小林航 (Wataru Kobayashi) - マイポータル

基本情報

所属: University of Dundee Principal Investigator

学位: 博士(理学)(早稲田大学)

研究者番号: 20778063
J-GLOBAL ID: 201601016475186696
researchmap会員ID: 7000017473

外部リンク: https://sites.dundee.ac.uk/wataru-kobayashi-group/

研究キーワード

研究分野

経歴

2025年4月 - 現在

University of Dundee, School of Life Sciences, Molecular Cell and Developmental Biology
2021年10月 - 2025年2月

Max Planck Institute of Biochemistry (MPIB)
2021年4月 - 2022年3月

早石修記念海外留学助成
2019年4月 - 2021年8月

オーストリア科学アカデミー分子細胞工学研究所
2019年4月 - 2021年3月

日本学術振興会海外特別研究員
2018年4月 - 2019年3月

早稲田大学, 理工学術院, 講師(任期付)
2017年4月 - 2018年3月

早稲田大学, 理工学術院, 助教
2016年4月 - 2017年3月

早稲田大学, 理工学術院, 助手
2013年4月 - 2016年3月

早稲田大学, 先進理工学研究科, 日本学術振興会特別研究員 (DC1)

学歴

2013年4月 - 2016年3月

早稲田大学, 先進理工学研究科, 電気・情報生命専攻博士課程
2011年4月 - 2013年3月

早稲田大学, 先進理工学研究科, 電気・情報生命専攻修士課程
2007年4月 - 2011年3月

早稲田大学, 先進理工学部, 電気・情報生命工学科

受賞

2026年3月

Wellcome Trust Career Development Award, Wellcome Trust
2023年7月

MPIB Junior Scientists’ Publication Award (JSPA)
2016年12月

第39回日本分子生物学会年会優秀ポスター賞, 日本分子生物学会

小林航
2015年12月

若手優秀発表賞, 第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会

小林航

論文

Protocol for integrative analysis of transcription factor-nucleosome interactions using SeEN-seq and cryo-EM structure determination.

Wataru Kobayashi, Alicia K Michael, Siwat Ruangroengkulrith, Maximilian Kümmecke, Kikuë Tachibana

STAR protocols 7(1) 104295-104295 2025年12月26日査読有り筆頭著者責任著者
Feed-forward loops by NR5A2 ensure robust gene activation during pre-implantation development.

Wataru Kobayashi, Siwat Ruangroengkulrith, Eda Nur Arslantas, Adarsh Mohanan, Kikuë Tachibana

Development (Cambridge, England) 2025年12月8日査読有り筆頭著者
CUT&Tag for Transcription Factor Binding Profiles During Mammalian Zygotic Genome Activation.

Wataru Kobayashi, Kikuë Tachibana

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2923 77-87 2025年査読有り筆頭著者
Cryo-EM structures of RAD51 assembled on nucleosomes containing a DSB site.

Takuro Shioi, Suguru Hatazawa, Eriko Oya, Noriko Hosoya, Wataru Kobayashi, Mitsuo Ogasawara, Takehiko Kobayashi, Yoshimasa Takizawa, Hitoshi Kurumizaka

Nature 628(8006) 212-220 2024年4月査読有り
Nucleosome-bound NR5A2 structure reveals pioneer factor mechanism by DNA minor groove anchor competition.

Wataru Kobayashi, Anna H Sappler, Daniel Bollschweiler, Maximilian Kümmecke, Jérôme Basquin, Eda Nur Arslantas, Siwat Ruangroengkulrith, Renate Hornberger, Karl Duderstadt, Kikuë Tachibana

Nature structural & molecular biology 2024年2月26日査読有り筆頭著者
Zygotic genome activation by the totipotency pioneer factor Nr5a2

Johanna Gassler, Wataru Kobayashi, Imre Gáspár, Siwat Ruangroengkulrith, Adarsh Mohanan, Laura Gómez Hernández, Pavel Kravchenko, Maximilian Kümmecke, Aleksandar Lalic, Nikita Rifel …

Science 2022年11月24日査読有り筆頭著者
Distinctive nuclear zone for RAD51-mediated homologous recombinational DNA repair

Yasunori Horikoshi, Hiroki Shima, Jiying Sun, Wataru Kobayashi, Volker J. Schmid, Hiroshi Ochiai, Lin Shi, Atsuhiko Fukuto, Yasuha Kinugasa, Hitoshi Kurumizaka …

2021年11月30日
Awakening of the zygotic genome by pioneer transcription factors.

Wataru Kobayashi, Kikuë Tachibana

Current opinion in structural biology 71 94-100 2021年7月10日査読有り
Structural basis of nucleosomal histone H4 lysine 20 methylation by SET8 methyltransferase.

Cheng-Han Ho, Yoshimasa Takizawa, Wataru Kobayashi, Yasuhiro Arimura, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka

Life science alliance 4(4) 2021年4月査読有り
RFWD3-Mediated Ubiquitination Promotes Timely Removal of Both RPA and RAD51 from DNA Damage Sites to Facilitate Homologous Recombination.

Shojiro Inano, Koichi Sato, Yoko Katsuki, Wataru Kobayashi, Hiroki Tanaka, Kazuhiro Nakajima, Shinichiro Nakada, Hiroyuki Miyoshi, Kerstin Knies, Akifumi Takaori-Kondo …

Molecular cell 78(1) 192-192 2020年4月2日
Cryo-EM Structures of Centromeric Tri-nucleosomes Containing a Central CENP-A Nucleosome.

Yoshimasa Takizawa, Cheng-Han Ho, Hiroaki Tachiwana, Hideyuki Matsunami, Wataru Kobayashi, Midori Suzuki, Yasuhiro Arimura, Tetsuya Hori, Tatsuo Fukagawa, Melanie D Ohi …

Structure (London, England : 1993) 28(1) 44-53 2020年1月7日査読有り
Structural transition of the nucleosome during chromatin remodeling and transcription

Hitoshi Kurumizaka

Current Opinion in Structural Biology 59 107-114 2019年12月査読有り
Structural and biochemical analyses of the nuclear pore complex component ELYS identify residues responsible for nucleosome binding.

Kobayashi W, Takizawa Y, Aihara M, Negishi L, Ishii H, Kurumizaka H

Communications biology 2 163-163 2019年査読有り筆頭著者
Homologous pairing activities of Arabidopsis thaliana RAD51 and DMC1.

Kobayashi W, Liu E, Ishii H, Matsunaga S, Schlögelhofer P, Kurumizaka H

Journal of biochemistry 165(3) 289-295 2018年12月査読有り筆頭著者
Cancer-associated mutations of histones H2B, H3.1 and H2A.Z.1 affect the structure and stability of the nucleosome

Arimura, Yasuhiro, Ikura, Masae, Fujita, Risa, Noda, Mamiko, Kobayashi, Wataru, Horikoshi, Naoki, Sun, Jiying, Shi, Lin, Kusakabe, Masayuki, Harata, Masahiko …

Nucleic acids research 46(19) 10007-10018 2018年11月査読有り
Histone H2A variants confer specific properties to nucleosomes and impact on chromatin accessibility

Akihisa Osakabe, Zdravko J Lorković, Wataru Kobayashi, Hiroaki Tachiwana, Ramesh Yelagandula, Hitoshi Kurumizaka, Frédéric Berger

Nucleic Acids Research 46(15) 7675-7685 2018年9月6日査読有り
Histone Methylation by SETD1A Protects Nascent DNA through the Nucleosome Chaperone Activity of FANCD2

Martin R. Higgs, Koichi Sato, John J. Reynolds, Shabana Begum, Rachel Bayley, Amalia Goula, Audrey Vernet, Karissa L. Paquin, David G. Skalnik, Wataru Kobayashi …

Molecular Cell 71(1) 25-41.e6 2018年7月5日査読有り
Cancer-associated mutations of histones H2B, H3.1 and H2A.Z.1 affect the structure and stability of the nucleosome.

Arimura Y, Ikura M, Fujita R, Noda M, Kobayashi W, Horikoshi N, Sun J, Shi L, Kusakabe M, Harata M …

Nucleic acids research 46(19) 10007-10018 2018年7月査読有り
Replication stress induces accumulation of FANCD2 at central region of large fragile genes

Yusuke Okamoto, Watal M. Iwasaki, Kazuto Kugou, Kazuki K. Takahashi, Arisa Oda, Koichi Sato, Wataru Kobayashi, Hidehiko Kawai, Ryo Sakasai, Akifumi Takaori-Kondo …

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 46(6) 2932-2944 2018年4月査読有り
SYCP3 regulates strand invasion activities of RAD51 and DMC1

Wataru Kobayashi, Noriko Hosoya, Shinichi Machida, Kiyoshi Miyagawa, Hitoshi Kurumizaka

GENES TO CELLS 22(9) 799-809 2017年9月査読有り筆頭著者

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MISC

ヒストンメチルトランスフェラーゼPR-Set7の生化学的および構造的解析(Biochemical and structural analyses of histone methyltransferase PR-Set7)

何承翰, 滝沢由政, 小林航, 石井初芽, 平野里奈, 有村泰宏, 胡桃坂仁志

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 92回 [2T13a-02] 2019年9月
CENP-Aを含むトリヌクレオソームのクライオ電子顕微鏡解析

何承翰, 滝沢由政, 小林航, 立和名博昭, マティアス・ウォルフ, 胡桃坂仁志

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 91回 [1P-243] 2018年9月
遺伝情報の維持継承におけるミクロとマクロの統合的理解:生化学の新たな挑戦 RAD51-単鎖DNA-ヌクレオソーム複合体の構造生物学的解析

小林航, 石井初芽, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 91回 [2S06m-04] 2018年9月
リンカーヒストンを含む高次クロマチン構造における相同組換え機構

町田晋一, 高久誉大, 井倉正枝, 孫継英, 鈴木秀和, 小林航, 木野村愛子, 越阪部晃永, 立和名博昭, 浦聖恵 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 2013年
相同組換えにおける高次クロマチンの動的な制御

町田晋一, 高久誉大, 井倉正枝, SUN Jiying, 鈴木秀和, 小林航, 越阪部晃永, 立和名博昭, 浦聖恵, 田代聡 …

日本生化学会大会(Web) 86th 2013年
クロマチン高次構造上における相同組換え反応の解析

町田晋一, 高久誉大, 小林航, 越阪部晃永, 立和名博昭, 鈴木秀和, 浦聖恵, 井倉正枝, 井倉毅, 田代聡 …

第35 回分子生物学会年会 2012 年12 月12 日 2012年12月
再構成系によるクロマチンでの相同組換え機構の解析

高久誉大, 町田晋一, 小林航, 林田亮太, 鈴木秀和, 井倉正枝, 越阪部晃永, 立和名博昭, 浦聖恵, 田代聡 …

日本生化学会大会(Web) 85th 2012年

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

核膜孔複合体構成因子ELYSによるヌクレオソームの認識機構解析

科学研究費助成事業(早稲田大学) 若手研究若手研究 2018年4月 - 2019年3月

小林航
シナプトネマ複合体構成因子SYCP3による減数分裂期組換えの制御機構解析

科学研究費助成事業(早稲田大学) 研究活動スタート支援 2016年8月 - 2018年3月

小林航
クロマチン構造上における減数分裂期組換えの分子機構

日本学術振興会特別研究員奨励費 2013年4月 - 2016年3月

小林航

小林航

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受賞

論文

MISC

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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