山口峻英 (Takahide Yamaguchi) - マイポータル

基本情報

所属: 茨城大学理工学研究科（理学野）化学領域助教

学位: 博士（理学）(茨城大学)
修士（理学）(茨城大学)

研究者番号: 80783456
J-GLOBAL ID: 201701017362955085
researchmap会員ID: 7000021031

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 / 生体関連化学

学歴

2013年 - 2016年

茨城大学, 理工学研究科, 応用粒子線科学専攻

論文

Second coordination sphere controls structural flexibility of blue copper protein: A basis for entatic state formation

Shota Hashimoto, Takahide Yamaguchi, Nao Ishikawa, Alice Klapproth, Kathleen Wood, Chie Shibazaki, Takashi Oda, Kazuhiko Yamasaki, Takamitsu Kohzuma

Journal of Inorganic Biochemistry 286 113469-113469 2027年1月査読有り責任著者
Revisiting the Oxidation State of [Cu(HIO ₆ ) ₂ ] ^5– : A Copper(III) Complex between Classical Werner-Type and Inverted Ligand Fields

Tomoyuki Takeyama, Reo Masui, Daisuke Shibata, Koji Mitamura, Fumito Tani, Takahide Yamaguchi, Tatsuo Yajima, Yuichi Shimazaki, Takehiro Ohta, Nobutsugu Hamamoto

Inorganic Chemistry 2026年4月7日査読有り
Effects of side-loop flexibility on the redox potential and stability of the blue copper protein, pseudoazurin

Aozora Sugai, Takahide Yamaguchi, Takamitsu Kohzuma

Bulletin of the Chemical Society of Japan 2026年2月4日査読有り責任著者
Enantioselective Adsorption of Laccase on Homocysteine-Modified Au(111) Single-Crystalline Electrodes for Oxygen Reduction

Sayuki Oka, Masaru Kato, Ryuto Ohashi, Hisayoshi Matsushima, Aozora Sugai, Takahide Yamaguchi, Shogo Hoshino, Ichizo Yagi

ACS Catalysis 18572-18579 2025年10月27日査読有り
Unraveling the unfolding mechanism of pseudoazurin: Insights into stabilizing cupredoxin fold as a common domain of Cu-containing proteins

Takahide Yamaguchi, Attila Taborosi, Kiyokazu Tsugane, Kathleen Wood, Andrew E. Whitten, Seiji Mori, Takamitsu Kohzuma

Journal of Inorganic Biochemistry 268 112907-112907 2025年7月査読有り筆頭著者責任著者
Systematic elucidation of the second coordination sphere effect on the structure and properties of a blue copper protein, pseudoazurin

Takahide Yamaguchi, Attila Taborosi, Chihiro Sakai, Kohei Akao, Seiji Mori, Takamitsu Kohzuma

https://doi.org/10.1016/j.jinorgbio.2023.112292 2023年5月15日査読有り筆頭著者
Syntheses, Characterizations, Crystal Structures, and Protonation Reactions of Dinitrogen Chromium Complexes Supported with Triamidoamine Ligands

Yoshiaki Kokubo, Kazuki Tsuzuki, Hikari Sugiura, Shunsuke Yomura, Yuko Wasada-Tsutsui, Tomohiro Ozawa, Sachiko Yanagisawa, Minoru Kubo, Tomoyuki Takeyama, Takahide Yamaguchi …

Inorganic Chemistry 62(14) 5320-5333 2023年3月27日査読有り
Effect of structural iron on nanoscroll formation via exfoliation of a high iron-content kaolin.

Balázs Zsirka, Katalin Győrfi, Takahide Yamaguchi, Attila Táborosi, Veronika Vágvölgyi, Clara Parameswary, Zoltán Homonnay, Ernő Kuzmann, Erzsébet Horváth & János Kristóf

2022年10月20日査読有り
Open-Bundle Structure as the Unfolding Intermediate of Cytochrome c′ Revealed by Small Angle Neutron Scattering

Takahide Yamaguchi, Kouhei Akao, Alexandros Koutsioubas, Henrich Frielinghaus, Takamitsu Kohzuma

Biomolecules 12(1) 2022年1月7日査読有り筆頭著者
2.85 and 2.99 Å resolution structures of 110 kDa nitrite reductase determined by 200 kV cryogenic electron microscopy

Naruhiko Adachi, Takahide Yamaguchi, Toshio Moriya, Masato Kawasaki, Kotaro Koiwai, Akira Shinoda, Yusuke Yamada, Fumiaki Yumoto, Takamitsu Kohzuma, ToshiyaSenda

Journal of Structural Biology 213(3) 107768-107768 2021年7月16日査読有り筆頭著者
Unusual Protein Stability of the Met16Leu Pseudoazurin Variant

Takahide Yamaguchi, Miyu Akatsu, Attila Taborosi, Takamitsu Kohzuma

Chemistry Letters 49(12) 1456-1458 2020年12月査読有り筆頭著者
Effect of Cavity Size of Mesoporous Silica on Type 1 Copper Site Geometry in Pseudoazurin

Akira Yamaguchi, Yurie Edanami, Takahide Yamaguchi, Yuuta Shibuya, Norihisa Fukaya, Takamitsu Kohzuma

Bulletin of the Chemical Society of Japan 2020年5月査読有り
The Role for the Weak Interaction on the Stabilization of Copper-Containing Complex: DFT Investigation of Noncovalent Interactions in Ternary-Cu(II) (DA)(AA) Complexes (DA = Diamine and AA = Amino Acids) as a Model of Metalloprotein

Attila Taborosi, Takahide Yamaguchi, Akira Odani, Osamu Yamauchi, Takamitsu Kohzuma

Bulletin of the Chemical Society of Japan 2019年11月査読有り
Computational Modelling Study on the Pseudoazurin Type 1 Cu Site

Attila Taborosi, Takahide Yamaguchi, Seiji Mori, Takamitsu Kohzuma

JPS Conference Proceedings, Proceedings of the 3rd International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University "Quantum Beam Science in Biology and Soft Materials (ISQBSS2018)" 2019年3月査読有り
Solution structure determination of a copper-containing nitrite reductase of achromobacter cycloclastes by small angle neutron scattering

Takahide Yamaguchi, Kathleen Wood, Attila Taborosi, Kouhei Akao, Takamitsu Kohzuma

Chemistry Letters 47(6) 751-752 2018年査読有り
Stabilization of protein structure through π-π interaction in the second coordination sphere of pseudoazurin

T. Yamaguchi, Y. Nihei, D.E. Sutherland, M.J. Stillman, T. Kohzuma

Protein Science 26(10) 1921-1931 2017年10月査読有り
The pH Dependent Protein Structure Transitions and Related Spin State Transition of Cytochrome c’ from Alcaligenes xylosoxidans NCIMB 11015

Akiko Takashina, Michael T. Tiedemann, Masaki Unno, Takahide Yamaguchi, Martin J. Stillman, Takamitsu Kohzuma

Bulletin of the Chemical Society of Japan 90(2) 169-177 2017年2月査読有り
SCCJ Café – Season 5 – 生命現象の分子科学 (3) 「量子ビーム • 軌道放射光 -X 線吸収分光法 -」

山口峻英, 高妻孝光

Journal of Computer Chemistry, Japan 15(4) A42-A46 2016年12月査読有り
X-ray crystallographic evidence for the simultaneous presence of axial and rhombic sites in cupredoxins: atomic resolution X-ray crystal structure analysis of pseudoazurin and DFT modelling

Takahide Yamaguchi, Kohei Akao, Akiko Takashina, Sayaka Asamura, Masaki Unno, Robert K. Szilagyi and Takamitsu Kohzuma

RSC Advances 6(91) 88358-88365 2016年9月査読有り筆頭著者
The Allosteric Regulation of Axial/Rhombic Population in a “Type 1” Copper Site: Multi-Edge X-ray Absorption Spectroscopic and Density Functional Studies of Pseudoazurin

Takahide Yamaguchi, Junko Yano, Vittal K. Yachandra, Yuko Nihei, Hiromi Togashi, Robert K. Szilagyi, Takamitsu Kohzuma

Bulletin of the Chemical Society of Japan 88(12) 1642-1652 2015年12月査読有り筆頭著者

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MISC

金属タンパク質の構造・電子状態を制御する外圏の弱い相互作用

高妻孝光, 山口峻英, 高階明子, 海野昌喜

茨城大学iFRC年報平成26年度 25 2015年9月
X-ray crystallographic structure analyses and characterization of a blue copper protein, pseudoazurin, Met16Ile variant

Kana Gunji, Takahide Yamaguchi, Akiko Takashina, Masaki Unno, Takamitsu Kohzuma

JOURNAL OF BIOLOGICAL INORGANIC CHEMISTRY 19 S834-S834 2014年8月
Geometry and electronic structures of axial/rhombic site in pseudoazurin Met16 variants: XAS and DFT investigations

Takahide Yamaguchi, Junko Yano, Vittal K. Yachandra, Robert K. Szilagyi, Takamitsu Kohzuma

JOURNAL OF BIOLOGICAL INORGANIC CHEMISTRY 19 S843-S843 2014年8月

書籍等出版物

クライオ電子顕微鏡ハンドブック

難波啓一、加藤貴之、牧野文信他 (担当:分担執筆, 範囲:脱窒菌由来の亜硝酸還元酵素の構造解析)

株式会社エヌ・ティー・エス 2023年1月 (ISBN: 9784860438043)

講演・口頭発表等

タイプⅠ銅近傍ループの柔軟性がシュウドアズリンの酸化還元電位と酸安定性に及ぼす効果

菅井碧宙, 山口峻英, 高妻孝光

第36回日本化学会関東支部茨城地区研究交流会 2025年12月13日
第二配位圏変異が乾燥・湿潤・溶液状態におけるシュウドアズリンの構造揺らぎと熱安定性に及ぼす効果

橋本将太, 山口峻英, 石川菜織, Alice Klapproth, Kathleen Wood, 柴崎千枝, 小田隆, 山崎和彦, 高妻孝光

第36回日本化学会関東支部茨城地区研究交流会 2025年12月13日
ジフラビン結合ジスルフィド酸化還元酵素の電子移動反応

小倉千紗都, 木村成伸, 山口峻英

第36回日本化学会関東支部茨城地区研究交流会 2025年12月13日
PGA analyses of hand-crafted silk fibers and the dyeing process in Tsumugi

Takahide Yamaguchi, Akinori Hoshikawa, Takahito Osawa, Masako Shinotsuka, Mutsuko Nakano, Takamitsu Kohzuma

10th International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University 2025年10月10日
第二配位圏がシュウドアズリンの構造ダイナミクスと熱安定性に与える影響

橋本将太, 山口峻英, Kathleen Wood, Alice Klapproth, 柴崎千枝, 小田隆, 高妻孝光

第61回熱測定討論会 2025年9月25日
ラッカーゼのアミノ酸修飾 Au(111)電極へのエナンチオ選択的吸着と酸素還元活性

加藤優, 岡紗雪, 大橋龍人, 松島永佳, 山口峻英, 菅井碧宙, 星野翔吾, 八木一三

日本表面真空学会東北・北海道支部令和6年度学術講演会 2025年3月
シュウドアズリンMet16Gly変異体の構造と性質

菅井碧宙, 山口峻英, 高妻孝光

第50回生体分子科学討論会 2024年6月22日
亜硝酸還元酵素Met56Phe変異体の性質

篠塚花音, 稲葉直人, 山口峻英, 高妻孝光

第50回生体分子科学討論会 2024年6月22日
中性子準弾性散乱によるシュウドアズリンMet16変異体のナノ・ピコ秒ダイナミクス解析

橋本将太, 山口峻英, Kathleen Wood, Alice Klapproth, 高妻孝光

第50回生体分子科学討論会 2024年6月22日
中性子小角散乱と MD 計算によるシュウドアズリン Met16 変異体の変性過程の解析

山口峻英, Taborosi Attil, 津金聖和, Wood Kathleen, Andrew Whitte, 森聖治, 高妻孝光

第50回生体分子科学討論会 2024年6月21日
ブルー銅タンパク質シュウドアズリンMet16X変異体を用いたタンパク質内弱い相互作用の系統的研究

高妻孝光、山口峻英、Taborosi Attila、森聖治

日本薬学会第143年会 2023年3月
Tuning of the Cu Site Properties and Protein Stability by the Noncovalent Interactions in Second Coordination Sphere of Pseudoazurin

Takahide Yamaguchi, Attila Taborosi, Wood Kathleen, Whitten Andrew, Seiji Mori, Takamitsu Kohzuma

10th Asian Biological Inorganic Chemistry (AsBIC10) 2022年11月
シュウドアズリンの構造安定性と変性に対する第二配位圏の効果

山口峻英・Taborosi Attila・津金聖和・Wood Kathleen・Whitten Andrew・高妻孝光

錯体化学会第72回討論会 2022年9月27日
クライオ電子顕微鏡による亜硝酸還元酵素のパッキングフリー構造解析

山口峻英, 安達成彦, 守屋俊夫, 川崎政夫, 小祝孝太郎, 篠田晃, 山田悠介, 湯本史明, 高妻孝光, 千田俊哉

第48回生体分子科学討論会 2022年6月30日
奥久慈産漆由来ラッカーゼとステラシアニンの小角X線散乱

菅井碧宙、中山綾乃、山口峻英、高妻孝光

第３１回金属の関与する生体関連反応シンポジウム 2022年6月18日
Effect of Noncovalent Weak Interaction in Pseudoazurin Met16Glu variant

第３１回金属の関与する生体関連反応シンポジウム 2022年6月18日
シュウドアズリンMet16X 変異体を用いたタンパク質における弱い相互作用の構造と機能の系統的理解

山口峻英、タボロシアティラ、森聖治、高妻孝光

第２２回日本蛋白質科学会年会 2022年6月8日
還元型Cytochrome c'のX線結晶構造解析

2021年度量子ビームサイエンスフェスタ 2022年3月9日
量子ビームによる絹の染色機構に関する研究

2021年度量子ビームサイエンスフェスタ 2022年3月8日
Alcaligenes xylosoxidans由来のAzurin IIの結晶構造解析

2021年度量子ビームサイエンスフェスタ 2022年3月8日

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所属学協会

2022年 - 現在

日本蛋白質科学会
2016年 - 現在

錯体化学会
日本化学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

酸素耐性化で拓く亜酸化窒素還元酵素の機能解明と環境応用への展望

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2026年4月 - 2029年3月

山口峻英
糖鎖を「捉え」、そして「切る」：抗体医薬品の活性を強化するレクチン-金属触媒融合型人工酵素の開発

公益財団法人天野工業技術研究所 2026年度研究助成（前期） 2026年4月 - 2027年3月
漆文化の科学的継承と文化財修復への応用に資する分子科学的研究

公益信託吉田学記念文化財科学研究助成基金 2025年 - 2027年
第二配位圏の合理的設計による酸素感受性金属酵素の安定化法開発

茨城大学令和６年度 Research Booster 2024年 - 2024年

山口峻英

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