奥田覚 (Satoru Okuda) - マイポータル

基本情報

所属: 金沢大学ナノ生命科学研究所准教授（Jr.PI）

学位: 博士（工学）(京都大学)

J-GLOBAL ID: 201601008741364144
researchmap会員ID: 7000018610

外部リンク: http://mechgen.jp

研究キーワード

研究分野

経歴

2019年4月 - 現在

金沢大学, ナノ生命科学研究所, 准教授（Jr. PI）
2016年10月 - 2020年3月

科学技術振興機構, さきがけ研究者
2016年4月 - 2018年3月

理化学研究所多細胞システム形成研究センター, 基礎科学特別研究員
2013年4月 - 2016年3月

理化学研究所多細胞システム形成研究センター, 研究員
2010年4月 - 2013年3月

日本学術振興会, 特別研究員 DC1

学歴

2010年4月 - 2013年3月

京都大学, 大学院工学研究科, マイクロエンジニアリング専攻
2008年4月 - 2010年3月

京都大学, 大学院工学研究科, 機械工学専攻
2004年4月 - 2008年3月

京都大学, 工学部, 物理工学科

受賞

2024年4月

令和6年度科学技術分野の文部科学大臣表彰若手科学者賞, 多細胞組織のアクティブな機械特性と力学動態に関する研究, 文部科学省

奥田覚
2022年11月

優秀研究賞, マイクロ構造体上での組織変形を記述する粒子ベース力学モデルの開発, 化学とマイクロ・ナノシステム学会

山下忠紘, 松澤諒介,松尾瑛,深町崇耶,Philip Kollmannsberger,須藤亮,奥田覚
2021年6月

瀬口賞, 日本機械学会バイオエンジニアリング部門

奥田覚
2020年4月

2019年度日本機械学会賞（論文）, 日本機械学会

奥田覚, 鵜木克幸, 永樂元次, 坪田健一
2020年3月

ライジングスター賞, さきがけ「統合1細胞解析のための革新的技術基盤」研究領域

奥田覚
2019年3月

2018 JBSE Papers of the Year, Bioengineering Division of Japan Society of Mechanical Engineers

Satoru Okuda, Katsuyuki Unoki, Mototsugu Eiraku, Ken-ichi Tsubota
2019年3月

2018 JBSE Graphics of the Year, Bioengineering Division of Japan Society of Mechanical Engineers

Satoru Okuda, Katsuyuki Unoki, Mototsugu Eiraku, Ken-ichi Tsubota
2018年6月

Young Scientist Award for Presentation, Joint annual meeting of JSDB 51st and JSCB 70th

奥田覚
2018年1月

Poster Award "Biology Prize", FY 2017 RIKEN SPDR & FPR Presentation of Research Results

奥田覚
2017年7月

Yamaguchi Medal, Asian-Pacific Association for Biomechanics

奥田覚
2017年4月

奨励賞（研究）, 日本機械学会

奥田覚

論文

Ex vivo SIM-AFM measurements reveal the spatial correlation of stiffness and molecular distributions in 3D living tissue

Itsuki Shioka, Ritsuko Morita, Rei Yagasaki, Duligengaowa Wuergezhen, Tadahiro Yamashita, Hironobu Fujiwara, Satoru Okuda

Acta Biomaterialia 2024年10月7日査読有り最終著者責任著者
Numerical assessment of the applicability of geometry-based force inference on homogeneous and heterogeneous cells

Shou Miyasaka, Keita Izumi, Satoru Okuda, Yuichiro Miki

PLOS ONE 19(4) e0299016-e0299016 2024年4月16日査読有り責任著者
Epithelial Folding Irreversibility is Controlled by Elastoplastic Transition via Mechanosensitive Actin Bracket Formation

Aki Teranishi, Misato Mori, Rihoko Ichiki, Satoshi Toda, Go Shioi, Satoru Okuda

bioRxiv 2023年12月20日
Machine learning-based estimation of spatial gene expression pattern during ESC-derived retinal organoid development

Yuki Fujimura, Itsuki Sakai, Itsuki Shioka, Nozomu Takata, Atsushi Hashimoto, Takuya Funatomi, Satoru Okuda

Scientific Reports 13(1) 22781 2023年12月20日査読有り責任著者
qMaLioffG: A single green fluorescent protein FLIM indicator enabling quantitative imaging of endogenous ATP

biRxiv 2023年8月31日
Multicellular dynamics on structured surfaces: Stress concentration is a key to controlling complex microtissue morphology on engineered scaffolds

Ryosuke Matsuzawa, Akira Matsuo, Shuya Fukamachi, Sho Shimada, Midori Takeuchi, Takuya Nishina, Philip Kollmannsberger, Ryo Sudo, Satoru Okuda, Tadahiro Yamashita

Acta Biomaterialia 166 301-316 2023年8月査読有り責任著者
Modelling contractile ring formation and division to daughter cells for simulating proliferative multicellular dynamics

Satoru Okuda, Tetsuya Hiraiwa

The European Physical Journal E 46(7) 2023年7月19日筆頭著者責任著者
Distinctive cellular and junctional dynamics independently regulate the rotation and elongation of the internal organ

Mikiko Inaki, Takamasa Higashi, Satoru Okuda, Kenji Matsuno

2023年5月22日
Long-term adherent cell dynamics emerging from energetic and frictional interactions at the interface

Satoru Okuda, Tetsuya Hiraiwa

Physical Review E 107(3) 2023年3月17日査読有り筆頭著者責任著者
Actin crosslinking by α-actinin averts viscous dissipation of myosin force transmission in stress fibers

Hiroki Katsuta, Satoru Okuda, Kazuaki Nagayama, Hiroaki Machiyama, Satoru Kidoaki, Masashi Kato, Masahiro Sokabe, Takaki Miyata, Hiroaki Hirata

iScience 26(3) 106090-106090 2023年3月査読有り
Continuum modeling of non-conservative fluid membrane for simulating long-term cell dynamics

Satoru Okuda, Katsuhiko Sato, Tetsuya Hiraiwa

The European Physical Journal E 45(8) 2022年8月査読有り筆頭著者責任著者
Src activation in lipid rafts confers epithelial cells with invasive potential to escape from apical extrusion during cell competition

Kentaro Kajiwara, Ping-Kuan Chen, Yuichi Abe, Satoru Okuda, Shunsuke Kon, Jun Adachi, Takeshi Tomonaga, Yasuyuki Fujita, Masato Okada

32(16) 3460-3476.e6 2022年8月査読有り
Polarized interfacial tension induces collective migration of cells, as a cluster, in a 3D tissue

Satoru Okuda, Katsuhiko Sato

Biophysical Journal 121(10) 1856-1867 2022年5月査読有り筆頭著者責任著者
Intestinal and optic-cup organoids as tools for unveiling mechanics of self-organizing morphogenesis

Sristilekha Nath, Satoshi Toda, Satoru Okuda

Biophysics and Physicobiology 19 n/a-n/a 2022年査読有り招待有り最終著者責任著者
Nano-scale physical properties characteristic to metastatic intestinal cancer cells identified by high-speed scanning ion conductance microscope

Dong Wang, Linhao Sun, Satoru Okuda, Daisuke Yamamoto, Mizuho Nakayama, Hiroko Oshima, Hideyuki Saito, Yuta Kouyama, Koshi Mimori, Toshio Ando …

Biomaterials 280 121256-121256 2021年11月査読有り
Marcksl1 modulates endothelial cell mechanoresponse to haemodynamic forces to control blood vessel shape and size

Igor Kondrychyn, Douglas J. Kelly, Núria Taberner Carretero, Akane Nomori, Kagayaki Kato, Jeronica Chong, Hiroyuki Nakajima, Satoru Okuda, Naoki Mochizuki, Li-Kun Phng

Nature Communications 11(1) 5476-5476 2020年12月査読有り
A Mechanical Instability in Planar Epithelial Monolayers Leads to Cell Extrusion

Satoru Okuda, Koichi Fujimoto

Biophysical Journal 118(10) 2549-2560 2020年4月査読有り筆頭著者責任著者
自己組織化によるオルガノイドの形作りと力学

奥田覚

生物物理 60(1) 2020年査読有り
Apical junctional fluctuations lead to cell flow while maintaining epithelial integrity

SatoruOkuda, ErinaKuranaga, Katsuhiko Sato

Biophysical Journal 116(6) 1159-1170 2019年3月査読有り筆頭著者責任著者
Strain-triggered mechanical feedback in self-organizing optic-cup morphogenesis.

S Okuda, N Takata, Y Hasegawa, M Kawada, Y Inoue, T Adachi, Y Sasai, M Eiraku

Science advances 4(11) eaau1354 2018年11月査読有り筆頭著者責任著者

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MISC

オルガノイドの形態形成シミュレーション

奥田覚

実験医学増刊 42(5) 124-129 2024年3月筆頭著者
脳構築における層構造形成の力学制御機構

奥田覚

Brain Science Review 2022 2022年4月筆頭著者
細胞競合の力学的理解

坪井有寿, 奥田覚, 藤本仰一

医学のあゆみ 274(5) 537-543 2020年8月
１細胞統合モデルによる多細胞組織の形態予測,

奥田覚

生体の科学 70(4) 2019年
組織・器官の形成過程における細胞変形の原理とモデル化

奥田覚

病理と臨床 37(7) 2019年
三次元バーテックスモデルによる物理シミュレーションとオルガノイドへの応用

奥田覚

実験医学別冊決定版オルガノイド実験スタンダード 2019年
眼杯オルガノイド×Computational Biologyーin vitroとin silicoの相補的アプローチ

奥田覚

実験医学 35(16) 2683-2688 2017年
器官をつくる―in vitro眼杯形成モデルと力学シミュレーションによる変形メカニズムの検証

奥田覚, 永楽元次

実験医学 33(3) 405-410 2015年
多細胞のダイナミクスに基づいた3次元組織形成シミュレーション

奥田覚, 井上康博, 安達泰治

MOOK別冊「細胞の3次元組織化に不可欠な最先端材料技術―再生医療，その支援分野（細胞研究，創薬研究）への応用と発展のために」第4章4項2節 2014年

講演・口頭発表等

脊椎動物胚における相同な管腔構造の種間で異なる成長の力学

黒田春也, 奥田覚

日本動物学会第95回長崎大会 2024年9月14日
形の記憶：器官形成に必須な組織の機械特性

奥田覚

NEURO2024 2024年7月25日招待有り
Diverged growth mechanisms in conserved otic vesicles: A mechanical perspective

Shunya Kuroda, Satoru Okuda

57th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists 2024年6月22日
Elastoplastic transition in epithelial folding controlled by actin bracket formation as a basis for the unidirectionality of morphogenesis

Aki Teranishi, Satoru Okuda

57th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists 2024年6月19日
Exploring the mechanism of optic vesicle evagination in mouse ES cell-derived retinal organoids

Sristilekha Nath, Satoru Okuda

57th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists 2024年6月19日
3D-AFM visualization of intracellular structures and their stiffness in dendritic spine

Rei Yagasaki, Keisuke Miyazawa, Mineko Kengaku, Takeshi Fukuma, Satoru Okuda

57th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists 2024年6月19日
3D-AFM visualization of intracellular structures and their stiffness in dendritic spine

Rei Yagasaki, Keisuke Miyazawa, Mineko Kengaku, Takeshi Fukuma, Satoru Okuda

International Symposium on Mechanical control of biological self-organization 2024年6月17日
Epithelial Stratification: A Crystallization Analog Driven by 3D Form Instability

Shuya Fukamachi, Razib Datta Shubhra, Rei Yagasaki, Satoru Okuda

International Symposium on Mechanical control of biological self-organization 2024年6月17日
Elastoplastic transition in epithelial folding controlled by actin bracket formation as a basis for the unidirectionality of morphogenesis

Aki Teranishi, Satoru Okuda

International Symposium on Mechanical control of biological self-organization 2024年6月17日
A phase separation driven by cell polarity

Ryunosuke Karimata, Satoru Okuda

International Symposium on Mechanical control of biological self-organization 2024年6月17日
Epithelial Folding Irreversibility is Controlled by Elastoplastic Transition via Mechanosensitive Actin Bracket Formation

Satoru Okuda

International Symposium on Mechanical control of biological self-organization 2024年6月17日招待有り
器官形成における多細胞のアクティブな物性制御とその役割

奥田覚

物性談話会 2024年5月20日招待有り
細胞の運動性の違いが駆動する新しいクラスの相分離

狩俣龍之介, 奥田覚

第36回バイオエンジニアリング講演会 2024年5月12日
多細胞の3D構造不安定性によって駆動される上⽪の多層化：結晶化現象に基づいた理解

深町崇耶, Razib Datta Shubhra, 奥田覚, 矢ヶ崎怜

第36回バイオエンジニアリング講演会 2024年5月12日
不可逆的な変形を引き起こす上⽪組織の弾塑性転移とF-アクチン⾼次構造を介した分⼦制御機構

寺西亜生, 奥田覚

第36回バイオエンジニアリング講演会 2024年5月11日
3D-AFMによるシナプス内部の構造と⼒学特性の可視化

矢ヶ崎怜, 奥田覚

第36回バイオエンジニアリング講演会 2024年5月11日
Epithelial Folding Irreversibility is Controlled by Elastoplastic Transition via Mechanosensitive Actin Bracket Formation.

Satoru Okuda

3rd edition EMBL - IBEC Conference ENGINEERING MULTICELLULAR SYSTEMS 2024年4月24日招待有り
Epithelial folding irreversibility is controlled by elastoplastic transition via mechanosensitive actin bracket formation

Satoru Okuda

EMBO | EMBL Symposium The mechanics of life: from development to disease 2024年4月15日招待有り
Elasto-plasticity as a key regulator of the progress of morphogenesis

Satoru Okuda

Exploring Organoid Design with Microengineering 2024年2月6日招待有り
器官形成の一方向性を決める機械的因子

奥田覚

第2回日本神経化学会若手KYOUEN 2024年1月27日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

メカノケミカルフィードバックによる自律的秩序化原理の理論展開

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 学術変革領域研究(A) 2022年6月 - 2027年3月

柴田達夫, 奥田覚
ＥＣＭが弾性を介して神経可塑性を制御する機構：新規ＡＦＭによる脳内の網羅計測

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2026年3月

奥田覚
３Ｄ力学動態モデリングによる細胞競合現象の理論的な理解

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2026年3月

奥田覚
核内の粘弾的特性がNanogの転写調節領域の空間的ゆらぎを制御する

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

岡本和子, 奥田覚
タンパク工学を用いた老化におけるシナプス周囲コラーゲンの役割の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2021年10月 - 2025年3月

長井淳, 早野元詞, 奥田覚
立体組織の形成過程を最適化するモデルベース培養法の開発

国立研究開発法人日本医療研究開発機構再生医療実現拠点ネットワークプログラム 2021年4月 - 2024年3月

奥田覚
力学場と生化学場の相互作用の計測・操作と予測

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 CREST 2019年 - 2024年

今吉格
三次元多細胞組織のアクティブな機械特性とその適応的な制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2021年4月 - 2023年3月

奥田覚, 岡本和子
器官形成において細胞が生じる力の動的ゆらぎ特性とその材料力学的な役割

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2020年7月 - 2022年3月

奥田覚
網膜オルガノイド形成におけるアクチン細胞骨格の動的ゆらぎ特性とその役割の解明

ノバルティス科学振興財団ノバルティス研究奨励金 2020年4月 - 2021年3月

奥田覚
脳構築における層構造形成の力学制御機構

ブレインサイエンス振興財団研究助成 2020年4月 - 2021年3月

奥田覚
器官形成における細胞骨格の動的ゆらぎ特性とその役割

上原記念生命科学財団研究奨励金 2020年4月 - 2021年3月

奥田覚
脳発生の数理モデリング：細胞分化・増殖の時間制御から空間構築への変換機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年4月 - 2021年3月

奥田覚
上皮細胞の集団運動: 形態形成の基礎メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

佐藤勝彦, 梅津大輝, 奥田覚
１細胞動態の統合モデリングによる三次元組織形成の予測制御

科学技術振興機構戦略的創造研究推進事業さきがけ 2016年10月 - 2020年3月

奥田覚
立体イメージベースモデリングによる眼杯組織の動力学場推定

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2015年4月 - 2017年3月

奥田覚
上皮組織形成における細胞極性化の動力学シミュレーション

日本科学協会笹川科学研究助成 2015年4月 - 2016年3月

奥田覚
器官形成における三次元多細胞力学場の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援研究活動スタート支援 2013年8月 - 2015年3月

奥田覚
溶融高分子の内部において分子鎖が形成するからみあい構造のダイナミクス解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2010年 - 2012年

奥田覚

産業財産権

特願2023-088762 細胞品質評価装置、細胞品質評価方法およびプログラム

宮坂翔, 三木裕一朗, 和泉啓太, 奥田覚
WO2017-090741 細胞塊に関する領域検出方法及び領域検出装置

奥田覚, 永樂元次, 桑原篤

奥田覚

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MISC

講演・口頭発表等

所属学協会

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