西嶋傑 (Suguru Nishijima) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院新領域創成科学研究科附属生命データサイエンスセンター特任准教授

J-GLOBAL ID: 201601019469047390
researchmap会員ID: 7000017556

外部リンク: https://nishijima-suguru.github.io/jp/

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研究分野

経歴

2025年4月 - 現在

東京大学, 生命データサイエンスセンター, 特任准教授
2024年11月 - 2025年3月

東京大学, 生命データサイエンスセンター, 客員共同研究員
2019年1月 - 2024年9月

European Molecular Biology Laboratory, Molecular and Systems Biology Unit, Postdoctoral Fellow
2016年9月 - 2018年12月

国立研究開発法人産業技術総合研究所, 産総研・早大生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ, 特別研究員
2016年4月 - 2016年8月

早稲田大学, ナノ・ライフ創新研究機構, 特任助教

学歴

2013年4月 - 2016年3月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, メディカル情報生命専攻
2011年4月 - 2013年3月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 情報生命科学専攻
2007年4月 - 2011年3月

早稲田大学, 人間科学部, 人間情報科学科

受賞

2017年10月

日本マイクロソフト賞, 生命情報科学若手の会第9回研究会
2017年8月

若手奨励賞, 第11回細菌学若手コロッセウム
2017年6月

Best Poster Award, The 12th International Workshop on Advanced Genomics
2015年6月

最優秀発表賞, 第19回腸内細菌学会
2013年9月

Outstanding Paper Award, The 4th International Human Microbiome Congress

論文

Global-scale microbiome analyses identify an ancestral gut cyanobacterial lineage enriched in African populations

Kotaro Murai, Yutaka Suzuki, Suguru Nishijima

2026年4月24日
The Japanese gut microbiome: ecology, uniqueness, and impact on health and disease

Suguru NISHIJIMA, Masahira HATTORI, Naoyoshi NAGATA

Proceedings of the Japan Academy, Series B 2026年2月10日筆頭著者責任著者
VIRE: a metagenome-derived, planetary-scale virome resource with environmental context

Suguru Nishijima*, Anthony Fullam*, Thomas S B Schmidt*, Michael Kuhn, Peer Bork

Nucleic Acids Research 2025年11月29日筆頭著者責任著者
Metalog: curated and harmonised contextual data for global metagenomics samples

Michael Kuhn, Thomas Sebastian B Schmidt, Pamela Ferretti, Anna Głazek, Shahriyar Mahdi Robbani, Wasiu Akanni, Anthony Fullam, Christian Schudoma, Ela Cetin, Mariam Hassan …

Nucleic Acids Research 2025年10月31日
Alcohol-related liver disease disrupts bile acid synthesis and is associated with compensatory gut microbiota changes

Marisa Isabell Keller, Andressa de Zawadzki, Maja Thiele, Tommi Suvitaival, Karolina Sulek, Michael Kuhn, Christian Schudoma, Daniel Podlesny, Suguru Nishijima, Anthony Noel Fullam …

2025年7月23日
Fecal microbial load is a major determinant of gut microbiome variation and a confounder for disease associations

Suguru Nishijima, Evelina Stankevic, Oliver Aasmets, Thomas S.B. Schmidt, Naoyoshi Nagata, Marisa Isabell Keller, Pamela Ferretti, Helene Bæk Juel, Anthony Fullam, Shahriyar Mahdi Robbani …

Cell 2025年1月9日筆頭著者
Multi-biome analysis identifies distinct gut microbial signatures and their crosstalk in ulcerative colitis and Crohn’s disease

Shintaro Akiyama, Suguru Nishijima, Yasushi Kojima, Moto Kimura, Mitsuru Ohsugi, Kohjiro Ueki, Masashi Mizokami, Masahira Hattori, Kiichiro Tsuchiya, Naomi Uemura …

Nature Communications 2024年11月27日責任著者
Refined Enterotyping Reveals Dysbiosis in Global Fecal Metagenomes

Marisa Isabell Keller, Suguru Nishijima, Daniel Podlesny, Chan Yeong Kim, Shahriyar Mahdi Robbani, Christian Schudoma, Anthony Fullam, Jonas Schiller, Ivica Letunic, Wasiu Akanni …

2024年8月13日
Opportunities and barriers in omics-based biomarker discovery for steatotic liver diseases

Maja Thiele, Ida Falk Villesen, Lili Niu, Stine Johansen, Karolina Sulek, Suguru Nishijima, Lore Van Espen, Marisa Keller, Mads Israelsen, Tommi Suvitaival …

Journal of Hepatology 2024年8月
Consistency across multi‐omics layers in a drug‐perturbed gut microbial community

Sander Wuyts*, Renato Alves*, Maria Zimmermann‐Kogadeeva*, Suguru Nishijima*, Sonja Blasche, Marja Driessen, Philipp E Geyer, Rajna Hercog, Ece Kartal, Lisa Maier …

Molecular Systems Biology 2023年9月12日筆頭著者
Sphingolipids Are Depleted in Alcohol-Related Liver Fibrosis

Maja Thiele, Tommi Suvitaival, Kajetan Trošt, Min Kim, Andressa de Zawadzki, Maria Kjaergaard, Ditlev Nytoft Rasmussen, Katrine Prier Lindvig, Mads Israelsen, Sönke Detlefsen …

Gastroenterology 164(7) 2023年6月
Population-level metagenomics uncovers distinct effects of multiple medications on the human gut microbiome

Naoyoshi Nagata*, Suguru Nishijima*, Tohru Miyoshi-Akiyama, Yasushi Kojima, Moto Kimura, Ryo Aoki, Mitsuru Ohsugi, Kohjiro Ueki, Kuniko Miki, Eri Iwata …

Gastroenterology 2022年10月筆頭著者責任著者
Extensive gut virome variation and its associations with host and environmental factors in a population-level cohort

Suguru Nishijima*, Naoyoshi Nagata*, Yuya Kiguchi, Yasushi Kojima, Tohru Miyoshi-Akiyama, Moto Kimura, Mitsuru Ohsugi, Kohjiro Ueki, Shinichi Oka, Masashi Mizokami …

Nature Communications 13(1) 2022年9月6日筆頭著者責任著者
Metagenomic Identification of Microbial Signatures Predicting Pancreatic Cancer From a Multinational Study

Naoyoshi Nagata*, Suguru Nishijima*, Yasushi Kojima, Yuya Hisada, Koh Imbe, Tohru Miyoshi-Akiyama, Wataru Suda, Moto Kimura, Ryo Aoki, Katsunori Sekine …

Gastroenterology 163(1) 222-238 2022年7月筆頭著者責任著者
Long-read metagenomics of multiple displacement amplified DNA of low-biomass human gut phageomes by SACRA pre-processing chimeric reads

Yuya Kiguchi, Suguru Nishijima, Naveen Kumar, Masahira Hattori, Wataru Suda

DNA Research 28(6) 2021年10月11日
Revealing the microbial assemblage structure in the human gut microbiome using latent Dirichlet allocation

Shion Hosoda, Suguru Nishijima, Tsukasa Fukunaga, Masahira Hattori, Michiaki Hamada

Microbiome 8(1) 2020年12月
Emergence of the novel aminoglycoside acetyltransferase variant Aac(6')-ib-d179y and acquisition of colistin heteroresistance in carbapenem-resistant klebsiella pneumoniae due to a disrupting mutation in the dna repair enzyme muts

Toyotaka Sato, Takayuki Wada, Suguru Nishijima, Yukari Fukushima, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki, Satoshi Takahashi, Shin-ichi Yokota

mBio 11(6) 2020年12月
Effects of storage temperature, storage time, and Cary-Blair transport medium on the stability of the gut microbiota

Naoyoshi Nagata, Mari Tohya, Fumihiko Takeuchi, Wataru Suda, Suguru Nishijima, Mitsuru Ohsugi, Kohjiro Ueki, Tetsuro Tsujimoto, Tomoka Nakamura, Takashi Kawai …

Drug Discoveries & Therapeutics 13(5) 256-260 2019年10月31日
Long-read metagenomic exploration of extrachromosomal mobile genetic elements in the human gut

Yoshihiko Suzuki, Suguru Nishijima, Yoshikazu Furuta, Jun Yoshimura, Wataru Suda, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Shinichi Morishita

Microbiome 7(1) 2019年8月27日筆頭著者
Effects of bowel preparation on the human gut microbiome and metabolome

Naoyoshi Nagata, Mari Tohya, Shinji Fukuda, Wataru Suda, Suguru Nishijima, Fumihiko Takeuchi, Mitsuru Ohsugi, Tetsuro Tsujimoto, Tomoka Nakamura, Akira Shimomura …

Scientific Reports 9(1) 2019年3月11日

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MISC

メタゲノムデータを用いた腸内細菌叢への影響因子の解明

永田尚義, 西嶋傑

ヒトマイクロバイオーム Vol.2 ～解析技術の進展とデータ駆動型・ターゲット機能型研究最前線～ 123-130 2020年6月
ロングリードメタゲノミクス

鈴木慶彦, 西嶋傑, 森下真一

ヒトマイクロバイオーム Vol.2 ～解析技術の進展とデータ駆動型・ターゲット機能型研究最前線～ 37-46 2020年6月
メタゲノムデータからの微生物ゲノムの再構成

西嶋傑

実験医学増刊シングルセルゲノミクス 161-166 2019年12月
日本人腸内細菌叢のユニークさと国間多様性

服部正平, 西嶋傑

週間医学のあゆみ 264(1) 27-33 2018年10月
大規模シークエンステータを用いたヒトマイクロバイオーム研究

須田亙, 緒方勇亮, 西嶋傑

CLINICAL CALCIUM 28(9) 112-119 2018年9月
メタゲノム解析によるヒト腸内マイクロバイオームの国レベル多様性

服部正平, 西嶋傑

最新醫學 73(4) 18-26 2018年
日本人腸内細菌叢の特徴と国間多様性

服部正平, 西嶋傑

糖尿病診療マスター 15(6) 456-464 2017年6月
ヒト腸内細菌叢のメタゲノム解析

大島健志朗, 西嶋傑, 服部正平

生体の科学 68(2) 165-169 2017年4月
ヒト腸内マイクロバイオームのメタゲノム解析

大島健志朗, 西嶋傑

ファルマシア 53(11) 1064-1068 2017年
腸内細菌叢のメタゲノム解析・メタ16S 解析

須田亙, 西嶋傑, 高安玲奈, 大島健志朗

今すぐ始める! メタゲノム解析実験プロトコール 28-38 2016年12月
日本人腸内細菌叢のメタゲノム解析と特徴解明

西嶋傑, 服部正平

今すぐ始める! メタゲノム解析実験プロトコール 39-43 2016年12月
ヒト腸内細菌叢のメタゲノムデータのインフォマティクス

西嶋傑

今すぐ始める! メタゲノム解析実験プロトコール 206-214 2016年12月
次世代シーケンサーを用いた腸内細菌叢の解析手法と日本人腸内細菌叢の特徴

須田亙, 西嶋傑, 服部正平

The Lipid 27(2) 20-26 2016年4月
メタゲノム解析・16S 解析とその解析技術

大島健志朗, 西嶋傑, 須田亙

ヒトマイクロバイオーム研究最前線〜常在菌の解析技術から生態、医療分野、食品への応用研究まで〜 7-15 2016年3月
日本人腸内細菌叢のメタゲノム解析

西嶋傑, 服部正平

ヒトマイクロバイオーム研究最前線〜常在菌の解析技術から生態、医療分野、食品への応用研究まで〜 17-26 2016年3月
ヒト腸内細菌マイクロバイオームの特徴

服部正平, 西嶋傑

G.I. Research 22(2) 128-135 2014年
ヒトの腸内マイクロバイオーム

西嶋傑, 服部正平

細胞工学 32(11) 1129-1132 2013年10月

共同研究・競争的資金等の研究課題

腸内細菌の株レベル個人差と疾患関連性の包括的解析

日本医療研究開発機構革新的先端研究開発支援事業性差・個人差の機構解明と予測技術の創出 2025年9月 - 2029年3月

西嶋傑
内視鏡・多層オミクスデータに基づく大腸発がんリスクモデルの構築と予防介入因子の同定

日本医療研究開発機構革新的がん医療実用化研究事業個人の発がんリスクを評価するコホート研究（疫学研究） 2025年10月 - 2028年3月

永田尚義, 西嶋傑, 濱端崇, 河合洋介
ヒト腸内に生息する広宿主域ファージのゲノム解析と機能解明

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2025年7月 - 2027年3月

西嶋傑
ヒト腸内におけるダークマター「腸内ファージ」の生態的および生理的意義の解明に挑む

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2024年6月 - 2027年3月

阪中幹祥, 西川洋平, 西嶋傑
超大規模メタゲノムデータに基づくマイクロバイオームの疾患横断解析と汎用診断モデルの開発

三菱財団自然科学研究助成 2025年10月 - 2026年9月

西嶋傑
超大規模メタゲノムデータに基づく腸内ダークマターの解明

武田科学振興財団ライフサイエンス研究助成 2025年9月 - 2026年8月

西嶋傑
シングルセル解析技術を用いた腸内ファージの生態系解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2018年4月 - 2018年12月

西嶋傑
日本人腸内マイクロバイオームの特徴解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2014年4月 - 2016年3月

西嶋傑