岩田洋佳 (HIROYOSHI IWATA) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院農学生命科学研究科教授

学位: 博士（農学）(1998年3月東京大学)

研究者番号: 00355489
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-6747-7036
J-GLOBAL ID: 201601008611024872
researchmap会員ID: 7000018607

外部リンク: https://www.ut-biomet.org

作物の遺伝的改良を促進することを主な目的として、様々な分野（生物測定学、統計遺伝学、集団遺伝学、データ科学など）の理論や手法の応用に強い関心を持って研究を行っています。

研究分野

環境・農学 / 遺伝育種科学 / 生物測定学

経歴

2023年4月 - 現在

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 教授
2010年4月 - 2023年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 准教授
2017年 - 2022年

鳥取大学, 乾燥地研究センター, 客員教授
2006年4月 - 2010年3月

独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 中央農業総合研究センター, 主任研究員
2005年4月 - 2006年3月

独立行政法人農業・生物系特定産業技術研究機構, 中央農業総合研究センター, 主任研究官
2002年4月 - 2005年3月

独立行政法人農業技術研究機構, 中央農業総合研究センター, 若手育成型任期付任用研究員
2002年1月 - 2002年3月

独立行政法人森林総合研究所（生物系特定産業技術研究推進機構）, 生物系特定産業技術研究推進機構派遣研究員
1999年1月 - 2001年12月

林野庁森林総合研究（科学技術振興事業団）, 科学技術特別研究員
1998年4月 - 1998年10月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 農学研究員

学歴

1995年4月 - 1998年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 生産・環境生物学専攻
1993年4月 - 1995年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 生産・環境生物学専攻
1990年4月 - 1993年3月

東京大学, 農学部, 農業生物学科
1988年4月 - 1990年3月

東京大学, 教養学部, 理科二類

委員歴

2024年4月 - 現在

日本学術会議, 連携会員
2024年4月 - 現在

日本育種学会, 幹事長
2022年3月 - 現在

日本育種学会, 代議員
2020年4月 - 現在

日本育種学会, 運営委員
2015年 - 現在

日本育種学会, Breeding Science/育種学研究編集委員
2023年3月 - 2024年3月

日本育種学会, 学会賞等選考委員会・委員
2014年4月 - 2023年3月

日本育種学会, シンポジウム委員
2021年1月 - 2022年12月

日本農学会, 常任委員（庶務担当）
2017年 - 2018年

内閣府, バイオ戦略検討ワーキンググループ
2012年4月 - 2015年3月

日本育種学会, 常任幹事
2012年1月 - 2013年12月

日本農学会, 常任委員（庶務担当）
2006年4月 - 2009年3月

日本育種学会, 常任幹事

受賞

論文

183

I-SVVS: integrative stochastic variational variable selection to explore joint patterns of multi-omics microbiome data

Tung Dang, Yushiro Fuji, Kie Kumaishi, Erika Usui, Shungo Kobori, Takumi Sato, Megumi Narukawa, Yusuke Toda, Kengo Sakurai, Yuji Yamasaki …

Briefings in Bioinformatics 26(3) 2025年5月1日査読有り最終著者責任著者
Ridge Redundancy Analysis for High-Dimensional Omics Data

Hayato Yoshioka, Julie Aubert, Hiroyoshi Iwata, Tristan Mary-Huard

2025年4月21日
Haplotype Bias Detection Using Pedigree-Based Transmission Simulation: Traces of Selection That Occurred in Apple Breeding

Hideto Mochizuki, Mai F. Minamikawa, Kosuke Hamazaki, Miyuki Kunihisa, Shigeki Moriya, Koji Noshita, Takeshi Hayashi, Yuichi Katayose, Toshiya Yamamoto, Hiroyoshi Iwata

2025年3月17日
A novel genome-wide association study method for detecting quantitative trait loci interacting with complex population structures in plant genetics

Kosuke Hamazaki, Hiroyoshi Iwata, Tristan Mary-Huard

GENETICS 2025年3月17日査読有り
The genomic landscape of gene-level structural variations in Japanese and global soybean Glycine max cultivars.

Ryoichi Yano, Feng Li, Susumu Hiraga, Ryoma Takeshima, Michie Kobayashi, Kyoko Toda, Yosuke Umehara, Hiromi Kajiya-Kanegae, Hiroyoshi Iwata, Akito Kaga …

Nature Genetics 2025年3月3日査読有り
Optimization of crossing strategy based on the usefulness criterion in inter-population crosses considering different genetic effects among populations

Sei Kinoshita, Kengo Sakurai, Kosuke Hamazaki, Takahiro Tsusaka, Miki Sakurai, Kenta Shirasawa, Sachiko Isobe, Hiroyoshi Iwata

2025年1月24日
Estimating fruit tree growth curves in breeding field using fragmented longitudinal data: An application to citrus hybrid seedlings

Soh Kimura, Mai F. Minamikawa, Keisuke Nonaka, Tokurou Shimizu, Hiroyoshi Iwata

2025年1月22日
Quantitative Genetic Aspects of Accuracy of Tree Biomass Measurement Using LiDAR

Haruka Sano, Naoko Miura, Minoru Inamori, Yamato Unno, Wei Guo, Sachiko Isobe, Kazutaka Kusunoki, Hiroyoshi Iwata

Remote Sensing 2024年12月22日査読有り最終著者責任著者
Cross Potential Selection: A Proposal for Optimizing Crossing Combinations in Recurrent Selection Using the Usefulness Criterion of Future Inbred Lines

Kengo Sakurai, Kosuke Hamazaki, Minoru Inamori, Akito Kaga, Hiroyoshi Iwata

G3: Genes, Genomes, Genetics 2024年9月23日査読有り責任著者
High-throughput Phenotyping of Soybean Biomass: Conventional Trait Estimation and Novel Latent Feature Extraction Using UAV Remote Sensing and Deep Learning Models

Mashiro Okada, Clément Barras, Yusuke Toda, Kosuke Hamazaki, Yoshihiro Ohmori, Yuji Yamasaki, Hirokazu Takahashi, Hideki Takanashi, Mai Tsuda, Masami Yokota Hirai …

Plant Phenomics 2024年8月14日査読有り責任著者
Modeling soybean growth: A mixed model approach

Maud Delattre, Yusuke Toda, Jessica Tressou, Hiroyoshi Iwata

PLOS Computational Biology 20(7) e1011258-e1011258 2024年7月11日査読有り
Machine learning for genomic and pedigree prediction in sugarcane

Minoru Inamori, Tatsuro Kimura, Masaaki Mori, Yusuke Tarumoto, Taiichiro Hattori, Michiko Hayano, Makoto Umeda, Hiroyoshi Iwata

The Plant Genome 2024年6月26日査読有り責任著者
Genomic prediction and genome-wide association study using combined genotypic data from different genotyping systems: application to apple fruit quality traits

Mai F Minamikawa, Miyuki Kunihisa, Shigeki Moriya, Tokurou Shimizu, Minoru Inamori, Hiroyoshi Iwata

Horticulture Research 2024年5月7日査読有り
Reaction norm for genomic prediction of plant growth: modeling drought stress response in soybean

Yusuke Toda, Goshi Sasaki, Yoshihiro Ohmori, Yuji Yamasaki, Hirokazu Takahashi, Hideki Takanashi, Mai Tsuda, Hiromi Kajiya-Kanegae, Hisashi Tsujimoto, Akito Kaga …

Theoretical and Applied Genetics 2024年4月査読有り責任著者
AI-assisted selection of mating pairs through simulation-based optimized progeny allocation strategies in plant breeding

Kosuke Hamazaki, Hiroyoshi Iwata

Frontiers in Plant Science 15 2024年3月28日査読有り
Assessing the potential for genome-assisted breeding in red perilla using quantitative trait locus analysis and genomic prediction

Sei Kinoshita, Kengo Sakurai, Kosuke Hamazaki, Takahiro Tsusaka, Miki Sakurai, Terue Kurosawa, Youichi Aoki, Kenta Shirasawa, Sachiko Isobe, Hiroyoshi Iwata

Genes 2023年10月17日査読有り責任著者
Genetic Dissection of Seasonal Changes in a Greening Plant Based on Time-Series Multispectral Imaging.

Taeko Koji, Hiroyoshi Iwata, Motoyuki Ishimori, Hideki Takanashi, Yuji Yamasaki, Hisashi Tsujimoto

Plants (Basel, Switzerland) 12(20) 2023年10月17日査読有り
Upcycling rice yield trial data using a weather-driven crop growth model

Hiroyuki Shimono, Akira Abe, Chyon Hae Kim, Chikashi Sato, Hiroyoshi Iwata

Communications Biology 2023年7月21日査読有り
Random regression for modeling soybean plant response to irrigation changes using time-series multispectral data

Kengo Sakurai, Yusuke Toda, Kosuke Hamazaki, Yoshihiro Ohmori, Yuji Yamasaki, Hirokazu Takahashi, Hideki Takanashi, Mai Tsuda, Hisashi Tsujimoto, Akito Kaga …

Frontiers in Plant Science 14 2023年7月5日査読有り責任著者
DeepCGP: A Deep Learning Method to Compress Genome-Wide Polymorphisms for Predicting Phenotype of Rice

Tanzila Islam, Chyon Hae Kim, Hiroyoshi Iwata, Hiroyuki Shimono, Akio Kimura

IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 20(3) 2078-2088 2023年5月1日査読有り

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MISC

107

複数形質の改良を目的とした遺伝特性の異なる家系間交配の最適化

木下青, 櫻井建吾, 濱崎甲資, 津坂宜宏, 櫻井美希, 白澤健太, 磯部祥子, 岩田洋佳

育種学研究 26 2024年
ゲノムや画像情報を利用した効率的な果樹育種法の開発:リンゴとカンキツを例に

南川舞, 國久美由紀, 森谷茂樹, 森谷茂樹, 野中圭介, 清水徳朗, 稲森稔, 岩田洋佳

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年
断片的な時系列測定からの成長曲線を推定する:カンキツの成長評価への応用

木村奏, 南川舞, 野中圭介, 清水徳朗, 岩田洋佳

育種学研究 26 2024年
植物育種における後代分離を考慮した新規交配戦略の考案

櫻井建吾, 濱崎甲資, 稲森稔, 加賀秋人, 岩田洋佳

育種学研究 26 2024年
ダイズにおける遺伝子情報を用いた発育予測モデルの汎用性及び精度にモデル構築に用いる品種群,遺伝子セットと回帰手法の違いが及ぼす影響

森崇, 西村和紗, 中野聡史, 小梶裕之, 元木航, 熊谷悦史, 加賀秋人, 岩田洋佳, 岩橋優, 長坂京香 …

育種学研究 26 2024年
農作物のホロゲノム育種(第1回)作物と微生物叢を同時改良するためのホロゲノム選抜—Hologenome crop breeding : Hologenomic selection for simultaneous improvement of crops and crop microbiome

岩田洋佳

アグリバイオ = Agricultural biotechnology 7(2) 133-137 2023年2月
ソルガムの閉花受粉形質を制御する遺伝子座の同定

牧野葵, 石森元幸, 山崎清志, 藤原徹, 岩田洋佳, 堤伸浩, 高梨秀樹

育種学研究 25 2023年
ダイズコアコレクションにおける二次通気組織形成の多様性

鈴村廉, 後藤万里奈, 加賀秋人, 岩田洋佳, 縣歩美, 中園幹生, 高橋宏和

育種学研究 25 2023年
バッチベイズ最適化を用いた遺伝子型と環境の最適組合せの探索

望月秀斗, 濱崎甲資, 佐藤睦志, 阿部陽, KIM C., KIM C., 下野裕之, 岩田洋佳

育種学研究 25 2023年
コムギNAM集団の茎立ち期におけるUAVによるハイスループットフェノタイピングおよびUAVから得られた形質と収量関連形質との関連

吉岡俊輔, 黒木健, 黒木健, 新田みゆき, NIE J., 石井昌範, 角井宏行, 岡田萌子, 岡田萌子, 岡田萌子 …

育種学研究 25 2023年
ゲノミック予測の精度が育種計画に及ぼす影響の評価とその低減に向けて

濱崎甲資, 岩田洋佳, 津田宏治, 津田宏治

育種学研究 25 2023年
ダイズにおける開花関連遺伝子の探索とそれら遺伝子情報に基づいた発育予測モデルの構築

森崇, 西村和紗, 中野聡史, 小梶裕之, 元木航, 熊谷悦史, 加賀秋人, 岩田洋佳, 岩橋優, 長坂京香 …

育種学研究 25 2023年
ソルガムの苞穎長・苞穎の硬さ・閉花受粉形質を同時に制御する遺伝子座の同定

牧野葵, 石森元幸, 山崎清志, 藤原徹, 岩田洋佳, 堤伸浩, 高梨秀樹

育種学研究 25 2023年
グラフ理論と隠れマルコフモデルによるマーカー遺伝子型データの補完と修正アルゴリズムの開発

稲森稔, 南川舞, 南川舞, 清水徳朗, 國久美由紀, 野中圭介, 森谷茂樹, 阿部和幸, 岩田洋佳

育種学研究 25 2023年
タバコ高品質リファレンスゲノムの構築と低ニコチン性に関わる自然変異同定への応用

宇田川久史, 竹内貴規, 真籠洋, 新井雅雄, 小峠雄輝, 小松知之, 佐藤正紀, 岩田洋佳, 高倉由光

育種学研究 25 2023年
農学における生物統計学- 農業データ解析のルーツから見ていく現代の農学と統計学 -

三中信宏, 岩田洋佳, 伊達康博, Cao Wei, Habaragamuwa Harshana, 桂樹哲雄, 小林暁雄, 山中武彦, 櫻井玄

計量生物学 44(1) 2023年
カラマツの成長とフェノロジーのリモートセンシング計測法の開発

佐野春香, 海野大和, 郭威, 三浦直子, 楠和隆, 岩田洋佳

日本森林学会大会学術講演集 134th 2023年
家系間交配による遺伝的多様性の拡がりの推定

木下青, 櫻井建吾, 濱崎甲資, 津坂宜宏, 櫻井美希, 黒沢輝枝, 白澤健太, 磯部祥子, 岩田洋佳

育種学研究 25 2023年
GS,GWAS,交配シミュレーションのためのインタラクティブなデータ駆動型育種プラットフォーム(DDB)

本田潔, DIOT J., 本多周平, PINEDA J., JENNINGS J., 岩田洋佳, 磯部祥子, 南川舞, 南川舞

育種学研究 25 2023年
非線形成長モデルに基づくUAVリモートセンシングデータと手計測データの融合

福本勇太, CHEN T., CHEN T., 戸田悠介, 大森良弘, 山崎裕司, 高橋宏和, 高梨秀樹, 津田麻衣, 平井優美 …

育種学研究 25 2023年

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書籍等出版物

Statistical Methods for the Quantitative Genetic Analysis of High-Throughput Phenotyping Data.

Gota Morota, Diego Jarquin, Malachy T Campbell, Hiroyoshi Iwata

2022年査読有り
ここまで進んだ!飛躍する農学

日本農学会, 北岡, 本光, 瀬筒, 秀樹, 能木, 雅也, 杉山, 純一, 広田, 知良, 南沢, 究, 柏崎, 直巳, 岩田, 洋佳, 平藤, 雅之, 三輪, 睿太郎, 会田, 勝美

養賢堂 2015年4月 (ISBN: 9784842505343)

担当経験のある科目(授業)

2022年 - 現在

農学部植物生産科学特別講義 (京都大学)
2022年 - 現在

Application of Biometrics and Biostatistics to Agricultural Science (東京大学)
2018年 - 現在

フィールドインフォマティクス (東京大学)
2015年 - 現在

生物統計学 (東京大学)
2013年 - 現在

バイオスタティスティクス基礎論 (東京大学)
2010年 - 現在

生物測定学特論 (東京大学)
2010年 - 現在

バイオメトリックス (東京大学)
2019年 - 2023年

農学現象の数理科学的理解 (東京大学)
2021年 - 2022年

Theory and Practice for Advanced Statistics (東京大学)
2011年 - 2020年

農学部生物統計学 (東京農工大学)
2020年

全学自由研究ゼミナール「これからの農業の話をしよう」（前期教養課程） (東京大学)
2018年 - 2019年

エグゼクティブ・マネジメント・プログラム (東京大学)
2009年 - 2018年

統計研修 (国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構)
2015年 - 2016年

初年次ゼミナール「90億人の食を支えるための新品種とその創出技術について考える」（前期教養課程） (東京大学)
2011年 - 2014年

応用遺伝学入門（前期教養課程） (東京大学)
2011年 - 2014年

植物、昆虫、微生物の分子生物学（前期教養課程） (東京大学)
2010年 - 2012年

作物の科学（前期教養課程） (東京大学)
2003年 - 2007年

統計研修 (国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構)

所属学協会

2018年 - 現在

農業情報学会
2017年 - 現在

アメリカ作物学会
1995年 - 現在

日本育種学会
2016年 - 2024年

日本シミュレーション学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

植物生殖の鍵分子ネットワーク

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際先導研究) 国際共同研究加速基金(国際先導研究) 2022年12月 - 2029年3月

東山哲也, 土松隆志, 岩田洋佳, 河内孝之, 那須田周平, 工藤洋, 植田美那子, 大林武, 榊原恵子, 佐藤良勝
作物改良を駆動力に作物×微生物叢ホロビオントを機能向上させる新たな育種法の開発

JST ALCA-Next 作物改良を駆動力に作物×微生物叢ホロビオントを機能向上させる新たな育種法の開発 2023年10月 - 2027年3月

岩田洋佳
強化学習に基づく「先読み」を用いた小規模・高効率ゲノミック選抜法の開発と実装

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

岩田洋佳, 加賀秋人, 辻本壽
作物科学研究へのパラダイムシフトを誘起するカキ属植物の研究加速化のための基盤形成

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(開拓) 2020年4月 - 2025年3月

田尾龍太郎, 岩田洋佳, 赤木剛士, 西山総一郎, 山根久代
コロナ時代の新たな都市農業：ICTが拓く可能性とその社会インパクト

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

古田尚也, 岩田洋佳, 齋藤知明, 高瀬顕功
イネの野外ビッグデータを用いた「人工知能」による育種プラットフォームの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2019年4月 - 2022年3月

下野裕之, 岩田洋佳, 阿部陽, 金天海
作物と微生物叢を同時改良するホロゲノム選抜法の開発

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進未来社会創造事業探索加速型 2020年 - 2022年

岩田洋佳
植物環境応答のモデル化に基づく発展型ゲノミックセレクションシステムの開発

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 CREST 2016年 - 2021年

岩田洋佳
遺伝資源から有用遺伝変異を高効率に発見するための新しい方法論の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

岩田洋佳, 辻本壽
ダイズの耐湿性に関与する根形質の網羅的評価とゲノムワイド・アソシエーション解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2015年4月 - 2017年3月

望月俊宏, 岩田洋佳
環境適応型品種をデザインするための統合的モデル化手法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2013年4月 - 2016年3月

岩田洋佳, 長谷川利拡, 江花薫子, 山崎将紀, 中川博視, 林武司
GWASを用いた野生イネの生育、代謝形質と遺伝変異の相関解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2013年4月 - 2016年3月

倉田のり, 久保貴彦, 平井優美, 澤田有司, 岩田洋佳, 小野木章雄, 鐘ケ江弘美
北方針葉樹における標高適応に関わるフェノロジーの分子遺伝機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

後藤晋, 北村系子, 岩田洋佳, 上野真義, 久本洋子
高ヘテロ植物集団を活用した高速育種の実証研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2013年4月 - 2016年3月

田口和憲, 岩田洋佳
ゲノミックセレクションを活用した革新的作物育種システムの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2010年 - 2012年

岩田洋佳, 江花薫子, 林武司
スギ雄花着花量を制御する遺伝子の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2008年 - 2012年

伊原徳子, 岩田洋佳, 坪村美代子, 渡辺敦史, 河崎久男
作物生育モデルと遺伝モデルの連携による作物環境応答の生態遺伝的メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2007年 - 2009年

長谷川利拡, 中川博視, 望月俊宏, 岩田洋佳, 大澤良, 林武司, 二宮正士
フタバガキ科の系統地理学的研究と産地識別のための塩基配列データベースの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2006年 - 2009年

津村義彦, 上野真義, 谷尚樹, 戸丸信弘, 岩田洋佳, 岩田洋佳, 戸丸信弘, ALFRED E.Szmidt
他殖性ならびに自殖性植物集団における適応性関連遺伝子の挙動解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2004年 - 2007年

大澤良, 岩田洋佳
分散する不斉一な育種栽培試験データのグリッド技術による仮想統合・利用環境の創出

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2004年 - 2006年

二宮正士, 岩田洋佳, 法隆大輔, 渡邊朋也, 島田信二, 長谷川利拡

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岩田洋佳

基本情報

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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