaori Murakami, Asuka Inoue, Ryoji Suno, Takahisa Ikegami …

Structure (London, England : 1993) 32(3) 352-361 2024年3月7日
Toward a high-resolution mechanism of intrinsically disordered protein self-assembly.

Naotaka Sekiyama, Ryoga Kobayashi, Takashi S Kodama

Journal of biochemistry 174(5) 391-398 2023年10月31日
ALS mutations in the TIA-1 prion-like domain trigger highly condensed pathogenic structures.

Naotaka Sekiyama, Kiyofumi Takaba, Saori Maki-Yonekura, Ken-Ichi Akagi, Yasuko Ohtani, Kayo Imamura, Tsuyoshi Terakawa, Keitaro Yamashita, Daigo Inaoka, Koji Yonekura …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(38) e2122523119 2022年9月20日
Conformational Space Sampled by Domain Reorientation of Linear Diubiquitin Reflected in Its Binding Mode for Target Proteins.

Xue-Ni Hou, Naotaka Sekiyama, Yasuko Ohtani, Feng Yang, Yohei Miyanoiri, Ken-Ichi Akagi, Xun-Cheng Su, Hidehito Tochio

Chemphyschem : a European journal of chemical physics and physical chemistry 22(14) 1505-1517 2021年7月16日
1H, 13C, and 15N backbone chemical shift assignments of 4E-BP144-87 and 4E-BP144-87 bound to eIF4E.

Naotaka Sekiyama, Andras Boeszoermenyi, Haribabu Arthanari, Gerhard Wagner, Mélissa Léger-Abraham

Biomolecular NMR assignments 11(2) 187-191 2017年10月
Molecular mechanism of the dual activity of 4EGI-1: Dissociating eIF4G from eIF4E but stabilizing the binding of unphosphorylated 4E-BP1.

Naotaka Sekiyama, Haribabu Arthanari, Evangelos Papadopoulos, Ricard A Rodriguez-Mias, Gerhard Wagner, Mélissa Léger-Abraham

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 112(30) E4036-45 2015年7月28日
Recognition of modification status on a histone H3 tail by linked histone reader modules of the epigenetic regulator UHRF1.

Kyohei Arita, Shin Isogai, Takashi Oda, Motoko Unoki, Kazuya Sugita, Naotaka Sekiyama, Keiko Kuwata, Ryuji Hamamoto, Hidehito Tochio, Mamoru Sato …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 109(32) 12950-5 2012年8月7日
NMR analysis of Lys63-linked polyubiquitin recognition by the tandem ubiquitin-interacting motifs of Rap80.

Naotaka Sekiyama, Jungoo Jee, Shin Isogai, Ken-Ichi Akagi, Tai-Huang Huang, Mariko Ariyoshi, Hidehito Tochio, Masahiro Shirakawa

Journal of biomolecular NMR 52(4) 339-50 2012年4月
Structural basis for regulation of poly-SUMO chain by a SUMO-like domain of Nip45.

Naotaka Sekiyama, Kyohei Arita, Yoshihiro Ikeda, Kohtaro Hashiguchi, Mariko Ariyoshi, Hidehito Tochio, Hisato Saitoh, Masahiro Shirakawa

Proteins 78(6) 1491-502 2010年5月1日
Structure of the small ubiquitin-like modifier (SUMO)-interacting motif of MBD1-containing chromatin-associated factor 1 bound to SUMO-3.

Naotaka Sekiyama, Takahisa Ikegami, Tsutomu Yamane, Mitsunori Ikeguchi, Yasuhiro Uchimura, Daichi Baba, Mariko Ariyoshi, Hidehito Tochio, Hisato Saitoh, Masahiro Shirakawa

The Journal of biological chemistry 283(51) 35966-75 2008年12月19日

MISC

TOPICS 生化学･分子生物学 TIA-1プリオン様ドメインのALS変異は高度に凝縮した病原体構造を誘起する

関山直孝

医学のあゆみ 285(13) 1138-1139 2023年6月24日
剪断力により誘起される相分離の機構解明—Elucidation of the Mechanism of Phase Separation Induced by Shear Force

菅瀬謙治, 関山直孝, 吉田紀生

豊田研究報告 = Reports of Toyota Physical and Chemical Research Institute (73) 202-205 2020年5月
翻訳開始因子eIF4Eの相互作用調節による翻訳制御機構

関山直孝

生物物理 56(3) 168-170 2016年
3P017 高圧を利用した還元型シトクロムcの折り畳み機構における水分子の寄与の解明(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど)

木村哲就, 関山直孝, 坂本光一, 森島績, 石森浩一郎

生物物理 44(supplement) S194 2004年

共同研究・競争的資金等の研究課題

動的溶液環境が制御する生体内自己凝縮過程の統合的理解

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(B) 2022年5月 - 2025年3月

関山直孝
生化学的手法を用いた天然変性タンパク質の自己凝縮過程を制御する動的溶液環境の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(B) 2022年5月 - 2025年3月

関山直孝
動的溶液科学の推進

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(B) 学術変革領域研究(B) 2022年5月 - 2025年3月

関山直孝, 菅瀬謙治, 吉田紀生, 中村秀樹, 山口毅
天然変性蛋白質による可逆的凝集機構の構造学的解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

関山直孝
ストレス顆粒を形成する天然変性蛋白質の自己組織化メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2017年4月 - 2019年3月

関山直孝
細胞増殖に関わるTOP mRNAの翻訳制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2015年8月 - 2017年3月

関山直孝