戸部隆太 (TOBE RYUTA) - マイポータル - researchmap

基本情報

所属: 東北大学大学院農学研究科准教授

学位: 農学博士(京都大学)

J-GLOBAL ID: 201501000205199361
researchmap会員ID: 7000013303

外部リンク: https://www.agri.tohoku.ac.jp/jp/researcher/tobe-ryuta/

研究キーワード

1

セレン、セレンタンパク質、微生物、哺乳類、酵素、代謝、癌

研究分野

3

経歴

6

2022年4月 - 現在

東北大学, 大学院農学研究科動物微生物学研究室, 准教授
2020年4月 - 2022年3月

ニプロ株式会社, 企画開発技術事業部酵素センター, 係長
2019年4月 - 2020年3月

立命館大学, 生命科学部生物工学科応用分子微生物学２研究室, 講師
2015年4月 - 2018年3月

立命館大学生命科学部生物工学科応用分子微生物学研究室、助教
2009年7月 - 2015年3月

米国国立衛生学研究所, 米国国立がん研究所, ポスドク研究員
2009年4月 - 2009年6月

京都大学化学研究所環境物質化学研究系分子微生物科学研究領、非常勤研究員

学歴

3

受賞

6

2018年7月

奨励賞, 日本微量元素学会
2018年6月

若手海外優秀発表賞, 日本ビタミン学会
2017年4月

若手奨励賞, 立命館大学生命科学部
2016年7月

優秀口頭発表賞, 日本微量元素学会
2013年12月

海外ポスドク招聘賞, 日本分子生物学会
2010年5月

Travel award, International Symposium on Selenium in Biology and Medicine

論文

35

Identification of Genes Associated with Resistance to Persulcatusin, a Tick Defensin from Ixodes persulcatus.

So Shimoda, Junya Ito, Tasuke Ando, Ryuta Tobe, Kiyotaka Nakagawa, Hiroshi Yoneyama

Microorganisms 12(2) 2024年2月19日
Identification of four genes responsible for antimicrobial resistance of MEL-B against S. aureus

Shinya Yamauchi, So Shimoda, Akio Kawahara, Tomohiro Sugahara, Shuhei Yamamoto, Masao Kitabayashi, Atsushi Sogabe, Christine A. Jansen, Ryuta Tobe, Ryota Hirakawa …

Biochemical and Biophysical Research Communications 149566-149566 2024年1月
l-Alanine Exporter AlaE Functions as One of the d-Alanine Exporters in Escherichia coli

Satoshi Katsube, Keiichiro Sakai, Tasuke Ando, Ryuta Tobe, Hiroshi Yoneyama

International Journal of Molecular Sciences 2023年6月16日査読有り
Characterization of Staphylococcus aureus Isolates from Bovine Mastitis and Bulk Tank Milk: First Isolation of Methicillin-Susceptible Staphylococcus aureus in Japan.

Ryota Miyazawa, So Shimoda, Keiichi Matsuda, Ryuta Tobe, Tasuke Ando, Hiroshi Yoneyama

Microorganisms 10(11) 2022年10月26日
Group II truncated haemoglobin YjbI prevents reactive oxygen species-induced protein aggregation in Bacillus subtilis.

Takeshi Imai, Ryuta Tobe, Koji Honda, Mai Tanaka, Jun Kawamoto, Hisaaki Mihara

eLife 11 2022年9月20日
Initial step of selenite reduction via thioredoxin for bacterial selenoprotein biosynthesis

Atsuki Shimizu, Ryuta Tobe, Riku Aono, Masao Inoue, Satoru Hagita, Kaito Kiriyama, Yosuke Toyotake, Takuya Ogawa, Tatsuo Kurihara, Kei Goto …

International Journal of Molecular Sciences 22(20) 2021年10月2日
Complete Genome Sequence of Pseudomonas stutzeri Strain F2a, Isolated from Seleniferous Soil.

Masao Inoue, Yuu Hirose, Ryuta Tobe, Shigeki Saito, Riku Aono, N Tejo Prakash, Hisaaki Mihara

Microbiology resource announcements 10(33) e0063121 2021年8月19日
Genetic analysis of tellurate reduction reveals the selenate/tellurate reductase genes ynfEF and the transcriptional regulation of moeA by NsrR in Escherichia coli.

Daiki Fujita, Ryuta Tobe, Hirotaka Tajima, Yukari Anma, Ryo Nishida, Hisaaki Mihara

Journal of biochemistry 169(4) 477-484 2021年4月29日
Characterization of a novel class of glyoxylate reductase belonging to the β-hydroxyacid dehydrogenase family in Acetobacter aceti

Jakkaphan Kumsab, Ryuta Tobe, Tatsuo Kurihara, Yuu Hirose, Taketo Omori, Hisaaki Mihara

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 84(11) 2303-2310 2020年11月1日
Complete Genome Sequence of an Acetic Acid Bacterium, Acetobacter aceti JCM20276.

Yuu Hirose, Jakkaphan Kumsab, Ryuta Tobe, Hisaaki Mihara

Microbiology resource announcements 9(42) 2020年10月15日
Selenite uptake by outer membrane porin ExtI and its involvement in the subcellular localization of rhodanese-like lipoprotein ExtH in Geobacter sulfurreducens

Jahan MI, Juengwiwattanakitti P, Izu Y, Tobe R, Imai T, Mihara H

Biochemical and Biophysical Research Communications 516(2) 474-479-479 2019年8月
Partial purification and characterization of glyoxylate dehydrogenase from Acetobacter aceti JCM20276

Jakkaphan K, Tobe R, Mihara H

Trace Nutrients Research in press 2019年
Comparative Biochemical Characterization of L-Asparaginases from Four Species of Lactic Acid Bacteria

Phetsri K, Furukawa M, Yamashiro R, Kawamura Y, Hayashi J, Tobe R, Toyotake Y, Wakayama M

Journal of Biotechnology and Biomedicine in press(03) 2019年
Characterization of a novel porin-like protein, ExtI, from geobacter sulfurreducens and its implication in the reduction of selenite and tellurite

Mst. Ishrat Jahan, Ryuta Tobe, Hisaaki Mihara

International Journal of Molecular Sciences 19(3) E809 2018年3月11日
Radioactive 75Se labeling and detection of selenoproteins

Sun Hee Yim, Ryuta Tobe, Anton A. Turanov, Bradley A. Carlson

Methods in Molecular Biology 1661 177-192 2018年
Delivery of selenium to selenophosphate synthetase for selenoprotein biosynthesis

Ryuta Tobe, Hisaaki Mihara

Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects 1862(11) 2433-2440-2440 2018年
Identification of selenomethionine, selenocysteine, and Se-methylselenocysteine in the selenium-enriched common ice plant

Tobe R, Koga H, Tani Y, Tajima H, Tsuji A, Mihara H

Biomed Res Trace Elements 28 135-142 2017年12月
Relationship between the glycosphingolipids and phospholipids synthesis and the mycelial growth in Neurospora crassa

Tobe R, Tani Y, Kataoka M, Yamashita Y, Mihara H

Trace Nutrients Research 33 13-20 2016年12月
Glutathione peroxidase 4 and vitamin E cooperatively prevent hepatocellular degeneration

Bradley A. Carlson, Ryuta Tobe, Elena Yefremova, Petra A. Tsuji, Victoria J. Hoffmann, Ulrich Schweizer, Vadim N. Gladyshev, Dolph L. Hatfield, Marcus Conrad

REDOX BIOLOGY 9(9) 22-31 2016年10月
Selenophosphate synthetase 1 is an essential protein with roles in regulation of redox homoeostasis in mammals

Ryuta Tobe, Bradley A. Carlson, Jang Hoe Huh, Nadia P. Castro, Xue-Ming Xu, Petra A. Tsuji, Sang-Goo Lee, Jeyoung Bang, Ji-Woon Na, Young-Yun Kong …

BIOCHEMICAL JOURNAL 473(14) 2141-2154 2016年7月

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MISC

4

必須微量元素セレンの生理作用と代謝セレンタンパク質の機能とセレン代謝

戸部隆太, 三原久明

化学と生物 57(6) 2019年
鉄硫黄クラスターおよびセレンタンパク質生合成とその分子機構

戸部隆太, 三原久明

硫酸と工業 70(2) 2017年
セレンも世界を救う

戸部隆太

生物工学会誌 94(7) 2016年
抗生物質が引き起こす哺乳動物細胞セレンタンパク質生合成異常「セレンって何?」から,「セレンってなんだか面白そう!」への変化に期待を込めて

戸部隆太

化学と生物 52(4) 2014年

書籍等出版物

7

Selenium in plants; Bacteria versus Selenium: A View from the Inside Out

Staicu LC, Oremland RS, Tobe R, Mihara H

Springer 2017年 (ISBN: 9783319562483)
Selenium; Selenocysteine tRNA[Ser]Sec: From Nonsense Suppressor tRNA to the Quintessential Constituent in Selenoprotein Biosynthesis

Carlson BA, Lee BJ, Tsuji PA, Tobe R, Park JM, Schweizer U, Gladyshev VN, Hatfield DL

Springer 2016年 (ISBN: 9781461410256)
Selenium; Mechanism, Structure, and Biological Role of Selenocysteine Lyase

Mihara H, Tobe R, Esaki N

Springer 2016年 (ISBN: 9781461410256)
Molecular, Genetic, and Nutritional Aspects of Major and Trace Minerals; Selenium and Cancer

Hatfield DL, Carlson BA, Tsuji PA, Tobe R, Gladyshev VN

Academic Press 2016年 (ISBN: 9780128021682)
Diversity of Selenium Functions in Health and Disease; Selenocysteine tRNA[Ser]Sec: The Central Component of Selenoprotein Biosynthesis

Carlson BA, Tobe R, Tsuji PA, Yoo MH, Feigenbaum L, Tessarollo L, Lee BJ, Schweizer U, Gladyshev VN, Hatfield DL

CRC Press 2015年 (ISBN: 9781482251265)
Selenium; Mouse models that target removal or over-expression of the selenocysteine tRNA[Ser]Sec gene to elucidate the role of selenoproteins in health and development

Carlson BA, Yoo MH, Xu XM, Tsuji P, Tobe R, Naranjo-Suarez S, Cheng F, Feigenbaum L, Tesserrollo L, Gladyshev VN, Hatfield DL

Springer 2011年 (ISBN: 9781461410256)
Selenium; Selenoproteins harboring a split personality in both preventing and promoting cancer

Yoo MH, Carlson BA, Tsuji PA, Tobe R, Naranjo-Suarez S, Lee BJ, Davis CD, Gladyshev VN, Hatfield DL

Springer 2011年 (ISBN: 9781461410256)

講演・口頭発表等

41

Geobacter sulfurreducens のマルチヘムセレンタンパク質型亜セレン酸還元酵素の機能・構造解析

第５回日本セレン研究会 2019年7月21日
細菌および動植物におけるセレンの代謝とセレンタンパク質の解析

日本微量元素学会 2019年7月7日
Bacillus sp. NTP-1 株の新奇 dimethyl sulfoxide reductase family 酵素の機能解析

日本微量栄養素学会 2019年6月22日
Bacillus属細菌におけるテルル酸還元酵素の解析

メタルバイオサイエンス研究会2018 2018年11月17日
Functional analysis of thioredoxin in selenium delivery in bacteria

The 7th International Selenium Conference (Se 2018) 2018年10月3日
Geobacter sulfurreducens の新規ポリン様タンパク質の機能解析

第91回日本生化学会 2018年9月24日
Reduction of toxic chalcogen oxyanions, selenite and tellurate, by Bacillus sp. NTP-1 isolated from a seleniferous soil

Extremophiles 2018 2018年9月19日
カルコゲンオキシアニオン還元菌 Bacillus sp. NTP-1 株におけるテルル酸還元酵素の解析

酵素補酵素研究会 2018年9月12日
細菌のセレンタンパク質生合成とそのセレン源供給メカニズムの解明

第4回日本セレン研究会 2018年7月21日
Geobacter sulfurreducens 由来の新規ポリン様タンパク質 ExtI の解析

第29回日本微量元素学会 2018年7月7日
Geobacter sulfurreducens 由来の新奇マルチヘム含有セレンタンパク質の解析

日本農芸化学会2018年度大会 2018年3月16日
細菌におけるテルル酸還元機構の解析

特殊環境微生物セミナー2017 2017年10月6日
Cellulomonas sp. D3a 株におけるカルコゲンオキシアニオン還元機構の解析

環境微生物系学会合同大会 2017年8月30日
Delivery of selenide to selenophosphate synthetase for selenoprotein biosynthesis in bacteria

The 11th International Symposium on Selenium in Biology and Medicine (Se 2017) 2017年8月14日
細菌におけるセレン化合物の代謝とセレンタンパク質生合成

日本微量元素学会 2017年7月29日
Geobacter sulfurreducens 由来の新規マルチヘム含有セレンタンパク質MHSEPの解析

酵素補酵素研究会 2017年6月23日
Pseudomonas putida の D-リジン異化代謝における制御機構の解析

日本ビタミン学会 2017年6月9日
微生物におけるセレンおよびテルルの代謝

第３回日本セレン研究会 2017年5月27日
Geobacter sulfurreducens が有するマルチヘム含有セレンタンパク質の精製と機能解析

日本農芸化学会 2017年3月18日
Selenium Delivery System for Selenophosphate Synthetase in Bacteria

The 6th International Selenium Conference (Se 2016) 2016年10月22日

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担当経験のある科目(授業)

7

所属学協会

3

2022年4月 - 現在

日本畜産学会
2015年4月 - 現在

日本微量元素学会
2009年4月 - 現在

日本農芸化学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

4

セレン耐性菌を用いたセレン代謝機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2019年4月 - 2020年3月

戸部隆太
高活性セレンタンパク質発現系の構築と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2018年6月 - 2020年3月

三原久明, 戸部隆太
セレンタンパク質生合成における活性型セレン特異的反応の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

三原久明, 戸部隆太
高濃度セレン耐性菌を利用したセレン代謝機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2016年4月 - 2018年3月

戸部隆太, 三原久明, 広瀬侑