中山卓郎 (Takuro NAKAYAMA) - マイポータル

基本情報

所属: 筑波大学計算科学研究センター助教

J-GLOBAL ID: 201701006627511620
researchmap会員ID: 7000019169

外部リンク: https://www.u.tsukuba.ac.jp/~nakayama.takuro.gb/

研究分野

ライフサイエンス / 進化生物学 /

経歴

2021年4月 - 現在

筑波大学, 計算科学研究センター, 助教
2016年11月 - 2021年3月

東北大学, データ科学国際共同大学院, 助教
2016年11月 - 2021年3月

東北大学, 生命科学研究科, 助教
2013年6月 - 2016年10月

筑波大学, 計算科学研究センター, 研究員
2011年6月 - 2013年6月

ダルハウジー大学, 日本学術振興会海外特別研究員
2010年4月 - 2011年6月

国立環境研究所, NIESポスドクフェロー
2007年4月 - 2010年3月

日本学術振興会特別研究員 DC1

受賞

主要な論文

Dinoflagellates with relic endosymbiont nuclei as models for elucidating organellogenesis

Chihiro Sarai, Goro Tanifuji, Takuro Nakayama, Ryoma Kamikawa, Kazuya Takahashi, Euki Yazaki, Eriko Matsuo, Hideaki Miyashita, Ken-ichro Ishida, Mitsunori Iwataki …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117(10) 2020年2月査読有り筆頭著者
Single-cell genomics unveiled a cryptic cyanobacterial lineage with a worldwide distribution hidden by a dinoflagellate host

Takuro Nakayama, Mami Nomura, Yoshihito Takano, Goro Tanifuji, Kogiku Shiba, Kazuo Inaba, Yuji Inagaki, Masakado Kawata

Proceedings of the National Academy of Sciences 116(32) 15973-15978 2019年6月24日査読有り筆頭著者責任著者
Genomic divergence within non-photosynthetic cyanobacterial endosymbionts in rhopalodiacean diatoms

Takuro Nakayama, Yuji Inagaki

SCIENTIFIC REPORTS 7 13075 2017年10月査読有り筆頭著者責任著者
Complete genome of a nonphotosynthetic cyanobacterium in a diatom reveals recent adaptations to an intracellular lifestyle

Takuro Nakayama, Ryoma Kamikawa, Goro Tanifuji, Yuichiro Kashiyama, Naohiko Ohkouchi, John M. Archibald, Yuji Inagaki

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 111(31) 11407-11412 2014年8月査読有り筆頭著者責任著者
Algal genomes reveal evolutionary mosaicism and the fate of nucleomorphs

Bruce A. Curtis, Goro Tanifuji, Fabien Burki, Ansgar Gruber, Manuel Irimia, Shinichiro Maruyama, Maria C. Arias, Steven G. Ball, Gillian H. Gile, Yoshihisa Hirakawa …

NATURE 492(7427) 59-65 2012年12月査読有り
Evolving a photosynthetic organelle

Takuro Nakayama, John M. Archibald

BMC BIOLOGY 10 35 2012年4月査読有り筆頭著者
Another acquisition of a primary photosynthetic organelle is underway in Paulinella chromatophora

Takuro Nakayama, Ken-ichiro Ishida

CURRENT BIOLOGY 19(7) R284-R285 2009年4月査読有り筆頭著者

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MISC

様々なヘテロ接合性レベルを持つゲノムで検証された実用的なアセンブリガイドライン

望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一

育種学研究 26 2024年
緑色渦鞭毛藻Lepidodinium chlorophorumにおけるヌクレオモルフゲノムの存在検証

中山卓郎, 稲垣祐司

藻類 70(1) 2022年
有殻アメーバ直伝,卵型シェルターの作り方

野村真未, 西上幸範, 市川正敏, 中山卓郎, 太田啓介, 中村桂一郎

日本植物生理学会年会(Web) 62nd 2021年
様々なヘテロ接合度の生物を用いたハプロイドセット構築のためのゲノムアセンブリ手法の評価

望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
珪藻のゲノム解析支援:Nitzschia sp.PL1-4株のゲノムアセンブリ

望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 矢倉勝, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一

日本植物生理学会年会(Web) 62nd 2021年
“Rappemonads” is the third lineage of Haptophyta

7th European Phycological Congress 2019年8月査読有り
一次共生型の光合成アメーバにおけるDNAウイルスを介した大規模遺伝子転移

松尾充啓, 潟端篤, 立川誠, 水口洋平, 野口英樹, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 鈴木穣, 佐藤壮一郎, 中山卓郎 …

日本植物生理学会年会(Web) 60th 2019年
ラピモナスとは何者か？

伊藤梓, 加山基, 野村真未, 中山卓郎, 宮下英明, 河地正伸, 神川龍馬

第2回日本共生生物学会 2018年11月
外洋性渦鞭毛藻Ornithocercus magnificusに見られる共生シアノバクテリアのゲノム解析

中山卓郎, 高野義人, 野村真未, 柴小菊, 稲葉一男, 谷藤吾朗, 河田雅圭, 稲垣祐司

藻類 66(1) 73 2018年3月10日
有殻アメーバPaulinellaのオルガネラ進化の話と被殻構築の話

野村真未, 中山卓郎

藻類 66(1) 2018年
セスジアカムカデ中のグレガリナ様寄生虫における非光合成性色素体

宮田凌佑, 松尾恵梨子, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 千頭康彦, 八畑謙介, 橋本哲男, 橋本哲男, 橋本哲男, 稲垣祐司 …

藻類 65(1) 2017年
有殻アメーバのゲノム解読による一次細胞内共生進化の初期プロセスの解析

松尾充啓, 潟端篤, 立川誠, 水口洋平, 野口英樹, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 鈴木穣, 中山卓郎, 神川龍馬 …

日本植物学会大会研究発表記録 81st 2017年
セスジアカムカデ消化管内寄生虫の網羅的mRNAデータに基づくアピコンプレクサの初期進化に関する一考察

宮田凌佑, 松尾恵梨子, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 千頭康彦, 八畑謙介, 稲垣祐司, 稲垣祐司

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 19th 2017年
シアノバクテリアと真核藻類の細胞統合 : 「窒素固定オルガネラ」へ続く道? (特集真核細胞の共生由来オルガネラ研究最前線 : 広がり続ける多様性と機能)

中山卓郎, 稲垣祐司

遺伝 : 生物の科学 70(2) 121-125 2016年3月
窒素固定シアノバクテリア共生体をもつ珪藻の核ゲノム解析:核コード共生体制御遺伝子の探索

中山卓郎, 稲垣祐司

日本植物学会大会研究発表記録 80th 2016年
窒素固定はじめました-Rhopalodia科珪藻に見る細胞内共生進化

中山卓郎, 神川龍馬, 谷藤吾朗, 稲垣祐司

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 18th 2016年
一次共生,二次共生に伴う藻類の細胞進化

石田健一郎, 塚越智夏, 中村篤史, 野村真未, 萩野恭子, 中山卓郎, 中山卓郎

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 18th 2016年
ヌクレオモルフをもつ2種の未記載渦鞭毛藻：「真核－真核型」細胞内共生を介した葉緑体成立過程を解き明かす新たなモデルとして.

皿井千裕, 谷藤吾朗, 中山卓郎, 神川龍馬, 高橋和也, 石田健一郎, 岩滝光儀, 稲垣祐司

日本進化学会第17回大会 17th 2015年8月
新奇緑色渦鞭毛藻鶴岡株・室蘭株の葉緑体ゲノム比較解析

森田幸之介, 谷藤吾朗, 中山卓郎, 神川龍馬, 皿井千裕, 高橋和也, 岩滝光儀, 稲垣祐司

日本藻類学会第39回大会 63(1) 2015年3月
山形県鶴岡産緑色渦鞭毛藻TRD132株の細胞内微細構造

皿井千裕, 高橋和也, 谷藤吾朗, 中山卓郎, 神川龍馬, 稲垣祐司, 石田健一郎, 岩滝光儀

日本藻類学会第39回大会 63(1) 2015年3月

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書籍等出版物

原生生物学事典

中山, 卓郎

朝倉書店 2023年5月 (ISBN: 4254171811)

講演・口頭発表等

真核生物におけるDNAポリメラーゼθの多様性とユーグレノゾア特異的ミトコンドリアDNAポリメラーゼPolIAの起源．

魏明哲, 磯貝龍邑, 原田亮, 矢﨑裕規, 中山卓郎, Ryan, Gawryluk, 稲垣, 祐司

第28回日本サンゴ礁学会・第9回日本共生生物学会合同大会
系統解析において座位ごとのアミノ酸組成をモデル化する手法(PMSF)に起因するバイアスの検証．

磯貝龍邑, 原田亮, 中山卓郎, 稲垣, 祐司

第28回日本サンゴ礁学会・第9回日本共生生物学会合同大会
メタモナダに近縁性が示唆された真核微生物2株のミトコンドリアゲノム解析．

松浦眞子, 磯貝龍邑, 原田亮, 白鳥峻志, 中山卓郎, 稲垣, 祐司

第28回日本サンゴ礁学会・第9回日本共生生物学会合同大会
緑色渦鞭毛藻TGD株のヌクレオモルフゲノムが示す二次共生ゲノム進化の新たなスナップショット

藤代彩花, 磯貝龍邑, 鈴木重勝, 高橋和也, 岩滝光儀, 稲垣, 祐司, 中山卓郎

日本植物学会第89回大会
Thermoproteota門古細菌におけるPCNA進化．

上西慧莉紗, 原田亮, 中山卓郎, 稲垣, 祐司

第37回Archaea研究会
tARP is an actin-related protein required for ciliary function that is conserved in ciliates and related eukaryotic groups.

Kagawa, Miku, Takuro, Nakayama, Shiba, Kogiku, Takako, Kato-Minoura, Matsuda, Shinya, Inaba, Kazuo, INAGAKI, Yuji, Kentaro, Nakano

第77回日本細胞生物学会・第58回日本発生生物学会合同大会
On the tree of Archaeplastida: The impact of rapidly evolving and heterotachious positions on nuclear and plastid phylogenomic inferences.

Isogai, Ryu, Harada, Ryo, Nakayama, Takuro, INAGAKI, Yuji

ICOP/ISEP2025
Nucleomorph genome of the dinoflagellate TGD reveals an early stage of genome reduction following secondary endosymbiosis.

Fujishiro, Ayaka, Isogai, Ryu, Suzuki, Shigekatsu, Takahashi, Kazuya, Iwataki, Mitsunori, INAGAKI, Yuji, Nakayama, Takuro

ICOP/ISEP2025
Recent plastid replacement in Karlodinium ballantinum (Kareniaceae, Dinoflagellata) challenges the paradigms of endosymbiotic gene transfer.

Maciszewski, Kacper, Takahashi, Kazuya, Harada, Ryo, Martinek, Inga, Nakayama, Takuro, Iwataki, Mitsunori, INAGAKI, Yuji, Hehenberger, Elisabeth

ICOP/ISOP2025
光合成をやめたシアノバクテリアのゲノム進化

中山, 卓郎

大隅基礎科学創成財団微生物機能探究コンソーシアムG4定例会招待有り
Hidden microbial diversity: Novel microbial lineages discovered in dinoflagellate symbioses

NAKAYAMA, Takuro

AIMEC Science Salon 招待有り
珪藻に共生する窒素固定シアノバクテリアと「ニトロプラスト」

中山, 卓郎

藍藻の分子生物学2024 招待有り
単細胞ゲノム増幅産物から発見された極小古細菌ゲノム．

原田亮, 西村祐貴, 野村真未, 矢吹彬憲, 稲垣, 祐司, 中山卓郎

日本微生物生態学会第37回大会
原生生物の核ゲノム転写物におけるRNA Editingの探索．

磯貝龍邑, 原田亮, 矢﨑裕規, 中山卓郎, 稲垣, 祐司, 矢吹彬憲

日本共生生物学会第8回大会
Metamonadaとの近縁性が示唆される好気性原生生物の系統分類学的研究．

白鳥峻志, 原田亮, 磯貝龍邑, 中山卓郎, 稲垣, 祐司

日本共生生物学会第8回大会
緑色渦鞭毛藻TGD株にみられるヌクレオモルフのゲノム解析ー既知ヌクレオモルフゲノムとの共通点・相違点を探るー

藤代彩花, 磯貝龍邑, 鈴木重勝, 高橋和也, 岩滝光儀, 稲垣, 祐司, 中山卓郎

日本共生生物学会第8回大会
光合成関連遺伝子に着目した緑色渦鞭毛藻TGD株のヌクレオモルフゲノムの解析．

藤代彩花, 磯貝龍邑, 高橋和也, 岩滝光儀, 稲垣, 祐司, 中山卓郎

日本藻類学会第48回大会
様々なヘテロ接合性レベルを持つゲノムで検証された実用的なアセンブリガイドライン

望月, 孝子, 坂本, 美佳, 谷澤, 靖洋, 中山, 卓郎, 谷藤, 吾朗, 神川, 龍馬, 中村, 保一

日本育種学会第145回講演会
様々なヘテロ接合性レベルを持つゲノムで検証された実用的なアセンブリガイドライン

望月, 孝子, 坂本, 美佳, 谷澤, 靖洋, 中山, 卓郎, 谷藤, 吾朗, 神川, 龍馬, 中村, 保一

第46回日本分子生物学会年会
一次植物内部系統関係におけるタクソンサンプリングの影響：紅藻類と灰色藻類のどちらが初期分岐系統なのか？

磯貝龍邑, 原田亮, 中山卓郎, 稲垣, 祐司

日本共生生物学会第7回大会

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所属学協会

日本植物学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

真核生物ゲノムデータに混入している原核共生体ゲノムの体系的探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2027年3月

稲垣祐司, 矢吹彬憲, 天笠俊之, 中山卓郎
極小ゲノムを持つ新奇古細菌系統の実態解明

財団法人発酵研究所一般研究助成 2025年4月 - 2027年3月

中山卓郎
二次共生の中間段階にある共生者ゲノムの解読

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(c)(一般） 2024年4月 - 2027年3月

中山卓郎
海洋微生物多様性の盲点―真核微生物に潜在する原核微生物叢の実態を探る

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2024年3月

中山卓郎
光合成補助色素フコキサンチンの未知なる生合成系の解明とその誕生の謎を紐解く

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2019年4月 - 2024年3月

神川龍馬
海洋原生生物に共生する細菌多様性の実態解明

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2018年10月 - 2023年3月

稲垣祐司
渦鞭毛藻細胞に見られるシアノバクテリア共生体の機能および進化の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

中山卓郎
ケルコゾア生物における“ミトコンドリア型解糖系”の理解に向けた基礎的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

中山卓郎, 矢吹彬憲, 白鳥峻志
細胞内共生を通じた新奇オルガネラ獲得:珪藻細胞に見られる窒素固定構造の進化解明

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援研究活動スタート支援 2010年 - 2011年

中山卓郎
Paulinella chromatophoraのシアネレに関する研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2007年 - 2009年

中山卓郎

中山卓郎

基本情報

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受賞

主要な論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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