矢野亮一 (Yano Ryoichi) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基盤技術研究本部高度分析研究センターゲノム情報大規模解析ユニット上級研究員

学位: 博士（理学）(東京大学)

研究者番号: 00443044
J-GLOBAL ID: 201701014252618319
researchmap会員ID: 7000021627

モデル植物からダイズ、トマト、メロン等の農業作物まで幅広く植物の研究に携わってきました。現在は高速シークエンサー等を利用したゲノム・トランスクリプトーム情報解析とデータベース開発に取り組んでいます。ゲノムの多様化や個体の環境応答など、生き物の仕組みを分子レベルで根本から理解したり、予測することに興味がありますが、生物情報解析の技術を基盤として新しい品種育成や農業生産に貢献する道も模索しています。

研究キーワード

研究分野

経歴

2021年4月 - 現在

農研機構基盤技術研究本部高度分析研究センター上級研究員
2019年10月 - 2021年3月

農研機構高度解析センター上級研究員
2018年4月 - 2021年3月

筑波大学生命環境系助教（クロスアポイント併任）
2017年10月 - 2021年3月

科学技術振興機構さきがけ研究員（併任）
2018年4月 - 2019年9月

農研機構高度解析センター主任研究員
2014年12月 - 2018年3月

筑波大学生命環境系助教
2013年5月 - 2014年11月

農業生物資源研究所農業生物先端ゲノム研究センター特別研究員
2013年4月 - 2013年4月

理化学研究所環境資源科学研究センター研究員
2010年10月 - 2013年3月

理化学研究所植物科学研究センター研究員
2008年4月 - 2010年9月

理化学研究所植物科学研究センター特別研究員
2005年10月 - 2008年3月

理化学研究所植物科学研究センターリサーチアソシエイト

学歴

2002年4月 - 2005年9月

東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻博士課程
2000年4月 - 2002年3月

東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻修士課程
1998年4月 - 2000年3月

東京大学理学部生物学科
1996年4月 - 1998年3月

東京大学教養学部理科一類

委員歴

2022年9月 - 現在

Plant Biotechnology 編集委員
2018年7月 - 現在

植物インフォマティクス研究会運営委員
2015年3月 - 2021年3月

日本学術振興会産学協力研究委員会「植物分子デザイン第178委員会」委員

受賞

2018年8月

奨励賞日本植物細胞分子生物学会（現：日本植物バイオテクノロジー学会）

矢野亮一
2014年9月

Best Poster Award The 12th International Symposium on Cytochrome P450 Biodiversity and Biotechnology

Ryoichi Yano

論文

Effects of light quality, photoperiod, CO2 concentration, and air temperature on chlorogenic acid and rutin accumulation in young lettuce plants

Mirai Endo, Naoya Fukuda, Hideo Yoshida, Naomichi Fujiuchi, Ryoichi Yano, Miyako Kusano

Plant Physiology and Biochemistry 186(1) 290-298 2022年9月査読有り
Comparative genomics of muskmelon reveals a potential role for retrotransposons in the modification of gene expression

Ryoichi Yano, Tohru Ariizumi, Satoko Nonaka, Yoichi Kawazu, Silin Zhong, Lukas Mueller, James J. Giovannoni, Jocelyn K. C. Rose, Hiroshi Ezura

Communications Biology 3, Article number: 432 1-13 2020年8月査読有り筆頭著者責任著者
Multiplex exome sequencing reveals genome-wide frequency and distribution of mutations in the ‘Micro-Tom’ Targeting Induced Local Lesions in Genomes (TILLING) mutant library

Ryoichi Yano, Ken Hoshikawa, Yoshihiro Okabe, Ning Wang, Pham Thi Dung, Pulungan Sri Imriani, Hiroshi Shiba, Tohru Ariizumi, Hiroshi Ezura

Plant Biotechnology 36(4) 223-231 2019年12月25日査読有り招待有り筆頭著者
Loss-of-Function of a Tomato Receptor-Like Kinase Impairs Male Fertility and Induces Parthenocarpic Fruit Set

Hitomi Takei, Yoshihito Shinozaki, Ryoichi Yano, Sachiko Kashojiya, Michel Hernould, Christian Chevalier, Hiroshi Ezura, Tohru Ariizumi

Frontiers in Plant Science 10 2019年4月16日査読有り
Evidence of the functional role of the ethylene receptor genes SlETR4 and SlETR5 in ethylene signal transduction in tomato

Syariful Mubarok, Ken Hoshikawa, Yoshihiro Okabe, Ryoichi Yano, Matthew Duc Tri, Tohru Ariizumi, Hiroshi Ezura

Molecular Genetics and Genomics 294(2) 301-313 2019年4月査読有り
Genetic and functional characterization of Sg-4 glycosyltransferase involved in the formation of sugar chain structure at the C-3 position of soybean saponins

Kyoko Takagi*, Ryoichi Yano* (*co-1st author), Saeko Tochigi, Yukiko Fujisawa, Hiroki Tsuchinaga, Yuya Takahashi, Yoshitake Takada, Akito Kaga, Toyoaki Anai, Chigen Tsukamoto, Hikaru Seki, Toshiya Muranaka, Masao Ishimoto

Phytochemistry 156 96-105 2018年12月査読有り筆頭著者
SlLAX1 is Required for Normal Leaf Development Mediated by Balanced Adaxial and Abaxial Pavement Cell Growth in Tomato

Sri Imriani Pulungan, Ryoichi Yano, Yoshihiro Okabe, Takuji Ichino, Mikiko Kojima, Yumiko Takebayashi, Hitoshi Sakakibara, Tohru Ariizumi, Hiroshi Ezura

Plant and Cell Physiology 59(6) 1170-1186 2018年6月1日査読有り
An improved assembly and annotation of the melon (Cucumis melo L.) reference genome

Valentino Ruggieri, Konstantinos G. Alexiou, Jordi Morata, Jason Argyris, Marta Pujol, Ryoichi Yano, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura, David Latrasse, Adnane Boualem, Moussa Benhamed, Abdelhafid Bendahmane, Riccardo Aiese Cigliano, Walter Sanseverino, Pere Puigdomènech, Josep M. Casacuberta, Jordi Garcia-Mas

Scientific Reports 8 8088 2018年5月査読有り
Isolation and Characterization of the Soybean Sg-3 Gene that is Involved in Genetic Variation in Sugar Chain Composition at the C-3 Position in Soyasaponins

Ryoichi Yano, Kyoko Takagi, Saeko Tochigi, Yukiko Fujisawa, Yuhta Nomura, Hiroki Tsuchinaga, Yuya Takahashi, Yoshitake Takada, Akito Kaga, Toyoaki Anai, Chigen Tsukamoto, Hikaru Seki, Toshiya Muranaka, Masao Ishimoto

Plant and Cell Physiology 59(4) 797-810 2018年4月1日査読有り筆頭著者
Melonet-DB, A Grand RNA-seq Gene Expression Atlas in Melon (Cucumis melo L.)

Ryoichi Yano, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura

Plant and Cell Physiology 59(1) e4 2017年12月査読有り筆頭著者
Metabolic switching of astringent and beneficial triterpenoid saponins in soybean is achieved by a loss-of-function mutation in cytochrome P450 72A69

Ryoichi Yano, Kyoko Takagi, Yoshitake Takada, Kyosuke Mukaiyama, Chigen Tsukamoto, Takashi Sayama, Akito Kaga, Toyoaki Anai, Satoru Sawai, Kiyoshi Ohyama, Kazuki Saito, Masao Ishimoto

The Plant Journal 89(3) 527-539 2017年2月査読有り筆頭著者
NIN-like protein 8 is a master regulator of nitrate-promoted seed germination in Arabidopsis

Dawei Yan, Vanathy Easwaran, Vivian Chau, Masanori Okamoto, Matthew Ierullo, Mitsuhiro Kimura, Akira Endo, Ryoichi Yano, Asher Pasha, Yunchen Gong, Yong-Mei Bi, Nicolas Provart, David Guttman, Anne Krapp, Steven J. Rothstein, Eiji Nambara

Nature Communications 2016年10月査読有り
The Glycine maxcv. Enrei Genome for Improvement of Japanese Soybean Cultivars

Michihiko Shimomura, Hiroyuki Kanamori, Setsuko Komatsu, Nobukazu Namiki, Yoshiyuki Mukai, Kanako Kurita, Kaori Kamatsuki, Hiroshi Ikawa, Ryoichi Yano, Masao Ishimoto, Akito Kaga, kito Kaga, Yuichi Katayose

International Journal of Genomics 2015 1-8 2015年査読有り
Combining association mapping and transcriptomics identify HD2B histone deacetylase as a genetic factor associated with seed dormancy in Arabidopsis thaliana.

Ryoichi Yano, Yumiko Takebayashi, Eiji Nambara, Yuji Kamiya, Mitsunori Seo

The Plant Journal 74(5) 815-828 2013年3月査読有り筆頭著者責任著者
The Time Required for Dormancy Release in Arabidopsis Is Determined by DELAY OF GERMINATION1 Protein Levels in Freshly Harvested Seeds

Kazumi Nakabayashi, Melanie Bartsch, Yong Xiang, Emma Miatton, Silke Pellengahr, Ryoichi Yano, Mitsunori Seo, Wim J.J. Soppe

The Plant Cell 24(7) 2826-2838 2012年7月査読有り
Abscisic acid and the control of seed dormancy and germination.

Eiji Nambara, Masanori Okamoto, Kiyoshi Tatematsu, Ryoichi Yano, Mitsunori Seo, Yuji Kamiya

Seed Science Research 20(2) 55-66 2010年2月査読有り
Temporal Expression Patterns of Hormone Metabolism Genes during Imbibition of Arabidopsis thaliana Seeds: A Comparative Study on Dormant and Non-Dormant Accessions

Jeremy Preston, Kiyoshi Tatematsu, Yuri Kanno, Tokunori Hobo, Mitsuhiro Kimura, Yusuke Jikumaru, Ryoichi Yano, Yuji Kamiya, Eiji Nambara

Plant and Cell Physiology 50(10) 1786-1800 2009年10月査読有り
CHOTTO1, a Putative Double APETALA2 Repeat Transcription Factor, Is Involved in Abscisic Acid-Mediated Repression of Gibberellin Biosynthesis during Seed Germination in Arabidopsis.

Ryoichi Yano, Yuri Kanno, Yusuke Jikumaru, Kazumi Nakabayashi, Yuji Kamiya, Eiji Nambara

Plant Physiology 151(2) 641-654 2009年10月査読有り筆頭著者
CHOTTO1, a Double AP2 Domain Protein of Arabidopsis thaliana, Regulates Germination and Seedling Growth Under Excess Supply of Glucose and Nitrate

Kazutoshi Yamagishi, Kiyoshi Tatematsu, Ryoichi Yano, Jeremy Preston, Sayaka Kitamura, Hideki Takahashi, Peter McCourt, Yuji Kamiya, Eiji Nambara

Plant and Cell Physiology 50(2) 330-340 2009年2月査読有り
Molecular and genetic studies of sugar metabolism and freezing tolerance in Arabidopsis thaliana.

矢野亮一

東京大学 2005年9月査読有り筆頭著者

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MISC

高速DNAシークエンサーの技術進展と植物ゲノム研究

矢野亮一

日本植物バイオテクノロジー学会40周年記念誌 22 2021年7月招待有り筆頭著者
Nanopore-based comparative genomics sheds light on genetic diversification of muskmelon

Ryoichi Yano, Hiroshi Ezura

Nature Research Bioengineering Community, blog post (Behind the paper) 2020年8月招待有り筆頭著者

書籍等出版物

Plant Genetics and Genomics: Crops and Models, R. Grumet et al. (eds.), Genetics and Genomics of Cucurbitaceae

Ryoichi Yano, Hiroshi Ezura (担当:共著, 範囲:Fruit ripening in melon, pp.345-375)

Springer 2017年9月
種子の科学とバイオテクノロジー

矢野亮一, 南原英司 (担当:共著, 範囲:「休眠の生理」)

種子生理生化学研究会 2009年4月

講演・口頭発表等

ジャスモン酸によるトマトの着果制御機構の解析

野村悠華子, 陸宇, 榎元廣文, 原田圭一郎, 矢野亮一, 小嶋美紀子, 竹林裕美子, 榊原均, 江面浩, 有泉亨

日本育種学会第142回講演会 2022年9月
トマトの着果時における染色体構造変化

鈴木彪吾, 江面健太郎, 岡部佳弘, 矢野亮一, 白澤健太, 江面浩, 有泉亨

日本育種学会第142回講演会 2022年9月
GWAS によるダイズの粒大に関与する遺伝要因の検出ならびにRIL を用いた効果の検証

李鋒, 竹島亮馬, 加藤信, 矢野亮一, Shenton Matthew, 平賀勧, 加賀秋人, 羽鹿牧太, 石本政男

日本育種学会第142回講演会 2022年9月
メロン市販品種の大規模リシークエンス解析と複合病害抵抗性育種への活用の試み

矢野亮一, 下村晃一郎, 杉山充啓, 川頭洋一

日本育種学会第142回講演会 2022年9月
野菜品目（キュウリ・ナス）の全ゲノム解析

清古貴, 武藤千秋, 下村晃一郎, 宮武宏治, 加藤鎌司, 矢野亮一, 内藤健

育種学会第141回講演会 2022年3月
1-MCP処理がリンゴの香気プロファイルに及ぼす効果と品種間差異

田中福代, 矢野亮一, 増田甚八, 岡崎圭毅, 立木美保

園芸学会 2022年春季大会 2022年3月
Physiological analysis of the parthenocarpic mutant in tomato

Yukako Nomura, Yu Lu, Keiichiro Harada, Ryoichi Yano, Mikiko Kojima, Yumiko Takebayashi, Hitoshi Sakakibara, Hiroshi Ezura, Tohru Ariizumi

日本ナス科コンソーシアム (JSOL), 2022年度大会 2021年11月
Comparative genomics research of muskmelon using Nanopore sequencer

Ryoichi Yano

7th Asia-Pacific Agrobiological Genome Symposium (South Korea) 2021年11月招待有り
リンゴ品種のみつ入り特性と香気プロファイルおよび遺伝子発現の比較解析

田中福与, 岡﨑圭毅, 矢野亮一, 葛西智, 和田博史, 立木美保

園芸学会 2021年春季大会 2021年3月27日
アールスフェボリットメロンの全ゲノム解読と複数遺伝資源の比較ゲノム解析

矢野亮一, 有泉亨, 野中聡子, 川頭洋一, 江面浩

第139回育種学会 2021年3月20日
アールスフェボリット・マスクメロンの全ゲノム解読

矢野亮一

第221回農林交流センターワークショップ「次世代シーケンサーのデータ解析技術」 2019年9月24日招待有り
メロンのゲノム解析およびデータベース構築

矢野亮一

園芸学会ウリ科集会 2019年3月22日
Developing Genome and Transcriptome Information Database for Functional Genomics Research of Japanese Muskmelon

Yano, Ryoichi, Ariizumi, Tohru, Nonaka, Satoko, Ezura, Hiroshi

Cucurbitaceae2018 (UC-Davis, USA) 2018年11月
Pacbioを用いたマスクメロンの全ゲノム情報解読

矢野亮一

第134回日本育種学会ランチョンセミナー 2018年9月23日招待有り
メロンのゲノム情報解析データベース「Melonet-DB」

矢野亮一, 野中聡子, 江面浩

第59回日本植物生理学会データベース講習会 2018年3月29日
新規受容体様タンパク質 SPFF の機能欠損はトマトの単為結果を引き起こす

武井瞳, 篠崎良仁, 矢野亮一, Hernould, Michel, Chevalier, Christian, 江面浩, 有泉亨

日本育種学会第133回講演会 2018年3月
Loss-of function of SPFF, a novel receptor-like kinase, induces parthenocarpy in tomato

Takei, Hitomi, Shinozaki, Yoshihito, Yano, Ryoichi, Hernould, Michel, Chevalier, Christian, Ezura, Hiroshi, Ariizumi, Toru

Agri World 2018 (Paris, France) 2018年2月
The identification of parthenocarpic genes in tomato by the EMS mutagenesis approach

Harada, Keiichi, Yano, Ryoichi, Okabe, Yoshinori, Ezura, Hirohi, Ariizumi, Toru

Plant and Animal genome Conference XXV 2018年1月12日
De novo assembly of Japanese muskmelon ‘Earl’s favorite Harukei-3’

Yano, Ryoichi, Ariizumi, Toru, Nonaka, Satoko, Ezura, Hiroshi

XIV Solanaceae and 3rd Cucurbitaceae Joint Conference (SolCuc2017, Valencia, Spain) 2017年9月3日
Formation and subsequent development of axillary bud affected by dominant-negative mutant allele in Micro-Tom

Wang, Ning, Wang Xiaolei, Yano, Ryoichi, Nada, Katsuki, Ezura, Hiroshi, Kusano, Miyako

XIV Solanaceae and 3rd Cucurbitaceae Joint Conference (SolCuc2017) 2017年9月