小林航 (Wataru Kobayashi) - マイポータル

基本情報

所属: Max Planck Institute of Biochemistry (MPIB)

学位: 博士(理学)(早稲田大学)

研究者番号: 20778063
J-GLOBAL ID: 201601016475186696
researchmap会員ID: 7000017473

研究キーワード

研究分野

経歴

2021年9月 - 現在

マックス・プランク生化学研究所
2021年4月 - 現在

早石修記念海外留学助成
2019年4月 - 2021年8月

オーストリア科学アカデミー分子細胞工学研究所
2019年4月 - 2021年3月

日本学術振興会海外特別研究員
2018年4月 - 2019年3月

早稲田大学理工学術院講師(任期付)
2017年4月 - 2018年3月

早稲田大学理工学術院助教
2016年4月 - 2017年3月

早稲田大学理工学術院助手
2013年4月 - 2016年3月

早稲田大学先進理工学研究科日本学術振興会特別研究員 (DC1)

学歴

2013年4月 - 2016年3月

早稲田大学先進理工学研究科電気・情報生命専攻博士課程
2011年4月 - 2013年3月

早稲田大学先進理工学研究科電気・情報生命専攻修士課程
2007年4月 - 2011年3月

早稲田大学先進理工学部電気・情報生命工学科

受賞

2016年12月

第39回日本分子生物学会年会優秀ポスター賞日本分子生物学会

小林航
2015年12月

若手優秀発表賞第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会

小林航

論文

Awakening of the zygotic genome by pioneer transcription factors.

Wataru Kobayashi, Kikuë Tachibana

Current opinion in structural biology 71 94-100 2021年7月10日
Structural basis of nucleosomal histone H4 lysine 20 methylation by SET8 methyltransferase.

Cheng-Han Ho, Yoshimasa Takizawa, Wataru Kobayashi, Yasuhiro Arimura, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka

Life science alliance 4(4) 2021年4月
Cryo-EM Structures of Centromeric Tri-nucleosomes Containing a Central CENP-A Nucleosome.

Yoshimasa Takizawa, Cheng-Han Ho, Hiroaki Tachiwana, Hideyuki Matsunami, Wataru Kobayashi, Midori Suzuki, Yasuhiro Arimura, Tetsuya Hori, Tatsuo Fukagawa, Melanie D Ohi, Matthias Wolf, Hitoshi Kurumizaka

Structure (London, England : 1993) 28(1) 44-53 2020年1月7日査読有り
Structural transition of the nucleosome during chromatin remodeling and transcription.

Kobayashi W, Kurumizaka H

Current opinion in structural biology 59 107-114 2019年8月査読有り
Structural and biochemical analyses of the nuclear pore complex component ELYS identify residues responsible for nucleosome binding.

Kobayashi W, Takizawa Y, Aihara M, Negishi L, Ishii H, Kurumizaka H

Communications biology 2 163 2019年査読有り
Homologous pairing activities of Arabidopsis thaliana RAD51 and DMC1.

Kobayashi W, Liu E, Ishii H, Matsunaga S, Schlögelhofer P, Kurumizaka H

Journal of biochemistry 2018年12月査読有り
Cancer-associated mutations of histones H2B, H3.1 and H2A.Z.1 affect the structure and stability of the nucleosome

Arimura, Yasuhiro, Ikura, Masae, Fujita, Risa, Noda, Mamiko, Kobayashi, Wataru, Horikoshi, Naoki, Sun, Jiying, Shi, Lin, Kusakabe, Masayuki, Harata, Masahiko, Ohkawa, Yasuyuki, Tashiro, Satoshi, Kimura, Hiroshi, Ikura, Tsuyoshi, Kurumizaka, Hitoshi

Nucleic acids research 46(19) 10007-10018 2018年11月査読有り
Histone H2A variants confer specific properties to nucleosomes and impact on chromatin accessibility

Akihisa Osakabe, Zdravko J Lorković, Wataru Kobayashi, Hiroaki Tachiwana, Ramesh Yelagandula, Hitoshi Kurumizaka, Frédéric Berger

Nucleic Acids Research 46(15) 7675-7685 2018年9月6日査読有り
Histone Methylation by SETD1A Protects Nascent DNA through the Nucleosome Chaperone Activity of FANCD2

Martin R. Higgs, Koichi Sato, John J. Reynolds, Shabana Begum, Rachel Bayley, Amalia Goula, Audrey Vernet, Karissa L. Paquin, David G. Skalnik, Wataru Kobayashi, Minoru Takata, Niall G. Howlett, Hitoshi Kurumizaka, Hiroshi Kimura, Grant S. Stewart

Molecular Cell 71(1) 25-41.e6 2018年7月5日査読有り
Cancer-associated mutations of histones H2B, H3.1 and H2A.Z.1 affect the structure and stability of the nucleosome.

Arimura Y, Ikura M, Fujita R, Noda M, Kobayashi W, Horikoshi N, Sun J, Shi L, Kusakabe M, Harata M, Ohkawa Y, Tashiro S, Kimura H, Ikura T, Kurumizaka H

Nucleic acids research 46(19) 10007-10018 2018年7月査読有り
Replication stress induces accumulation of FANCD2 at central region of large fragile genes

Yusuke Okamoto, Watal M. Iwasaki, Kazuto Kugou, Kazuki K. Takahashi, Arisa Oda, Koichi Sato, Wataru Kobayashi, Hidehiko Kawai, Ryo Sakasai, Akifumi Takaori-Kondo, Takashi Yamamoto, Masato T. Kanemaki, Masato Taoka, Toshiaki Isobe, Hitoshi Kurumizaka, Hideki Innan, Kunihiro Ohta, Masamichi Ishiai, Minoru Takata

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 46(6) 2932-2944 2018年4月査読有り
SYCP3 regulates strand invasion activities of RAD51 and DMC1

Wataru Kobayashi, Noriko Hosoya, Shinichi Machida, Kiyoshi Miyagawa, Hitoshi Kurumizaka

GENES TO CELLS 22(9) 799-809 2017年9月査読有り
RFWD3-Mediated Ubiquitination Promotes Timely Removal of Both RPA and RAD51 from DNA Damage Sites to Facilitate Homologous Recombination

Shojiro Inano, Koichi Sato, Yoko Katsuki, Wataru Kobayashi, Hiroki Tanaka, Kazuhiro Nakajima, Shinichiro Nakada, Hiroyuki Miyoshi, Kerstin Knies, Akifumi Takaori-Kondo, Detlev Schindler, Masamichi Ishiai, Hitoshi Kurumizaka, Minoru Takata

MOLECULAR CELL 66(5) 622-+ 2017年6月査読有り
Xeroderma pigmentosum group C protein interacts with histones: regulation by acetylated states of histone H3

Erina Kakumu, Seiya Nakanishi, Hiromi M. Shiratori, Akari Kato, Wataru Kobayashi, Shinichi Machida, Takeshi Yasuda, Naoko Adachi, Naoaki Saito, Tsuyoshi Ikura, Hitoshi Kurumizaka, Hiroshi Kimura, Masayuki Yokoi, Wataru Sakai, Kaoru Sugasawa

GENES TO CELLS 22(3) 310-327 2017年3月査読有り
FANCI-FANCD2 stabilizes the RAD51-DNA complex by binding RAD51 and protects the 5 '-DNA end

Koichi Sato, Mayo Shimomuki, Yoko Katsuki, Daisuke Takahashi, Wataru Kobayashi, Masamichi Ishiai, Hiroyuki Miyoshi, Minoru Takata, Hitoshi Kurumizaka

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 44(22) 10758-10771 2016年12月査読有り
Chromatin architecture may dictate the target site for DMC1, but not for RAD51, during homologous pairing

Wataru Kobayashi, Motoki Takaku, Shinichi Machida, Hiroaki Tachiwana, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka

SCIENTIFIC REPORTS 6 24228 2016年4月査読有り
Green fluorescent protein fused to the C terminus of RAD51 specifically interferes with secondary DNA binding by the RAD51-ssDNA complex

Wataru Kobayashi, Satoshi Sekine, Shinichi Machida, Hitoshi Kurumizaka

GENES & GENETIC SYSTEMS 89(4) 169-179 2014年8月査読有り
Nap1 stimulates homologous recombination by RAD51 and RAD54 in higher-ordered chromatin containing histone H1

Shinichi Machida, Motoki Takaku, Masae Ikura, Jiying Sun, Hidekazu Suzuki, Wataru Kobayashi, Aiko Kinomura, Akihisa Osakabe, Hiroaki Tachiwana, Yasunori Horikoshi, Atsuhiko Fukuto, Ryo Matsuda, Kiyoe Ura, Satoshi Tashiro, Tsuyoshi Ikura, Hitoshi Kurumizaka

SCIENTIFIC REPORTS 4 4863 2014年5月査読有り
Sufficient Amounts of Functional HOP2/MND1 Complex Promote Interhomolog DNA Repair but Are Dispensable for Intersister DNA Repair during Meiosis in Arabidopsis

Clemens Uanschou, Arnaud Ronceret, Mona Von Harder, Arnaud De Muyt, Daniel Vezon, Lucie Pereira, Liudmila Chelysheva, Wataru Kobayashi, Hitoshi Kurumizaka, Peter Schloegelhofer, Mathilde Grelon

PLANT CELL 25(12) 4924-4940 2013年12月査読有り

MISC

遺伝情報の維持継承におけるミクロとマクロの統合的理解:生化学の新たな挑戦 RAD51-単鎖DNA-ヌクレオソーム複合体の構造生物学的解析

小林航, 石井初芽, 滝沢由政, 胡桃坂仁志

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 91回 [2S06m-04] 2018年9月

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

核膜孔複合体構成因子ELYSによるヌクレオソームの認識機構解析

科学研究費助成事業(早稲田大学) 若手研究 2018年4月 - 2019年3月

小林航
シナプトネマ複合体構成因子SYCP3による減数分裂期組換えの制御機構解析

科学研究費助成事業(早稲田大学) 研究活動スタート支援 2016年8月 - 2018年3月

小林航
クロマチン構造上における減数分裂期組換えの分子機構

日本学術振興会特別研究員奨励費 2013年4月 - 2016年3月

小林航

小林航

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論文

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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