共同研究・競争的資金等の研究課題

2010年 - 2012年

タンパク質の構造解析に対する位相幾何学的研究

日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究  挑戦的萌芽研究

課題番号
22654016
体系的課題番号
JP22654016
担当区分
研究代表者
配分額
(総額)
2,590,000円
(直接経費)
2,200,000円
(間接経費)
390,000円

本研究ではタンパク質構造解析の諸問題に対して位相幾何学的な研究手法の開発を行った.まずタンパク質の柔らかさに関する物性指標である圧縮率を,データベース(Protein Data Bank)が提供しているデータを用いて定量化することに成功した.パーシステントホモロジー群という位相幾何学の道具をもちいて,圧縮率に影響を及ぼすと思われている特徴的な空洞の情報を抽出することにより,このような成果を得ることができた.またパーシステント図の空間に定まる距離関数をもちいてタンパク質の新たな幾何学的構造に基づく分類法も提案した

リンク情報
URL
https://kaken.nii.ac.jp/file/KAKENHI-PROJECT-22654016/22654016seika.pdf
KAKEN
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22654016
ID情報
  • 課題番号 : 22654016
  • 体系的課題番号 : JP22654016