深尾陽一朗 (FUKAO YOICHIRO) - マイポータル

基本情報

所属: 立命館大学生命科学部生命情報学科教授

学位: 博士（理学）(総合研究大学院大学)

J-GLOBAL ID: 201501018386192645
researchmap会員ID: 7000013348

外部リンク: https://fukaoyoichirolab.wixsite.com/rits

研究キーワード

植物、ミネラル、接ぎ木、オミクス

研究分野

経歴

2020年4月 - 現在

立命館大学, 生命科学部生命情報学科, 教授
2015年4月 - 2020年3月

立命館大学, 生命科学部生命情報学科, 准教授
2010年4月 - 2015年3月

奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科特任准教授
2007年4月 - 2010年3月

奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科特任助教
2006年1月 - 2007年3月

奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科特任助手
2003年4月 - 2005年12月

日本学術振興会特別研究員-PD
2000年4月 - 2003年3月

科学技術振興事業団（CREST）博士研究員
2000年4月 - 2003年3月

日本学術振興会特別研究員-DC1

学歴

- 2003年3月

総合研究大学院大学, 生命科学研究科, 分子生物機構論専攻
- 1998年3月

福井県立大学, 生物資源学部, 生物資源学科

委員歴

2018年4月 - 2020年3月

科学技術・学術政策研究所, NISTEP専門調査員

受賞

2014年9月

平成26年度日本植物学会特別賞（教育）, 日本植物学会

論文

113

Neofunctionalization of VAMP7 opened up a plant-unique vacuolar transport pathway.

Masaru Fujimoto, Yutaro Shimizu, Yoko Ito, Kazuo Ebine, Naoki Minamino, Takehiko Kanazawa, Yoichiro Fukao, Akihiko Nakano, Tomohiro Uemura, Takashi Ueda

Current biology : CB 2025年5月9日
Plant-specific tail-anchored coiled-coil protein MAG3 stabilizes Golgi-associated ERESs to facilitate protein exit from the ER

Junpei Takagi, Hideyuki Takahashi, Kenta C. Moriya, Minoru Nagano, Yoichiro Fukao, Haruko Ueda, Kentaro Tamura, Tomoo Shimada, Ikuko Hara-Nishimura

Communications Biology 8(1) 2025年3月4日
An NLR paralog Pit2 generated from tandem duplication of Pit1 fine-tunes Pit1 localization and function.

Yuying Li, Qiong Wang, Huimin Jia, Kazuya Ishikawa, Ken-Ichi Kosami, Takahiro Ueba, Atsumi Tsujimoto, Miki Yamanaka, Yasuyuki Yabumoto, Daisuke Miki …

Nature Communications 15(1) 4610-4610 2024年5月30日査読有り
ARGONAUTE1-binding Tudor domain proteins function in small interfering RNA production for RNA-directed DNA methylation.

Takahito Takei, Michio Tsukada, Kentaro Tamura, Ikuko Hara-Nishimura, Yoichiro Fukao, Yukio Kurihara, Minami Matsui, Hidetoshi Saze, Masayuki Tsuzuki, Yuichiro Watanabe …

Plant physiology 2024年3月6日
MHP1 and MHL generate odd-chain fatty acids from 2-hydroxy fatty acids in sphingolipids and are related to immunity in Arabidopsis thaliana

Marina Ushio, Toshiki Ishikawa, Takakazu Matsuura, Izumi C. Mori, Maki Kawai-Yamada, Yoichiro Fukao, Minoru Nagano

Plant Science 336 111840-111840 2023年11月
Zinc deficiency-induced defensin-like proteins are involved in the inhibition of root growth in Arabidopsis

Sachie Kimura, Aleksia Vaattovaara, Tomoya Ohshita, Kotomi Yokoyama, Kota Yoshida, Agnes Hui, Hidetaka Kaya, Ai Ozawa, Mami Kobayashi, Izumi C. Mori …

PLANT JOURNAL 2023年6月
Histone chaperone NUCLEOSOME ASSEMBLY PROTEIN 1 proteins affect plant growth under nitrogen deficient conditions in Arabidopsis thaliana

Linnan Jie, Miho Sanagi, Yongming Luo, Haruna Maeda, Yoichiro Fukao, Yukako Chiba, Shuichi Yanagisawa, Junji Yamaguchi, Junpei Takagi, Takeo Sato

PLANT BIOTECHNOLOGY 40(1) 93-98 2023年3月
Sphingolipids with 2-hydroxy fatty acids aid in plasma membrane nanodomain organization and oxidative burst

Tomomi Ukawa, Fumihiko Banno, Toshiki Ishikawa, Kota Kasahara, Yuuta Nishina, Rika Inoue, Keigo Tsujii, Masatoshi Yamaguchi, Takuya Takahashi, Yoichiro Fukao …

Plant Physiology 189(2) 839-857 2022年6月1日
The endoplasmic reticulum membrane-bending protein RETICULON facilitates chloroplast relocation movement in Marchantia polymorpha.

Kazuya Ishikawa, Ryota Konno, Satoyuki Hirano, Yuta Fujii, Masayuki Fujiwara, Yoichiro Fukao, Yutaka Kodama

The Plant journal : for cell and molecular biology 111(1) 205-216 2022年4月27日
The TGN/EE SNARE protein SYP61 and the ubiquitin ligase ATL31 cooperatively regulate plant responses to carbon/nitrogen conditions in Arabidopsis.

Yoko Hasegawa, Thais Huarancca Reyes, Tomohiro Uemura, Anirban Baral, Akari Fujimaki, Yongming Luo, Yoshie Morita, Yasushi Saeki, Shugo Maekawa, Shigetaka Yasuda …

The Plant cell 34(4) 1354-1374 2022年3月29日
HBD1 protein with a tandem repeat of two HMG-box domains is a DNA clip to organize chloroplast nucleoids in Chlamydomonas reinhardtii.

Mari Takusagawa, Yusuke Kobayashi, Yoichiro Fukao, Kumi Hidaka, Masayuki Endo, Hiroshi Sugiyama, Takashi Hamaji, Yoshinobu Kato, Isamu Miyakawa, Osami Misumi …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118(20) 2021年5月18日
Transport-coupled ubiquitination of the borate transporter BOR1 for its boron-dependent degradation

Akira Yoshinari, Takuya Hosokawa, Marcel Pascal Beier, Keishi Oshima, Yuka Ogino, Chiaki Hori, Taichi E Takasuka, Yoichiro Fukao, Toru Fujiwara, Junpei Takano

The Plant Cell 33(2) 420-438 2021年4月17日
FMT, a protein that affects mitochondrial distribution, interacts with translation-related proteins in Arabidopsis thaliana

Hiroki Ayabe, Narumi Kawai, Mitsuhiro Shibamura, Yoichiro Fukao, Masaru Fujimoto, Nobuhiro Tsutsumi, Shin-ichi Arimura

Plant Cell Reports 40(2) 327-337 2021年2月
Polar recruitment of RLD by LAZY1-like protein during gravity signaling in root branch angle control

Masahiko Furutani, Yoshinori Hirano, Takeshi Nishimura, Moritaka Nakamura, Masatoshi Taniguchi, Kanako Suzuki, Ryuichiro Oshida, Chiemi Kondo, Song Sun, Kagayaki Kato …

Nature Communications 11(1) 76-76 2020年12月査読有り
DNA methylation is reconfigured at the onset of reproduction in rice shoot apical meristem

Asuka Higo, Noriko Saihara, Fumihito Miura, Yoko Higashi, Megumi Yamada, Shojiro Tamaki, Tasuku Ito, Yoshiaki Tarutani, Tomoaki Sakamoto, Masayuki Fujiwara …

Nature Communications 11(1) 4079-4079 2020年12月査読有り
Cultivation of spinach in hot seasons using a micro-mist-based temperature-control system

Choyo Tai, Yuji Sawada, Junichi Masuda, Hiroyuki Daimon, Yoichiro Fukao

Scientia Horticulturae 273 109603-109603 2020年11月
Manganese Treatment Alleviates Zinc Deficiency Symptoms in Arabidopsis Seedlings

Sayuri Nakayama, Shigeo S Sugano, Haruna Hirokawa, Izumi C Mori, Hiroyuki Daimon, Sachie Kimura, Yoichiro Fukao

Plant and Cell Physiology 61(10) 1711-1723 2020年10月1日査読有り最終著者責任著者
Generation of Arabidopsis lines with a red fluorescent marker for endoplasmic reticulum using a tail-anchored protein cytochrome b5 -B

Minoru Nagano, Haruko Ueda, Yoichiro Fukao, Maki Kawai-Yamada, Ikuko Hara-Nishimura

Plant Signaling & Behavior 15(9) 1790196-1790196 2020年9月1日査読有り
Structural and functional relationships between plasmodesmata and plant endoplasmic reticulum–plasma membrane contact sites consisting of three synaptotagmins

Kazuya Ishikawa, Kentaro Tamura, Yoichiro Fukao, Tomoo Shimada

New Phytologist 226(3) 798-808 2020年5月査読有り
Identification of endogenous small peptides involved in rice immunity through transcriptomics‐ and proteomics‐based screening

Pingyu Wang, Shaolun Yao, Ken‐ichi Kosami, Ting Guo, Jing Li, Yuanyuan Zhang, Yoichiro Fukao, Takako Kaneko‐Kawano, Heng Zhang, Yi‐Min She …

Plant Biotechnology Journal 18(2) 415-428 2020年2月査読有り

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MISC

シロイヌナズナのカハールボディの機能解析

太田翔平, 櫻井貴之, 嶋田知生, 深尾陽一朗, 田村謙太郎

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 84th 2020年
小胞体-細胞膜接着部位の構成因子の同定と機能解析

石川一也, 田村謙太郎, 深尾陽一朗, 嶋田知生

日本植物生理学会年会(Web) 60th 2019年
MAG3は小胞体とゴルジ体の境界で効率的な物質輸送に寄与する

TAKAGI Junpei, TAKAHASHI Hideyuki, NAGANO Minoru, FUKAO Yoichiro, UEDA Haruko, TAMURA Kentaro, SHIMADA Tomoo, HARA-NISHIMURA Ikuko

日本植物生理学会年会(Web) 59th 2018年
イネ茎頂分裂組織のDNAメチル化パターンの動態と制御機構の解析

肥後あすか, 才原徳子, 三浦史仁, 東陽子, 山田恵美, 玉置祥二郎, 伊藤佑, 樽谷芳明, 坂本智昭, 藤原正幸 …

日本植物生理学会年会(Web) 59th 2018年
イネ幹細胞のDNAメチル化パターンの解析

肥後あすか, 才原徳子, 三浦史仁, 東陽子, 山田恵美, 玉置祥二郎, 坂本智昭, 藤原正幸, 倉田哲也, 深尾陽一朗 …

日本生化学会大会(Web) 90th 2017年
4-1-9 植物の炭素/窒素栄養バランス応答を制御する膜局在型ユビキチンリガーゼATL31の機能解析(4-1 植物の多量栄養素,2015年度京都大会)

佐藤長緒, HUARANCCA REYES Thais, 植村知博, 深尾陽一朗, 山口淳二

日本土壌肥料学会講演要旨集 (61) 50-50 2015年9月9日
葉緑体核様体コア因子の多様性と進化

小林優介, 田草川真理, 田草川真理, 原田尚実, 深尾陽一朗, 深尾陽一朗, 山岡尚平, 河内孝之, 堀孝一, 太田啓之 …

日本植物学会大会研究発表記録 79th 165 2015年9月1日
Novel grana-localized proteins, RIQ1 and RIQ2, contribute to efficient induction of NPQ in Arabidopsis

Ryo Yokoyama, Hiroshi Yamamoto, Kentaro Ifuku, Satomi Takeda, Yoichiro Fukao, Maki Kondo, Mikio Nishimura, Toshiharu Shikanai

第56回日本植物生理学会年会 2015年3月
化学架橋と質量分析を用いた高等植物光化学系IIにおける膜表在性タンパク質の結合様式の解析

伊福健太郎, 井戸邦夫, 深尾陽一朗, Jon Nield, 西村太志, 佐藤文彦

第56回日本植物生理学会年会 2015年3月
植物免疫における膜局在型ユビキチンリガーゼATL31のリン酸化とその機能解析

安田盛貴, 長谷川陽子, 門田康弘, 深尾陽一朗, 佐藤長緒, 山口淳二

日本植物生理学会年会要旨集 56th 2015年
植物の自然免疫に関わる膜局在型ユビキチンリガーゼの標的タンパク質の探索

安田盛貴, 長谷川陽子, 門田康弘, 深尾陽一朗, 佐藤長緒, 山口淳二

日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集 2015 (Web) 2015年
小胞体-ゴルジ体間のタンパク質輸送に関わるMAG3の機能解析

高木純平, 高橋英之, 長野稔, 藤原正幸, 深尾陽一朗, 上田晴子, 田村謙太郎, 嶋田知生, 西村いくこ

日本植物生理学会年会要旨集 56th 2015年
Localization of the Extrinsic Proteins in a Higher Plant Photosystem II Supercomplex

Kentaro Ifuku, Kunio Ido, Jon Nield, Yoichiro Fukao, Taishi Nishimura, Fumihiko Sato

The International Conference on Artificial Photosynthesis 2014年11月招待有り
高等植物の光化学系II膜表在性サブユニットの結合様式

西村太志, 宇野千尋, 井戸邦夫, 長尾遼, 深尾陽一郎, 野口巧, 佐藤文彦, 伊福健太郎

第55回日本植物生理学会年会，富山大学 2014年3月18日
シロイヌナズナAP‐2アダプター複合体のダイナミクス

山岡尚平, 下野裕貴, 白川一, 深尾陽一朗, 川瀬貴士, 初谷紀幸, 田村謙太郎, 嶋田知生, 西村いくこ

日本植物生理学会年会要旨集 55th 211 2014年3月11日
高等植物の光化学系 II における膜表在性タンパク質の配置と機能

西村太志, 宇野千尋, 井戸邦夫, 長尾遼, 深尾陽一朗, 野口巧, 佐藤文彦, 伊福健太郎

第4回フォーラム「人工光合成」，名古屋大学 2014年3月
植物の核膜がもつ新しい役割

田村謙太郎, 岩渕功誠, 深尾陽一朗, 近藤真紀, 岡本圭史, 上田晴子, 西村幹夫, 西村いくこ

日本植物生理学会年会要旨集 55th 2014年
KAKU4とLINC1は協調して核膜の支持に働く

後藤千恵子, 田村謙太郎, 深尾陽一朗, 嶋田知生, 西村いくこ

日本植物生理学会年会要旨集 55th 2014年
MAG5はCOPII構成因子と相互作用しCOPIIコートを安定化する

高木純平, RENNA Luciana, 高橋英之, 河本恭子, 田村謙太郎, STEFANO Giovanni, 深尾陽一朗, 近藤真紀, 西村幹夫, 嶋田知生 …

日本植物生理学会年会要旨集 55th 2014年
Peptide Separation Methodologies for In-Depth Proteomics in Arabidopsis

Fukao Yoichiro, Yoshida Masami, Kurata Rie, KOBAYASHI Mami, NAKANISHI Miyako, FUJIWARA Masayuki, NAKAJIMA Keiji, FERJANI Ali

Plant and cell physiology 54(5) 808-815 2013年5月1日

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書籍等出版物

Peptide separation methodologies for in-depth proteomics.

Zargar S.M, Kurata R, Rakwal R, Fukao Y

Estevez, Springer 2015年 (ISBN: 9781493919024)
Omics based approaches for improvement of common bean.

Zargar S.M, Bhattacharjee C, Rai R, Fukao Y, Agarwal G.K, Rakwal R

CRC Press 2014年 (ISBN: 9781466586680)
Peroxisome

Arai Y, Fukao Y, Hayashi M, Nishimura M

John Wiley & Sons, Inc. 2008年 (ISBN: 9780470069769)
プロテオーム解析から見たペルオキシソーム代謝

深尾陽一朗, 西村幹夫

共立出版 2003年 (ISBN: 432005623X)

講演・口頭発表等

Zinc responsive defensin-like family proteins may have a role in root elongation

The 23rd international conference on Plant growth substances (IPGSA) 2019年6月28日
夏季の高温ストレス下おけるホウレンソウの栽培法の確立

園芸学会平成31年度春期大会 2019年3月24日
プロテオーム解析による接ぎ木メカニズムの解明

園芸学会平成31年度春期大会 2019年3月24日
ANGUSTIFOLIAはアクチン繊維の配向調節を介してシロイヌナズナの葉の求心性核定位を制御する

第60回日本植物生理学会 2019年3月14日
小胞体-細胞膜接着部位の構成因子の同定と機能解析

第60回日本植物生理学会 2019年3月13日
核様体局在のHMGBタンパク質がDNA結合ドメインを2つもつ利点

第60回日本植物生理学会 2019年3月13日
CEP5とCEPR1はシロイヌナズナにおいて亜鉛恒常性維持に寄与する

第60回日本植物生理学会 2019年3月13日
亜鉛欠乏したシロイヌナズナの根においてdefensin-like family proteinが果たす機能の解明

第60回日本植物生理学会 2019年3月13日
ホウレンソウの芽生えを用いたアグロインフィルトレーション法によるゲノム編集系の確立

第60回日本植物生理学会 2019年3月13日
亜鉛欠乏した植物において機能するペプチド群の探索

植物の栄養研究会第４回研究交流会 2018年9月8日
マンガン添加はシロイヌナズナの亜鉛欠乏障害を緩和する

植物の栄養研究会第４回研究交流会 2018年9月7日
元素欠乏したシロイヌナズナの生育を制御するペプチドの機能解析

植物の栄養研究会第４回研究交流会 2018年9月7日
シロイヌナズナの根において亜鉛欠乏応答する defensin-like family protein の解析

植物の栄養研究会第４回研究交流会 2018年9月7日
マルチオミクスを活用したブドウ培養細胞におけるレスベラトロール蓄積機構の解明およびレスベラトロール輸送体の探索

第13回トランスポーター研究会年会 2018年7月21日
Multi-Omics for Secondary Metabolite Accumulation in Grape Berry Skin and Culture Cells

XII INTERNATIONAL CONFERENCE ON GRAPEVINE BREEDING AND GENETICS 2018年7月16日
The DNA methylation dynamics in rice shoot apical meristem

25th International Conference on Sexual Plant Reproduction (ICSPR) 2018年6月12日
イネ幹細胞のDNAメチル化動態の特徴およびその制御機構の解析

第12回日本エピジェネティクス研究会年会 2018年5月24日
オルガネラ核様体に局在するHMG-boxタンパク質の収斂進化

第59回日本植物生理学会 2018年3月30日
MAG3 は小胞体とゴルジ体の境界で効率的な物質輸送に寄与する

第59回日本植物生理学会 2018年3月30日
シロイヌナズナにおける長鎖 DNA切断を誘導する網羅的gRNA設計ツール

第59回日本植物生理学会 2018年3月30日

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担当経験のある科目(授業)

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

タバコ属植物において異科接ぎ木成立を促進する候補ペプチドの作用機作解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2022年6月 - 2024年3月

深尾陽一朗
植物の亜鉛恒常性維持に寄与するペプチドと受容体の機能解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

深尾陽一朗
画期的機能を持つ接ぎ木システムの実用化と接ぎ木効率を向上させる接ぎ木促進剤の開発

イノベーション創出強化研究推進事業応用研究ステージ 2019年 - 2021年
画期的機能を持つ野菜の接ぎ木システムの実用化と接ぎ木効率を向上させる接ぎ木接着剤の開発

農林水産業・食品産業科学技術研究推進事業シーズ創出ステージ 2016年7月 - 2019年3月
ペプチドを利用した作物の亜鉛欠乏改善

加藤記念バイオサイエンス振興財団 2016年4月 - 2018年3月
細胞分裂から分化への変換を統御する分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

梅田正明, 高橋直紀, 関原明, 深尾陽一朗
植物の根において亜鉛欠乏を感知するセンサータンパク質の探索とその機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

深尾陽一朗, 稲葉尚子
マイクロＲＮＡ生合成経路撹乱による神経発達障害発症の新規分子基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2012年5月 - 2016年3月

中島欽一, 辻村啓太, 深尾陽一朗
プロテインホスファターゼが標的とするタンパク質の網羅的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2012年4月 - 2014年3月

深尾陽一朗, 石崎公庸, 藤原正幸
ミネラル欠乏ストレス時に根で機能する輸送体の包括的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2013年3月

深尾陽一朗
植物根毛細胞の先端成長に関与する SNARE 相互作用因子の同定および機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2010年 - 2012年

佐藤雅彦, 深尾陽一郎
植物における亜鉛に応答した細胞内膜輸送系のプロテオーム解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究特定領域研究 2007年 - 2008年

深尾陽一朗

深尾陽一朗

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書籍等出版物

講演・口頭発表等

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