五味良太 (Ryota Gomi) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院工学系研究科附属水環境工学研究センター特任准教授

学位: 博士（工学）（京都大学）

研究者番号: 30794284
J-GLOBAL ID: 201601000196666536
researchmap会員ID: 7000018112

研究キーワード

研究分野

環境・農学 / 環境影響評価 /

経歴

2025年4月 - 現在

東京大学, 大学院工学系研究科附属水環境工学研究センター, 特任准教授
2016年10月 - 2025年3月

京都大学, 大学院工学研究科都市環境工学専攻, 助教
2019年1月 - 2019年8月

Monash University, Visiting Researcher
2018年8月 - 2018年12月

University of Melbourne, Visiting Researcher

学歴

2014年4月 - 2016年9月

京都大学, 工学研究科, 都市環境工学専攻博士後期課程
2012年4月 - 2014年3月

京都大学, 工学研究科, 都市環境工学専攻修士課程
2008年4月 - 2012年3月

京都大学, 工学部, 地球工学科

委員歴

受賞

論文

Development of microbial source tracking markers for detection of human-associated Clostridium perfringens

Thi Thu Huong Nguyen, Tomohiro Nakanishi, Ryota Gomi, Sadahiko Itoh

Water Research 298 125814-125814 2026年6月査読有り
Simultaneous detection of protozoa, bacteria, and viruses from environmental water through membrane-adsorption followed by direct nucleic acid extraction

Shotaro Torii, Masaaki Kitajima, Eiji Haramoto, Ryota Gomi, Kumiko Oguma, Hiroyuki Katayama

Water Research 125792-125792 2026年6月査読有り
Integrating whole-genome sequencing into antimicrobial resistance surveillance: methodologies, challenges, and perspectives

Yasufumi Matsumura, Masaki Yamamoto, Ryota Gomi, Yasuhiro Tsuchido, Koh Shinohara, Taro Noguchi, Miki Nagao

Clinical Microbiology Reviews 2025年12月査読有り
Occurrence of antibiotics and antibiotic-resistant bacteria in a Japanese city revealed by wastewater surveillance in the sewer system

Yu Tang, Ryota Gomi, Haruka Takeuchi, Fumitake Nishimura, Masaru Ihara

Water Research 285 124136-124136 2025年10月査読有り
Quinolone Resistance Genes qnr, aac(6′)-Ib-cr, oqxAB, and qepA in Environmental Escherichia coli: Insights into Their Genetic Contexts from Comparative Genomics

Ryota Gomi, Fumie Adachi

Microbial Ecology 88(1) 2025年2月17日査読有り筆頭著者責任著者
Genomic surveillance of antimicrobial-resistant Escherichia coli in fecal sludge and sewage in Uganda

Ryota Gomi, Yasufumi Matsumura, Masaki Yamamoto, Mai Tanaka, Allan John Komakech, Tomonari Matsuda, Hidenori Harada

Water Research 248 120830-120830 2024年1月査読有り筆頭著者責任著者
Recommendations of Key Elements within an Integrated Monitoring Framework of Antimicrobial Resistance for Asian Countries

Ryo Honda, Manish Kumar, Mardalisa, Rongxuan Wang, Muhammad Adnan Sabar, Tushara Chaminda, Kwanrawee Sirikanchana, Prasert Makkeaw, Sulfikar, Feng Ju …

Environmental Science & Technology Letters 11(1) 5-8 2023年12月26日査読有り
Development of two microbial source tracking markers for detection of wastewater-associated Escherichia coli isolates

Ryota Gomi, Eiji Haramoto, Hiroyuki Wada, Yoshinori Sugie, Chih-Yu Ma, Sunayana Raya, Bikash Malla, Fumitake Nishimura, Hiroaki Tanaka, Masaru Ihara

Science of The Total Environment 864 160952-160952 2023年3月査読有り筆頭著者責任著者
Chromosomal integration of blaCTX-M genes in diverse Escherichia coli isolates recovered from river water in Japan

Ryota Gomi, Masaki Yamamoto, Michio Tanaka, Yasufumi Matsumura

Current Research in Microbial Sciences 3 100144-100144 2022年6月査読有り筆頭著者責任著者
Genomic dissection of Klebsiella pneumoniae infections in hospital patients reveals insights into an opportunistic pathogen.

Claire Gorrie, Mirčeta M, Ryan Wick, Louise Judd, Margaret Lam, Ryota Gomi, Abbott IJ, Nicholas Thomson, Richard Strugnell, Pratt NF …

Nature communications 13(1) 2022年5月31日査読有り
Emergence of rare carbapenemases (FRI, GES-5, IMI, SFC and SFH-1) in Enterobacterales isolated from surface waters in Japan

Ryota Gomi, Yasufumi Matsumura, Michio Tanaka, Masaru Ihara, Yoshinori Sugie, Tomonari Matsuda, Masaki Yamamoto

Journal of Antimicrobial Chemotherapy 77(5) 1237-1246 2022年4月27日査読有り筆頭著者責任著者
Occurrence of class 1 integrons carrying two copies of the blaGES-5 gene in carbapenem-non-susceptible Citrobacter freundii and Raoultella ornithinolytica isolated from wastewater

Ryota Gomi, Tomonari Matsuda, Masaki Yamamoto, Michio Tanaka, Thomas Jové, Pei-Hsin Chou, Yasufumi Matsumura

Journal of Global Antimicrobial Resistance 26 230-232 2021年9月査読有り筆頭著者責任著者
Detection of plasmid contigs in draft genome assemblies using customized Kraken databases

Ryota Gomi, Kelly Wyres, Kathryn Holt

Microbial Genomics 7(4) 2021年4月7日査読有り筆頭著者責任著者
Molecular Characterization of a Multidrug-Resistant IncF Plasmid Carrying mcr-3.1 in an Escherichia coli Sequence Type 393 Strain of Wastewater Origin

Ryota Gomi, Tomonari Matsuda, Masaki Yamamoto, Michio Tanaka, Satoshi Ichiyama, Minoru Yoneda, Yasufumi Matsumura

International Journal of Antimicrobial Agents 54(4) 524-526 2019年10月査読有り筆頭著者責任著者
Molecular Analysis of a blaIMP-1-Harboring Class 3 Integron in Multidrug-Resistant Pseudomonas fulva.

Masaki Yamamoto, Yasufumi Matsumura, Ryota Gomi, Tomonari Matsuda, Satoshi Nakano, Miki Nagao, Michio Tanaka, Satoshi Ichiyama

Antimicrobial agents and chemotherapy 62(8) 2018年8月査読有り
Pathotyping of Escherichia coli isolated from community toilet wastewater and stored drinking water in a slum in Bangladesh

H. Harada, Y. Fujimori, R. Gomi, Md.N. Ahsan, S. Fujii, A. Sakai, T. Matsuda

Letters in Applied Microbiology 66(6) 542-548 2018年6月1日査読有り
Characteristics of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae in wastewater revealed by genomic analysis

Ryota Gomi, Tomonari Matsuda, Masaki Yamamoto, Pei-Hsin Chou, Michio Tanaka, Satoshi Ichiyama, Minoru Yoneda, Yasufumi Matsumura

Antimicrobial Agents and Chemotherapy 62(5) 2018年5月1日査読有り筆頭著者責任著者
Occurrence of clinically important lineages, including the ST131 C1-M27 subclone, among extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli in wastewater.

Ryota Gomi, Tomonari Matsuda, Yasufumi Matsumura, Masaki Yamamoto, Michio Tanaka, Satoshi Ichiyama, Minoru Yoneda

Antimicrobial Agents and Chemotherapy 61(9) 2017年9月査読有り筆頭著者責任著者
Rapid Identification of Different Escherichia coli Sequence Type 131 Clades

Yasufumi Matsumura, Johann D. D. Pitout, Gisele Peirano, Rebekah DeVinney, Taro Noguchi, Masaki Yamamoto, Ryota Gomi, Tomonari Matsuda, Satoshi Nakano, Miki Nagao …

Antimicrobial Agents and Chemotherapy 61(8) 2017年8月査読有り
Whole-genome analysis of antimicrobialresistant and extraintestinal pathogenic Escherichia coli in river water

Ryota Gomi, Tomonari Matsuda, Yasufumi Matsumur, Masaki Yamamoto, Michio Tanaka, Satoshi Ichiyama, Minoru Yoneda

Applied and Environmental Microbiology 83(5) 2017年査読有り筆頭著者

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MISC

水環境中のカルバペネム耐性腸内細菌目細菌のゲノム解析

五味良太, 松村康史, 田中美智男, 杉江由規, 松田知成, 山本正樹, 井原賢

環境衛生工学研究 37(3) 2023年
琵琶湖および流域河川における薬剤耐性大腸菌の存在実態とその起源

杉江由規, MA Chih-Yu, Tang Yu, ZHAO Bo, 五味良太, 西村文武, 田中宏明, 井原賢

土木学会論文集 G(環境)(Web) 78(7) 2022年
流域データ及びRep-PCR DNAフィンガープリンティング法を用いた大和川における大腸菌の起源推定 (京都大学環境衛生工学研究会第35回シンポジウム講演論文集) -- (一般講演)

五味良太, 松井康人, 米田稔

環境衛生工学研究 : 京都大学環境衛生工学研究会機関誌 27(3) 224-227 2013年7月
Rep-PCR DNAフィンガープリンティング法を利用した大和川水系における大腸菌の起源推定に関する研究 (京都大学環境衛生工学研究会第34回シンポジウム講演論文集)

五味良太, 松井康人, 米田稔

環境衛生工学研究 : 京都大学環境衛生工学研究会機関誌 26(3) 57-60 2012年7月

講演・口頭発表等

環境細菌のゲノム解析による薬剤耐性遺伝子新規拡散機構の探索

五味良太

日本微生物生態学会第38回東京大会 2025年9月10日招待有り
下水由来大腸菌を検出するための遺伝子マーカーの開発

五味良太, 原本英司, 和田浩幸, 杉江由規, MA Chih-Yu, RAYA Sunayana, MALLA Bikash, 西村文武, 田中宏明, 井原賢

日本水環境学会年会講演集 2023年
関西地方の河川から単離したESBL産生大腸菌のゲノム解析

五味良太, 山本正樹, 田中美智男, 松村康史

第25回日本水環境学会シンポジウム 2022年9月
雨天時の下水処理場および河川における微生物濃度の変動

井原賢, 杉江由規, YU Zaizhi, 西田光希, MA Yu, ZHAO Bo, 和田浩幸, PARK Kyong-Soo, TANG Yu, 五味良太, 西村文武, 田中宏明

日本水環境学会シンポジウム講演集 2022年
琵琶湖,及び周辺河川における薬剤耐性大腸菌の存在実態と起源推定

杉江由規, TANG Yu, ZHAO Bo, 五味良太, 西村文武, 田中宏明, MA Chih-Yu, 井原賢

日本水環境学会年会講演集 2022年
環境水中に潜む耐性菌のモニタリング

五味良太

第95回日本感染症学会学術講演会 2021年5月招待有り
ベトナム国Nhue川の流下に伴う河川糞便汚染源の変化と飲食物汚染源との関係

田中麻衣, 原田英典, 藤井滋穂, Min Li Chua, 五味良太

日本水環境学会年会講演集 2019年3月8日
IS26-mediated reorganization of a multidrug-resistance IncF plasmid carrying mcr-3.1

Ryota Gomi

The 2019 MGE meeting 2019年2月
全ゲノム解析を取り入れた河川水中の薬剤耐性大腸菌の実態解明

五味良太, 松田知成, 松村康史, 山本正樹, 田中美智男, 一山智, 米田稔

第20回日本水環境学会シンポジウム 2017年9月
琵琶湖南湖から検出される大腸菌の全ゲノム解析

井原賢, 田村太一, 五味良太, 林東範, 劉思瑶, 馬緻宇, 山下尚之, 田中宏明

第20回日本水環境学会シンポジウム 2017年
大和川における病原性大腸菌の存在実態

五味良太, 松田知成, 米田稔

日本水環境学会シンポジウム講演集 2016年9月13日
河川水中における病原性大腸菌の実態調査

五味良太, 松田知成, 松井康人, 米田稔

第50回日本水環境学会年会 2016年3月
Microbial source tracking of Escherichia coli reveals humans as a major source of fecal contamination in the Yamato River, Japan

Gomi, R, Matsuda, T, Matsui, Y, Yoneda, M

18th International Symposium on Health-Related Water Microbiology 2015年9月
Novel genetic markers for identifying sources of fecal contamination in environmental water

Gomi, R, Matsuda, T, Matsui, Y, Yoneda, M

Environmental Health 2013 2013年3月

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

アフリカ都市周縁貧困地域の水・衛生由来下痢リスク構造と気候変動影響の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2028年3月

原田英典, 佐藤圭輔, 五味良太, 松田知成, 浅田安廣, 佐野大輔, 大石若菜
環境水中の薬剤耐性菌の網羅的ゲノム解析

独立行政法人環境再生保全機構環境研究総合推進費革新型研究開発（若手枠） 2023年4月 - 2026年3月

五味良太
環境水中の腸内細菌科細菌が保有する薬剤耐性プラスミドの構造解析及び伝達性評価

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2022年4月 - 2025年3月

五味良太
環境水中の細菌における薬剤耐性遺伝子の可動性に関する研究

公益財団法人住友財団環境研究助成一般研究助成 2022年11月 - 2023年10月

五味良太
環境水中での薬剤耐性遺伝子の拡散にはインテグロンがどの程度関与しているのか？

公益財団法人クリタ水・環境科学振興財団国内研究助成 2022年10月 - 2023年9月

五味良太
アジア・アフリカの都市下水の全ゲノム解析による多剤耐性大腸菌プロファイリング

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2018年6月 - 2023年3月

原田英典, 五味良太, 松田知成, 松村康史, 山本正樹
水環境における新興・再興微生物リスク管理に向けた微生物起源解析の活用に関する研究

環境再生保全機構環境研究総合推進費 2020年4月 - 2023年3月

片山浩之
全ゲノム解析による河川水中の薬剤耐性腸内細菌科細菌の実態解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2019年4月 - 2022年3月

五味良太
放射性CsやSrで汚染された廃棄物の中間貯蔵と最終処分のための安定化技術に関する研究

独立行政法人環境再生保全機構環境研究総合推進費環境研究総合推進費・委託費【問題対応型】【革新型】【課題調査型】 2017年4月 - 2020年3月

米田稔, 高岡昌輝, 島田洋子, 大下和徹, 福谷哲, 藤森崇, 池上麻衣子, 五味良太
下水処理水中カルバペネム耐性腸内細菌科細菌の遺伝学的特性の解明

公益財団法人クリタ水・環境科学振興財団国内研究助成 2017年10月 - 2018年9月

五味良太
下水処理水および病院排水中の薬剤耐性大腸菌の病原性の解明

河川財団河川基金若手研究者一般的助成 2017年4月 - 2018年3月

五味良太
全ゲノム解析を取り入れた河川水中における薬剤耐性大腸菌の存在実態の解明

公益財団法人日本科学協会笹川科学研究助成 2016年4月 - 2017年2月

五味良太

五味良太

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