竹中瑞樹 (Mizuki Takenaka) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学理学研究科准教授

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-3242-5092
J-GLOBAL ID: 201701016322198951
researchmap会員ID: 7000021262

外部リンク: https://sites.google.com/site/mizukitakenakassite/home

研究分野

ライフサイエンス / 植物分子、生理科学 /

経歴

2017年10月 - 現在

京都大学, 大学院理学研究科生物科学専攻, 准教授
2017年6月

ウルム大学、ドイツ, 代理教授
2011年11月

教皇庁立チリ・カトリック大学、チリ, 客員教授
2011年6月

ウルム大学、ドイツ, ハイゼンベルグ奨学金研究員
2007年5月

ウルム大学、ドイツ, グループリーダー
2005年5月

ウルム大学、ドイツ, 海外学振研究員
2001年5月

ウルム大学、ドイツ, ポスドク

論文

L3R-seq: A long-read 3’RACE approach for deep quantitative analysis of RNA processing

Akihito Mamiya, Mizuki Takenaka, Munetaka Sugiyama

2026年5月23日
The molecular basis and evolution of the organellar RNA editosome by complementary DYW deaminases in seed plants

Tenghua Wang, Mizuki Takenaka

Plant Physiology 2025年3月28日
PCIS1, Encoded by a Pentatricopeptide Protein Co-expressed Gene, Is Required for Splicing of Three Mitochondrial nad Transcripts in Angiosperms

Brody Frink, Matthias Burger, Maya Yarkoni, Sofia Shevtsov-Tal, Hagit Zer, Shohei Yamaoka, Oren Ostersetzer-Biran, Mizuki Takenaka

Plant And Cell Physiology 2024年10月3日
Multilayered Regulation of Plastids and Mitochondria

Shin-Ichi Arimura, Iris Finkemeier, Kristina Kühn, Mizuki Takenaka

Plant And Cell Physiology 2024年5月14日
The Gating Domain of MEF28 Is Essential for Editing Two Contiguous Cytidines in nad2 mRNA in Arabidopsis thaliana

Eszter Bayer-Császár, Anja Jörg, Barbara Härtel, Axel Brennicke, Mizuki Takenaka

Plant And Cell Physiology 2024年5月14日
植物オルガネラゲノム育種の可能性

桑原康介, 辻村真衣, 中里一星, 堤伸浩, 竹中瑞樹, 風間智彦

育種学研究 26(1) 61-66 2024年
DYW cytidine deaminase domains have a long‐range impact on RNA recognition by the PPR array of chimeric plant C‐to‐U RNA editing factors and strongly affect target selection

Yingying Yang, Bastian Oldenkott, Shyam Ramanathan, Elena Lesch, Mizuki Takenaka, Mareike Schallenberg‐Rüdinger, Volker Knoop

The Plant Journal 2023年11月
The MITOCHONDRIAL TRANSCRIPT STABILITY FACTOR 4 (MTSF4) is essential for the accumulation of dicistronic rpl5-cob mRNAs in Arabidopsis thaliana.

Lisa Jung, Sarah Schleicher, Fatema Alsaied Taha, Mizuki Takenaka, Stefan Binder

The Plant journal : for cell and molecular biology 113(2) 375-386 2023年1月
Structural insight into the activation of an Arabidopsis organellar C-to-U RNA editing enzyme by active site complementation.

Sachiko Toma-Fukai, Yuto Sawada, Ayako Maeda, Hikaru Shimizu, Toshiharu Shikanai, Mizuki Takenaka, Toshiyuki Shimizu

The Plant cell 2022年11月7日
DYW deaminase domain has a distinct preference for neighboring nucleotides of the target RNA editing sites.

Ayako Maeda, Sachi Takenaka, Tenghua Wang, Brody Frink, Toshiharu Shikanai, Mizuki Takenaka

The Plant journal : for cell and molecular biology 111(3) 756-767 2022年8月
Arabidopsis thalianaのミトコンドリアゲノムにおける標的塩基編集【JST機械翻訳】

ZHOU Chang, NAKAZATO Issei, TAMURA Yoshiko, TSUTSUMI Nobuhiro, TAKENAKA Mizuki, ARIMURA Shin-ichi

日本植物バイオテクノロジー学会大会講演要旨集(Web) 119(20) 2022年5月17日
DYW domain structures imply an unusual regulation principle in plant organellar RNA editing catalysis

Mizuki Takenaka, Sachi Takenaka, Tatjana Barthel, Brody Frink, Sascha Haag, Daniil Verbitskiy, Bastian Oldenkott, Mareike Schallenberg-Rüdinger, Christian G. Feiler, Manfred S. Weiss …

Nature Catalysis 2021年6月21日
A single nucleotide substitution in the coding region of Ogura male sterile gene, orf138, determines effectiveness of a fertility restorer gene, Rfo, in radish.

Mizuki Takenaka

Molecular genetics and genomics : MGG 2021年3月26日
The pentatricopeptide repeat protein PGR3 is required for the translation of petL and ndhG by binding their 5'UTRs.

Higashi H, Kato Y, Fujita T, Iwasaki S, Nakamura M, Nishimura Y, Takenaka M, Shikanai T

Plant & cell physiology 62(7) 1146-1155 2021年1月
One C-to-U RNA Editing Site and Two Independently Evolved Editing Factors: Testing Reciprocal Complementation with DYW-Type PPR Proteins from the Moss Physcomitrium (Physcomitrella) patens and the Flowering Plants Macadamia integrifolia and Arabidopsis

Bastian Oldenkott, Matthias Burger, Anke-Christiane Hein, Anja Jörg, Jennifer Senkler, Hans-Peter Braun, Volker Knoop, Mizuki Takenaka, Mareike Schallenberg-Rüdinger

The Plant Cell 32(9) 2997-3018 2020年9月
Mitochondrial Pentatricopeptide Repeat Protein, EMB2794, Plays a Pivotal Role in NADH Dehydrogenase Subunit nad2 mRNA Maturation in Arabidopsis thaliana.

Marchetti F, Cainzos M, Shevtsov S, Córdoba JP, Sultan LD, Brennicke A, Takenaka M, Pagnussat G, Ostersetzer-Biran O, Zabaleta E

Plant & cell physiology 61(6) 1080-1094 2020年6月
MEF46 and MEF47 are novel specificity factors for RNA editing sites in mitochondrial nad transcripts.

Brehme N, Glass F, Jörg A, Takenaka M

Mitochondrion 53 121-127 2020年5月
The Analysis of the Editing Defects in the dyw2 Mutant Provides New Clues for the Prediction of RNA Targets of Arabidopsis E+-Class PPR Proteins.

Malbert B, Burger M, Lopez-Obando M, Baudry K, Launay-Avon A, Härtel B, Verbitskiy D, Jörg A, Berthomé R, Lurin C …

Plants (Basel, Switzerland) 9(2) 2020年2月
Plant organellar RNA editing: what 30 years of research has revealed.

Small ID, Schallenberg-Rüdinger M, Takenaka M, Mireau H, Ostersetzer-Biran O

The Plant journal : for cell and molecular biology 2019年12月査読有り
RNA editing mutants as surrogates for mitochondrial SNP mutants.

Takenaka M, Jörg A, Burger M, Haag S

Plant physiology and biochemistry : PPB 135 310-321 2018年12月査読有り

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MISC

Arabidopsis thalianaにおけるatp9遺伝子の複数の転写開始部位の研究

JI Jingxiu, ZHOU Chang, TAKENAKA Sachi, ARIMURA Shin-ichi, TAKENAKA Mizuki

日本植物生理学会年会(Web) 66th 2025年
ペンタトリコペプチドタンパク質共発現遺伝子,PCIS1,は種子植物における3つのミトコンドリアnad転写物のスプライシングに含まれる

FRINK Brody, BURGER Matthias, YARKONI Maya, SHEVTSOV-TAL Sofi, ZER Hagit, YAMAOKA Shohei, OSTERSETZER-BIRAN Oren, TAKENAKA Mizuki

日本植物生理学会年会(Web) 66th 2025年
ミトコンドリア電子伝達系複合体IV COX2のRNA編集の重金属耐性における役割

YAMAZAKI Akiho, MISAWA Koki, SAWAI Riho, ASAHI Fumiaki, TAKENAKA Mizuki, NAKAZATO Issei, ARIMURA Shin-ichi, YOTSUI Izumi, TAJI Teruaki, SAKATA Yoichi

日本植物生理学会年会(Web) 66th 2025年
Triticum-Aegilops核細胞質置換系統におけるRf^multiと対応する細胞質雄性不稔遺伝子の単離にむけた取り組み

辻村真衣, 押川祐輝, 竹中瑞樹, 寺地徹, 竹中祥太朗

育種学研究 27 2025年
植物オルガネラゲノム育種の可能性—Prospects for organelle genome breeding—2023年第64回シンポジウム(シンポジウム・ワークショップ)報告

桑原康介, 辻村真衣, 中里一星, 堤伸浩, 竹中瑞樹, 風間智彦

育種学研究 = Breeding research : 日本育種学会和文誌 / 日本育種学会編 26(1) 61-66 2024年6月
ダイコンのオグラ型雄性不稔に対する新規稔性回復遺伝子(Rfs)における変異

山岸博, 福永明日美, 竹中瑞樹, 寺地徹

育種学研究 26 2024年
多くのPPRタンパク質と共発現パターンを示すPCIS1の翻訳産物は植物ミトコンドリアの三種類のnad遺伝子のスプライシングに必要である

FRINK Brody, BURGER Matthias, YARKONI Maya, SHEVTSOV-TAL Sofi, ZER Hagit, 山岡尚平, OSTERZETZER-BIRAN Oren, 竹中瑞樹

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年
mitoTALECDを用いたシロイヌナズナの重金属ストレスにおけるミトコンドリアRNA編集の役割解析

山崎明歩, 三沢昴輝, 澤井里歩, 旭文輝, 竹中瑞樹, 中里一星, 有村慎一, 四井いずみ, 太治輝昭, 坂田洋一

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 88th 2024年
植物オルガネラC-to-U RNA編集酵素DYW1の結晶構造解析

藤間祥子, 藤間祥子, 澤田優斗, 前田彩子, 清水光, 鹿内利治, 竹中瑞樹, 清水敏之

日本結晶学会年会講演要旨集 2023 2023年
植物オルガネラのRNA編集酵素が複合体形成によって活性化される機構

竹中瑞樹, 藤間祥子, BRODY Frink, WANG Tenghua, 竹中佐知, 鹿内利治, 清水敏之

日本植物生理学会年会(Web) 64th 2023年
シロイヌナズナの環境ストレス耐性におけるミトコンドリアRNA編集の役割

澤井里歩, 三沢昴輝, 旭文暉, 竹中瑞樹, 四井いずみ, 太治輝昭, 坂田洋一

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 87th 2023年
植物オルガネラRNA編集酵素の機能とその応用の可能性

竹中瑞樹

育種学研究 25 2023年
立体構造が示唆する植物オルガネラRNA編集酵素のユニークな活性制御

竹中瑞樹

日本生化学会大会(Web) 95th 2022年
植物オルガネラのRNA編集酵素について

竹中瑞樹, 前田彩子, 竹中佐知, WANG Tenghua, FRINK Brody

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 86th 2022年
ミトコンドリアゲノム標的一塩基置換法を用いたシロイヌナズナのRNA編集解析実験

中里一星, ZHOU C., 田村美子, 増田麗子, 堤伸浩, 竹中瑞樹, 有村慎一

育種学研究 24 2022年
ダイコンのオグラ型細胞質雄性不稔に対する新規稔性回復遺伝子(Rfs)の同定.1.背景およびRfsの位置

山岸博, 橋本絢子, 福永明日美, 竹中瑞樹, 寺地徹

育種学研究 24 2022年
ダイコンのオグラ型細胞質雄性不稔に対する新規稔性回復遺伝子(Rfs)の同定.2.RFSタンパクの構造と機能

寺地徹, 橋本絢子, 福永明日美, 竹中瑞樹, 山岸博

育種学研究 24 2022年
植物オルガネラC-to-U RNA編集酵素DYW-1の構造生物研究

藤間祥子, 藤間祥子, 澤田優斗, 前田彩子, 清水光, 鹿内利治, 竹中瑞樹, 清水敏之

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2021 2022年
植物オルガネラのC-to-U RNA編集酵素の構造が示すユニークな活性制御機構

竹中瑞樹, 竹中佐知, FRINK Brody, 前田彩子, WANG Tenghua, WEBER Gert

日本植物生理学会年会(Web) 63rd 2022年
シロイヌナズナのミトコンドリアゲノム標的一塩基置換技術を用いたRNA編集解析の試み

中里一星, ZHOU Chang, 田村美子, 増田麗子, 堤伸浩, 竹中瑞樹, 有村慎一

日本植物生理学会年会(Web) 63rd 2022年

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所属学協会

2023年10月 - 現在

日本ミトコンドリア学会
2023年9月 - 現在

日本育種学会
2022年9月 - 現在

日本植物学会
2022年6月 - 現在

日本生化学会
日本RNA学会
日本植物生理学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

細胞内共生オルガネラのゲノム制御：技術革新から生命現象の理解と応用へ

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2029年3月

有村慎一, 石原直忠, 竹中瑞樹, 鳥山欽哉, 松村浩由, 風間智彦, 庄司佳祐, 沼田圭司, 神吉智丈, 山田勇磨, 木内隆史, 高梨秀樹, 細川正人, 佐藤美由紀, 西村芳樹, 小笠原絵美, 矢守航
植物細胞質ゲノムの遺伝子発現制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2029年3月

竹中瑞樹
植物オルガネラのRNA編集複合体制御の分子基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2028年3月

竹中瑞樹
PPR「裏コード」を発見する

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2024年6月 - 2026年3月

竹中瑞樹
植物オルガネラRNA編集複合体の再構築とその構成タンパク質の機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2023年3月 - 2025年3月

竹中瑞樹
植物オルガネラRNA編集複合体の再構築とその構成タンパク質の機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2022年11月 - 2025年3月

竹中瑞樹, SCHATZ-DAAS DEBORAH MARIE
遺伝コード修復治療の研究-人為的RNA編集によるRNAの変異修復

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

塚原俊文
PPRタンパク質の細胞質内での機能探索

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2020年7月 - 2022年3月

竹中瑞樹
植物オルガネラのRNA編集複合体を再構築する

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2018年4月 - 2022年3月

竹中瑞樹

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