田高周 (Shu Tadaka) - マイポータル

基本情報

所属: 東北大学東北メディカル・メガバンク機構ゲノム解析部門講師

学位: 博士 (情報科学)(東北大学大学院情報科学研究科)

J-GLOBAL ID: 201701019750076070
researchmap会員ID: 7000020966

外部リンク: http://www.sb.ecei.tohoku.ac.jp/lab/members/

研究分野

経歴

2023年10月 - 現在

東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構ゲノム解析部門, 講師
2017年4月 - 2023年9月

東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構ゲノム解析部門, 助教

論文

Returning genetic risk information for hereditary cancers to participants in a population-based cohort study in Japan.

Kinuko Ohneda, Yoichi Suzuki, Yohei Hamanaka, Shu Tadaka, Muneaki Shimada, Junko Hasegawa-Minato, Masanobu Takahashi, Nobuo Fuse, Fuji Nagami, Hiroshi Kawame …

Journal of human genetics 2025年1月17日
Next-generation sequencing analysis with a population-specific human reference genome.

Tomohisa Suzuki, Kota Ninomiya, Takamitsu Funayama, Yasunobu Okamura, Shu Tadaka, Kengo Kinoshita, Masayuki Yamamoto, Shigeo Kure, Atsuo Kikuchi, Gen Tamiya …

Genes & genetic systems 2024年10月28日
Functional significance of CYP2B6 gene rare allelic variants identified in Japanese individuals

Shuki Yamazaki, Eiji Hishinuma, Yuma Suzuki, Akiko Ueda, Caroline Kijogi, Tomoki Nakayoshi, Akifumi Oda, Sakae Saito, Shu Tadaka, Kengo Kinoshita …

Biochemical Pharmacology 116515-116515 2024年8月
Functional evaluation of novel variants of B4GALNT1 in a patient with hereditary spastic paraplegia and the general population

Kei-ichiro Inamori, Katsuya Nakamura, Fumi Shishido, Jia-Chen Hsu, Masakazu Nagafuku, Takahiro Nitta, Junji Ikeda, Hidekane Yoshimura, Minori Kodaira, Naomi Tsuchida …

Frontiers in Neuroscience 18 1437668-1437668 2024年7月31日査読有り
Identifying critical age and gender-based metabolomic shifts in a Japanese population of the Tohoku Medical Megabank cohort.

Miyuki Sakurai, Ikuko N Motoike, Eiji Hishinuma, Yuichi Aoki, Shu Tadaka, Mana Kogure, Masatsugu Orui, Mami Ishikuro, Taku Obara, Naoki Nakaya …

Scientific reports 14(1) 15681-15681 2024年7月8日
Two-stage strategy using denoising autoencoders for robust reference-free genotype imputation with missing input genotypes

Kaname Kojima, Shu Tadaka, Yasunobu Okamura, Kengo Kinoshita

Journal of Human Genetics 69(10) 511-518 2024年6月25日
Next-generation sequencing analysis with a population-specific human reference genome

Tomohisa Suzuki, Kota Ninomiya, Takamitsu Funayama, Yasunobu Okamura, Shu Tadaka, Kengo Kinoshita, Masayuki Yamamoto, Shigeo Kure, Atsuo Kikuchi, Gen Tamiya …

Genes & Genetic Systems 2024年
jMorp: Japanese Multi-Omics Reference Panel update report 2023.

Shu Tadaka, Junko Kawashima, Eiji Hishinuma, Sakae Saito, Yasunobu Okamura, Akihito Otsuki, Kaname Kojima, Shohei Komaki, Yuichi Aoki, Takanari Kanno …

Nucleic acids research 2023年11月1日
Functional Characterization of 29 Cytochrome P450 4F2 Variants Identified in a Population of 8,380 Japanese Subjects and Assessment of Arachidonic Acid ω-Hydroxylation.

Yu Sato, Eiji Hishinuma, Shuki Yamazaki, Akiko Ueda, Masaki Kumondai, Sakae Saito, Shu Tadaka, Kengo Kinoshita, Tomoki Nakayoshi, Akifumi Oda …

Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals 2023年9月29日
新生児臍帯血の網羅的エピゲノム解析による妊娠初期までの喫煙経験が次世代に及ぼす影響

美辺詩織, 小巻翔平, 大桃秀樹, 高嶋聰, 小野加奈子, 山崎弥生, 須藤洋一, 田高周, 水野聖士, 石黒真美 …

DOHaD研究 11(3) 37-37 2023年8月
Functional characterization of 12 dihydropyrimidinase allelic variants in Japanese individuals for the prediction of 5-fluorouracil treatment-related toxicity.

Eiji Hishinuma, Yoko Narita, Evelyn Marie Gutiérrez Rico, Akiko Ueda, Kai Obuchi, Yoshikazu Tanaka, Sakae Saito, Shu Tadaka, Kengo Kinoshita, Masamitsu Maekawa …

Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals 51(2) 165-173 2022年11月22日
遺伝・生活習慣が日本人の血中代謝プロファイルに与える影響の解析

小柴生造, 元池育子, 井上仁, 菱沼英史, 青木裕一, 櫻井美由紀, 佐藤允治, 七谷圭, 田高周, 城田松之 …

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 95回 1T17e-02 2022年11月
jMorp: Japanese Multi Omics Reference Panel

田高周, 菱沼英史, 井上仁, 青木裕一, 岡村容伸, 川嶋順子, 大槻晃史, 田口恵子, 菅野貴成, 元池育子 …

トーゴーの日2022 1 2022年10月5日
Pathological variants in genes associated with disorders of sex development and central causes of hypogonadism in a whole-genome reference panel of 8380 Japanese individuals.

Naomi Shiga, Yumi Yamaguchi-Kabata, Saori Igeta, Jun Yasuda, Shu Tadaka, Takamichi Minato, Zen Watanabe, Junko Kanno, Gen Tamiya, Nobuo Fuse …

Human genome variation 9(1) 34-34 2022年9月28日
Construction of a trio-based structural variation panel utilizing activated T lymphocytes and long-read sequencing technology.

Akihito Otsuki, Yasunobu Okamura, Noriko Ishida, Shu Tadaka, Jun Takayama, Kazuki Kumada, Junko Kawashima, Keiko Taguchi, Naoko Minegishi, Shinichi Kuriyama …

Communications biology 5(1) 991-991 2022年9月20日
A Pilot Study for Return of Individual Pharmacogenomic Results to Population-Based Cohort Study Participants.

Kinuko Ohneda, Masahiro Hiratsuka, Hiroshi Kawame, Fuji Nagami, Yoichi Suzuki, Kichiya Suzuki, Akira Uruno, Mika Sakurai-Yageta, Yohei Hamanaka, Makiko Taira …

JMA journal 5(2) 177-189 2022年4月15日査読有り
Importance of Rare DPYD Genetic Polymorphisms for 5-Fluorouracil Therapy in the Japanese Population.

Eiji Hishinuma, Yoko Narita, Kai Obuchi, Akiko Ueda, Sakae Saito, Shu Tadaka, Kengo Kinoshita, Masamitsu Maekawa, Nariyasu Mano, Noriyasu Hirasawa …

Frontiers in pharmacology 13 930470-930470 2022年
dbTMM: an integrated database of large-scale cohort, genome and clinical data for the Tohoku Medical Megabank Project.

Soichi Ogishima, Satoshi Nagaie, Satoshi Mizuno, Ryosuke Ishiwata, Keita Iida, Kazuro Shimokawa, Takako Takai-Igarashi, Naoki Nakamura, Sachiko Nagase, Tomohiro Nakamura …

Human genome variation 8(1) 44-44 2021年12月10日
Genetic loci for lung function in Japanese adults with adjustment for exhaled nitric oxide levels as airway inflammation indicator

Mitsuhiro Yamada, Ikuko N. Motoike, Kaname Kojima, Nobuo Fuse, Atsushi Hozawa, Shinichi Kuriyama, Fumiki Katsuoka, Shu Tadaka, Matsuyuki Shirota, Miyuki Sakurai …

Communications Biology 4(1) 2021年12月
代謝プロファイルに影響を与える遺伝要因の網羅的解析

小柴生造, 元池育子, 三枝大輔, 井上仁, 菱沼英史, 青木裕一, 田高周, 城田松之, 木下賢吾, 山本雅之

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 94回 [P-837] 2021年11月

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MISC

日本人8,380人の全ゲノム解析から同定された27種のCYP2E1バリアントの酵素機能変化解析

大森悠生, 菱沼英史, 菱沼英史, 上田昭子, 山崎柊紀, 鈴木祐眞, 佐藤裕, 仲吉朝希, 小田彰史, 斎藤さかえ …

日本薬学会年会要旨集(Web) 144th 2024年
日本人8,380人の全ゲノム解析から同定された27種のDPDバリアントの酵素機能変化解析

寺内健人, 菱沼英史, 菱沼英史, 上田昭子, 小渕開, 前川正充, 前川正充, 佐藤裕, 齋藤さかえ, 齋藤さかえ …

日本薬学会年会要旨集(Web) 144th 2024年
出生三世代コホートにおける7人家族のエピゲノム研究基盤構築

美辺詩織, 小巻翔平, 大桃秀樹, 高嶋聰, 小野加奈子, 山崎弥生, 須藤洋一, 田高周, 水野聖士, 石黒真美 …

日本抗加齢医学会総会プログラム・抄録集 23回 252-252 2023年6月
血中代謝プロファイルに遺伝・環境要因が与える影響の解析

小柴生造, 小柴生造, 元池育子, 元池育子, 菱沼英史, 菱沼英史, 青木裕一, 櫻井美由紀, 佐藤允治, 七谷圭 …

日本生化学会大会(Web) 96th 2023年
日本人8,380人の全ゲノム解析から同定されたCYP2B6レアバリアントの酵素機能変化解析

山崎柊紀, 菱沼英史, 菱沼英史, 上田昭子, 前川正充, 前川正充, 前川正充, 佐藤裕, 公文代將希, 眞野成康 …

日本薬学会年会要旨集(Web) 143rd 2023年
大規模ゲノム解析データを活用した日本人DPD活性予測パネルの構築

菱沼英史, 菱沼英史, 小渕開, 寺内健人, 上田昭子, 田高周, 齋藤さかえ, 前川正充, 木下賢吾, 平澤典保 …

日本薬学会東北支部大会講演要旨集 62nd 2023年
バイオバンク情報を活用した40種のCYP3A4バリアントにおける機能変化解析

平塚真弘, 平塚真弘, 平塚真弘, 平塚真弘, 公文代將希, 公文代將希, GUTIERREZ Evelyn, 菱沼英史, 菱沼英史, 上田昭子 …

日本人類遺伝学会大会(CD-ROM) 66th 2021年
代謝プロファイルに影響を与える遺伝要因の網羅的解析

小柴生造, 小柴生造, 小柴生造, 元池育子, 元池育子, 三枝大輔, 三枝大輔, 井上仁, 井上仁, 井上仁 …

日本生化学会大会(Web) 94th 2021年
日本人4776人の全ゲノム解析により同定された18種のCYP3A4遺伝子多型に由来するバリアント酵素の機能変化解析

公文代將希, GUTIERREZ Evelyn, 菱沼英史, 菱沼英史, 齋藤さかえ, 田高周, 木下賢吾, 前川正充, 前川正充, 三枝大輔 …

臨床薬理 51(Supplement) 2020年
大規模コホート研究におけるGC-MS/MSによるヒト血漿メタボローム解析

三枝大輔, 三枝大輔, 松川直美, 松川直美, 田高周, 田高周, 元池育子, 元池育子, 小柴生造, 小柴生造

日本プロテオーム学会誌(Web) 4(1) 2019年
ゲノム情報と連携した日本人多層オミックス参照パネルの意義

小柴生造, 小柴生造, 元池育子, 元池育子, 三枝大輔, 三枝大輔, 井上仁, 井上仁, 城田松之, 城田松之 …

糖尿病(Web) 61(Suppl) 2018年
Identification of functional modules in protein networks by near-clique detection

Shu Tadaka, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita

研究報告バイオ情報学（BIO） 2013(4) 1-2 2013年3月14日

書籍等出版物

バリアントデータ検索&活用 : 変異・多型情報を使いこなす達人レシピ

坊農, 秀雅

羊土社 2020年10月 (ISBN: 9784758122450)

所属学協会

日本バイオインフォマティクス学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

網膜層厚と遺伝環境因子による孤発性晩期発症型アルツハイマー病前臨床期診断法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

平良摩紀子, 布施昇男, 川崎良, 三木篤也, 小島要, 田高周
三世代男系由来Ｙ染色体パネル作成とその応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2018年4月 - 2021年3月

鈴木吉也, 黒木陽子, 立花眞仁, 勝岡史城, 田高周, 栗山進一, 長崎正朗